Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
2,069,253 |
T→C |
Q252R (CAG→CGG) |
RPPX_09275 ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 2,069,253 | 0 | T | C | 99.2%
| 917.7
/ ‑4.9
| 261 | Q252R (CAG→CGG) | RPPX_09275 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (127/132); total (128/133) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
AGATCGCCCAGTTCCTCCCGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCTGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGAACCAGGCACCTTCTTCGATTCCAGCCGACCAGTGCTGCTGA > CP009974/2069106‑2069400
|
cGCCCAGTTCCTCCCGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGacac > 2:787858/1‑151 (MQ=255)
ccAGTTCCTCCCGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTAc > 2:1992160/1‑151 (MQ=255)
cAGTTCCTCCCGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACa < 1:2606325/151‑1 (MQ=255)
gTTCCTCCCGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACaaa > 1:3191601/1‑151 (MQ=255)
ttCCTCCCGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACTCTACAAAc < 2:5175166/151‑1 (MQ=255)
ttCCTCCCGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAAc < 1:4169417/151‑1 (MQ=255)
tcctccCGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACt < 2:1673043/151‑1 (MQ=255)
ctccCGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTcc > 1:4004973/1‑151 (MQ=255)
tccCGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTCCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGCCCGTGCCACTACAAACTCCa > 2:2581798/1‑151 (MQ=255)
ccGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATg < 1:4459828/151‑1 (MQ=255)
ccGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATg < 2:1485814/151‑1 (MQ=255)
cGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGc < 2:3868135/151‑1 (MQ=255)
cATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCa < 1:1005125/151‑1 (MQ=255)
tCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAAc < 2:1221170/151‑1 (MQ=255)
cTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAAcc < 2:128812/151‑1 (MQ=255)
tCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCaa < 2:1147790/151‑1 (MQ=255)
tCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCaa < 2:1266756/151‑1 (MQ=255)
tctATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCa > 1:4041576/1‑151 (MQ=255)
ttATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAg < 2:85871/150‑1 (MQ=255)
ctATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAg < 2:1534248/151‑1 (MQ=255)
aTCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGAc < 1:988013/151‑1 (MQ=255)
tCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACg > 1:3413286/1‑151 (MQ=255)
ccATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGc < 1:1437140/151‑1 (MQ=255)
cATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCt > 1:251638/1‑151 (MQ=255)
ttCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTc < 2:4960560/151‑1 (MQ=255)
gATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTc > 2:2230783/1‑151 (MQ=255)
aTAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCt > 2:2504319/1‑151 (MQ=255)
tAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCtt < 1:3342844/151‑1 (MQ=255)
aaGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTAAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCttt < 1:1783626/151‑1 (MQ=255)
aGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTg < 1:2635765/151‑1 (MQ=255)
ggATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGa < 1:744795/151‑1 (MQ=255)
ggATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGa > 2:4330156/1‑151 (MQ=255)
gatcatCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGAc < 2:3523941/151‑1 (MQ=255)
atgatCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACg > 1:614516/1‑151 (MQ=255)
atgatCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACg < 1:4600135/151‑1 (MQ=255)
tgatCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGa > 1:1276799/1‑151 (MQ=255)
gatCAACCGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGAt < 1:3678766/151‑1 (MQ=255)
ccGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATg < 2:2491170/151‑1 (MQ=255)
cGGCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATgg > 1:1686854/1‑151 (MQ=255)
ggCATCCGGCTAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGc > 1:4662623/1‑151 (MQ=255)
ggCATCCGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGc < 1:5155800/151‑1 (MQ=255)
ccGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATg < 1:2327520/151‑1 (MQ=255)
cGGATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGa > 2:2030384/1‑151 (MQ=255)
gATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGaaa > 1:1198073/1‑151 (MQ=255)
gATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGaaa < 1:2910140/151‑1 (MQ=255)
gATAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCAATGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGaaa < 1:1499695/151‑1 (MQ=255)
aTAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAAc < 1:89969/151‑1 (MQ=255)
aTAAGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAAc < 1:3928379/151‑1 (MQ=255)
gagagGTTCGAGCCGAGCCGGAGCGGAGTTGGTGACTTCCGGGGGGATGTGCGCGAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTGCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTc < 2:4922305/150‑1 (MQ=255)
aaGAGATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTc < 1:4330156/151‑1 (MQ=255)
agagATTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCa > 1:5200051/1‑151 (MQ=255)
agaTTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCAtt > 2:726091/1‑151 (MQ=255)
agaTTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCAtt > 2:1573407/1‑151 (MQ=255)
gaTTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCAttt > 1:1310290/1‑151 (MQ=255)
gaTTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCAttt > 1:3817243/1‑151 (MQ=255)
gaTTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCAttt > 1:4296221/1‑151 (MQ=255)
ttCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTg > 2:3271704/1‑151 (MQ=255)
aCCAATGCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTACTCAAACTCAGCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCCTGCATTCAACCAATCCAGACGCTTCACTGCCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATc < 2:5032495/151‑1 (MQ=255)
aCCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATc < 2:2405574/151‑1 (MQ=255)
aCCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTAAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCCGAGGCGTCACTGTCTTTGACGATTCAGTGGCGGATGAACCTCATTTTGGGAtg > 2:4248474/1‑150 (MQ=255)
cAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCaa > 2:1835694/1‑151 (MQ=255)
cAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCaa < 2:1927319/151‑1 (MQ=255)
aaGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCaaa < 2:3003630/151‑1 (MQ=255)
aGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCaaaa < 1:2190757/151‑1 (MQ=255)
gaatcgaatTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCTGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGCCGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATg > 1:2929051/1‑151 (MQ=255)
aatcgaatTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATgc > 1:5232271/1‑151 (MQ=255)
tcgaatTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATgccg > 1:2097252/1‑151 (MQ=255)
tcgaatTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATgccg > 1:4516259/1‑151 (MQ=255)
tcgaatTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATgccg < 2:2691038/151‑1 (MQ=255)
cgaatTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCATGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATgccgc < 2:2261709/151‑1 (MQ=255)
atTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCtt < 2:4003332/151‑1 (MQ=255)
tttGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTc < 2:5112291/151‑1 (MQ=255)
ttGATGACTTCCTTGTGAATGTGGTCAAGCGCACCTCAGCGAGGCCGTTACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTCAGATCAAAATATGCCGCCTGCg < 2:484297/151‑1 (MQ=255)
gaCTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGAACCa < 2:1601505/151‑1 (MQ=255)
agttCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAACCTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGAACCAg < 2:3328339/149‑1 (MQ=255)
cTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGACGCCTTCGAACCAgg > 2:3141672/1‑151 (MQ=255)
tCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGAACCAGGCa < 2:2051753/151‑1 (MQ=255)
cTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGAACCAGGCAcc < 2:581886/151‑1 (MQ=255)
cTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGAACCAGGCAcc > 1:3008924/1‑151 (MQ=255)
tgtgAATGTGCTCAAGCTGACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGAACCAGGCACctt < 2:76656/151‑1 (MQ=255)
gtgAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGAACCAGGCACcttc < 1:668791/151‑1 (MQ=255)
tgAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGCTTCGCTGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGACCCAGGCACcttct > 1:4235076/1‑151 (MQ=255)
tgAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGAACCAGGCACcttct > 2:3789176/1‑151 (MQ=255)
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CCGGATAAGAGA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATG < SRR10918231.2338073/151‑1 (MQ=60)
GGATAAGAGA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAA > SRR10918231.1565354/1‑151 (MQ=60)
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ATAAGAGA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAAC > SRR10918231.5100148/1‑151 (MQ=60)
ATAAGAGA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAAC < SRR10918231.3946724/151‑1 (MQ=60)
TAAGAGA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACT > SRR10918231.2930276/1‑151 (MQ=60)
TAAGAGA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACT > SRR10918231.3427920/1‑151 (MQ=60)
AAGAGA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTC < SRR10918231.4220831/151‑1 (MQ=60)
AAGAGA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTC > SRR10918231.4192043/1‑151 (MQ=60)
AAGAGA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTC < SRR10918231.4350723/151‑1 (MQ=60)
AGAGA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCA > SRR10918231.5225706/1‑151 (MQ=60)
AGATTTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCTCGAGGCTGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCGAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCAT < SRR10918231.799384/151‑1 (MQ=60)
GA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTT > SRR10918231.4316604/1‑151 (MQ=60)
GA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTT > SRR10918231.1316593/1‑151 (MQ=60)
GA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTT > SRR10918231.3834862/1‑151 (MQ=60)
A‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTT > SRR10918231.2750699/1‑151 (MQ=60)
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AGGCCGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGAACCAGGCACCTTCTTCGATTCCAGCCGACCAGTGCTGCTG > SRR10918231.2172997/1‑151 (MQ=60)
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AGCAGATCGCCCAGTTCCTCCCGGGCCATCTTCACTCTATCCATTCTGCGATAAGGATGATCAACCGGCATCCGGATAAGAGA‑TTCGAACCAAGCCGAATCGAATTTGATGACTTCCTTGTGAATGTGCTCAAGCTCACCTCCGCGAGGCTGTGACACTACAAACTCCATGCTTTCAACCAAGCCAGACGCTTCACTGTCTTTGACGATTCGATGGCGGATGAAACTCATTTTGAGATCAAAATATGCCGCCTTCGAACCAGGCACCTTCTTCGATTCCAGCCGACCAGTGCTGCTG > CP009974/2069103‑2069399
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
