Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,618,960 |
A→C |
6.7% |
intergenic (‑206/‑70) |
ydeI ← / → ydeJ |
hydrogen peroxide resistance OB fold protein; putative periplasmic protein/inactive PncC family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,618,960 | 0 | A | C | 6.7%
| 797.5
/ 49.0
| 285 | intergenic (‑206/‑70) | ydeI/ydeJ | hydrogen peroxide resistance OB fold protein; putative periplasmic protein/inactive PncC family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (130/134); new base C (9/10); total (139/146) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.08e-01 |
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
TTGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATCCGCGTTGAGTCAAA > CP009273/1618812‑1619108
|
tGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGaaaa < 2:2966324/149‑1 (MQ=255)
gCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAat < 2:3848591/149‑1 (MQ=255)
aaaTAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAattat < 2:4751152/149‑1 (MQ=255)
aTAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCTCTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAAttatta < 1:2375081/149‑1 (MQ=255)
aTAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAAttatta > 1:1200057/1‑149 (MQ=255)
aGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTatat > 1:4107611/1‑149 (MQ=255)
aGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTatat > 1:1918623/1‑149 (MQ=255)
gAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATAtt < 2:1011085/149‑1 (MQ=255)
gAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATAtt < 1:3785404/149‑1 (MQ=255)
gAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATAtt > 2:3416660/1‑149 (MQ=255)
aaTATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTg < 2:505207/149‑1 (MQ=255)
tatTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGa < 2:1633213/149‑1 (MQ=255)
atTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGAc > 1:1873116/1‑149 (MQ=255)
atTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGAc < 2:277066/149‑1 (MQ=255)
atTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGAc < 1:1442969/149‑1 (MQ=255)
ttGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACg < 2:2362391/149‑1 (MQ=255)
ttGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACg > 2:1933075/1‑149 (MQ=255)
gCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAg < 1:1699551/149‑1 (MQ=255)
ccAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGc > 2:3621374/1‑149 (MQ=255)
cAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCa > 1:2956469/1‑149 (MQ=255)
aTTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATa < 1:2211372/149‑1 (MQ=255)
ttATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGa > 1:4191009/1‑149 (MQ=255)
taAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGgaaa > 2:547669/1‑149 (MQ=255)
aGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAg > 1:4727625/1‑149 (MQ=255)
cATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCaa > 2:3224322/1‑149 (MQ=255)
tttAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAAt > 1:3397423/1‑149 (MQ=255)
ttAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATc < 2:4557800/149‑1 (MQ=255)
aaaaTCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCAc > 2:3264112/1‑149 (MQ=255)
aaaTCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCAcc < 2:313804/149‑1 (MQ=255)
aTCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCtt < 2:3175430/149‑1 (MQ=255)
gCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACa < 2:1529535/149‑1 (MQ=255)
gCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACa > 1:66715/1‑149 (MQ=255)
gCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACa < 1:434294/149‑1 (MQ=255)
cAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACata < 1:932348/149‑1 (MQ=255)
aaCTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACatat > 2:603562/1‑149 (MQ=255)
aGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATaaaa < 1:2635368/149‑1 (MQ=255)
gCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAg < 2:2254422/149‑1 (MQ=255)
tGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCg < 2:4198643/149‑1 (MQ=255)
tCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTg > 2:2310988/1‑149 (MQ=255)
aaaTATACAGAGAATTTAACTCACTAAATTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGa < 2:2557410/149‑1 (MQ=255)
aaTATAAATAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAATATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGAc < 2:466640/149‑1 (MQ=255)
taCAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACaaaa > 1:100306/1‑149 (MQ=255)
aCAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACaaaaa > 2:3957465/1‑149 (MQ=255)
aCAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACaaaaa < 1:2048534/149‑1 (MQ=255)
agagAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAAc > 1:3199195/1‑149 (MQ=255)
taaTTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGt < 2:692553/148‑1 (MQ=255)
gaATTTAACTCACTAAAGTTAATAAGATTGAAAAGTCTTAAAAATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGt < 2:1554491/149‑1 (MQ=255)
gaATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGt < 2:1809322/149‑1 (MQ=255)
aaTTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTg > 1:2536403/1‑149 (MQ=255)
aaTTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTg < 2:267021/149‑1 (MQ=255)
aaTTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTg < 2:267184/149‑1 (MQ=255)
tttAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGaa < 1:1395723/149‑1 (MQ=255)
ttAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAAc < 1:1597013/149‑1 (MQ=255)
aCTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACAtt < 1:2869932/149‑1 (MQ=255)
tCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTaa > 1:477741/1‑149 (MQ=255)
cACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAAt > 2:3866049/1‑149 (MQ=255)
aCTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATa < 1:1069103/149‑1 (MQ=255)
tAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATaga > 2:1104512/1‑149 (MQ=255)
aaaGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATagag > 2:1207292/1‑149 (MQ=255)
aaaGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATagag > 1:45690/1‑149 (MQ=255)
gTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATa > 1:208379/1‑149 (MQ=255)
gTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATa > 1:3267998/1‑149 (MQ=255)
ttAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGTACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATaa > 1:1307859/1‑149 (MQ=255)
gaTTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTa > 1:2860162/1‑149 (MQ=255)
tGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAACATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACaa < 2:2536403/149‑1 (MQ=255)
tGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACaa > 2:211524/1‑149 (MQ=255)
gAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAAc < 2:907299/149‑1 (MQ=255)
aaaaGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACt < 2:2858967/149‑1 (MQ=255)
aaGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAATACAGTGAACATTAATAGAGATCAAAGTGTACAACTTg > 2:3764272/1‑149 (MQ=255)
aaGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTg > 1:4647629/1‑149 (MQ=255)
attCTTAAAAATATTTTCATAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGt < 2:1307859/147‑1 (MQ=255)
tCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGTACATTAATAGAGATCAAATTGTCCAAGTTGtcg > 2:4329579/1‑147 (MQ=255)
cTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGa < 1:846332/149‑1 (MQ=255)
cTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGa < 2:3645336/149‑1 (MQ=255)
cTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGa < 1:3895237/149‑1 (MQ=255)
cTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGa < 1:1721526/149‑1 (MQ=255)
ttAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGAt < 2:1396304/149‑1 (MQ=255)
aaaCATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATAc > 2:2911109/1‑149 (MQ=255)
aaaCATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATAc < 1:2321975/149‑1 (MQ=255)
cATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGa < 1:3586430/149‑1 (MQ=255)
cATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGa > 2:3504216/1‑149 (MQ=255)
cATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGa > 1:4485565/1‑149 (MQ=255)
ttCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTAt < 1:2694534/149‑1 (MQ=255)
tCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTAtt > 1:2821270/1‑149 (MQ=255)
tCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTAtt < 2:4167694/149‑1 (MQ=255)
gAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATAGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGaa > 1:3333253/1‑149 (MQ=255)
ataatCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGaaaa < 1:3988730/149‑1 (MQ=255)
ataatCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGaaaa > 1:2218729/1‑149 (MQ=255)
atCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCt > 1:2182765/1‑149 (MQ=255)
gATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACa < 1:3708321/149‑1 (MQ=255)
ttATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATcc < 2:2700628/149‑1 (MQ=255)
tatGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATCcgcg > 1:4542033/1‑149 (MQ=255)
atGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATCCGCGt < 2:2399321/149‑1 (MQ=255)
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tttGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGTACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATCCGCGTTGa < 2:4107611/149‑1 (MQ=255)
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tGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATCCGCGTTGAGt < 2:3793851/149‑1 (MQ=255)
tGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATCCGCGTTGAGt > 1:3128700/1‑149 (MQ=255)
gAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATCCGCGTTGAGTc < 1:2445785/149‑1 (MQ=255)
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TTGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTTATAAGGCATTTAAAATCAGCCAACTAGCTGTCAAATATACAGAGAATTTAACTCACTAAAGTTAAGAAGATTGAAAAGTCTTAAACATATTTTCAGAATAATCGGATTTATATGTTTGAAAATTATTATATTGGACGAGCATACAGAAAAAGCAAATCACCTTTACATATAAAAGCGTGGACAAAAAACAGTGAACATTAATAGAGATAAAATTGTACAACTTGTAGATACCGATACTATTGAAAACCTGACATCCGCGTTGAGTCAAA > CP009273/1618812‑1619108
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
