Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
2,947,371 |
C→T |
A77T (GCT→ACT) |
RPPX_13125 ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 2,947,371 | 0 | C | T | 92.7%
| 946.4
/ 36.3
| 290 | A77T (GCT→ACT) | RPPX_13125 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (10/11); new base T (136/131); total (147/143) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.23e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
GGGAGAAAAACCTGTACAGCTCGGATTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGCGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCGGCGA > CP009974/2947221‑2947517
|
gggAGAAAAACCTGTACAGCTCGGATTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAgc > 1:4712074/1‑151 (MQ=255)
agaAAAACCTGTACAGCTCGGATTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCCCAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTCTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGACGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCCAgtgcg > 2:106571/1‑151 (MQ=255)
aaaaCCTGTACAGCTCGGATTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGCGCGCCa < 1:487641/151‑1 (MQ=255)
tGTACAGCTCGGATTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGCGCGCCAGCCcct < 1:1560346/151‑1 (MQ=255)
aCAGCTCGGATTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCcctgac > 2:3275714/1‑151 (MQ=255)
aGCTCGGATTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCcctgacct < 2:1636852/151‑1 (MQ=255)
tCGGATTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCctgacctgac > 1:3611158/1‑151 (MQ=255)
cGGATTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCtgacctgacc < 2:2025591/151‑1 (MQ=255)
ggATTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCg < 1:3465813/151‑1 (MQ=255)
ggATTTGGAGGCGCACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCg < 1:5040346/151‑1 (MQ=255)
gATTTGGAGGCGGCCAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGCTAATCGCCGTCGCTAGTACGCCACCCCCCCACCTCACCGt > 2:4705928/1‑151 (MQ=255)
aTTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGtt > 2:1179656/1‑151 (MQ=255)
aTTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGtt > 2:2352737/1‑151 (MQ=255)
tGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTg < 1:3381354/151‑1 (MQ=255)
gAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGtt > 2:3611521/1‑151 (MQ=255)
gAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGtt > 2:100918/1‑151 (MQ=255)
ggCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCg < 1:2367056/151‑1 (MQ=255)
cGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCCGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCt > 2:4263718/1‑151 (MQ=255)
cGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCt > 1:410919/1‑151 (MQ=255)
ggACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTg > 1:2762335/1‑151 (MQ=255)
ggACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGCTCTGTTCGCtt > 2:3858373/1‑150 (MQ=255)
aGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCt < 1:5175870/151‑1 (MQ=255)
gCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTgg > 1:3419963/1‑151 (MQ=255)
gCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTgg < 2:1999266/151‑1 (MQ=255)
gCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTgg > 1:5001641/1‑151 (MQ=255)
gCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTgg < 1:2745830/151‑1 (MQ=255)
cAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGcc < 1:2079331/151‑1 (MQ=255)
aGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCg > 1:4236676/1‑151 (MQ=255)
ttATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGaa > 2:2284560/1‑151 (MQ=255)
aTCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAAc > 1:2481621/1‑151 (MQ=255)
tcACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTACTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGa < 2:4854426/151‑1 (MQ=255)
aCCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATa > 1:2826073/1‑151 (MQ=255)
gATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGc > 1:1175818/1‑151 (MQ=255)
gATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGc > 1:3678622/1‑151 (MQ=255)
cacaGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGACACCGATACGCcgcgc > 2:3942769/1‑150 (MQ=255)
caGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGAcc < 1:2593918/151‑1 (MQ=255)
ggCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCAc > 1:387705/1‑151 (MQ=255)
ggCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCAc < 1:3175015/151‑1 (MQ=255)
gCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTGTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACt < 1:4290206/151‑1 (MQ=255)
aTTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATg < 2:650296/151‑1 (MQ=255)
cATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGccc > 2:1419811/1‑150 (MQ=255)
cATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCa > 2:3105881/1‑151 (MQ=255)
cATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCa < 2:4636397/151‑1 (MQ=255)
aTGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAg < 1:377139/151‑1 (MQ=255)
gCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAgcg < 1:4355889/151‑1 (MQ=255)
aCGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAgcgcc > 2:2495745/1‑150 (MQ=255)
aCGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGca > 1:1971133/1‑151 (MQ=255)
aCGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGca < 1:690305/151‑1 (MQ=255)
tgtttcggtttTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTTTGGTAATGTCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTTACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGcacc > 2:837158/2‑151 (MQ=255)
gtttcggtttTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGcacca < 1:2304904/151‑1 (MQ=255)
tttcggtttTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGcaccac < 1:3512520/151‑1 (MQ=255)
cggtttTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCt < 1:1416386/151‑1 (MQ=255)
ggtttTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTc < 1:834206/151‑1 (MQ=255)
ttGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATg > 1:4543743/1‑151 (MQ=255)
gCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAg < 1:1838599/151‑1 (MQ=255)
gCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAg < 1:251861/151‑1 (MQ=255)
ccAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGc < 2:617973/151‑1 (MQ=255)
ccAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGGTCGCTGCCCTGGCCGAAAGCGATACGCTGCGACCACTCATGCGACAGCACTAACATCGATGAggg > 2:4393613/1‑150 (MQ=255)
ccAGCCGCCCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCCTTGGTAATGGCCGGCGCTACTGCGCTAGCCCCCGACCTGACGGTTCTGTTCGCGCTCCTGGCCGAAACCCCTACGCTGCGACCCCCCATGCCAGCGCACCCCGCTCGATGAgcc > 2:3018014/1‑149 (MQ=255)
cAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCa < 2:1779993/151‑1 (MQ=255)
gCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGGTGCTCTCTGTGGTACTGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAAt < 2:4457905/151‑1 (MQ=255)
gCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAAt > 1:2334113/1‑151 (MQ=255)
ggcCGGTGCGGCGATCTGCGGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCTCTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGCcg < 2:2751051/150‑1 (MQ=255)
cgcCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGCGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGAcg > 1:1007976/1‑151 (MQ=255)
gcCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCCGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGAcgg > 2:3813685/1‑151 (MQ=255)
gcCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCCATGAcgg > 2:4422822/1‑151 (MQ=255)
gcCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGAcgg > 2:3159742/1‑151 (MQ=255)
ccAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGAcggc < 1:3258829/151‑1 (MQ=255)
cAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGAcggcg > 1:1903541/1‑151 (MQ=255)
cAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGAcggcg > 1:5224804/1‑151 (MQ=255)
cAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGCGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGAcggcg > 1:2272107/1‑151 (MQ=255)
aGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGAcggcgg < 1:1049516/151‑1 (MQ=255)
aGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGAcggcgg > 2:5114602/1‑151 (MQ=255)
gcggcgATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGAcggcggcgg > 1:4809392/1‑151 (MQ=255)
gATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCa > 2:2093514/1‑151 (MQ=255)
tCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATc < 1:2201451/151‑1 (MQ=255)
cTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATcc < 1:291844/151‑1 (MQ=255)
tGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTACGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCCTGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGCCAATGACGGCGTCGGTGCCCTccc > 1:4046534/1‑150 (MQ=255)
tGCCGATGCGCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCa < 2:5234278/151‑1 (MQ=255)
gCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCAc > 2:1309741/1‑151 (MQ=255)
gATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCt > 2:3477881/1‑151 (MQ=255)
aTGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCAcccgc > 2:1490108/1‑149 (MQ=255)
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GTAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTG > SRR10918231.2576222/1‑151 (MQ=60)
TAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGG > SRR10918231.721823/1‑151 (MQ=60)
TAATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGG < SRR10918231.2409545/151‑1 (MQ=60)
AATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGG < SRR10918231.3749211/151‑1 (MQ=60)
ATGGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACTGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGA > SRR10918231.2415643/1‑151 (MQ=60)
GGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGT > SRR10918231.1122129/1‑151 (MQ=60)
GGCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGG > SRR10918231.1949895/1‑151 (MQ=60)
GCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTG > SRR10918231.25540/1‑151 (MQ=60)
GCCGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTG > SRR10918231.23198/1‑151 (MQ=60)
GCCGTCGCTAGCGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTG < SRR10918231.3027251/151‑1 (MQ=60)
CGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTC > SRR10918231.3402114/1‑151 (MQ=60)
CGTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTC < SRR10918231.3828353/151‑1 (MQ=60)
GTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCG < SRR10918231.4035054/151‑1 (MQ=60)
GTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCG < SRR10918231.5049615/151‑1 (MQ=60)
GTCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCG < SRR10918231.1719090/151‑1 (MQ=60)
TCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCGG > SRR10918231.1761928/1‑151 (MQ=60)
TCGCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCGG < SRR10918231.4686719/151‑1 (MQ=60)
GCTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCGGCG > SRR10918231.3342696/1‑151 (MQ=60)
CTAGTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCGGCGA < SRR10918231.2306116/151‑1 (MQ=60)
GTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCGGCGATGA > SRR10918231.1016267/1‑151 (MQ=60)
GTGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCGGCGATGA < SRR10918231.1298096/151‑1 (MQ=60)
TGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCGGCGATGAC > SRR10918231.1928119/1‑151 (MQ=60)
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GGGAGAAAAACCTGTACAGCTCGGATTTGGAGGCGGACAGGCCAGTTATCTCACCGATGTCACAGGCAAATTCATGCACGGTTTCGGTTTTGCCCAGCCGCGCCAGTGCGGCGATCTGCCGATGCTCGCTGTGGTAATGGCCGTCGCTAGCGCGCCAGCCCCTGACCTGACCGTTCTGTTCGCTGCCCTGGCCGAAACCGATACGCTGCGACCACTCATGCCAGCGCACCACGCTCGATGAGGCAATGACGGCGGCGGTGTCATCCACCCTCATGCGCAACTTGGGAGTGTCGGCGATGAC > CP009974/2947221‑2947521
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
