Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP009974 |
1,844,787 |
G→A |
R199Q (CGG→CAG) |
RPPX_08230 → |
monooxygenase |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP009974 | 1,844,787 | 0 | G | A | 99.4%
| 1327.4
/ NA
| 353 | R199Q (CGG→CAG) | RPPX_08230 | monooxygenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (162/186); total (166/187) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 358 total aligned reads displayed.
CTCACCCTCAAGGCCCGAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCGGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCAACATTCA > CP009974/1844639‑1844934
|
ctcaccctcaAGGCCCGAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGATCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCagg > 2:3904797/1‑151 (MQ=255)
accctcaAGGCCCGAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGaa < 2:1608810/151‑1 (MQ=255)
cctcaAGGCCCGAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGc > 1:6095141/1‑151 (MQ=255)
cctcaAGGCCCGAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGc < 1:2672820/151‑1 (MQ=255)
tcaAGGCCCGAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGccc < 1:3540752/151‑1 (MQ=255)
tcaAGGCCCGAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGccc > 2:4883335/1‑151 (MQ=255)
aGGCCCGAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCggg > 1:5812689/1‑151 (MQ=255)
gCCCGAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGt < 1:3351567/151‑1 (MQ=255)
ccGAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTg < 1:910851/151‑1 (MQ=255)
gAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTgcg > 1:4671831/1‑151 (MQ=255)
gAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTgcg > 1:1929577/1‑151 (MQ=255)
gAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTgcg > 1:132818/1‑151 (MQ=255)
gAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTgcg > 1:2860826/1‑151 (MQ=255)
aaTTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTgcgc > 1:4854607/1‑151 (MQ=255)
aTTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCa > 2:4086916/1‑151 (MQ=255)
gcgcCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGa > 2:1005080/1‑151 (MQ=255)
cgcCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCCCCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGAt < 1:4975317/151‑1 (MQ=255)
ccGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTACAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAGGCCCGGGGTTGCGCATGGTCGATGa > 2:3609684/1‑151 (MQ=255)
ccGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGa < 1:4365542/151‑1 (MQ=255)
ggCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACt > 2:2332451/1‑151 (MQ=255)
gCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTg < 1:3590410/151‑1 (MQ=255)
aCAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTc > 1:5710421/1‑151 (MQ=255)
cAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTcc > 1:1834508/1‑151 (MQ=255)
cAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTGCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTcc < 1:225298/151‑1 (MQ=255)
aGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGATGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCg < 2:5245848/151‑1 (MQ=255)
cTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCggg < 1:598152/151‑1 (MQ=255)
cTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCggg < 1:113252/151‑1 (MQ=255)
cATCAGTGGCGAGAAGTTCTACGCCACCGGTGCCGTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGGCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGc < 1:6425002/151‑1 (MQ=255)
tAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCa > 2:3813410/1‑151 (MQ=255)
aaGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAg > 1:3967827/1‑151 (MQ=255)
aaGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAg < 1:3283517/151‑1 (MQ=255)
aGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAgc > 1:4057155/1‑151 (MQ=255)
aGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAgc < 2:5531357/151‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAgcg < 2:56127/151‑1 (MQ=255)
tGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAgcgc > 2:1540673/1‑151 (MQ=255)
gCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGcac > 2:2123102/1‑151 (MQ=255)
cGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGcacc > 1:779258/1‑151 (MQ=255)
gaAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCaccacc > 1:1889938/1‑151 (MQ=255)
aaGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCg < 1:4281302/151‑1 (MQ=255)
ttCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCa > 2:4180243/1‑151 (MQ=255)
ttCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAAGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCa > 2:1174795/1‑151 (MQ=255)
cTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGc > 2:1106377/1‑151 (MQ=255)
tACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCg < 2:2792735/151‑1 (MQ=255)
aCTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCgg > 2:3033033/1‑151 (MQ=255)
aCTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCgg > 2:1036507/1‑151 (MQ=255)
tCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCCGCGGTa > 2:2198047/1‑151 (MQ=255)
tCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTa > 2:6412751/1‑151 (MQ=255)
tCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTa < 1:6047557/151‑1 (MQ=255)
cACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTAcc < 2:3430375/151‑1 (MQ=255)
aCCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGTCGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCTGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTGGATTTCTGGTTCGGGGTCGGCAGGCGCACCACCGCCATCGGTAccc > 2:3746899/1‑150 (MQ=255)
ccGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGt < 1:5837267/151‑1 (MQ=255)
cGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCTGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGAGGACTGGGCCGGGTTCGGCCGGCGCACCACCGCCAGCGGTTCCGtg > 2:2690791/1‑151 (MQ=255)
gTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGtgct > 1:5100779/1‑151 (MQ=255)
ccTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTgctgct < 1:1208600/151‑1 (MQ=255)
ccTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTgctgct > 1:254915/1‑151 (MQ=255)
ttGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTgg < 2:2098346/151‑1 (MQ=255)
ttGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTgg > 2:3546364/1‑151 (MQ=255)
gTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGAc < 1:1491798/151‑1 (MQ=255)
cGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAg > 2:1451737/1‑151 (MQ=255)
cGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAg < 2:616277/151‑1 (MQ=255)
cGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGAGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGCACCAg > 2:1982018/1‑151 (MQ=255)
ccATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTg < 2:1808321/151‑1 (MQ=255)
gggTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGt > 2:534848/1‑151 (MQ=255)
tGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGa > 1:4546514/1‑151 (MQ=255)
tGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGa > 2:3193793/1‑151 (MQ=255)
ggTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGAcgcg < 2:4006627/151‑1 (MQ=255)
gTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCgg > 1:245405/1‑151 (MQ=255)
gTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCgg < 2:1523957/151‑1 (MQ=255)
aaGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACt > 2:1740078/1‑151 (MQ=255)
aaGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACt < 2:1369532/151‑1 (MQ=255)
aGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTg > 1:5929148/1‑151 (MQ=255)
cgacgacgaAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATc > 2:873609/1‑151 (MQ=255)
gacgacgaAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCCTTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCg < 2:5464864/151‑1 (MQ=255)
gacgacgaAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCg > 1:208793/1‑151 (MQ=255)
gacgaAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACa < 1:1028752/151‑1 (MQ=255)
gacgaAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACa > 2:1890767/1‑151 (MQ=255)
gacgaAGGCCGCCAGCGCCTGCCATTCGTGCGCCAGGGGAGCCCGGGCTTGCCCGTTGTCGATGACGCGACCGGGTTCGGCCACCGCACCACCGCCCGCGGTACCGCCCTGCTGGACCAGCCGCCGGTTGACGCAGAACCGGTGATCGAcc > 2:2583621/1‑150 (MQ=255)
gaAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACt < 1:6268290/151‑1 (MQ=255)
aaGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCGTTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTg < 2:6260329/151‑1 (MQ=255)
aaGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTg < 2:679467/151‑1 (MQ=255)
aGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTgg > 2:595729/1‑151 (MQ=255)
gccgccAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGgcg > 1:5410287/1‑151 (MQ=255)
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AGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGCCAACTGG > SRR10918232.1933138/1‑151 (MQ=60)
GCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCG > SRR10918232.5434925/1‑151 (MQ=60)
CCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTGGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAAGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGC < SRR10918232.510451/151‑1 (MQ=60)
CGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCC < SRR10918232.261957/151‑1 (MQ=60)
GCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCA < SRR10918232.5994915/151‑1 (MQ=60)
GCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCA < SRR10918232.231152/151‑1 (MQ=60)
CCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAG < SRR10918232.1362220/151‑1 (MQ=60)
CCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAG < SRR10918232.1361704/151‑1 (MQ=60)
CAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGC < SRR10918232.5852264/151‑1 (MQ=60)
CAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGC > SRR10918232.3984803/1‑151 (MQ=60)
CAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGC > SRR10918232.3984625/1‑151 (MQ=60)
ctcttccgatcTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGC < SRR10918232.3209544/140‑1 (MQ=60)
GCGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGC > SRR10918232.2813711/1‑151 (MQ=60)
CGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCG > SRR10918232.5934680/1‑151 (MQ=60)
CGCCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCG > SRR10918232.2157053/1‑151 (MQ=60)
CCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGAT < SRR10918232.1880476/151‑1 (MQ=60)
CCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGAT < SRR10918232.6194019/151‑1 (MQ=60)
CCTGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGAT < SRR10918232.6193641/151‑1 (MQ=60)
TGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATAT < SRR10918232.3345866/151‑1 (MQ=60)
AGGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATAT < SRR10918232.314199/151‑1 (MQ=60)
GGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATC > SRR10918232.5565186/1‑151 (MQ=60)
GGCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGCTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATC > SRR10918232.6543883/1‑151 (MQ=60)
GCATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCC > SRR10918232.4515217/1‑151 (MQ=60)
CATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCC < SRR10918232.3947725/151‑1 (MQ=60)
ATTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCC < SRR10918232.1663635/151‑1 (MQ=60)
TTCGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCA < SRR10918232.4729980/151‑1 (MQ=60)
CGTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCAAC > SRR10918232.5291793/1‑151 (MQ=60)
GTGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCAACA > SRR10918232.5426853/1‑151 (MQ=60)
TGCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCAACAT < SRR10918232.2975106/151‑1 (MQ=60)
GCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCAACATT < SRR10918232.312347/151‑1 (MQ=60)
GCGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCAACATT < SRR10918232.1083591/151‑1 (MQ=60)
CGCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCAACATTC > SRR10918232.4819938/1‑151 (MQ=60)
GCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCACCATTCA > SRR10918232.6049584/1‑151 (MQ=60)
GCCAGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCAACATTCA > SRR10918232.5865309/1‑151 (MQ=60)
AGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTTACGCGGAACTGGTTATCGACCACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCAACATTCAGGG > SRR10918232.2706838/1‑151 (MQ=60)
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CCCTCACCCTCAAGGCCCGAATTACGCGCGCCGGCGACAGCTACCGCATAAGTGGCGAGAAGTTCTACTCCACCGGTGCCTTGTTCGCCCATTGGGTGGCGGTAAAAGCCCTCGACGACGAAGGCCGCCAGCGCCTGGCATTCGTGCGCCGGGGAAGCCCGGGGTTGCGCATTGTCGATGACTGGTCCGGGTTCGGCCAGCGCACCACCGCCAGCGGTACCGTGCTGCTGGACCAGGTGCCGGTTGACGCGGAACTGGTGATCGACAACTGGCGCCAGCGCGATATCCCCAACATTCAGGG > CP009974/1844637‑1844937
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |