Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F54 I0 R1
|
640 |
319.5 |
10493376 |
95.3% |
10000187 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,194,365 |
G→T |
22.7% |
W72L (TGG→TTG) |
lit → |
e14 prophage; cell death peptidase, inhibitor of T4 late gene expression |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,194,365 | 0 | G | T | 22.7%
| 740.3
/ 196.8
| 317 | W72L (TGG→TTG) | lit | e14 prophage; cell death peptidase, inhibitor of T4 late gene expression |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (120/125); new base T (40/32); total (160/157) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.50e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.19e-01 |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
GAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAACAACAG > CP009273/1194216‑1194514
|
aGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTggg > 1:958638/1‑150 (MQ=255)
aGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATGTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTggg < 1:697758/150‑1 (MQ=255)
ggAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGc > 1:2300801/1‑150 (MQ=255)
aaGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCAtttt > 2:4961600/1‑150 (MQ=255)
aTCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCa < 2:4851979/150‑1 (MQ=255)
tCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCaa > 2:149102/1‑150 (MQ=255)
ttAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAAtt < 2:3682841/150‑1 (MQ=255)
ttAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAAtt < 1:4048168/150‑1 (MQ=255)
aaCGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCtt > 1:2814261/1‑150 (MQ=255)
aCGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCttt > 1:1539161/1‑150 (MQ=255)
aCGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCttt < 2:129470/150‑1 (MQ=255)
cGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCtttt < 1:4231731/150‑1 (MQ=255)
gATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTg > 1:2901196/1‑150 (MQ=255)
tAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTggg < 2:9752/150‑1 (MQ=255)
tAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTggg < 1:1050923/150‑1 (MQ=255)
aGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGt > 1:2677964/1‑150 (MQ=255)
aGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGt < 1:1600069/150‑1 (MQ=255)
ttGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGttt < 1:2150941/150‑1 (MQ=255)
ttGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGttt < 2:3372501/150‑1 (MQ=255)
ttGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGttt > 1:4708584/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAaga < 2:72659/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAaga < 2:232977/150‑1 (MQ=255)
aaaTTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGt > 2:2513928/1‑150 (MQ=255)
aaaTTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGt > 2:5105367/1‑150 (MQ=255)
aaTTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTa > 2:4254552/1‑150 (MQ=255)
aTTTTAATTTCTGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGATTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTAc < 1:1639544/150‑1 (MQ=255)
aTTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTATTTGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCaaa > 2:1401480/1‑150 (MQ=255)
aGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGTGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCa < 2:3830550/150‑1 (MQ=255)
gtgagtgaACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGACTATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGaaa > 2:2554609/1‑150 (MQ=255)
gagtgaACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGaaaaa > 1:5130789/1‑150 (MQ=255)
agtgaACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAaat > 1:1981732/1‑150 (MQ=255)
gaACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAaataat > 2:3063159/1‑150 (MQ=255)
aaCCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAatg > 1:1442815/1‑150 (MQ=255)
aaCCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAatg > 2:1066112/1‑150 (MQ=255)
aaCCTGGTTTGAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAAGTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAatg < 2:5155061/150‑1 (MQ=255)
aCCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAatga < 1:2182644/150‑1 (MQ=255)
aCCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAatga > 2:2078627/1‑150 (MQ=255)
ccTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAatgat < 2:1190878/150‑1 (MQ=255)
cTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCCAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAattatg > 2:3702079/1‑150 (MQ=255)
cTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAatgatg < 1:136694/150‑1 (MQ=255)
tGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAAtgatga > 2:3935464/1‑150 (MQ=255)
tGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAAtgatga < 2:1925893/150‑1 (MQ=255)
tAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACtt > 2:1751209/1‑150 (MQ=255)
aaTATGCGAGTCATGAAGAATGAGAGTTATTATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACttt < 2:4916772/150‑1 (MQ=255)
aaTATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACttt < 1:4144103/150‑1 (MQ=255)
aaTATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTAACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACttt < 2:330113/150‑1 (MQ=255)
atatCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTg > 2:2908940/1‑150 (MQ=255)
atatCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTg < 2:595568/150‑1 (MQ=255)
tatCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGa > 2:3750278/1‑150 (MQ=255)
gAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTaa < 2:2909985/150‑1 (MQ=255)
aGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAAc < 1:983944/150‑1 (MQ=255)
aGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAAc < 1:235761/150‑1 (MQ=255)
aGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAAc > 2:2202675/1‑150 (MQ=255)
aGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAAc < 2:2178711/150‑1 (MQ=255)
gTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACa < 1:3069660/150‑1 (MQ=255)
tCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAg < 2:5177997/150‑1 (MQ=255)
cAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAgg > 2:4310538/1‑150 (MQ=255)
ataaTGAGAGTATTTATTCTCATGAAATATTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGTATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGaaaaa < 2:4089287/148‑1 (MQ=255)
agaaTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGaaaaa > 1:3602593/1‑150 (MQ=255)
gaaTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGaaaaaa > 2:3806947/1‑150 (MQ=255)
aTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATa < 2:648426/150‑1 (MQ=255)
aTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATa < 2:313738/150‑1 (MQ=255)
tGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAg < 1:5042883/150‑1 (MQ=255)
gagaGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAgg > 2:1695218/1‑150 (MQ=255)
agagTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGc > 1:1801163/1‑150 (MQ=255)
gagTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCt < 1:2066089/150‑1 (MQ=255)
gagTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCt < 2:958638/150‑1 (MQ=255)
aataatTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTaaa > 2:3045600/1‑150 (MQ=255)
aataatTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTaaa > 2:564122/1‑150 (MQ=255)
ataatTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTaaaa > 2:1937015/1‑150 (MQ=255)
taatTCACATCAAATAGTTCTAACATTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTACAATTTCTTTTGTGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCATAAAAATAATGATGATCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTaaaaa < 2:3242702/150‑1 (MQ=255)
aatTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAg < 1:2222016/150‑1 (MQ=255)
atTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGt > 1:5213311/1‑150 (MQ=255)
ttCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTc < 1:1300587/150‑1 (MQ=255)
tCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCt > 1:4781314/1‑150 (MQ=255)
cacaTGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATCTTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGCAAAAATAGGCTTAAAAAGTCtg > 2:4483122/1‑150 (MQ=255)
cacaTGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCAATTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCtg < 2:4703372/150‑1 (MQ=255)
cacaTGAAATAGGTCTAACAGTAGCTTCACTTGCATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCATTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCtg > 2:4553557/1‑150 (MQ=255)
tGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCtgatga > 1:2506328/1‑150 (MQ=255)
aGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTACAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCAAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGAACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGATTAAAAAGTCTGAAGAActtct > 1:4589758/1‑150 (MQ=255)
gTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAActtctt > 2:3488594/1‑150 (MQ=255)
aCAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTGTGAGTTAACAGGCAAAAATAGGCTTAACAAGTCTGCTGCACTACTTACATgg > 2:2742101/1‑150 (MQ=255)
cattAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATggg < 2:4207965/147‑1 (MQ=255)
cAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATggg < 1:1212941/150‑1 (MQ=255)
cAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATggg < 2:1367361/150‑1 (MQ=255)
aGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGc < 1:3800048/150‑1 (MQ=255)
gTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCa < 1:891340/150‑1 (MQ=255)
cTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGa < 1:1949217/150‑1 (MQ=255)
cTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGa > 1:1464476/1‑150 (MQ=255)
ttCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGaa > 1:1186101/1‑150 (MQ=255)
tGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACtt < 1:1228586/150‑1 (MQ=255)
tGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACtt > 2:1417943/1‑150 (MQ=255)
gAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTg > 2:2601908/1‑150 (MQ=255)
gAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTg < 2:883187/150‑1 (MQ=255)
gAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTg < 1:3935464/150‑1 (MQ=255)
atatTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCaaa > 1:4855384/1‑150 (MQ=255)
tatTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAaac < 1:3515333/150‑1 (MQ=255)
tttGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAaacaa > 1:1747436/1‑150 (MQ=255)
tGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCACGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAacaaca > 1:1338622/1‑150 (MQ=255)
gggCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAACAACAg > 1:667403/1‑150 (MQ=255)
|
GAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAACAACAG > CP009273/1194216‑1194514
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
