Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
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position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,448,131 |
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49.1% |
intergenic (‑232/‑53) |
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fused oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase/ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,448,131 | 0 | G | A | 49.1%
| 11.6
/ inf
| 275 | intergenic (‑232/‑53) | paaZ/paaA | fused oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase/ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (80/60); new base A (71/64); total (151/124) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.69e-01 |
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
GTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCC > CP009273/1447982‑1448280
|
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tATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTc < 2:2365089/150‑1 (MQ=255)
aTGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCg > 1:1229706/1‑150 (MQ=255)
aTGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCg > 1:3007089/1‑150 (MQ=255)
cGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCgttt < 2:2007196/150‑3 (MQ=255)
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ataGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTttaatt < 2:2807966/150‑1 (MQ=255)
taGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTttaatta < 2:1785575/150‑1 (MQ=255)
taGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTttaatta > 2:145884/1‑150 (MQ=255)
aGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTttaattaa > 1:383923/1‑150 (MQ=255)
aGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTttaattaa > 2:4186886/1‑150 (MQ=255)
aGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTttaattaa > 1:1859975/1‑150 (MQ=255)
cAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTaattaatt < 1:50971/150‑1 (MQ=255)
cAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTaattaatt < 2:1712392/150‑1 (MQ=255)
cAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTaattaatt < 2:3156258/150‑1 (MQ=255)
cAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTaattaatt < 1:2356744/150‑1 (MQ=255)
aaCTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTc < 1:3185338/150‑1 (MQ=255)
cTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCAc < 2:2172050/150‑1 (MQ=255)
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gCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGa > 2:3297710/1‑150 (MQ=255)
gCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGa > 2:1927036/1‑150 (MQ=255)
gCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGCGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGa > 2:1200918/1‑150 (MQ=255)
ggAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGaaa < 1:2102414/150‑1 (MQ=255)
aaCATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTg < 2:3120666/150‑1 (MQ=255)
aaCATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTg < 2:629701/150‑1 (MQ=255)
cATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGa < 1:1193452/150‑1 (MQ=255)
cATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGa < 1:4536770/150‑1 (MQ=255)
tAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATc < 1:1004153/150‑1 (MQ=255)
aaTGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCg > 1:1536599/1‑150 (MQ=255)
tGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTa > 1:3366217/1‑150 (MQ=255)
tGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTa > 2:4039686/1‑150 (MQ=255)
gCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTaa < 2:1980299/150‑1 (MQ=255)
cTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAATgg > 2:1321878/1‑150 (MQ=255)
gATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGtg > 2:1023393/1‑150 (MQ=255)
gATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGtg < 2:1750068/150‑1 (MQ=255)
aaataaTGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGtgatg > 1:3010742/1‑150 (MQ=255)
taatGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACg > 1:646436/1‑150 (MQ=255)
gATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGAc > 2:35535/1‑150 (MQ=255)
aTTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGAcc < 1:4483011/150‑1 (MQ=255)
tttATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGAccc > 1:4265490/1‑150 (MQ=255)
ttATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCa > 2:3613567/1‑150 (MQ=255)
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aaaTAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAagaaga > 1:1330252/1‑150 (MQ=255)
aaTAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAgaagaa > 2:2885825/1‑150 (MQ=255)
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gggTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCt < 1:1432325/150‑1 (MQ=255)
gTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCttt < 2:321316/150‑1 (MQ=255)
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gCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGa < 1:194243/150‑1 (MQ=255)
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gAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGc > 2:569788/1‑150 (MQ=255)
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cacaGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAg < 1:1773120/150‑1 (MQ=255)
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caGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGcc < 1:2396821/150‑1 (MQ=255)
caGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGcc < 1:4312321/150‑1 (MQ=255)
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cAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGa > 2:3829423/1‑150 (MQ=255)
aCATACAAAATTTGTTATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAAc < 2:4431492/150‑1 (MQ=255)
tACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGc > 1:3897004/1‑150 (MQ=255)
aCAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTAACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCt > 2:3000969/1‑150 (MQ=255)
aaaTTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTCTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATc < 2:4302852/150‑1 (MQ=255)
aaaTTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATc > 1:2897466/1‑150 (MQ=255)
aTTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGa > 1:3606714/1‑150 (MQ=255)
ttGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGc > 2:1788130/1‑150 (MQ=255)
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aTTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAg > 1:833707/1‑150 (MQ=255)
ttttACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAgg > 2:3648749/1‑150 (MQ=255)
aCTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTg > 2:2059359/1‑150 (MQ=255)
aCTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTg < 1:743966/150‑1 (MQ=255)
aCTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTg < 2:54920/150‑1 (MQ=255)
ttAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGa > 1:1783582/1‑150 (MQ=255)
tAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAt > 1:3668544/1‑150 (MQ=255)
tAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAt > 2:4523689/1‑150 (MQ=255)
tAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGAt > 1:1399310/1‑150 (MQ=255)
tATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGccc < 1:4186886/150‑1 (MQ=255)
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AAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATC > SRR19973076.2901672/1‑150 (MQ=60)
AATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCG > SRR19973076.1821262/1‑150 (MQ=60)
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TGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTATGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCAATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATAGATC > SRR19973076.4515498/1‑150 (MQ=60)
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GTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATAC < SRR19973076.456412/150‑1 (MQ=60)
ATGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCC < SRR19973076.2400041/150‑1 (MQ=60)
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TTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCC > CP009273/1447983‑1448280
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
