Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,728,247 |
G→A |
G159D (GGC→GAC) |
RPPX_21060 → |
quinohemoprotein amine dehydrogenase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,728,247 | 0 | G | A | 95.8%
| 825.5
/ 13.7
| 240 | G159D (GGC→GAC) | RPPX_21060 | quinohemoprotein amine dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/3); new base A (114/114); total (122/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.34e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.99e-01 |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
GTAGCCGGTGAGGTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGGCCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGATGGACGTGAAGACCGGCAAGTACACGGTGGCCCTGCCGCT > CP009974/4728099‑4728394
|
gTAGCCGGTGAGGTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGAcc > 1:460785/1‑151 (MQ=255)
aGCCGGTGAGGTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCtt < 1:1579855/151‑1 (MQ=255)
gCCGGTGAGGTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTc < 1:4660137/151‑1 (MQ=255)
gCCGGTGAGGTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTc < 1:1846921/151‑1 (MQ=255)
ccGGTGAGGTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCa < 2:2793136/151‑1 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAgg > 1:5145677/1‑151 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAgg > 2:646756/1‑151 (MQ=255)
aGGTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCaa < 2:3911171/151‑1 (MQ=255)
aGGTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCaa > 2:268270/1‑151 (MQ=255)
gTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGc > 1:60882/1‑151 (MQ=255)
tCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGcc < 1:3054004/151‑1 (MQ=255)
gcGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGcc < 2:3988171/150‑1 (MQ=255)
cGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGccc > 2:5198064/1‑151 (MQ=255)
ccGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCcgta > 1:2457499/1‑151 (MQ=255)
cGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCcgtac > 2:1991716/1‑151 (MQ=255)
cGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCcgtac < 1:3619916/151‑1 (MQ=255)
cGATCTATTCGTTCGCCATCCGCCCTGACGGCAAAGAGGTTTACGCCACGGTCAACCCGACCTAGAGGCCGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGCGGGGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCgtacgtac > 1:667313/1‑151 (MQ=255)
cGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCgtacgtac > 1:3181567/1‑151 (MQ=255)
cGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCgtacgtac < 1:1758279/151‑1 (MQ=255)
tCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCtt < 1:648090/151‑1 (MQ=255)
tCTATGCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATGACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCtt < 2:3940429/151‑1 (MQ=255)
cTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGGCCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTc > 2:797648/1‑151 (MQ=255)
cTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTc < 1:1589242/151‑1 (MQ=255)
tATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTcc > 1:738426/1‑151 (MQ=255)
tATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTcc > 1:832590/1‑151 (MQ=255)
tATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTcc < 2:1273583/151‑1 (MQ=255)
ttcgttcgCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCg > 2:4762547/1‑151 (MQ=255)
gttcgCCATCAGTCCTGTCGGCATAGAGGTGTACGCCACTGCCATCCCGACCCAGTGGCCGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGCGTTCAGCACCGCCGATGACCCTCAGGCCAAGCCCGCCCGTCCCCTCCCCATg > 2:184645/1‑151 (MQ=255)
tcgCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCACACCACCGCGGCTGGAGGCGTCCAGCCCCGCTGATGCCCTTCAGGCCACGCCCGTACCTACCTTCCCGATGcc > 2:4955440/1‑151 (MQ=255)
tcgCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGcc < 2:1602947/151‑1 (MQ=255)
aTCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGcc > 2:451568/1‑151 (MQ=255)
cAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAg > 2:74529/1‑151 (MQ=255)
aGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAgg > 2:719417/1‑151 (MQ=255)
aGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAgg < 2:4244975/151‑1 (MQ=255)
cccTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGgtg < 2:412031/151‑1 (MQ=255)
cTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTa > 1:1961263/1‑151 (MQ=255)
tGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTAc > 2:936740/1‑151 (MQ=255)
gACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTAcc > 2:4441453/1‑151 (MQ=255)
cGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTg > 1:1459043/1‑151 (MQ=255)
ggCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGa < 1:2296983/151‑1 (MQ=255)
cAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATg > 1:3370675/1‑151 (MQ=255)
aaaGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATgc > 2:2432122/1‑151 (MQ=255)
aaaGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATgc > 2:132124/1‑151 (MQ=255)
aaaGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATgc > 1:4879958/1‑151 (MQ=255)
ggTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGcc < 1:1413221/151‑1 (MQ=255)
gtgtACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCt < 2:4640026/151‑1 (MQ=255)
tgtACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTc > 1:3296825/1‑151 (MQ=255)
aCGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGGCCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCcga < 2:3371266/151‑1 (MQ=255)
gCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCcgacg > 1:402216/1‑151 (MQ=255)
ccACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCcgacga > 1:2599235/1‑151 (MQ=255)
cACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGAt < 1:1966799/151‑1 (MQ=255)
cACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGAt > 2:2974091/1‑151 (MQ=255)
cGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCATCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATgg > 2:4590104/1‑151 (MQ=255)
gTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCa < 1:705320/151‑1 (MQ=255)
tCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAg < 2:3014661/151‑1 (MQ=255)
tCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAg > 2:1340974/1‑151 (MQ=255)
cAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGc > 2:1848870/1‑151 (MQ=255)
aCCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCt < 2:3771968/151‑1 (MQ=255)
ccGACCCAGAGGCTTAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTGCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGt < 2:3545433/151‑1 (MQ=255)
ccGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGt > 1:915253/1‑151 (MQ=255)
ccGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGt < 1:38010/151‑1 (MQ=255)
ccGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGCCAGCCTGt > 2:1455406/1‑151 (MQ=255)
gACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCcg < 2:3759331/134‑1 (MQ=255)
ccAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGtt > 1:3926526/1‑151 (MQ=255)
agagGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTgc > 1:4753629/1‑151 (MQ=255)
gagGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTgcc > 1:3556825/1‑151 (MQ=255)
ggCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTgccgg > 2:882104/1‑151 (MQ=255)
ggCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTgccgg < 2:1961932/151‑1 (MQ=255)
cTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTgccgg > 2:1494592/1‑149 (MQ=255)
gAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTTCGACGATGGCAGCCTGTACGTTgcttggccg > 2:2065924/1‑151 (MQ=255)
gAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTgccgggccg < 2:1752439/151‑1 (MQ=255)
aaCGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTgccgggccgg > 2:4409334/1‑151 (MQ=255)
aCGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGa < 1:1249335/151‑1 (MQ=255)
aCGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGa < 1:3721124/151‑1 (MQ=255)
gACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCGGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACa > 1:4433092/1‑151 (MQ=255)
gACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACa > 1:4095487/1‑151 (MQ=255)
gACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACa < 2:3091966/151‑1 (MQ=255)
ccATTACGTGGTCCAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACAtt < 1:4255883/151‑1 (MQ=255)
cGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAg < 1:4185468/151‑1 (MQ=255)
tGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGAt < 2:227198/151‑1 (MQ=255)
ggTCAAACGACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGATg < 1:3640837/151‑1 (MQ=255)
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CACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGTGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCTGCGCCAGGTGTACCTGTTGCGTGCCTCCGTCGAT > SRR10918231.3644791/1‑151 (MQ=60)
CACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGAT < SRR10918231.1975660/151‑1 (MQ=60)
CGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGG < SRR10918231.649217/151‑1 (MQ=60)
GTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCA < SRR10918231.708075/151‑1 (MQ=60)
TCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAG < SRR10918231.4083933/151‑1 (MQ=60)
AACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCC > SRR10918231.4181768/1‑151 (MQ=60)
CCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGT > SRR10918231.919173/1‑151 (MQ=60)
CCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGT < SRR10918231.38154/151‑1 (MQ=60)
CGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTA < SRR10918231.4312577/151‑1 (MQ=60)
CGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTA < SRR10918231.2293515/151‑1 (MQ=60)
GACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCCCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGAgatcggaagagcacac > SRR10918231.3776612/1‑135 (MQ=60)
CCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTT > SRR10918231.3944866/1‑151 (MQ=60)
CCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTT > SRR10918231.3945017/1‑151 (MQ=60)
AGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGC > SRR10918231.4776380/1‑151 (MQ=60)
GAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCC > SRR10918231.3573054/1‑151 (MQ=60)
AGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCG > SRR10918231.1940691/1‑151 (MQ=60)
ctCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGG < SRR10918231.1501557/149‑1 (MQ=60)
CTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGC > SRR10918231.1640585/1‑151 (MQ=60)
AACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGG < SRR10918231.3598819/151‑1 (MQ=60)
ACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGA < SRR10918231.1255309/151‑1 (MQ=60)
ACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGA < SRR10918231.3738203/151‑1 (MQ=60)
GACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCGGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACA > SRR10918231.4454122/1‑151 (MQ=60)
GACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACA > SRR10918231.4114788/1‑151 (MQ=60)
CCATTACGTGGTCCAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATT < SRR10918231.4276026/151‑1 (MQ=60)
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CGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGTGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAG < SRR10918231.4205241/151‑1 (MQ=60)
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GGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGATG > SRR10918231.672266/1‑151 (MQ=60)
GTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGATGG > SRR10918231.1857498/1‑151 (MQ=60)
CAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGATGGAC > SRR10918231.4659720/1‑151 (MQ=60)
AACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGATGGACGT < SRR10918231.1774444/151‑1 (MQ=60)
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ACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGATGGACGTG < SRR10918231.3213873/151‑1 (MQ=60)
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CACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCTGGCCGGACATTTACAAGATGGACGTGAA < SRR10918231.5258466/151‑1 (MQ=60)
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GATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGATGGACGTGAAGACCGGCAAGTACACGGTGGCCCTGCCGC < SRR10918231.4824099/151‑1 (MQ=60)
ATGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGATGGACGTGAAGACCGGCAAGTACACGGTGGCCCTGCCGCT < SRR10918231.4316995/151‑1 (MQ=60)
TGACCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGATGGACGTGAAGACCGGCAAGTACACGGTGGCCCTGCCGCTG < SRR10918231.241299/151‑1 (MQ=60)
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CGTAGCCGGTGAGGTCGGCCGGTCGATCTATTCGTTCGCCATCAGCCCTGACGGCAAAGAGGTGTACGCCACGGTCAACCCGACCCAGAGGCTGAACGACCATTACGTGGTCAAACCACCGCGGCTGGAGGTGTTCAGCACCGCTGATGGCCTTCAGGCCAAGCCCGTACGTACCTTCCCGATGCCGCGCCAGGTGTACCTGATGCGCGCCTCCGACGATGGCAGCCTGTACGTTGCCGGGCCGGACATTTACAAGATGGACGTGAAGACCGGCAAGTACACGGTGGCCCTGCCGCTG > CP009974/4728098‑4728395
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |