Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
2,672,064 |
C→T |
G249E (GGG→GAG) |
RPPX_11870 ← |
FAD‑dependent oxidoreductase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 2,672,064 | 0 | C | T | 98.1%
| 938.0
/ NA
| 271 | G249E (GGG→GAG) | RPPX_11870 | FAD‑dependent oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); major base T (120/143); minor base G (1/4); total (123/148) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.82e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
AGCAGGTTGGCGATTTCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCCCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCAACACGATGC > CP009974/2671914‑2672211
|
cAGGTTGGCGATTTCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCtcg < 2:3244486/151‑1 (MQ=255)
ggTTGGCGATTTCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCtcgcc > 2:334056/1‑151 (MQ=255)
gTTGGCGATTTCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCtcgccg > 2:701913/1‑151 (MQ=255)
ttGGCGATTTCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCtcgccgc > 1:512080/1‑151 (MQ=255)
tGGCGATTTCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGCTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCtcgccgcc > 2:2837641/1‑151 (MQ=255)
ggCGATTTCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCtcgccgccg < 2:1075931/151‑1 (MQ=255)
ggCGATTTCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCtcgccgccg < 2:2919833/151‑1 (MQ=255)
gCGATTTCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGa < 2:3598513/151‑1 (MQ=255)
tttCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCa > 2:1370992/1‑151 (MQ=255)
tttCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGCCa > 2:1589296/1‑151 (MQ=255)
ttCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAg > 1:1158079/1‑151 (MQ=255)
ttCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAg < 1:2773778/151‑1 (MQ=255)
ttCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAg > 2:630506/1‑151 (MQ=255)
ccTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTg < 1:312554/151‑1 (MQ=255)
ccTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTg < 1:1806767/151‑1 (MQ=255)
cTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCg > 1:2875123/1‑151 (MQ=255)
tGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGt > 2:4042420/1‑151 (MQ=255)
gcgcTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTa < 1:4490238/151‑1 (MQ=255)
gcgcTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCGCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTa < 1:3977358/151‑1 (MQ=255)
cgcTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTAc < 1:1560634/151‑1 (MQ=255)
cTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACaa > 1:810911/1‑151 (MQ=255)
tGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACcaa > 2:3961571/1‑151 (MQ=255)
agcaATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGCGCCAGTGGGCGTACACAGGt > 2:4331706/1‑151 (MQ=255)
agcaATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGt > 2:3035594/1‑151 (MQ=255)
gcaATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGtt > 1:1406521/1‑151 (MQ=255)
caATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGttt < 1:3497902/151‑1 (MQ=255)
caATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGttt > 2:3193888/1‑151 (MQ=255)
aaTCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTc > 2:788925/1‑151 (MQ=255)
aaTCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTc < 1:4301455/151‑1 (MQ=255)
aaTCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTc < 1:4442305/151‑1 (MQ=255)
aTCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCa < 2:2064522/151‑1 (MQ=255)
tCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAg < 2:1886933/151‑1 (MQ=255)
cgcTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTc < 2:4608696/151‑1 (MQ=255)
cgcTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTc < 2:253001/151‑1 (MQ=255)
tGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCggg > 1:2087770/1‑151 (MQ=255)
gCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTTCCAGTCCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGc < 2:2973797/151‑1 (MQ=255)
cTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGGGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTg > 2:2289137/1‑151 (MQ=255)
tCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTgg < 1:3103748/151‑1 (MQ=255)
tCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTgg > 1:2861068/1‑151 (MQ=255)
ccgcgcgCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGCGCCCCACCGAGCTGCCCGACGCCCGCGCCGCCCGCTGCCGGACGGGTGGGCGCCGTGACCCGCGCCGTGGGCCGGCCGCCGCGGCGCTGGGCGCCCAAAGGGTTCAGATGCGGGgcccggg > 2:2901203/2‑147 (MQ=255)
ccaggcaaTCGGCTTCGGCCAGGTTCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGAc < 1:4961297/151‑1 (MQ=255)
ccacgccaTCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGAc < 1:1780285/151‑1 (MQ=255)
gccaTCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGGTGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACCAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATTACCacg > 2:1133581/1‑149 (MQ=255)
tCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCa < 1:2546561/151‑1 (MQ=255)
cGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAgcgggcg > 1:3747282/1‑151 (MQ=255)
ggCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCgg > 1:1725584/1‑120 (MQ=255)
ggCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCgg < 2:1725584/120‑1 (MQ=255)
gCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGcgggcggg > 2:1189832/1‑151 (MQ=255)
aGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGttt > 2:276253/1‑151 (MQ=255)
ggTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTg > 1:4897739/1‑151 (MQ=255)
ggTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTg > 1:2359709/1‑151 (MQ=255)
cgccGAGGTACCCGACCCACTGGCCATCGGCTGCCTGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGc < 2:4515765/149‑1 (MQ=255)
cACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGc > 2:1648428/1‑151 (MQ=255)
cACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGc > 2:4237339/1‑151 (MQ=255)
cACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGc < 1:4001265/151‑1 (MQ=255)
aCCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGcc < 1:1067938/151‑1 (MQ=255)
aCCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGcc < 1:2459709/151‑1 (MQ=255)
ccGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCg < 1:2196175/151‑1 (MQ=255)
cGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCgg > 2:4851927/1‑151 (MQ=255)
gAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGc > 1:4797590/1‑151 (MQ=255)
gAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGCTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGc > 2:3805747/1‑151 (MQ=255)
ggTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTg < 1:1967402/151‑1 (MQ=255)
gTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGa < 1:2653056/151‑1 (MQ=255)
ccAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGGGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATcc < 1:4102962/151‑1 (MQ=255)
ccACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGccc > 1:780658/1‑151 (MQ=255)
ccACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGccc < 1:576671/151‑1 (MQ=255)
cTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAgc < 1:1938460/151‑1 (MQ=255)
tGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAgcg < 1:4609379/151‑1 (MQ=255)
ccATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCt > 1:2151306/1‑151 (MQ=255)
agcGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGCGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAGGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTgc < 2:2682241/149‑1 (MQ=255)
tCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTgca < 1:4707790/151‑1 (MQ=255)
tCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGGTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTgca < 2:3087453/151‑1 (MQ=255)
cGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTgcag > 1:1675548/1‑151 (MQ=255)
ggCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTgcagc < 1:1094638/151‑1 (MQ=255)
ggCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTgcagc < 1:4753163/151‑1 (MQ=255)
cTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCaa > 2:4792959/1‑151 (MQ=255)
tGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAg > 1:2928999/1‑151 (MQ=255)
gCCGGATGGGTGGTCACCGTGCCCCGCGGGTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGc < 2:3023078/151‑1 (MQ=255)
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ccGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGcc < 2:5221970/151‑1 (MQ=255)
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CCGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTC < SRR10918231.1218309/151‑1 (MQ=60)
CGCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCA < SRR10918231.5232860/151‑1 (MQ=60)
GCGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCCGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCAA < SRR10918231.4747838/151‑1 (MQ=60)
CGGCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCAAC > SRR10918231.720807/1‑151 (MQ=60)
GCTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCAACAC < SRR10918231.3614093/151‑1 (MQ=60)
CTTGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCAACACG > SRR10918231.2930815/1‑151 (MQ=60)
TGGGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCAACACGAT > SRR10918231.3604915/1‑151 (MQ=60)
GGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCAACACGATGC < SRR10918231.1115792/151‑1 (MQ=60)
GGCTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCAACACGATGC < SRR10918231.4639749/151‑1 (MQ=60)
CTCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCAACACGATGCGT > SRR10918231.2206911/1‑151 (MQ=60)
TCGCCGCCGCGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCAACACGATGCGTT < SRR10918231.3304876/151‑1 (MQ=60)
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AGCAGGTTGGCGATTTCCTTCTGCGCTGCAGCAATCTGCGCTGCAGGCTCGCGCGCCACGCCATCGGCTTCGGCCAGGTCCCCACCGAGGTACCAGACCCACTGGCCATCGGCTGCCGGATGGGTGGTCACCGTTACCCGCGGCTTGGGCCCGCCGCCGAGGCAGTGGGCGTACAAAGGTTTCAGGTTCGGGCCCTTGGCCATGACCATGTGCAGCGGGCGGGTTTGCATGGCCGGCTGATCCAGGCCCAGCGCCTGCAGCAAGCCTTCGGTGCCGGCTCCGGCGCTCAACACGATGCGTT > CP009974/2671914‑2672214
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |