Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F56 I0 R1
|
543 |
285.0 |
9366284 |
95.7% |
8963533 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,471,707 |
A→T |
48.1% |
*769C (TGA→TGT) |
ydbD → |
PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,471,707 | 0 | A | T | 48.1%
| 75.8
/ inf
| 267 | *769C (TGA→TGT) | ydbD | PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (71/67); new base T (66/62); total (137/130) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
ATGTATTAAAGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAGCGCA > CP009273/1471559‑1471854
|
aTGTATTAAAGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGa < 2:250286/149‑1 (MQ=255)
tGTATTAAAGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGAt > 1:586055/1‑149 (MQ=255)
tAAAGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTCAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCcaca > 2:2462584/1‑149 (MQ=255)
aaaGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACaa < 1:3674896/149‑1 (MQ=255)
aaaGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACaa < 2:3416925/149‑1 (MQ=255)
aaGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAAc > 1:4204688/1‑149 (MQ=255)
aGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACg > 2:1192163/1‑149 (MQ=255)
cGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTaa < 1:2652955/149‑1 (MQ=255)
gAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAAt > 2:3889772/1‑149 (MQ=255)
gAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAAt < 2:1709540/149‑1 (MQ=255)
aGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATg < 2:4015829/149‑1 (MQ=255)
ggCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGt < 2:2297034/149‑1 (MQ=255)
gCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGtt < 2:3835442/149‑1 (MQ=255)
aaaCGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGtttttt > 2:3132203/1‑149 (MQ=255)
aCGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTaa < 2:738058/149‑1 (MQ=255)
cGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAAc < 1:676192/149‑1 (MQ=255)
tGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTa > 1:2061077/1‑149 (MQ=255)
tGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCGTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAATCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTa > 1:420468/1‑149 (MQ=255)
gATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTCAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTAt > 2:1013526/1‑149 (MQ=255)
ttgctgtGCTGGCTTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTTGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTTAGACTCGCGCAATACGGGAACTAGCGATTAGAAAACTTGATGAGTTGTTTTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATc < 2:4232851/143‑1 (MQ=255)
aTCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATc < 1:3940707/149‑1 (MQ=255)
tcatttGCTGGCGTTAGAGCTTGTTATCCCTGATCTGGATTTAGTCCTCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATTCGGGAACAAGATATGAGAAAACTTGATGATTTGTATTGATACACAACGTAATGTTTTTTAACTATCt < 1:1540311/146‑1 (MQ=255)
tCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCt < 1:720633/149‑1 (MQ=255)
ccTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTg > 2:2632376/1‑149 (MQ=255)
cTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGa > 2:3260538/1‑149 (MQ=255)
gCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTaa < 2:290133/149‑1 (MQ=255)
tGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAAtt > 2:3474704/1‑149 (MQ=255)
ggCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTg > 2:4099913/1‑149 (MQ=255)
cGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTggg < 1:2858343/149‑1 (MQ=255)
ttAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGa > 1:1726585/1‑149 (MQ=255)
tAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGAt < 1:69032/149‑1 (MQ=255)
agagCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATa > 2:81799/1‑149 (MQ=255)
agagCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATa > 1:128024/1‑149 (MQ=255)
agagCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATa > 1:128276/1‑149 (MQ=255)
agCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAAt > 1:2708033/1‑149 (MQ=255)
gCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATc < 2:4617744/149‑1 (MQ=255)
gCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATc < 1:1857431/149‑1 (MQ=255)
gCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATc > 1:1387274/1‑149 (MQ=255)
gCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATc > 2:333313/1‑149 (MQ=255)
ttGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCAt < 1:4082222/149‑1 (MQ=255)
gTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTc > 1:4419658/1‑149 (MQ=255)
aaCCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTg > 1:2428362/1‑149 (MQ=255)
aCTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAg > 2:3658260/1‑149 (MQ=255)
aCTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAg < 1:4328550/149‑1 (MQ=255)
cTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGt > 1:2829095/1‑149 (MQ=255)
tGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTc > 1:1483482/1‑149 (MQ=255)
tGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTc > 1:2876113/1‑149 (MQ=255)
ggATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTcc > 2:1944616/1‑149 (MQ=255)
ttAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCaa < 2:2809964/149‑1 (MQ=255)
tAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAAt < 1:2313932/149‑1 (MQ=255)
gTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATAc < 1:3432235/149‑1 (MQ=255)
tCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATAcc > 1:4659325/1‑149 (MQ=255)
tCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATAcc > 1:4371446/1‑149 (MQ=255)
tCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATAcc > 1:4371330/1‑149 (MQ=255)
gCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTATCTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTg > 2:1896795/1‑149 (MQ=255)
ccAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGa < 2:4142028/149‑1 (MQ=255)
ccAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGa > 1:2171899/1‑149 (MQ=255)
gCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGatat < 2:1557023/149‑1 (MQ=255)
gCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGatat < 1:887370/149‑1 (MQ=255)
gCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGatat < 1:1203235/149‑1 (MQ=255)
gcTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTg < 1:49851/149‑1 (MQ=255)
ttAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGaa > 1:4158669/1‑149 (MQ=255)
aaCGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAAtt > 2:641196/1‑149 (MQ=255)
gTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTa > 1:912479/1‑149 (MQ=255)
tAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTaa < 1:2017222/149‑1 (MQ=255)
tAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTaa > 1:2767917/1‑149 (MQ=255)
tAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGAT‑ATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAAt > 1:1674029/1‑149 (MQ=255)
gACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGa < 1:4582939/149‑1 (MQ=255)
aCGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGaa < 2:4436488/149‑1 (MQ=255)
cgcgcgCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGaaa < 1:81799/149‑1 (MQ=255)
cgcgcgCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGaaa > 1:4554880/1‑149 (MQ=255)
cgcgcAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACg < 2:2166785/149‑1 (MQ=255)
aaTACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTTATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCgtg < 2:3019398/149‑1 (MQ=255)
aTACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCgtgt > 1:194770/1‑149 (MQ=255)
tACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGtt < 2:4062158/149‑1 (MQ=255)
aCGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTg > 1:3645181/1‑149 (MQ=255)
gggAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCg > 1:2474718/1‑149 (MQ=255)
ggAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGa > 1:4674850/1‑149 (MQ=255)
ggAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGa < 2:1253706/149‑1 (MQ=255)
gAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGat > 1:1099724/1‑149 (MQ=255)
aCAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGatat > 1:2547743/1‑149 (MQ=255)
aGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATAtctc < 1:2241616/149‑1 (MQ=255)
gATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGt > 1:4617654/1‑149 (MQ=255)
gagaAAACTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAg > 1:3292546/1‑149 (MQ=255)
gagaAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAg < 2:586055/149‑1 (MQ=255)
aaaaCTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAgggg < 1:628221/149‑1 (MQ=255)
aaCTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGaa > 2:4543775/1‑149 (MQ=255)
aaCTTGATGAGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGaa > 2:4543658/1‑149 (MQ=255)
cTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAAtt < 2:2076354/149‑1 (MQ=255)
cTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAAtt < 1:1023627/149‑1 (MQ=255)
tgatgaGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGTGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATAACTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCAGTCAGGGGAATTGa > 1:804798/1‑149 (MQ=255)
atgaGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATg > 1:4635300/1‑149 (MQ=255)
atgaGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATg > 1:2293513/1‑149 (MQ=255)
atgaGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATg > 2:3867031/1‑149 (MQ=255)
tgaGTTGTATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGc > 2:1144298/1‑149 (MQ=255)
ttGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCa > 1:3491457/1‑149 (MQ=255)
gTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATa > 1:3079621/1‑149 (MQ=255)
tATTGTTCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAg < 2:2419850/149‑1 (MQ=255)
ttGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAgcg > 1:3562329/1‑149 (MQ=255)
ttGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAgcg > 1:537753/1‑149 (MQ=255)
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ATGTATTAAAGGCGAGGCTGAAACGTGATCCTTTGCTGGCGTTAGAGCTTGTTAACCCTGAACTGGATTTAGTCCGCCAGCTGGCGCTTAACGGTAAGACGCGCGCAATACGGGAACAAGCGATGAGAAAACTTGATGAGTTGTATTGATCCACAACGTAATGTTTTTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAGCGCA > CP009273/1471559‑1471854
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
