Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F54 I0 R1
|
640 |
319.5 |
10493376 |
95.3% |
10000187 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,471,707 |
A→T |
30.7% |
*769C (TGA→TGT) |
ydbD → |
PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,471,707 | 0 | A | T | 30.7%
| 444.7
/ 239.1
| 271 | *769C (TGA→TGT) | ydbD | PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (93/94); new base T (38/45); total (131/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
GATGTATTAAAGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAGCGCAA > CP009273/1471558‑1471855
|
gATGTATTAAAGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGa < 1:159914/150‑1 (MQ=255)
tGTATTAAAGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTc > 2:494730/1‑150 (MQ=255)
tATTAAAGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCca < 2:2905780/150‑1 (MQ=255)
aaGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACg > 1:1543864/1‑150 (MQ=255)
aaGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACg > 1:440562/1‑150 (MQ=255)
aGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGt < 2:2804787/150‑1 (MQ=255)
ggCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTa > 1:340577/1‑150 (MQ=255)
gCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCTCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTaa < 2:2253743/150‑1 (MQ=255)
gCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGttt < 1:2945364/150‑1 (MQ=255)
cTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGtttt < 1:1843893/150‑1 (MQ=255)
cTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGtttt > 1:4876305/1‑150 (MQ=255)
cTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGtttt > 1:2279734/1‑150 (MQ=255)
tGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGttttt > 1:1835932/1‑150 (MQ=255)
tGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGttttt < 1:2928723/150‑1 (MQ=255)
tGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCAACAACGTAATGttttt > 1:3659873/1‑150 (MQ=255)
gAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTCAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATACACAACGTAATGtttttt > 2:3608834/1‑150 (MQ=255)
gAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGtttttt > 2:1424005/1‑150 (MQ=255)
cGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACt < 1:4001070/150‑1 (MQ=255)
gTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTa < 2:186020/150‑1 (MQ=255)
tGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTAGTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTAt > 1:2701546/1‑150 (MQ=255)
gATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATc < 2:469172/150‑1 (MQ=255)
gATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATc < 2:3198861/150‑1 (MQ=255)
gATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATc > 1:3793702/1‑150 (MQ=255)
gATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATc < 1:1199624/150‑1 (MQ=255)
aTCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCt > 1:258217/1‑150 (MQ=255)
tCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTg > 1:3322635/1‑150 (MQ=255)
tCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTg < 1:3883091/150‑1 (MQ=255)
cTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGAt < 2:200957/150‑1 (MQ=255)
cTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGAt < 2:1327071/150‑1 (MQ=255)
ttGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTGAACGGGAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGGTCCACAACGTAAGGTTTTTTAACTATCTGAGTa < 2:1649536/150‑1 (MQ=255)
gCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAAt < 2:2413919/150‑1 (MQ=255)
cTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAAtt < 2:3752736/150‑1 (MQ=255)
ggCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGACCTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTgg < 2:448079/150‑1 (MQ=255)
cGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTgggg < 1:3169265/150‑1 (MQ=255)
cGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTgggg > 1:818261/1‑150 (MQ=255)
cGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTgggg > 1:1562963/1‑150 (MQ=255)
gTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGa > 1:4221881/1‑150 (MQ=255)
gTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGa > 1:678470/1‑150 (MQ=255)
ttGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCAtt > 1:5150330/1‑150 (MQ=255)
tGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTc < 2:4297318/150‑1 (MQ=255)
ttAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCt > 1:4995099/1‑150 (MQ=255)
tAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTg < 2:5132188/150‑1 (MQ=255)
cTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGt < 2:1038389/150‑1 (MQ=255)
tGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTg > 2:1146191/1‑150 (MQ=255)
cTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTc < 2:2949534/150‑1 (MQ=255)
tttAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCaa > 1:3204834/1‑150 (MQ=255)
ttAGTCCGCCAGCTGGAGCTTAACGTTAAGACGCGCGCAATAAGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTTATGAGTTGTATTGATCCTCAACGTATTGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGTATAATCATTCCTGACAGTGTGTCCCCAAt < 2:3968372/150‑1 (MQ=255)
tAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAACACATGATGAGTTGTCTTGATCCACAACGTAATGTATTTTAACTATCTGAGTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATa > 1:1576310/1‑150 (MQ=255)
tAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATa > 1:2474513/1‑150 (MQ=255)
tAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATa < 2:2670054/150‑1 (MQ=255)
tAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATa < 2:578896/150‑1 (MQ=255)
tAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATa < 2:2978729/150‑1 (MQ=255)
tCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCt > 1:4963813/1‑150 (MQ=255)
tCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCt > 1:4788347/1‑150 (MQ=255)
ccAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGat < 1:3191977/150‑1 (MQ=255)
aGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGatat < 1:1377188/150‑1 (MQ=255)
tGGCGCTTACCGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGCAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATAtt < 2:5030275/150‑1 (MQ=255)
tGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCTATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATAtt < 2:1477773/150‑1 (MQ=255)
tGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATAtt < 2:2349732/150‑1 (MQ=255)
ggCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTc > 2:1485910/1‑150 (MQ=255)
cgcTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTg < 2:1565449/150‑1 (MQ=255)
cgcTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTg < 1:2174349/150‑1 (MQ=255)
tAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAAtt > 1:3528519/1‑150 (MQ=255)
aaCGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACATTGATATATTCTGAAttt > 2:3915993/1‑150 (MQ=255)
ggTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGACCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTa > 1:3817506/1‑150 (MQ=255)
tAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAAt > 2:2157142/1‑150 (MQ=255)
aaGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATTATAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTACACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATg < 2:3668939/150‑1 (MQ=255)
aaGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATg < 2:1958399/150‑1 (MQ=255)
aaGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATg < 1:4777643/150‑1 (MQ=255)
aGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGa < 1:3248963/150‑1 (MQ=255)
cgcAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCg < 2:315295/150‑1 (MQ=255)
aTACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGtt > 1:4825792/1‑150 (MQ=255)
gggAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGa > 1:1958716/1‑150 (MQ=255)
aaCAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGatat > 1:1112209/1‑150 (MQ=255)
aaGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATAtctc < 2:3308006/150‑1 (MQ=255)
gCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATTAAACGGAGTGTTGCGATATCTCCg > 2:3511370/1‑150 (MQ=255)
gATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTc < 2:3108986/150‑1 (MQ=255)
gagaAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAgg < 2:1835932/150‑1 (MQ=255)
agaAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAggg > 2:1156653/1‑150 (MQ=255)
aaaaCTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGa > 1:307196/1‑150 (MQ=255)
aaaCTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGaa < 2:602574/150‑1 (MQ=255)
aaaCTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGaa > 2:4450912/1‑150 (MQ=255)
aaaCTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAAAGGCGTGTTGCGATATCTCCGACAGGGGaa > 2:1258316/1‑150 (MQ=255)
aaCTTGTTGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAAt < 2:3697001/150‑1 (MQ=255)
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aCTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAAtt > 1:1150468/1‑150 (MQ=255)
aCTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAAtt > 1:2135801/1‑150 (MQ=255)
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tgatgaGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTGAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGAt < 1:2539371/150‑1 (MQ=255)
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atgaGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGc > 1:2785756/1‑150 (MQ=255)
tgaGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCa < 2:4274239/150‑1 (MQ=255)
aGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCAcc > 1:1880158/1‑150 (MQ=255)
gTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCa > 2:3542737/1‑150 (MQ=255)
tGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATa < 2:94528/150‑1 (MQ=255)
gTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAg > 2:837200/1‑150 (MQ=255)
aTTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAgcg > 1:1189187/1‑150 (MQ=255)
ttGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAgcgc > 1:4090069/1‑150 (MQ=255)
gATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAGCGCaa > 2:2432466/1‑150 (MQ=255)
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GATGTATTAAAGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAGCGCAA > CP009273/1471558‑1471855
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
