Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,618,960 |
A→C |
27.7% |
intergenic (‑206/‑70) |
ydeI ← / → ydeJ |
hydrogen peroxide resistance OB fold protein; putative periplasmic protein/inactive PncC family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,618,960 | 0 | A | C | 27.7%
| 339.3
/ 258.3
| 267 | intergenic (‑206/‑70) | ydeI/ydeJ | hydrogen peroxide resistance OB fold protein; putative periplasmic protein/inactive PncC family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (115/78); new base C (38/36); total (153/114) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.69e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
ATTGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATCCGCGTTGAGTCAAAG > CP009273/1618811‑1619109
|
gCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAatt > 2:3118767/1‑150 (MQ=255)
aaaTAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAattatt < 1:494837/150‑1 (MQ=255)
tAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATtata < 2:4522164/150‑1 (MQ=255)
tatTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGAc > 1:1588225/1‑150 (MQ=255)
atTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACg < 2:4469100/150‑1 (MQ=255)
tGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAg > 1:2858028/1‑150 (MQ=255)
ccAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCa > 1:621426/1‑150 (MQ=255)
cAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCAt < 2:2578842/150‑1 (MQ=255)
cAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTGGAAAATTATTATATTGGACGAGCAt > 2:2165866/1‑150 (MQ=255)
aaTTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATa > 1:537968/1‑150 (MQ=255)
aaTTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATa > 1:311566/1‑150 (MQ=255)
aTTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATAc > 1:1160448/1‑150 (MQ=255)
aTTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATAc < 1:91551/150‑1 (MQ=255)
gTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGa > 1:2980952/1‑150 (MQ=255)
ataAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGaaaa > 1:54971/1‑150 (MQ=255)
ataAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGaaaa > 1:3526264/1‑150 (MQ=255)
aGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGc < 1:594025/150‑1 (MQ=255)
aGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGc < 1:4214515/150‑1 (MQ=255)
aGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGc < 1:4585170/150‑1 (MQ=255)
aTTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAAt > 1:1695860/1‑150 (MQ=255)
aaaaTCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCAcc < 1:2180987/150‑1 (MQ=255)
aaaaTCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCAcc > 1:3360922/1‑150 (MQ=255)
aTCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCttt > 1:563213/1‑150 (MQ=255)
aTCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCttt > 2:2739288/1‑150 (MQ=255)
cAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTAc < 2:607423/150‑1 (MQ=255)
cAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTAc > 2:3846692/1‑150 (MQ=255)
ccAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACata > 2:3615146/1‑150 (MQ=255)
ccAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACata < 2:1328132/150‑1 (MQ=255)
aaCTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACAtata > 2:3170814/1‑150 (MQ=255)
aaCTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACAtata > 1:3758651/1‑150 (MQ=255)
cTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATaaa > 2:907674/1‑150 (MQ=255)
cTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATaaa > 1:719471/1‑150 (MQ=255)
gCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGc < 2:3208355/150‑1 (MQ=255)
tGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGt > 1:424308/1‑150 (MQ=255)
tGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGt > 1:4324234/1‑150 (MQ=255)
cAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGa < 1:3051080/150‑1 (MQ=255)
cAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGa < 1:3813353/150‑1 (MQ=255)
aaaTATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGAc < 2:3395804/150‑1 (MQ=255)
atatACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACaa > 1:15067/1‑150 (MQ=255)
tataCAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACaaa > 2:626246/1‑150 (MQ=255)
ataCAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACaaaa > 2:2221480/1‑150 (MQ=255)
taCAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACaaaaa > 2:2097745/1‑150 (MQ=255)
agagAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACa > 1:2320198/1‑150 (MQ=255)
gagaATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAg > 1:1065088/1‑150 (MQ=255)
gagaATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAg > 2:399578/1‑150 (MQ=255)
agaATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGt < 2:1076898/150‑1 (MQ=255)
gaATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTg < 1:3341577/150‑1 (MQ=255)
aaTTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGa < 2:2033492/150‑1 (MQ=255)
aaTTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGa > 2:2347262/1‑150 (MQ=255)
aTTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGaa < 1:1393324/150‑1 (MQ=255)
aCTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTa > 2:2708757/1‑150 (MQ=255)
cTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTTGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACAAATAAAATCGGGGACAAAAAACAGTGAACAGTaa > 2:1989148/1‑150 (MQ=255)
tCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAAt > 1:2251878/1‑150 (MQ=255)
tCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAAt < 1:2393660/150‑1 (MQ=255)
cACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATa < 2:3132416/150‑1 (MQ=255)
tAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATagag > 1:3878402/1‑150 (MQ=255)
aaaGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAgaga > 2:3453895/1‑150 (MQ=255)
aaaGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAgaga < 1:3183131/150‑1 (MQ=255)
aaGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGAt > 1:2601847/1‑150 (MQ=255)
aGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATa < 1:123325/150‑1 (MQ=255)
aGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATa < 2:1504423/150‑1 (MQ=255)
ttAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATaaa > 1:1598327/1‑150 (MQ=255)
aTTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACa > 2:77143/1‑150 (MQ=255)
ttGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACaa > 2:4344934/1‑150 (MQ=255)
tGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGTATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGATCATACAGAAAATGAAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACATTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAAc > 1:3679943/1‑150 (MQ=255)
aaaGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTg > 1:2173975/1‑150 (MQ=255)
aaGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGt < 1:1961779/150‑1 (MQ=255)
gTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAg < 2:143394/150‑1 (MQ=255)
ttAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATa > 1:2457021/1‑150 (MQ=255)
aaaCATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATAcc > 1:360357/1‑150 (MQ=255)
aaCATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCg > 2:2022724/1‑150 (MQ=255)
aaCATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCg > 2:388199/1‑150 (MQ=255)
cATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGAt < 2:3857110/150‑1 (MQ=255)
cATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGAt > 1:1799599/1‑150 (MQ=255)
atTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACt > 2:176724/1‑150 (MQ=255)
atTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACt > 2:1457490/1‑150 (MQ=255)
tCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTg > 2:2546226/1‑150 (MQ=255)
cAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGa > 1:2726187/1‑150 (MQ=255)
cAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGa > 2:4170817/1‑150 (MQ=255)
aGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAGAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGaa > 1:3178330/1‑150 (MQ=255)
aGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGaa > 1:2086914/1‑150 (MQ=255)
atCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTg < 1:1464106/150‑1 (MQ=255)
cGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGAc < 2:1281485/150‑1 (MQ=255)
ggATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACa > 1:4422616/1‑150 (MQ=255)
ggATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGAAGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGAGAAAATTAATAGAGATAAAATTGTACAACAAGTAGATACCTATAATATTGAAAAACTGACa > 1:2917009/1‑150 (MQ=255)
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ATTGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATCCGCGTTGAGTCAAAG > CP009273/1618811‑1619109
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
