Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,448,131 |
G→A |
61.2% |
intergenic (‑232/‑53) |
paaZ ← / → paaA |
fused oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase/ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,448,131 | 0 | G | A | 61.2%
| 207.8
/ inf
| 277 | intergenic (‑232/‑53) | paaZ/paaA | fused oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase/ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (52/55); new base A (102/67); total (154/123) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.26e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
GTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGA > CP009273/1447982‑1448277
|
gTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAAtg > 2:1046631/1‑150 (MQ=255)
tAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAAtatg > 2:1207720/1‑150 (MQ=255)
tAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAAtatg < 1:2972981/150‑1 (MQ=255)
aCTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGAt < 2:4371905/150‑1 (MQ=255)
aTGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCg > 1:649259/1‑150 (MQ=255)
aTGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCg > 2:2696051/1‑150 (MQ=255)
aTGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCg > 1:2373311/1‑150 (MQ=255)
gCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCgtg < 2:94727/150‑1 (MQ=255)
cGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCgtgt > 1:1389710/1‑150 (MQ=255)
cGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAAATTTCATAAAACAATGTGATTCgtgt < 1:1938551/150‑1 (MQ=255)
aTCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGttt < 2:2259246/150‑1 (MQ=255)
ataGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTttaatt > 2:1270752/1‑150 (MQ=255)
aGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTttaattaa > 2:1174477/1‑150 (MQ=255)
gCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTtaattaat < 1:4066741/150‑1 (MQ=255)
ggAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGaaa < 1:3295244/150‑1 (MQ=255)
aaaCATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACt > 2:4428909/1‑150 (MQ=255)
ttAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAAt < 2:2183460/150‑1 (MQ=255)
tAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATc < 1:3335325/150‑1 (MQ=255)
tAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATc < 2:1723618/150‑1 (MQ=255)
tAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATc > 1:2878122/1‑150 (MQ=255)
aaTGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCg > 2:2025068/1‑150 (MQ=255)
tGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTa < 1:3784018/150‑1 (MQ=255)
cACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAGTCGTaaa < 2:306256/150‑1 (MQ=255)
cACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTaaa < 1:3419561/150‑1 (MQ=255)
gATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGtg > 2:1983969/1‑150 (MQ=255)
taaataaTGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGtgat > 2:900261/1‑150 (MQ=255)
taaataaTGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGtgat > 2:4236012/1‑150 (MQ=255)
aaataaTGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGtgatg > 1:45471/1‑150 (MQ=255)
aaataaTGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAAATGGAATCGTAAAGGttatg > 2:2505418/1‑150 (MQ=255)
ataatGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTGACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGAc < 2:1168801/150‑1 (MQ=255)
ataatGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGAc > 2:3722821/1‑150 (MQ=255)
taatGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACg < 2:739609/150‑1 (MQ=255)
taatGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACg > 1:4464322/1‑150 (MQ=255)
aatGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAAATTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGt < 1:211580/150‑1 (MQ=255)
atGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTg > 1:1847391/1‑150 (MQ=255)
tGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGa < 1:2638622/150‑1 (MQ=255)
gATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGAc > 2:3873508/1‑150 (MQ=255)
gATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGAc > 2:1610415/1‑150 (MQ=255)
ttATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCa > 1:4395240/1‑150 (MQ=255)
ataAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCaag > 1:4117688/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCaagaa > 1:3936949/1‑150 (MQ=255)
aTAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAAc < 2:3338610/150‑1 (MQ=255)
tAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACg < 1:2312663/150‑1 (MQ=255)
aGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACTAAAACTGGAATAGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGc > 2:3380449/1‑150 (MQ=255)
gggTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCt < 2:2955221/150‑1 (MQ=255)
ggTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCtt < 1:620289/150‑1 (MQ=255)
gTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCttt < 2:859650/150‑1 (MQ=255)
cGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAg > 2:2881177/1‑150 (MQ=255)
cGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAg < 1:3580696/150‑1 (MQ=255)
aTCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAAc < 1:2048290/150‑1 (MQ=255)
aTCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAAc > 1:1679257/1‑150 (MQ=255)
tCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACg < 2:2232730/150‑1 (MQ=255)
tCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACg < 1:2947204/150‑1 (MQ=255)
ccGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACgg < 1:910557/150‑1 (MQ=255)
gTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGAt > 1:1372914/1‑150 (MQ=255)
gTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGAt > 2:3474405/1‑150 (MQ=255)
gTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGAt > 1:2806855/1‑150 (MQ=255)
cacaGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAg > 1:397787/1‑150 (MQ=255)
cacaGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAg < 2:514180/150‑1 (MQ=255)
caGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGcc > 1:1667886/1‑150 (MQ=255)
gTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCa < 2:1287062/150‑1 (MQ=255)
tCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAgg < 1:4411126/150‑1 (MQ=255)
cAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGa > 1:2563623/1‑150 (MQ=255)
aaaCATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGaa < 2:243039/150‑1 (MQ=255)
aaCATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGaaa > 1:3867881/1‑150 (MQ=255)
aCATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAAc > 1:145629/1‑150 (MQ=255)
cATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTGTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACAGGAATCGTAATGTTGAGGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCAAGGAAACg > 2:247337/1‑150 (MQ=255)
aTACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACgg > 1:523888/1‑150 (MQ=255)
tACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGc < 1:3323890/150‑1 (MQ=255)
aaaaTTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAGCAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTAt > 2:1954380/1‑150 (MQ=255)
aaaTTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATc < 1:2359125/150‑1 (MQ=255)
aaTTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCg < 1:1363714/150‑1 (MQ=255)
aaTTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCg > 1:419461/1‑150 (MQ=255)
gtgATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCca > 1:426990/1‑150 (MQ=255)
aTTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAg > 2:3102287/1‑150 (MQ=255)
tACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACt < 2:2803448/150‑1 (MQ=255)
tAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAt < 2:647762/150‑1 (MQ=255)
tAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAt < 1:900261/150‑1 (MQ=255)
tAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAt > 1:110800/1‑150 (MQ=255)
tAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAt < 1:182653/150‑1 (MQ=255)
tAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAt < 2:2623831/150‑1 (MQ=255)
aaCTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATg < 1:1207703/150‑1 (MQ=255)
ccaTTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGcc > 2:1678633/3‑150 (MQ=255)
cTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGcc > 1:4295859/1‑150 (MQ=255)
cTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGcc > 1:772413/1‑150 (MQ=255)
tATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTACCGAGCCACAGGACTGGATGccc > 1:1012470/1‑150 (MQ=255)
tgtgTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGAt < 1:2905183/150‑1 (MQ=255)
gtAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCt < 2:4098475/150‑1 (MQ=255)
aCTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTAc > 1:3958640/1‑150 (MQ=255)
aCTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTAc < 2:2114264/150‑1 (MQ=255)
cTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTAcc > 2:3919589/1‑150 (MQ=255)
ttCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGa < 1:3505801/150‑1 (MQ=255)
tAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGa < 1:2507122/150‑1 (MQ=255)
aaaaCAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGAc > 2:1440996/1‑150 (MQ=255)
aaaaCAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGAc > 2:691479/1‑150 (MQ=255)
aaaCAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACa < 2:1919781/150‑1 (MQ=255)
aaCAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACAt < 2:1088275/150‑1 (MQ=255)
aaCAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACAt < 2:3303262/150‑1 (MQ=255)
aaCAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACAt < 2:468660/150‑1 (MQ=255)
aCAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACAtt > 1:3377009/1‑150 (MQ=255)
|
GTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGA > CP009273/1447982‑1448277
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATT > CP009273/1447982‑1448275
|
GTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATG < SRR19973072.86086/150‑1 (MQ=60)
GTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATA > SRR19973072.4463306/1‑150 (MQ=60)
TTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGT < SRR19973072.3953896/150‑1 (MQ=60)
TTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGT < SRR19973072.3953953/150‑1 (MQ=60)
TAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATG < SRR19973072.2979295/150‑1 (MQ=60)
TAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATG < SRR19973072.2979323/150‑1 (MQ=60)
ACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGG‑AAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATT < SRR19973072.1054906/150‑1 (MQ=60)
CTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATT > SRR19973072.39894/1‑150 (MQ=60)
CTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATA > SRR19973072.39851/1‑150 (MQ=60)
TATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTC > SRR19973072.3993944/1‑150 (MQ=60)
ATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCG > SRR19973072.650731/1‑150 (MQ=60)
ATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCG > SRR19973072.3858833/1‑150 (MQ=60)
ATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCG > SRR19973072.2378435/1‑150 (MQ=60)
ATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCG < SRR19973072.825023/150‑1 (MQ=60)
GCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTG < SRR19973072.4221304/150‑1 (MQ=60)
CGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGT > SRR19973072.1392736/1‑150 (MQ=60)
CGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAAATTTCATAAAACAATGTGATTCGTGT < SRR19973072.1942682/150‑1 (MQ=60)
CGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAAATTTCATAAAACAATGTGATTCGTGT < SRR19973072.1942807/150‑1 (MQ=60)
ATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTT < SRR19973072.2651100/150‑1 (MQ=60)
CTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTT > SRR19973072.3310279/1‑150 (MQ=60)
CTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTT < SRR19973072.2104586/150‑1 (MQ=60)
GTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAA > SRR19973072.1556539/1‑150 (MQ=60)
ATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATT < SRR19973072.2362140/150‑1 (MQ=60)
AGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTTTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAA > SRR19973072.243628/1‑150 (MQ=60)
GCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAAT < SRR19973072.4075272/150‑1 (MQ=60)
GCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGA < SRR19973072.4196495/150‑1 (MQ=60)
GGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAA < SRR19973072.3302232/150‑1 (MQ=60)
GGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAA < SRR19973072.520590/150‑1 (MQ=60)
AAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACT < SRR19973072.3311004/150‑1 (MQ=60)
ACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGG > SRR19973072.3480639/1‑150 (MQ=60)
ACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGG > SRR19973072.3480334/1‑150 (MQ=60)
ATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTTGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAA < SRR19973072.2385896/150‑1 (MQ=60)
ATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAA > SRR19973072.4173995/1‑150 (MQ=60)
TAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAATTAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAAATGGAATC > SRR19973072.4475530/1‑150 (MQ=60)
TAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATC < SRR19973072.3342282/150‑1 (MQ=60)
TAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATC < SRR19973072.3342399/150‑1 (MQ=60)
TAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATC > SRR19973072.2884291/1‑150 (MQ=60)
TAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATC > SRR19973072.2884251/1‑150 (MQ=60)
TGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTA < SRR19973072.3791951/150‑1 (MQ=60)
TGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTA < SRR19973072.3791971/150‑1 (MQ=60)
CACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAA < SRR19973072.31527/150‑1 (MQ=60)
CACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAA < SRR19973072.3426764/150‑1 (MQ=60)
CACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAA < SRR19973072.2548051/150‑1 (MQ=60)
TGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGT > SRR19973072.3911066/1‑150 (MQ=60)
TGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGT < SRR19973072.4095420/150‑1 (MQ=60)
AAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATG > SRR19973072.4611352/1‑150 (MQ=60)
AAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATG < SRR19973072.986866/150‑1 (MQ=60)
AAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATG > SRR19973072.45594/1‑150 (MQ=60)
AAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATG > SRR19973072.45484/1‑150 (MQ=60)
ATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGAC < SRR19973072.2846805/150‑1 (MQ=60)
TAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACG > SRR19973072.4473743/1‑150 (MQ=60)
TAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACG > SRR19973072.2591786/1‑150 (MQ=60)
TAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACG > SRR19973072.270837/1‑150 (MQ=60)
AATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAAATTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGT < SRR19973072.212108/150‑1 (MQ=60)
ATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTG > SRR19973072.1851392/1‑150 (MQ=60)
ATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTG > SRR19973072.1851775/1‑150 (MQ=60)
TGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGA < SRR19973072.2644287/150‑1 (MQ=60)
TTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCA > SRR19973072.4404480/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAATGTGATGACGTGACCCAAG > SRR19973072.4286677/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAG > SRR19973072.4286648/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAG > SRR19973072.1410260/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAG > SRR19973072.1410107/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAG > SRR19973072.4126332/1‑150 (MQ=60)
AAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAA > SRR19973072.3945171/1‑150 (MQ=60)
AAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAG > SRR19973072.712369/1‑150 (MQ=60)
AAAAAGGGTGCGAAATCCTTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAAAGTGATTCTTTTTTTTAATTAATTCAAGAAAAATTGAATAGTAAAGGTGATGACGTTAACAAAGAAGA > SRR19973072.2162788/1‑150 (MQ=60)
ATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAAC < SRR19973072.574595/150‑1 (MQ=60)
TAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACG < SRR19973072.2317598/150‑1 (MQ=60)
TAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACG < SRR19973072.2960956/150‑1 (MQ=60)
GGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTT < SRR19973072.621710/150‑1 (MQ=60)
GGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTT > SRR19973072.2624492/1‑150 (MQ=60)
CGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAG < SRR19973072.3588235/150‑1 (MQ=60)
CGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAAAAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAG < SRR19973072.4472423/150‑1 (MQ=60)
GAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGC > SRR19973072.1772455/1‑150 (MQ=60)
GAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGC > SRR19973072.4108050/1‑150 (MQ=60)
ATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAAC < SRR19973072.2052743/150‑1 (MQ=60)
ATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAAC < SRR19973072.2049679/150‑1 (MQ=60)
ATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAAC > SRR19973072.1275301/1‑150 (MQ=60)
ATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAAC > SRR19973072.1684402/1‑150 (MQ=60)
ATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAAC > SRR19973072.1682929/1‑150 (MQ=60)
TCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACG < SRR19973072.2953502/150‑1 (MQ=60)
TCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACG < SRR19973072.2953504/150‑1 (MQ=60)
CCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGG < SRR19973072.3409378/150‑1 (MQ=60)
CCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGG < SRR19973072.912526/150‑1 (MQ=60)
GTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGAT > SRR19973072.1375911/1‑150 (MQ=60)
GTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGAT > SRR19973072.1375929/1‑150 (MQ=60)
GTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGAT > SRR19973072.2812866/1‑150 (MQ=60)
GTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGAT > SRR19973072.3371424/1‑150 (MQ=60)
CACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAG > SRR19973072.398660/1‑150 (MQ=60)
CACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAG > SRR19973072.3940675/1‑150 (MQ=60)
CACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAG > SRR19973072.714428/1‑150 (MQ=60)
CAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCC > SRR19973072.1671541/1‑150 (MQ=60)
TCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGG < SRR19973072.4420404/150‑1 (MQ=60)
TCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGG < SRR19973072.4420406/150‑1 (MQ=60)
CAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGA > SRR19973072.2569174/1‑150 (MQ=60)
AACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAA > SRR19973072.2927/1‑150 (MQ=60)
AACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAA > SRR19973072.1371466/1‑150 (MQ=60)
AACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAA > SRR19973072.3875925/1‑150 (MQ=60)
ACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAAC < SRR19973072.1871570/150‑1 (MQ=60)
ACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAAC > SRR19973072.146001/1‑150 (MQ=60)
ACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAAC < SRR19973072.2248763/150‑1 (MQ=60)
ATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGG > SRR19973072.525136/1‑150 (MQ=60)
TACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGC > SRR19973072.2885233/1‑150 (MQ=60)
TACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGC < SRR19973072.3331511/150‑1 (MQ=60)
TACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGC < SRR19973072.3330948/150‑1 (MQ=60)
CAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTA < SRR19973072.3563232/150‑1 (MQ=60)
AAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATC < SRR19973072.2364206/150‑1 (MQ=60)
AAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATC < SRR19973072.2364278/150‑1 (MQ=60)
AATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCG > SRR19973072.3654822/1‑150 (MQ=60)
AATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCG < SRR19973072.1366696/150‑1 (MQ=60)
AATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCG < SRR19973072.1366716/150‑1 (MQ=60)
AATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCG > SRR19973072.420407/1‑150 (MQ=60)
TTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAG > SRR19973072.3760768/1‑150 (MQ=60)
TTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGC < SRR19973072.3377317/150‑1 (MQ=60)
TGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCC < SRR19973072.539193/150‑1 (MQ=60)
GTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACTTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCA > SRR19973072.427707/1‑150 (MQ=60)
GTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCA > SRR19973072.427969/1‑150 (MQ=60)
TTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGG > SRR19973072.159165/1‑150 (MQ=60)
TACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACT < SRR19973072.648623/150‑1 (MQ=60)
TACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACT < SRR19973072.648644/150‑1 (MQ=60)
CTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTGTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGG > SRR19973072.965016/1‑150 (MQ=60)
TTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGA > SRR19973072.1834241/1‑150 (MQ=60)
TTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGA > SRR19973072.1834243/1‑150 (MQ=60)
TTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGA > SRR19973072.2063109/1‑150 (MQ=60)
TAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAT < SRR19973072.902210/150‑1 (MQ=60)
TAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAT < SRR19973072.902239/150‑1 (MQ=60)
TAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAT < SRR19973072.183111/150‑1 (MQ=60)
TAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAT > SRR19973072.111078/1‑150 (MQ=60)
AACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATG > SRR19973072.2377206/1‑150 (MQ=60)
AACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATG > SRR19973072.1191491/1‑150 (MQ=60)
AACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATG < SRR19973072.1210235/150‑1 (MQ=60)
AACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATG < SRR19973072.1210287/150‑1 (MQ=60)
AACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATG < SRR19973072.1210304/150‑1 (MQ=60)
CTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCC > SRR19973072.1384766/1‑150 (MQ=60)
CTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCC > SRR19973072.4304813/1‑150 (MQ=60)
CTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCC > SRR19973072.4304821/1‑150 (MQ=60)
CTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCC > SRR19973072.4304824/1‑150 (MQ=60)
CTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCC > SRR19973072.774053/1‑150 (MQ=60)
CTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGGTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGATTTGAGCAACGGATAGCCAAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGCACTGGATGCC > SRR19973072.3097919/1‑150 (MQ=60)
TATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTACCGAGCCACAGGACTGGATGCCC > SRR19973072.1014675/1‑150 (MQ=60)
TGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGAT < SRR19973072.2911403/150‑1 (MQ=60)
TGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGC > SRR19973072.4466613/1‑150 (MQ=60)
AACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTA > SRR19973072.3546541/1‑150 (MQ=60)
ACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTAC > SRR19973072.3966912/1‑150 (MQ=60)
TTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGA > SRR19973072.1680794/1‑150 (MQ=60)
TTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGA < SRR19973072.3513149/150‑1 (MQ=60)
TAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGA < SRR19973072.2512588/150‑1 (MQ=60)
TAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGA < SRR19973072.2512569/150‑1 (MQ=60)
ACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATT > SRR19973072.3384156/1‑150 (MQ=60)
|
GTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATT > CP009273/1447982‑1448275
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |