Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,543,776 |
C→G |
K449N (AAG→AAC) |
RPPX_20290 ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,543,776 | 0 | C | G | 100.0%
| 410.9
/ NA
| 151 | K449N (AAG→AAC) | RPPX_20290 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (75/76); total (75/76) |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
CACTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGT > CP009974/4543631‑4543860
|
aCTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGc < 1:4732060/151‑1 (MQ=255)
cTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCg < 2:2543403/151‑1 (MQ=255)
ttAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGa > 1:3264552/1‑151 (MQ=255)
ttAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGa < 2:4724520/151‑1 (MQ=255)
tAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGAt < 1:3762340/151‑1 (MQ=255)
tAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGAt < 2:4123062/151‑1 (MQ=255)
aaTCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATa > 1:74699/1‑151 (MQ=255)
aTCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATaa < 2:3111100/151‑2 (MQ=255)
aTCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATaa < 1:4519927/151‑2 (MQ=255)
aTCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATaa < 1:378970/151‑2 (MQ=255)
tctcAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATaag > 1:4801485/1‑149 (MQ=255)
tctcAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATaag < 1:2872412/151‑3 (MQ=255)
tcAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGAt < 2:199508/151‑1 (MQ=255)
cAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATg > 1:6034972/1‑151 (MQ=255)
cAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATg > 1:6035005/1‑151 (MQ=255)
aGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCCCCCCGAACCCAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTACTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATCAGATGt > 2:6381561/1‑151 (MQ=14)
aGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGt < 1:5939499/151‑1 (MQ=255)
aGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGt > 2:383893/1‑151 (MQ=255)
cATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTg > 2:1970475/1‑151 (MQ=255)
aTGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGa < 1:2497856/151‑1 (MQ=255)
aTGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGa < 1:278536/151‑1 (MQ=255)
gACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAAc < 2:1041658/151‑1 (MQ=255)
aCGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAAcc > 2:5404216/1‑151 (MQ=255)
aCGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGGTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAAcc > 1:5922221/1‑151 (MQ=255)
cGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACca < 1:1680605/151‑1 (MQ=255)
ggCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACcac > 1:3667734/1‑151 (MQ=255)
ggCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACcac < 1:5483176/151‑1 (MQ=255)
ggCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCAGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTGCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACcac > 2:6313739/1‑151 (MQ=14)
gCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACcaca < 2:4053490/151‑1 (MQ=255)
gCCGTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAGTGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGGTGAACcaca < 2:3002553/151‑1 (MQ=14)
ccTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAg < 1:6223267/151‑1 (MQ=255)
ccTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCCGTTGTAGGCCGTGGTGAGCGATAAGATGTTGAACcacac > 2:3849087/1‑150 (MQ=14)
ttATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCa > 1:2484990/1‑151 (MQ=255)
tATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCAt > 1:1147389/1‑151 (MQ=255)
aTGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATc > 2:5954677/1‑151 (MQ=255)
aTGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATc > 1:4415169/1‑151 (MQ=255)
aTGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATc > 1:5720487/1‑151 (MQ=255)
aTGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATc < 2:2525004/151‑1 (MQ=255)
tGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATcc < 1:3092638/151‑1 (MQ=255)
gCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATccc < 1:2236269/151‑1 (MQ=255)
gCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATccc < 1:2235026/151‑1 (MQ=255)
gCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATccc < 1:1362283/151‑1 (MQ=255)
cGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATccct > 1:2437378/1‑150 (MQ=255)
cGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATccct < 1:2331315/151‑2 (MQ=255)
cGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATccct < 2:24915/151‑2 (MQ=255)
cGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATccct < 2:3135824/151‑2 (MQ=255)
gTTGCCCGCGCGCTGACCAATGTCGGTGCCGCTGGGCCAATCACCCCGAACGCAGGTGAGGCGGCCCCGACGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCGGGCTGTTGGAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATccctg < 2:5503475/151‑3 (MQ=11)
ttGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCtgc < 2:3323455/151‑1 (MQ=255)
tGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGt < 1:1269066/131‑1 (MQ=255)
tGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCtgcg > 1:3282050/1‑151 (MQ=255)
tGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGGGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGt > 2:1269066/1‑131 (MQ=255)
gCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGGACCACAGCATcccttcgt > 1:2108382/1‑146 (MQ=14)
gCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGt < 2:4709685/151‑1 (MQ=255)
cccGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGtt > 1:2006749/1‑151 (MQ=255)
ccGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGttt < 1:5756383/151‑1 (MQ=11)
ccGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGttt > 1:3991068/1‑151 (MQ=255)
ccGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGttt > 1:6487043/1‑151 (MQ=255)
aCGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAac > 1:3504515/1‑151 (MQ=255)
cGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAacc < 2:1136376/151‑1 (MQ=11)
cGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAacc > 1:4936606/1‑151 (MQ=11)
cGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAacc < 2:5737181/151‑1 (MQ=11)
cTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGACAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccac < 1:587787/151‑1 (MQ=11)
tGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccacc < 1:3698679/151‑1 (MQ=11)
gACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccacca > 1:1591460/1‑151 (MQ=255)
ccAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccacc < 2:2291814/151‑1 (MQ=11)
cAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccacca < 2:3274997/151‑1 (MQ=11)
aaTGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccaccac < 1:4337655/151‑1 (MQ=255)
aTGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccaccacc > 2:5955791/1‑151 (MQ=255)
aTGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccaccacc > 1:623163/1‑151 (MQ=11)
gTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGc < 1:629046/151‑1 (MQ=11)
tCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGcc < 1:5619847/151‑1 (MQ=255)
tCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGcc < 1:5619804/151‑1 (MQ=11)
tCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGcc > 1:4545770/1‑151 (MQ=11)
tCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGcc > 1:979306/1‑151 (MQ=255)
ctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGccgcc > 2:5034111/1‑148 (MQ=11)
ctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGa > 1:636036/1‑151 (MQ=11)
tgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAg > 2:5174599/1‑151 (MQ=11)
tgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAg < 2:826590/151‑1 (MQ=11)
gccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAgg > 1:4279747/1‑151 (MQ=11)
ccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGt > 1:5470981/1‑151 (MQ=11)
cgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTg > 2:1188581/1‑151 (MQ=11)
gctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGa > 2:1828586/1‑151 (MQ=11)
ctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAg > 1:4407117/1‑151 (MQ=11)
ctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTCAACCACAGCATCCCTGCGCTTAAACCCCCACCACCGCCGGAggcgcg > 2:516149/1‑147 (MQ=11)
gcgcCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCATGCAGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGAAGGTGAGCa > 2:3943642/1‑151 (MQ=11)
gcCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCACTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAAc > 1:3993272/1‑151 (MQ=11)
ccAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAAcc > 2:1500033/1‑151 (MQ=11)
aTCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCaa > 1:6122565/1‑151 (MQ=11)
cACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAgg > 2:4955369/1‑151 (MQ=11)
cACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAgg < 1:5405317/151‑1 (MQ=11)
aCCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGa < 1:4932378/151‑1 (MQ=11)
ccccGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGaa < 1:896394/151‑1 (MQ=11)
cccGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAg < 2:4168596/151‑1 (MQ=11)
cGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGtt < 1:5282819/151‑1 (MQ=11)
gAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTg < 2:5629991/151‑1 (MQ=11)
acacAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTggg > 2:2953783/1‑151 (MQ=11)
acacAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTggg > 2:1747239/1‑151 (MQ=11)
cacaGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGt > 1:884812/1‑151 (MQ=11)
cacaGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGt < 1:5851121/151‑1 (MQ=1)
cacaGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGt < 1:1127720/151‑1 (MQ=1)
|
CACTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGT > CP009974/4543631‑4543860
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTGGCACTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGC > CP009974/4543626‑4543922
|
TGTGGCACTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTG > SRR10918232.5760579/1‑151 (MQ=60)
TGTGGCACTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTG < SRR10918232.5194887/151‑1 (MQ=60)
GTGGCACTTAATCTCAGCATGGCGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGT < SRR10918232.4439757/151‑1 (MQ=60)
GTGGCACTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGT < SRR10918232.5657710/151‑1 (MQ=60)
GTGGCACTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGT > SRR10918232.305610/1‑151 (MQ=60)
CACTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAG > SRR10918232.596607/1‑151 (MQ=60)
ACTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGC < SRR10918232.4753019/151‑1 (MQ=60)
TTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGA > SRR10918232.3278897/1‑151 (MQ=60)
TAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGAT < SRR10918232.3778799/151‑1 (MQ=60)
AATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATA > SRR10918232.74911/1‑151 (MQ=60)
ATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAA < SRR10918232.4926412/151‑1 (MQ=60)
ATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAA < SRR10918232.380275/151‑1 (MQ=60)
ATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAA < SRR10918232.4538514/151‑1 (MQ=60)
ATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAA < SRR10918232.4539709/151‑1 (MQ=60)
TCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAG > SRR10918232.4822878/1‑151 (MQ=60)
TCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAG < SRR10918232.2884762/151‑1 (MQ=60)
TCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGAT < SRR10918232.5681044/151‑1 (MQ=60)
TCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGAT < SRR10918232.3726162/151‑1 (MQ=60)
TCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGAT > SRR10918232.6499054/1‑151 (MQ=60)
CAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATG > SRR10918232.6062831/1‑151 (MQ=58)
CAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATG > SRR10918232.6062798/1‑151 (MQ=58)
CAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATG < SRR10918232.2523284/151‑1 (MQ=58)
gacgtgtgctcttccgatcTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGT < SRR10918232.1274437/132‑1 (MQ=60)
AGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGT < SRR10918232.5966757/151‑1 (MQ=56)
ATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGA < SRR10918232.2508450/151‑1 (MQ=50)
ATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGA < SRR10918232.279456/151‑1 (MQ=50)
ATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGA > SRR10918232.3289390/1‑151 (MQ=50)
TGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAA < SRR10918232.2310998/151‑1 (MQ=48)
ACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGGTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACC > SRR10918232.5949390/1‑151 (MQ=43)
CGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCA < SRR10918232.1688173/151‑1 (MQ=42)
GGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCAC < SRR10918232.5508196/151‑1 (MQ=40)
GGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCAC < SRR10918232.5576741/151‑1 (MQ=40)
GGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCAC > SRR10918232.3683779/1‑151 (MQ=40)
CCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAG < SRR10918232.6252129/151‑1 (MQ=42)
CTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGC > SRR10918232.4363984/1‑151 (MQ=42)
TTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCA > SRR10918232.2491936/1‑151 (MQ=42)
TTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCA > SRR10918232.2495537/1‑151 (MQ=42)
TATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCAT > SRR10918232.1152109/1‑151 (MQ=42)
ATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATC > SRR10918232.5746611/1‑151 (MQ=42)
ATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATC > SRR10918232.4434440/1‑151 (MQ=42)
ATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATC < SRR10918232.1271411/151‑1 (MQ=42)
ATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATC < SRR10918232.3027857/151‑1 (MQ=42)
TGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCC < SRR10918232.3106094/151‑1 (MQ=40)
GCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCC < SRR10918232.1368157/151‑1 (MQ=40)
GCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCC < SRR10918232.2244608/151‑1 (MQ=40)
GCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCC < SRR10918232.2245854/151‑1 (MQ=40)
CGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCT > SRR10918232.2447711/1‑151 (MQ=38)
CGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCT < SRR10918232.2341228/151‑1 (MQ=38)
TTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGC < SRR10918232.1407934/151‑1 (MQ=33)
TGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCG > SRR10918232.3296464/1‑151 (MQ=31)
GCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGGACCACAGCATCCCttcgt > SRR10918232.2117513/1‑146 (MQ=37)
CCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTT > SRR10918232.2015524/1‑151 (MQ=29)
CCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTT > SRR10918232.3993109/1‑151 (MQ=29)
CCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTT > SRR10918232.4008379/1‑151 (MQ=27)
CCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTT > SRR10918232.6517769/1‑151 (MQ=27)
CCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTT < SRR10918232.5782727/151‑1 (MQ=27)
CGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTA < SRR10918232.6142804/151‑1 (MQ=25)
ACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAAC > SRR10918232.3519858/1‑151 (MQ=19)
CGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACC > SRR10918232.4958812/1‑151 (MQ=19)
CTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGACAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCAC < SRR10918232.589920/151‑1 (MQ=19)
TGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACC < SRR10918232.3714888/151‑1 (MQ=19)
GACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCA > SRR10918232.1598662/1‑151 (MQ=19)
GACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCA > SRR10918232.2147744/1‑151 (MQ=19)
ACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCAC > SRR10918232.5812606/1‑151 (MQ=19)
AATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCAC < SRR10918232.4356548/151‑1 (MQ=19)
AATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCAC < SRR10918232.916229/151‑1 (MQ=19)
ATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACC > SRR10918232.625391/1‑151 (MQ=19)
ATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACC < SRR10918232.3633156/151‑1 (MQ=19)
GTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGC > SRR10918232.5431648/1‑151 (MQ=19)
GTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGC < SRR10918232.631289/151‑1 (MQ=19)
GTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGC > SRR10918232.6235851/1‑151 (MQ=19)
GTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGC < SRR10918232.5257720/151‑1 (MQ=19)
TCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCC < SRR10918232.5645434/151‑1 (MQ=19)
TCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCC < SRR10918232.5645477/151‑1 (MQ=19)
TCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCC > SRR10918232.983174/1‑151 (MQ=19)
TCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCC > SRR10918232.4565691/1‑151 (MQ=19)
CTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCggg > SRR10918232.6288945/1‑148 (MQ=16)
CTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGA > SRR10918232.4155929/1‑151 (MQ=10)
CTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGA > SRR10918232.638301/1‑151 (MQ=10)
GCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGG > SRR10918232.4298330/1‑151 (MQ=6)
CCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGT > SRR10918232.5495930/1‑151 (MQ=6)
GCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGA < SRR10918232.5915471/151‑1 (MQ=6)
GCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGA < SRR10918232.866503/151‑1 (MQ=6)
CTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAG > SRR10918232.4426340/1‑151 (MQ=6)
CGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAA < SRR10918232.1970881/151‑1 (MQ=4)
GCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCACTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAAC > SRR10918232.4010593/1‑151 (MQ=4)
ATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAA > SRR10918232.6150880/1‑151 (MQ=4)
CACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGG < SRR10918232.5429935/151‑1 (MQ=4)
ACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGA < SRR10918232.4954563/151‑1 (MQ=4)
CCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAA < SRR10918232.899827/151‑1 (MQ=4)
CGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTT < SRR10918232.5306750/151‑1 (MQ=4)
CACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGT < SRR10918232.5877962/151‑1 (MQ=0)
CACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGT < SRR10918232.1132349/151‑1 (MQ=0)
CACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGT > SRR10918232.888200/1‑151 (MQ=0)
CACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGT > SRR10918232.4651194/1‑151 (MQ=0)
CAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTT < SRR10918232.1965778/151‑1 (MQ=0)
AGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGC < SRR10918232.5686820/151‑1 (MQ=0)
GAGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCG < SRR10918232.668056/151‑1 (MQ=0)
GAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCA < SRR10918232.4562846/151‑1 (MQ=0)
CCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGG < SRR10918232.4945718/151‑1 (MQ=0)
CCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGG > SRR10918232.451119/1‑151 (MQ=0)
AGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGG > SRR10918232.6068911/1‑151 (MQ=0)
TATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCT > SRR10918232.4276894/1‑151 (MQ=0)
NTTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTC > SRR10918232.2585283/1‑151 (MQ=0)
ATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTC > SRR10918232.2188307/1‑151 (MQ=0)
ATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTC > SRR10918232.5352246/1‑151 (MQ=0)
CGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATA > SRR10918232.5512173/1‑151 (MQ=0)
CGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATA > SRR10918232.978199/1‑151 (MQ=0)
TGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGAC > SRR10918232.4354001/1‑151 (MQ=0)
CGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACAC < SRR10918232.4487406/151‑1 (MQ=0)
GTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACC > SRR10918232.3806769/1‑151 (MQ=0)
TCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCG > SRR10918232.5366210/1‑151 (MQ=0)
ccgatcTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGT < SRR10918232.539784/145‑1 (MQ=0)
GCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTG > SRR10918232.5880806/1‑151 (MQ=0)
CTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGC < SRR10918232.2740477/151‑1 (MQ=0)
TCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCTCCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCG < SRR10918232.1437118/151‑1 (MQ=0)
TTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGC < SRR10918232.519411/151‑1 (MQ=0)
TCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCT > SRR10918232.6159767/1‑151 (MQ=0)
TGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTAC < SRR10918232.364855/151‑1 (MQ=0)
TGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTAC > SRR10918232.1415260/1‑151 (MQ=0)
GCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACC < SRR10918232.4421289/151‑1 (MQ=0)
CAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCC < SRR10918232.695675/151‑1 (MQ=0)
AGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCG < SRR10918232.5577295/151‑1 (MQ=0)
CTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGA > SRR10918232.1419852/1‑151 (MQ=0)
TGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGAT > SRR10918232.5475051/1‑151 (MQ=0)
TGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCG > SRR10918232.4847471/1‑151 (MQ=0)
GTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGC > SRR10918232.968130/1‑151 (MQ=0)
AAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAA > SRR10918232.1119401/1‑151 (MQ=0)
AAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAA > SRR10918232.2202723/1‑151 (MQ=0)
AAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAA > SRR10918232.2207740/1‑151 (MQ=0)
AGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAAC > SRR10918232.6186259/1‑151 (MQ=0)
CCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGC > SRR10918232.4265643/1‑151 (MQ=0)
|
TGTGGCACTTAATCTCAGCATGACGGCCTTATGCGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGC > CP009974/4543626‑4543922
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
