Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
2,336,379 |
(C)10→9 |
intergenic (‑343/+12) |
RPPX_10460 ← / ← RPPX_10465 |
EVE domain protein/5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 2,336,370 | 0 | C | . | 89.3%
| 1093.5
/ 123.4
| 265 | intergenic (‑334/+21) | RPPX_10460/RPPX_10465 | EVE domain protein/5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (11/17); new base . (116/119); total (127/138) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.26e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
TCAACGTAAAAAGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATACCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAG > CP009974/2336220‑2336520
|
cAACGTAAAAAGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATAcc < 2:6490432/151‑1 (MQ=255)
cGTAAAAAGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATAccccc > 1:2471716/1‑151 (MQ=255)
cGTAAAAAGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATAccccc < 2:1708146/151‑1 (MQ=255)
aaaaGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATAccccccccc < 2:5442844/151‑1 (MQ=255)
ggATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGgcg < 2:2876827/151‑1 (MQ=255)
ggATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGgcg > 1:4611304/1‑151 (MQ=255)
gATCTGTGGTGGTTCCGGGTGTTCATTTTTGGCCGGGGTGTGGCCACTCCGGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGACCGCAAGCTGGACAACGCCTACCAGATGCCGGTCGACGCCGGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGgcgc < 2:6341913/151‑1 (MQ=255)
tCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATACCCCCCCCCCGCTGGcgcc > 1:139684/1‑151 (MQ=255)
ctgTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCaa > 1:3491610/1‑151 (MQ=255)
ggATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACgg > 2:5702381/1‑150 (MQ=255)
aTCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGgc < 2:2040692/151‑1 (MQ=255)
tCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGgc < 2:2490671/151‑1 (MQ=255)
cTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGgcgc < 1:115631/151‑1 (MQ=255)
tGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGcc > 1:1230964/1‑151 (MQ=255)
ggTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATACCCCCCCCCC‑CTGGCGCCCGGCAACGTGGCGccc > 1:2151322/1‑150 (MQ=255)
ggTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCa < 2:1152608/151‑1 (MQ=255)
tgtTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCCACCTGGCGCCCGGt > 2:1589848/1‑151 (MQ=255)
gtTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCGGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGt < 1:6284832/151‑1 (MQ=255)
gtTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTATGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGt < 1:2310975/151‑1 (MQ=255)
tCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATACCCCCCCCCC‑CTGGCGCCGCTGAACGTGGCGCCAGGCAc > 2:867640/1‑151 (MQ=255)
tCATTTTTGGCCTGGGTGAGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCCGGCCCCGCCCAAAGTGGCGCCGGGTAc > 1:6094597/1‑151 (MQ=255)
gaTTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGATGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTAcc < 2:3850268/150‑1 (MQ=255)
cATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTAcc < 1:3280495/151‑1 (MQ=255)
aTTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCa > 1:6358395/1‑151 (MQ=255)
tttttGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCac > 1:1992686/1‑150 (MQ=255)
ttGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTCGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCa < 1:3232131/151‑1 (MQ=255)
tGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACg > 2:1096402/1‑151 (MQ=255)
gCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACgg < 1:6177377/151‑1 (MQ=255)
gCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGt > 1:1013079/1‑151 (MQ=255)
ccTGGGTGTGGCCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGt < 1:6496844/151‑1 (MQ=255)
tGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTcc > 1:2534853/1‑151 (MQ=255)
tGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTcc < 1:5823861/151‑1 (MQ=255)
tGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCg < 1:337617/151‑1 (MQ=255)
ggTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCCGGCGCCGCCCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCCCGGcccca > 2:2640488/1‑149 (MQ=255)
tgGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGAcc < 2:5885110/151‑1 (MQ=255)
tCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTg < 1:1858018/151‑1 (MQ=255)
aCTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCCACGGGGCGCCCGGGACCAGCCACGGTCCGCGACCGTGgcc > 2:4414400/1‑151 (MQ=255)
cTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACACCGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGccc < 1:1105038/151‑1 (MQ=255)
tACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGcccc > 2:4738393/1‑150 (MQ=255)
tACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCt < 1:3865746/151‑1 (MQ=255)
tACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCt < 2:4494731/151‑1 (MQ=255)
aCCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCCCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTg > 2:217881/1‑151 (MQ=255)
ccGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCCCCGCTCAACGTGGCGCCACGGACCAGCCACGGTCCGAGACCGCGCCCTGc > 2:5357245/1‑151 (MQ=255)
ggTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAg < 1:4749257/151‑1 (MQ=255)
ggTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAg < 1:6027376/151‑1 (MQ=255)
tATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCCGCCAGCGACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTGAACGTGGCGACAGGGACCAGGCACGGAACGAGACCGTGCCCCGCCGCgg > 1:1742442/1‑151 (MQ=255)
gcgcAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATACCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGaa < 1:3027746/151‑1 (MQ=255)
gcgcAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAAc < 2:712225/151‑1 (MQ=255)
gcgcAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCCCAACGCGGCGCCCGGTACCAGCCCCGGTCCGAGACCGCTGCCTTCAGCGGAAc > 2:1947238/1‑151 (MQ=255)
cgcAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACa < 1:1567466/151‑1 (MQ=255)
gcAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCCGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCCGCAGCGGAACAt > 2:5835606/1‑151 (MQ=255)
cAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATc < 2:2562256/151‑1 (MQ=255)
aaGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATccc < 1:4181729/151‑1 (MQ=255)
aGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCCCCACCTGGCGCCCGGTACCCGCCCCGGTCCGAGGCCGGGCCCCGCAGCGGGACCTccc > 2:2318154/1‑151 (MQ=255)
gCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCCAGACCGTGCCCTGCAGCGCAACATCCCaa > 2:6296199/1‑151 (MQ=255)
cTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATACCCCCCCCCC‑CTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGCGACCGTGCCTCGCCGCGGAACATCCCAAc > 2:3228886/1‑151 (MQ=255)
cTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACt > 1:3781550/1‑151 (MQ=255)
cTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTgg < 1:864372/151‑1 (MQ=255)
tGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGc < 1:4830532/151‑1 (MQ=255)
gggAGCGGAAGCTGGCCACCGCCTATCAGATGCCGGCCGACGCCCGCCAGCAACAACGTTGAT‑CCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTAACAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGcc < 1:2012065/151‑1 (MQ=255)
gggAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGcc < 1:1593456/151‑1 (MQ=255)
ggAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCt < 1:2425208/151‑1 (MQ=255)
gAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTg > 2:791515/1‑151 (MQ=255)
cgcAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCCACTGGCCTgcgc > 1:5530200/1‑151 (MQ=255)
gcAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCCGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCCACTGGCCTGCGcc > 1:2829788/1‑151 (MQ=255)
gcAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGcc > 1:686378/1‑151 (MQ=255)
cAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTTCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCa > 1:2233422/1‑151 (MQ=255)
ggCTGGACACCGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGc < 2:948462/150‑1 (MQ=255)
gCTGGACACCGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGcc < 1:1686138/151‑1 (MQ=255)
gCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGACAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCCCAACCTGGTGCCCGGTCCCACCCCCGGTCCGAGACCGTGCCCGCCCCCGGAACAACCCAACTGGCCTGCTCCCGcc > 2:2978305/1‑151 (MQ=255)
tGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTTCGCCAGCCGc > 1:1444905/1‑151 (MQ=255)
ggACACCGCCTATCAGATGCCGGTGGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCt < 2:4152760/151‑1 (MQ=255)
gACACCGCGTATCAGAGGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTc < 2:1267369/151‑1 (MQ=255)
gACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTc < 1:4320556/151‑1 (MQ=255)
gACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACCGGCCTGCGCCAGCCGccc > 2:2684517/1‑149 (MQ=255)
cccGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGAc < 2:4856605/149‑1 (MQ=255)
aaCGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGAc < 2:4546033/151‑1 (MQ=255)
cTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCt < 2:2246510/151‑1 (MQ=255)
tATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTg < 1:914358/151‑1 (MQ=255)
aGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCCGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCACCCACCGCCCGAGACCGGGCCCTGCAGCCGAATATCCCAACAGGCCTTCGCCACCCGCTCACCACTCTGGCAt > 2:394170/1‑151 (MQ=255)
cgggcggACGCCGGCCAGCCACAGCGTTGAT‑GCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATg < 2:1639257/145‑1 (MQ=255)
cGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCCACTGGCCGGCGCCAGCCGCCCCACCTTCTGGCGTTCATgg > 1:5754868/1‑150 (MQ=255)
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ACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCC < SRR10918232.2000637/151‑1 (MQ=60)
CTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACACCGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCC < SRR10918232.1109553/151‑1 (MQ=60)
TACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCT < SRR10918232.3882597/151‑1 (MQ=60)
TACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCT < SRR10918232.1544761/151‑1 (MQ=60)
CCCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTG < SRR10918232.3785855/151‑1 (MQ=60)
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gtcctcttccgaccccaagctgcccaacgcctccCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCACCCACACCGTGGAT‑TCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCC < SRR10918232.5497065/117‑1 (MQ=60)
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CAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAG > SRR10918232.5474180/1‑151 (MQ=60)
AGCCACAACGTTGATACCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAG < SRR10918232.2755967/151‑1 (MQ=60)
CCACAACGTTGTTA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAA < SRR10918232.1530097/151‑1 (MQ=60)
CACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAAT > SRR10918232.5185595/1‑151 (MQ=60)
CACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCCCGACCCTCTGGCATTCATGCGCCCGCCCCACCAGCCAT > SRR10918232.5459187/1‑151 (MQ=60)
CAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGAGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGG < SRR10918232.67782/151‑1 (MQ=60)
NTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGANCATCCCAANTNGCCTGCGCCAGCCGCCCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCCGCCCCCGCAGCCATGGTTTT > SRR10918232.6456453/1‑151 (MQ=60)
TGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTC < SRR10918232.1482151/151‑1 (MQ=60)
GATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTC < SRR10918232.1056447/151‑1 (MQ=60)
ctcccggtctCCCGCTGGCGCCGCTCAGCGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTC < SRR10918232.5380996/141‑1 (MQ=60)
taCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCA < SRR10918232.4273114/149‑1 (MQ=60)
CCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAG < SRR10918232.4035068/151‑1 (MQ=60)
ACCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCCCGACCTTCCGGCCTTCATGCGCCAGCCCCCGCAGCAATGGTTTTTTCCCG > SRR10918232.6294356/1‑151 (MQ=60)
CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGGTTTTTCCAGG > SRR10918232.5004116/1‑151 (MQ=60)
CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAGGT > SRR10918232.6408299/1‑151 (MQ=60)
CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAGGT > SRR10918232.6407852/1‑151 (MQ=60)
CCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAGGTT < SRR10918232.5171682/151‑1 (MQ=60)
CCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAGGTT > SRR10918232.1334946/1‑151 (MQ=60)
CCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAGGTT > SRR10918232.6445007/1‑151 (MQ=60)
CCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGAGCCGAGGCCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCACAGCAGCAATGGAGTTTTCCAGGTT > SRR10918232.2547891/1‑151 (MQ=60)
CCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAGGTTT < SRR10918232.4718702/151‑1 (MQ=60)
CCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAGGTTT < SRR10918232.4718701/151‑1 (MQ=60)
CCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAGGTTTGCC < SRR10918232.2042273/151‑1 (MQ=60)
CCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGCTTTTTCCAGGTTTGCC > SRR10918232.5776669/1‑151 (MQ=60)
CCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAGGTTTGCCG < SRR10918232.5379313/151‑1 (MQ=60)
CGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAGGTTTGCCGA < SRR10918232.2093211/151‑1 (MQ=60)
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AGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATACCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAGGTTTGCCGA > CP009974/2336231‑2336529
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |