Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
5,134,626 |
T→C |
T170A (ACG→GCG) |
RPPX_22775 ← |
serine acetyltransferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 5,134,626 | 0 | T | C | 88.9%
| 639.7
/ 55.7
| 234 | T170A (ACG→GCG) | RPPX_22775 | serine acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (10/16); new base C (106/102); total (116/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
AACCATCGGTGGAACCCGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGTGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATGCGAATACTGCCCAGCACCTTGGCCCCGGTGCCGA > CP009974/5134477‑5134772
|
aaCCATCGGTGGAACCCGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGTg < 1:4799305/151‑1 (MQ=255)
aCCATCGGTGGAACCCGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCgg > 1:3624146/1‑151 (MQ=255)
ccATCGGTGGAACCCGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCggc > 2:3288514/1‑151 (MQ=255)
cATCGGTGGAACCCGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCgcggcg < 1:3733377/151‑1 (MQ=255)
cATCGGTGGAACCCGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGTggcg > 2:313601/1‑151 (MQ=255)
gAACCCGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCCCCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTg < 1:1146005/151‑1 (MQ=255)
gAACCCGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTg < 2:4524651/151‑1 (MQ=255)
aaCCCGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCCCGGCGGCCGGTTGc > 2:3233817/1‑151 (MQ=255)
cccGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCg < 1:3554322/151‑1 (MQ=255)
cGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCggg < 1:537757/151‑1 (MQ=255)
cGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCggg < 1:3855912/151‑1 (MQ=255)
cGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCggg > 2:1697641/1‑151 (MQ=255)
gAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGTGGCGGCCGGTTGCCGGGc > 1:5144286/1‑151 (MQ=255)
tCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCtt > 2:571120/1‑151 (MQ=255)
aCGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTtgat > 1:1478408/1‑151 (MQ=255)
aCGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGCTGCCGGGCCTtgat > 2:1827807/1‑151 (MQ=255)
cGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTtga > 2:3963203/1‑149 (MQ=255)
gTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTtgatga > 1:4384456/1‑151 (MQ=255)
gTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTtgatga > 1:3528345/1‑151 (MQ=255)
gTACATGACCTTGTCCGGCCCCGGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTtgatga < 2:1950045/151‑1 (MQ=255)
tGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGcc < 1:1733253/151‑1 (MQ=255)
tGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGcc < 1:4040394/151‑1 (MQ=255)
ccGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCCTAGGCCTCACCCGACCGATGCGGCGGCGGCCGGCTGCCGCGCCGTGATGATGGCTGCCAccccc > 2:3435565/1‑151 (MQ=255)
ccGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCAccccc < 2:2305787/151‑1 (MQ=255)
cGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCa < 1:2197064/151‑1 (MQ=255)
cccTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGc > 2:758980/1‑151 (MQ=255)
ccTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGcc > 1:2634251/1‑151 (MQ=255)
cgcCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGTGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTg < 1:1094951/151‑1 (MQ=255)
gcCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGa > 2:3626761/1‑151 (MQ=255)
gcCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGa < 2:4253867/151‑1 (MQ=255)
ccAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGaa > 2:1071882/1‑151 (MQ=255)
aGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAAtt > 1:760866/1‑151 (MQ=255)
aGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAAtt > 2:376429/1‑151 (MQ=255)
aGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAAtt < 1:298169/151‑1 (MQ=255)
aaaCAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTcc > 2:303686/1‑151 (MQ=255)
aaaCAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTcc < 2:2482863/151‑1 (MQ=255)
cAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCCTAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGACTTGTCCGGc > 2:1342090/1‑151 (MQ=255)
ggCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGcaca > 2:678152/1‑151 (MQ=255)
cAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATc < 2:1020693/151‑1 (MQ=255)
cTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCa < 1:2726622/151‑1 (MQ=255)
tCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAg < 1:3254908/151‑1 (MQ=255)
tCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAg < 2:493978/151‑1 (MQ=255)
cGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGTTGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGc < 1:2263145/151‑1 (MQ=255)
gagaCGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCa > 1:4344025/1‑151 (MQ=255)
agaCGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCCCCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCac < 2:4709760/151‑1 (MQ=255)
agaCGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCac < 1:3089774/151‑1 (MQ=255)
agaCGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCac < 2:3503776/151‑1 (MQ=255)
ggCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCa < 1:138358/151‑1 (MQ=255)
gCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCAt < 1:895299/151‑1 (MQ=255)
ttCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTgg > 1:677138/1‑151 (MQ=255)
tCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGgc < 2:1688016/151‑1 (MQ=255)
tCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGCCCGCTTTCGGTGCCTGGACGCAGTCCGGGCACCCGACTCCCGCGGAACGGTCCGGCGCAACTACGACGACGACGGCATGGgc > 2:3857223/1‑151 (MQ=255)
cATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGgcg > 2:459579/1‑151 (MQ=255)
aTTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGgcgc < 1:1949255/151‑1 (MQ=255)
ttGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGcc < 2:2201959/151‑1 (MQ=255)
gCGGCCGATCGCCACCACGCCGATCACCGTTGCGATAGGCCTCGCTCGACCGAGGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCGTGATGATGGCCGGCCCCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCga < 2:2153184/151‑1 (MQ=255)
cGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCgat < 1:3033534/151‑1 (MQ=255)
ggCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCgatg > 1:1841382/1‑151 (MQ=255)
gCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCgatga < 1:2936119/151‑1 (MQ=255)
cGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCCTAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCCTTGGCGCCgatgatt > 2:5354/1‑150 (MQ=255)
cGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATc > 1:4579876/1‑151 (MQ=255)
cGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATc > 2:5087/1‑151 (MQ=255)
cccaccccGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACgtt < 2:4076979/150‑1 (MQ=255)
ccaccacGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGTCGGCATTGGCGCCGATGATCACgttg > 1:5019406/1‑151 (MQ=255)
ccaccacGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACgttg < 1:1290234/151‑1 (MQ=255)
ccacGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGttgttg > 1:4085021/1‑151 (MQ=255)
ccacGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGttcttg > 2:2972012/1‑151 (MQ=255)
acGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGcc < 2:4498783/151‑1 (MQ=255)
cGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCg < 1:3465828/151‑1 (MQ=255)
cGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCg < 1:1007956/151‑1 (MQ=255)
ccGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGTGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGAt > 2:2411824/1‑151 (MQ=255)
cGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATg > 1:469681/1‑151 (MQ=255)
gATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATGc > 1:282846/1‑151 (MQ=255)
gATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCGTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGGGAATGGTCCGGCACATCTACCAGCTCGTCGGCATTGGCGCCGATTTTCAGGTTTTTGCCGATgg > 2:1752863/1‑150 (MQ=255)
cACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATGCGaa < 1:1411512/151‑1 (MQ=255)
cACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATGCGaa < 2:4052691/151‑1 (MQ=255)
aCCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGTGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATGCGAAt < 1:3141446/151‑1 (MQ=255)
aCCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATGCGaaa > 2:4133673/1‑150 (MQ=255)
cGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATGCGAATAc < 1:473621/151‑1 (MQ=255)
gTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATGCGAATACt < 2:1379418/151‑1 (MQ=255)
ttGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATGCGAATACTg < 2:1283853/151‑1 (MQ=255)
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CATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCG > SRR10918231.4668280/1‑151 (MQ=60)
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TAGGCCTCACTCGACCGATGCCGCGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATGCGAATACTGCCCAGC > SRR10918231.4095356/1‑151 (MQ=60)
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AACCATCGGTGGAACCCGAGTCGACGTACATGACCTTGTCCGGCCCCTGCGCCAGCGAAACAAGGCAGCGCTCGAGACGCTGGCCTTCATTGCGGCCGATCACCACCACGCCGATCACCGTTGCCATAGGCCTCACTCGACCGATGCCGTGGCGGCCGGTTGCCGGGCCTTGATGATGGCCGGCACCCCCACTGCCAGTGAATTGTCCGGCACATCTACCAGCACGACGGCATTGGCGCCGATGATCACGTTGTTGCCGATGCGAATACTGCCCAGCACCTTGGCCCCGGTGCCGATGTC > CP009974/5134477‑5134776
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |