Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,514,540 |
(G)6→5 |
coding (316/2754 nt) |
RPPX_15700 ← |
chemotaxis protein CheY |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,514,535 | 0 | G | . | 98.8%
| 1796.1
/ 7.0
| 342 | coding (321/2754 nt) | RPPX_15700 | chemotaxis protein CheY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/3); new base . (169/169); total (170/172) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.23e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 377 total aligned reads displayed.
CAGCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGGGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTG > CP009974/3514385‑3514683
|
gCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTggg < 2:5846348/151‑1 (MQ=255)
gCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTggg < 1:5588250/151‑1 (MQ=255)
gATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTgggggca > 1:2898796/1‑149 (MQ=255)
gATCTCCACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCTGTACCGCCCCTgggggtc > 1:1125237/1‑149 (MQ=255)
aTCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTgggggcag < 2:5107981/151‑4 (MQ=255)
aTCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTgggggcag > 1:2007876/1‑148 (MQ=255)
tctcTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTgggggcagg > 2:4581810/1‑147 (MQ=255)
tctcTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTgggggcagg < 1:5092686/151‑5 (MQ=255)
cccagcccagCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGc > 2:3263940/1‑151 (MQ=255)
cccagcccagCAGGCGATGGGCTTCGGCGGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGc < 1:1667484/151‑1 (MQ=255)
ccagcccagcAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCa > 2:2327834/1‑151 (MQ=255)
ccagcccagcAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCa < 1:3388601/151‑1 (MQ=255)
cccagcAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCt < 1:6413025/151‑1 (MQ=255)
cccagcAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCt > 1:2341558/1‑151 (MQ=255)
cccagcAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCt < 2:355573/151‑1 (MQ=255)
cagcggGCGCTCGGCTGCGGCCGGGACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTg < 2:6355606/151‑1 (MQ=255)
cagcagGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTg > 2:5504144/1‑151 (MQ=255)
gcagGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTggg < 1:1786063/151‑1 (MQ=255)
agGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGcc > 1:4380190/1‑151 (MQ=255)
tCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTg > 1:5726159/1‑151 (MQ=255)
cTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGcc > 1:4731975/1‑151 (MQ=255)
ttCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGGGGGCCa > 2:6513011/1‑151 (MQ=255)
cggccggcACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAgg > 1:3186383/1‑151 (MQ=255)
gccggcACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGgcg < 1:1088988/151‑1 (MQ=255)
ccggcACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGgcgc < 1:101104/151‑1 (MQ=255)
cggcACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGcgcg > 1:4500600/1‑151 (MQ=255)
ggcACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGCCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGt < 1:1154185/151‑1 (MQ=255)
gcACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTg > 1:554181/1‑151 (MQ=255)
cGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCgg > 2:3197834/1‑151 (MQ=255)
ggCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGt > 1:253223/1‑151 (MQ=255)
cGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTcc < 1:3959382/151‑1 (MQ=255)
gTCGGTGGCCGGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCCCTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCCGGGTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCg < 1:2849662/151‑1 (MQ=255)
gTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCg > 1:2554404/1‑151 (MQ=255)
ggTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCgggg < 2:4846917/151‑1 (MQ=255)
ggTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCgggg < 1:599607/151‑1 (MQ=255)
ggTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCgggg > 1:3678566/1‑151 (MQ=255)
gCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAg < 2:2158523/151‑1 (MQ=255)
cAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGaa < 1:1510503/151‑1 (MQ=255)
gTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACg > 1:5404623/1‑151 (MQ=255)
gTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACg < 2:682903/151‑1 (MQ=255)
gcgGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCa > 1:876246/1‑151 (MQ=255)
ggtggtGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACt < 1:4008095/151‑1 (MQ=255)
ggtggtGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGAAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACt > 1:1875844/1‑151 (MQ=255)
gtggtgGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTg < 1:4466637/151‑1 (MQ=255)
gtggtgGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTg > 2:2627534/1‑151 (MQ=255)
tggtggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTgc < 2:3953505/151‑1 (MQ=255)
tggtggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGCGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTgc > 2:1707234/1‑151 (MQ=255)
gtggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTgcgc > 1:1424917/1‑151 (MQ=255)
tggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTgcgc < 1:1945914/150‑1 (MQ=255)
ggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGc < 1:3621139/141‑1 (MQ=255)
ccGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGAGGCACGGGGCCACAGACGCCACTGCGCGcac > 2:5024703/1‑151 (MQ=255)
cGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGTGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGTGCCAGAAACGCCACTGCGCGcaca > 2:2580742/1‑151 (MQ=255)
cGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGcaca > 1:5023049/1‑151 (MQ=255)
gAACACTGGCATCCGGTACCAGGTGGCCTCGTTGCCACTGCGCTCCAGGAGCTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTCGGCCGGCGTGGGCCCGGCGCGCGCGGGGCGGGGCCCGCAGCGCCGCTGCGCGcactg > 2:1498574/1‑149 (MQ=255)
aaCACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATc < 2:1963040/151‑1 (MQ=255)
aaCACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATc < 1:3122172/151‑1 (MQ=255)
acacTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCg < 2:4380190/151‑1 (MQ=255)
cacTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCgg > 1:822915/1‑151 (MQ=255)
cctagCATCAGGTGGCGGGTGGCGTCGTTACCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGC‑GGGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGc < 2:2870267/147‑1 (MQ=255)
acTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGc > 2:1319653/1‑151 (MQ=255)
cTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGGGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGcc < 2:1439/151‑1 (MQ=255)
tGGCATCAGGTAGCGGGGGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTCGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCt < 2:5707850/151‑1 (MQ=255)
ggCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTg < 2:4468707/151‑1 (MQ=255)
cATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCt < 1:2436821/151‑1 (MQ=255)
gTAGCGGGTGGCGTCGTGGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAggg < 2:1807622/151‑1 (MQ=255)
gCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGttt < 2:3783932/151‑1 (MQ=255)
gggTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTtgt < 1:2697276/151‑1 (MQ=255)
tGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCg > 2:2464362/1‑151 (MQ=255)
cgtcgtTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCa > 2:2372229/1‑151 (MQ=255)
cgtcgtTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCa > 1:4101544/1‑151 (MQ=255)
gtcgtTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGGCACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGGGTGTGCGGcga > 2:4118888/1‑149 (MQ=255)
gtTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATtc > 2:1014445/1‑151 (MQ=255)
gtTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATtc > 1:4299578/1‑151 (MQ=255)
ttGCCGCGGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGGCGCT‑GGGGGCAGGCTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATtct < 2:6278427/151‑1 (MQ=255)
gCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATtctct > 1:3260305/1‑151 (MQ=255)
gCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATtctct < 1:5288970/151‑1 (MQ=255)
aCTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCa < 2:4299578/151‑1 (MQ=255)
cTGCGCTGCAGGAGGTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAg < 2:5772319/151‑1 (MQ=255)
gcgcTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGtt > 2:1086562/1‑151 (MQ=255)
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ggcTGCAGGAGTGGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTg < 2:4683749/150‑1 (MQ=255)
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GATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGGGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAG > CP009974/3514391‑3514690
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |