Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 462 total aligned reads displayed.
GTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGG > CP009974/3994602‑3994902
|
TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCGCAGGCCGCC > SRR10918232.2382040/1‑151 (MQ=60)
TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGAAACCCCGCTCCTACGCCGGATTGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCC > SRR10918232.3734735/1‑151 (MQ=59)
TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCggg > SRR10918232.2216802/1‑148 (MQ=56)
TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGT < SRR10918232.6016730/151‑1 (MQ=60)
GAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATGACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCGGT < SRR10918232.5828524/151‑1 (MQ=51)
GGCGCGGTTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGT < SRR10918232.5594318/151‑1 (MQ=16)
ggaggggtgatgagcgacgaggccgggactactggcgaatgacctCCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAG < SRR10918232.6067822/106‑1 (MQ=14)
AGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAG > SRR10918232.6527561/1‑151 (MQ=60)
AGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAG < SRR10918232.893369/151‑1 (MQ=24)
GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGC‑‑GGTAGGAGCG > SRR10918232.775809/1‑151 (MQ=35)
GTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCggtaggagcggc > SRR10918232.6028478/1‑139 (MQ=31)
tttccccgcgaagaggccggccctgctttcttttttcaagccgaagacggcatacgaggtgacattccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctgtGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGGGCGG < SRR10918232.1478350/47‑1 (MQ=9)
atacgaggtgacattccgtgactggagttcagacgtgtgctctcccgatcttgttgacgccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGG < SRR10918232.3703890/87‑1 (MQ=2)
TTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGG < SRR10918232.6202991/151‑1 (MQ=27)
acattccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGG < SRR10918232.1032435/110‑1 (MQ=32)
TTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTCCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGG < SRR10918232.6290642/151‑1 (MQ=60)
TTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCCGGCCGCCGGGTCGGAGCGGG > SRR10918232.3863312/1‑151 (MQ=44)
TTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGG < SRR10918232.4403324/151‑1 (MQ=60)
TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGG < SRR10918232.4887518/151‑1 (MQ=27)
TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGAGTAAACCCGCTCCAACGCCGGATTGGTGGTGGACACCGATCGGTGATAGGGCGCAGGCCGGCGGGTAGGAGCCGG > SRR10918232.4036524/1‑151 (MQ=3)
CCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918232.2589975/151‑1 (MQ=60)
cccgaggagggcgtccctactggttttttttctcacgcagtagacggctgccgatgtgacattccgtgactggagttcagacgcgtgctcggacgatctGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTAC < SRR10918232.6124914/52‑1 (MQ=52)
GCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACC < SRR10918232.1786619/151‑1 (MQ=60)
GCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGGTTACC > SRR10918232.4532647/1‑151 (MQ=33)
cgaaagggccgggccggtTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCG < SRR10918232.599651/133‑1 (MQ=0)
CGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTACACCCGCTCCGACGCGGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCC < SRR10918232.3587626/151‑1 (MQ=60)
gtagttgtttgacctagtggacggtttacgcgtggagttgcctggactcgaggttagacgtgtgctcgttagacctgattgggCGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCG < SRR10918232.1472523/68‑1 (MQ=60)
aaagggccgggccggtTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG < SRR10918232.1047603/135‑1 (MQ=5)
aaagGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGC < SRR10918232.2499705/147‑1 (MQ=41)
AAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTGACCCGC > SRR10918232.4614773/1‑151 (MQ=56)
aagggccgggccggtTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA > SRR10918232.6281898/16‑151 (MQ=9)
gaggcccgccctgctagccagttaccggccgtcggacgctgtctccgccgatatcggcttggcgggtgagcgcggtcgttCGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA < SRR10918232.948087/71‑1 (MQ=60)
AGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGAGACAGGTCGGTGATTGGGCCCGGGCCGCCGTGaaggataggttttcgcggcgga > SRR10918232.223617/1‑129 (MQ=20)
GCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGAGTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAAG > SRR10918232.4320471/1‑151 (MQ=55)
CCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATGGGGCGCGGGCCGCCGTGGAGGAGCGGGCTTACCCGCGAAAGG > SRR10918232.5063960/1‑151 (MQ=43)
cgggccggtTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggc > SRR10918232.646663/10‑146 (MQ=27)
CGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGG > SRR10918232.2805861/1‑151 (MQ=60)
GGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggc > SRR10918232.3999904/1‑146 (MQ=16)
GGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGGGCGGGTTTCCCCGCGAGAGGGC > SRR10918232.1116023/1‑151 (MQ=35)
GCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC > SRR10918232.1591261/1‑151 (MQ=8)
gccggtTGGCCACTTTCCACCCGCCGTTGACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGG < SRR10918232.5141390/145‑1 (MQ=29)
gccgccgctaccgtattcgcgggtaaacccgctcctacacagattgggggtggacacaggtcggtgattgggCGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAgagggcg > SRR10918232.3033891/73‑144 (MQ=37)
CCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCG > SRR10918232.3678143/1‑151 (MQ=60)
CCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCG > SRR10918232.4696471/1‑151 (MQ=60)
TGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTGGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCC < SRR10918232.1219420/151‑1 (MQ=4)
GCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGCGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCC < SRR10918232.6541741/151‑1 (MQ=60)
GCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTCGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCC < SRR10918232.5747162/151‑1 (MQ=6)
ACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCC > SRR10918232.1488731/1‑151 (MQ=60)
CTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCT < SRR10918232.5650977/151‑1 (MQ=8)
TGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGGCCCCGGGCGGGGGTTGGGCGCCGGCCGGCGTGTAGGTGCGGGTTTACTCGCGAAGAGGCCGGCCCTGC > SRR10918232.5870042/1‑151 (MQ=3)
TGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGC < SRR10918232.2016646/151‑1 (MQ=44)
TGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGC > SRR10918232.2836868/1‑151 (MQ=44)
GGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCT > SRR10918232.497456/1‑151 (MQ=46)
GGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGCCGGTGATTGGGCGCAGGCAGTCGTGTAGCAGCTGGGTTTCCCGCGTATAGGCCGGCCCTGC > SRR10918232.1546109/1‑151 (MQ=0)
ccgatttgccCCCGCCGTACTCCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTG < SRR10918232.3274581/141‑1 (MQ=18)
CAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCAGAGGCCGGCCCTGCTGGC > SRR10918232.396546/1‑151 (MQ=46)
CAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGCC > SRR10918232.4948132/1‑151 (MQ=47)
CAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGG > SRR10918232.1888442/1‑151 (MQ=60)
ATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGGTTGGTGGTGGACACAGGCCGGTGAGTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCC > SRR10918232.3165802/1‑151 (MQ=25)
TTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCTCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGAGCGGGGG‑GGCCACAGGTCGGGGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGCAGTGGCCGGCCCTGCTGTCCAA > SRR10918232.357304/1‑151 (MQ=28)
TTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAA < SRR10918232.5508525/151‑1 (MQ=57)
TTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAAT > SRR10918232.3833297/1‑151 (MQ=59)
TTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAAT < SRR10918232.5318530/151‑1 (MQ=59)
TACCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAA < SRR10918232.2321674/151‑1 (MQ=27)
CCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGGATTCGCGGGTAAACCCGCTTCTTCGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGAAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAAT < SRR10918232.4005792/151‑1 (MQ=60)
CCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAAT < SRR10918232.1848758/151‑1 (MQ=28)
ACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAAT > SRR10918232.5369479/1‑151 (MQ=60)
ctatgccattccgtcactggagttcagacgtgtgctcttccgatctCCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATT < SRR10918232.4829436/105‑1 (MQ=60)
CCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATT > SRR10918232.4312952/1‑151 (MQ=60)
CCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCGGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTA > SRR10918232.3461550/1‑151 (MQ=57)
CACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTA < SRR10918232.639597/151‑1 (MQ=7)
CCCGCCGTTCATCGTTTCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCAGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATctcc < SRR10918232.3786749/151‑5 (MQ=7)
CCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACC < SRR10918232.720920/151‑1 (MQ=60)
CCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACC < SRR10918232.1614388/151‑1 (MQ=13)
CCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCC > SRR10918232.4441169/1‑151 (MQ=60)
CCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCA < SRR10918232.625740/151‑1 (MQ=60)
CCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCA < SRR10918232.3367563/151‑1 (MQ=15)
agcagtacactgccggcgcggcgtccgtacgtGCGGGCAAACGCGCTCCCACGCCGCATCGGGGGTGGACCCAGGTGGGTGCTTCGGCGCTGGCCGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCAC < SRR10918232.3063999/119‑1 (MQ=33)
CGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCAC > SRR10918232.5827212/1‑151 (MQ=17)
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AAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCATGCTGGCCAAATACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCAACCGTATTCGCGGG > SRR10918232.1908324/1‑151 (MQ=55)
aaccggtaatacacaggagtggtgttgggcccacGTCGGTGATTGGGCGCAGGCAGTAGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTA < SRR10918232.2109047/117‑1 (MQ=20)
ACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTA > SRR10918232.4117164/1‑151 (MQ=60)
CCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAA < SRR10918232.5847786/151‑1 (MQ=0)
CCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAA > SRR10918232.1805401/1‑151 (MQ=60)
ggaCCTACGCCGGATCGGGGGTCGACACAGGTCGGTGGTTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACC < SRR10918232.6101060/148‑1 (MQ=42)
ttgggCGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCG > SRR10918232.2884812/6‑151 (MQ=4)
TCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCG > SRR10918232.467453/1‑151 (MQ=4)
CGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCT > SRR10918232.905966/1‑151 (MQ=26)
CGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCT > SRR10918232.3506189/1‑151 (MQ=26)
CGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGT < SRR10918232.4038945/46‑1 (MQ=0)
CGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGACTTCGTGTAGGAGCGGGTTTTCCCGCGAA > SRR10918232.2171452/1‑72 (MQ=0)
tgctcttccgagctGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGGGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTAC < SRR10918232.4464314/137‑1 (MQ=8)
CCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < SRR10918232.1950943/151‑1 (MQ=19)
CCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC > SRR10918232.2055706/1‑151 (MQ=19)
CCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC > SRR10918232.2060337/1‑151 (MQ=19)
GGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC > SRR10918232.3077562/1‑151 (MQ=18)
tggtggtggacccacaTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGA > SRR10918232.3007633/17‑151 (MQ=16)
CGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCgctcctacgcctga > SRR10918232.4420645/1‑137 (MQ=7)
gtggtggacccacaTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTGTCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATA < SRR10918232.4458064/137‑1 (MQ=1)
ggctcttccgatcgGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGC < SRR10918232.4648234/137‑1 (MQ=35)
gtggacacacctctggggttggacaCAGGCCGCCGTGTAGGAGGGGGGTTACCCGCGATAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTGGACTGTTGCCGCCGCTACCGGATTTGCGGGTAAgcccgcccctgcgcagattggtg > SRR10918232.982621/26‑128 (MQ=0)
GTGGACCCACATCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCG > SRR10918232.129324/1‑151 (MQ=14)
TGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCTACCGTATTCGCGtgtacacccgccactgaacgtgatttggt > SRR10918232.670478/1‑122 (MQ=5)
gacccacaTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCT > SRR10918232.1418302/9‑151 (MQ=25)
GACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCcggattgggggt > SRR10918232.2694320/1‑139 (MQ=0)
ccacgcaacgggGATTGGGCGCAGGCCGTCGGGTAGCAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCgctcctacaccggattggtggtg < SRR10918232.85007/139‑24 (MQ=0)
cccacGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCG < SRR10918232.5626646/146‑1 (MQ=46)
CACA‑‑TCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTT < SRR10918232.4508729/151‑1 (MQ=40)
CACA‑‑TCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTT > SRR10918232.2095502/1‑151 (MQ=40)
ataGGTGATTGGGCGCATGCCGTCGTGTAGGCGCTGGTTTAACCGGGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCT < SRR10918232.2722148/148‑1 (MQ=48)
ATCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACTGGATAGCGGGGCGATCCT > SRR10918232.1588293/1‑151 (MQ=28)
ATCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCCCTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATCGCGGCGCGTTCCT > SRR10918232.4786224/1‑151 (MQ=37)
ATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGTCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCTGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTAAGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGG > SRR10918232.2627333/1‑151 (MQ=36)
CGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGT < SRR10918232.4075596/151‑1 (MQ=60)
CGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGT > SRR10918232.6564161/1‑151 (MQ=53)
AGGCCGTCGTAGAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCC < SRR10918232.4245895/151‑1 (MQ=60)
CCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAgatcggtagagcacacgtctggactccagccacggaatgtcatctcgtatgg > SRR10918232.3854240/1‑99 (MQ=24)
CGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGT > SRR10918232.3489404/1‑151 (MQ=60)
GTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTG < SRR10918232.3542019/151‑1 (MQ=60)
TCGTGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGG < SRR10918232.551477/151‑1 (MQ=60)
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GTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGG > CP009974/3994602‑3994902
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
