Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,278,038 |
C→T |
T278I (ACC→ATC) |
RPPX_14610 → |
3‑carboxy‑cis,cis‑muconate cycloisomerase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,278,038 | 0 | C | T | 89.5%
| 766.3
/ 57.6
| 260 | T278I (ACC→ATC) | RPPX_14610 | 3‑carboxy‑cis,cis‑muconate cycloisomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (16/11); new base T (134/97); total (151/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.40e-01 |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
CCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGACCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCTTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTG > CP009974/3277889‑3278186
|
aGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCAt < 1:3679360/151‑1 (MQ=255)
gcgcGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGGTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATg < 1:4404142/151‑1 (MQ=255)
gcgACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCACACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTGCGGGTGGTTCTTCGAGCATGcc > 2:4911564/1‑151 (MQ=255)
gACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCcac > 1:3604869/1‑151 (MQ=255)
gACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCcac > 2:2157563/1‑151 (MQ=255)
aCCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGACCATGCcaca > 1:628995/1‑151 (MQ=255)
ccGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCcacac > 1:124377/1‑151 (MQ=255)
ccGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCcacac < 1:4444668/151‑1 (MQ=255)
nccTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACaa > 1:4714144/2‑151 (MQ=255)
gCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACaa < 1:2068800/151‑1 (MQ=255)
cTGGTGGAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAgc < 1:448493/151‑1 (MQ=255)
ggtggAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAgcgc < 2:3802624/151‑1 (MQ=255)
gtggAGTTTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAgcgcn < 1:4152175/151‑2 (MQ=255)
gAGTGTGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAAcc < 2:4843623/151‑1 (MQ=255)
ttGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCggt < 2:2767395/151‑1 (MQ=255)
ttGCCTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCggt > 1:1064671/1‑151 (MQ=255)
ccTCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGGTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCgggggg > 2:3150153/1‑151 (MQ=255)
tCGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCggtgggtg > 1:1400311/1‑151 (MQ=255)
cGGTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTgc > 1:3474586/1‑151 (MQ=255)
gTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTgccg > 1:2915506/1‑151 (MQ=255)
gTACTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTgccg > 1:1428582/1‑151 (MQ=255)
gTACGGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTgccg < 2:1046484/151‑1 (MQ=255)
gcTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTgccgcc < 2:1464905/150‑1 (MQ=255)
ccTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTg < 2:1483095/151‑1 (MQ=255)
ggTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATc > 2:3941415/1‑151 (MQ=255)
gctGCCGGCAGGCCGGGCATGTTCGGCAGTGATACCAGCTTGCCGGTGCAAGCCGCGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCg < 2:1841131/149‑1 (MQ=255)
ttGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCgg > 1:2242852/1‑151 (MQ=255)
ccGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGc > 2:773727/1‑151 (MQ=255)
ggCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGACCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCcg > 2:4179755/1‑151 (MQ=255)
ggCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGACCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCcg > 2:896148/1‑151 (MQ=255)
cAGCGTGGGCAAGTTCGGGCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCcgcg < 2:1859272/151‑1 (MQ=255)
gCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGAc < 1:908073/151‑1 (MQ=255)
cTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGAccc < 2:3711312/151‑1 (MQ=255)
cTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGAccc < 1:201042/151‑1 (MQ=255)
cTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGAccc > 1:3489645/1‑151 (MQ=255)
gggCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCcgc > 2:1154032/1‑151 (MQ=255)
gCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGt > 1:427652/1‑151 (MQ=255)
cAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTg > 1:456683/1‑151 (MQ=255)
cAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTg > 1:3244241/1‑151 (MQ=255)
cAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGCGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTg > 2:626701/1‑151 (MQ=255)
ttCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCgg > 1:5101951/1‑151 (MQ=255)
tCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCggg < 1:316074/151‑1 (MQ=255)
gCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTg < 1:693020/122‑1 (MQ=255)
ccGTGATATCAGCTTGCTGGTGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGGGCCTTCTGCGCCGTGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAGCCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTg < 2:1117835/151‑1 (MQ=255)
ccGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTg > 2:5197522/1‑151 (MQ=255)
ccGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGGGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTg > 2:3239326/1‑151 (MQ=255)
cGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGc > 2:3309193/1‑151 (MQ=255)
gTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCtcggc > 2:2696989/1‑147 (MQ=255)
tGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGTCGTGTTGATCGGCGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTg > 2:3996583/1‑151 (MQ=255)
atatCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTc < 1:4093931/151‑1 (MQ=255)
atCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGa > 1:2214478/1‑151 (MQ=255)
cTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTg > 1:832839/1‑151 (MQ=255)
cTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTg > 1:834274/1‑151 (MQ=255)
cTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGTCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCg > 2:1674124/1‑151 (MQ=255)
cTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCg > 2:5104770/1‑151 (MQ=255)
cTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCg < 1:2291271/151‑1 (MQ=255)
tGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGc > 1:1132270/1‑151 (MQ=255)
aTGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAg < 1:4689456/151‑1 (MQ=255)
gCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGcc > 1:2374827/1‑151 (MQ=255)
cAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTCGCTGTCGACTCTGTTCGCAGCCa > 2:407600/1‑151 (MQ=255)
cGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGACCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCt > 1:1014172/1‑151 (MQ=255)
gAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTc > 1:2595967/1‑151 (MQ=255)
gAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTc > 1:3047239/1‑151 (MQ=255)
gAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGACCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTc > 1:3669877/1‑151 (MQ=255)
gggggAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGCCGCTGTTCGCAGCCATGCCCCAgggt > 2:3615535/1‑149 (MQ=255)
gggggAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAg > 1:1496168/1‑151 (MQ=255)
ggggggGTGTTTGCGCCTTCTGCGCCGGGTAGGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGc < 2:1295904/151‑1 (MQ=255)
ggggAGGTGTTGGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGc < 2:4236698/151‑1 (MQ=255)
ggAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCAc > 1:5196850/1‑151 (MQ=255)
ggTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGACCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGaa < 2:4535746/151‑1 (MQ=255)
gtgtTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAAc > 1:757037/1‑151 (MQ=255)
gtgtTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAAc > 2:255704/1‑151 (MQ=255)
gtgtTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAAc < 2:43649/151‑1 (MQ=255)
gtTTGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGc > 1:4928936/1‑151 (MQ=255)
tttGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCa < 1:2748094/151‑1 (MQ=255)
ttGAGCCTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAg < 1:170394/151‑1 (MQ=255)
ccTTCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCCGGAGCACGAACGCAGCCTgg > 2:4220182/1‑151 (MQ=255)
ttCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGCGCACGAACGCAGCCTGGGc > 2:3110311/1‑151 (MQ=255)
tCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCt > 1:1763705/1‑151 (MQ=255)
tCTGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCt > 1:3359733/1‑151 (MQ=255)
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tGCGCCGGGTAAGGGTGGTTCTTCGATCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCCGCCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCTTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCTTa < 1:3941415/151‑1 (MQ=255)
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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
