Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F86 I0 R1
|
593 |
297.4 |
9515568 |
94.4% |
8982696 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,355,349 |
T→A |
6.4% |
intergenic (‑184/‑28) |
puuA ← / → puuD |
glutamate‑‑putrescine ligase/gamma‑glutamyl‑gamma‑aminobutyrate hydrolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,355,349 | 0 | T | A | 6.4%
| 599.6
/ 24.6
| 171 | intergenic (‑184/‑28) | puuA/puuD | glutamate‑‑putrescine ligase/gamma‑glutamyl‑gamma‑aminobutyrate hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (90/70); new base A (8/3); total (98/73) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.57e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.35e-01 |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
CAAAGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCT > CP009273/1355201‑1355497
|
cAAAGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCTCAGTAATGGCGATa > 1:3217399/1‑150 (MQ=255)
aaaGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATaa > 1:4571926/1‑150 (MQ=255)
aaGCGAAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAAt < 2:3445490/150‑1 (MQ=255)
cGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTa < 2:2201051/150‑1 (MQ=255)
gTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAg < 2:3697118/150‑1 (MQ=255)
tAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGt > 1:831106/1‑150 (MQ=255)
tataATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACt < 2:1662668/150‑1 (MQ=255)
tataATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACt < 2:2468284/150‑1 (MQ=255)
ataATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACtt < 2:1654677/150‑1 (MQ=255)
taATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACttt < 1:4451475/150‑1 (MQ=255)
gACCAACATGCGAATCTGTATGCAAACTAAATTATTGTCAAATGATAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTga < 2:1297218/150‑1 (MQ=255)
accaTTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGAtt > 1:3694242/1‑150 (MQ=255)
ccaTTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTg > 1:2130829/1‑150 (MQ=255)
cagtCGAATCTGTATGCACACTAAATGTTTGACAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAACGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGa < 1:2356505/147‑1 (MQ=255)
aTTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAg > 2:144305/1‑150 (MQ=255)
ttCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGTTTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGc > 2:4548653/1‑150 (MQ=255)
ttCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGTTTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGc > 2:4548318/1‑150 (MQ=255)
cGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCAt > 1:4748834/1‑150 (MQ=255)
gAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATg > 1:3173666/1‑150 (MQ=255)
gAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATg > 1:1376513/1‑150 (MQ=255)
aaTCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATgg < 1:3643492/150‑1 (MQ=255)
aaTCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATgg > 1:3928934/1‑150 (MQ=255)
aaTCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATgg < 1:4192036/150‑1 (MQ=255)
aTCTGTATGCAAACTAATTGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGa < 1:3207806/150‑1 (MQ=255)
aTCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGa > 1:1106330/1‑150 (MQ=255)
aTCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGa < 1:3679575/150‑1 (MQ=255)
aTCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGa > 1:1107577/1‑150 (MQ=255)
cTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGaaa > 1:3757067/1‑150 (MQ=255)
gTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAat > 1:4523120/1‑150 (MQ=255)
gTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAat < 2:2043460/150‑1 (MQ=255)
tGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGACAAtata > 2:2635258/1‑150 (MQ=255)
aaaCTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATg > 1:907013/1‑150 (MQ=255)
aaCTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGa > 1:41405/1‑150 (MQ=255)
tAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACa < 2:641060/150‑1 (MQ=255)
tAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACa < 1:1811351/150‑1 (MQ=255)
aaTGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAAt > 1:3600789/1‑150 (MQ=255)
tttGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCgg < 2:2835250/150‑1 (MQ=255)
tttGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCgg < 1:144305/150‑1 (MQ=255)
aaaTGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCg > 2:3513513/1‑150 (MQ=255)
tAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTATATTTAAAAAATATTGAACATAAATGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCg < 1:893645/150‑1 (MQ=255)
tAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCg < 1:3266724/150‑1 (MQ=255)
aaTTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTa > 1:1357873/1‑150 (MQ=255)
tGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAAtg > 1:411017/1‑150 (MQ=255)
gAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAAtgt < 1:848319/150‑1 (MQ=255)
gAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAAtgt < 2:1805732/150‑1 (MQ=255)
tGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAgg < 1:4258169/150‑1 (MQ=255)
tGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAgg > 2:4262218/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAAc > 2:2969872/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACa < 1:663659/150‑1 (MQ=255)
aaaTGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAg > 2:3145779/1‑150 (MQ=255)
aaTGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAgg > 1:296344/1‑150 (MQ=255)
aaTGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAgg > 2:4248806/1‑150 (MQ=255)
aTGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGc > 2:827887/1‑150 (MQ=255)
aaCCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAg > 2:1223146/1‑150 (MQ=255)
aaCCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAg > 2:268707/1‑150 (MQ=255)
aCCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAgg > 2:4084329/1‑150 (MQ=255)
aCCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAgg < 1:50419/150‑1 (MQ=255)
cACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTc < 2:3095513/150‑1 (MQ=255)
aCTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCa > 1:770041/1‑150 (MQ=255)
cTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCAt > 1:2024797/1‑150 (MQ=255)
gCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGc < 1:4344940/150‑1 (MQ=255)
cTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCg > 2:3538881/1‑150 (MQ=255)
tAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGa < 2:97493/150‑1 (MQ=255)
aGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGAc < 1:4102956/150‑1 (MQ=255)
aGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGAc < 1:4102964/150‑1 (MQ=255)
aTTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGAccc > 2:1545004/1‑150 (MQ=255)
gAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGTAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGa > 1:2532363/1‑150 (MQ=255)
aaaaaaTATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGAc < 2:4145854/150‑1 (MQ=255)
aaaaaaTATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGAc < 2:3976679/150‑1 (MQ=255)
aaTATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTg < 2:4571935/150‑1 (MQ=255)
aaTATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTg > 2:188618/1‑150 (MQ=255)
aaTATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTg < 1:4548653/150‑1 (MQ=255)
atTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCaa > 1:809557/1‑150 (MQ=255)
atTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCaa > 2:1120643/1‑150 (MQ=255)
tGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGa > 1:1790759/1‑150 (MQ=255)
aaCATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGaaa < 2:1106330/150‑1 (MQ=255)
cATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAg > 2:120505/1‑150 (MQ=255)
cATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAg > 2:120465/1‑150 (MQ=255)
cATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGAGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAg > 2:565085/1‑150 (MQ=255)
aaaGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTAc < 1:1764865/150‑1 (MQ=255)
aaaGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTAc < 2:1376513/150‑1 (MQ=255)
aGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCt > 1:2221714/1‑150 (MQ=255)
aGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCt > 1:4603394/1‑150 (MQ=255)
aTTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATg > 1:2256733/1‑150 (MQ=255)
tAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCca > 1:1578622/1‑150 (MQ=255)
aaaGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCcat > 2:333438/1‑150 (MQ=255)
aaaGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCcat < 2:3583973/150‑1 (MQ=255)
aaGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCcatc > 2:2869499/1‑150 (MQ=255)
aGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCcatca < 2:319283/150‑1 (MQ=255)
aGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCcatca < 2:1932806/150‑1 (MQ=255)
gcgcAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCcatcat < 1:3552755/150‑1 (MQ=255)
aGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCAt > 1:1179909/1‑150 (MQ=255)
tAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGc < 2:3757067/150‑1 (MQ=255)
ggCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAggc < 1:1988510/150‑1 (MQ=255)
gATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAggcggc > 1:3292448/1‑150 (MQ=255)
gATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAggcggc > 2:2723020/1‑150 (MQ=255)
aTAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCt > 1:4380917/1‑150 (MQ=255)
aTAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCt > 1:2973895/1‑150 (MQ=255)
aTAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCt > 2:1529248/1‑150 (MQ=255)
aTAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCt > 2:1526465/1‑150 (MQ=255)
|
CAAAGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCT > CP009273/1355201‑1355497
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
