Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F98 I0 R1
|
799 |
294.1 |
9752082 |
92.2% |
8991419 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,355,349 |
T→A |
27.3% |
intergenic (‑184/‑28) |
puuA ← / → puuD |
glutamate‑‑putrescine ligase/gamma‑glutamyl‑gamma‑aminobutyrate hydrolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,355,349 | 0 | T | A | 27.3%
| 332.0
/ 151.0
| 172 | intergenic (‑184/‑28) | puuA/puuD | glutamate‑‑putrescine ligase/gamma‑glutamyl‑gamma‑aminobutyrate hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (77/47); new base A (28/19); total (106/66) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.61e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
TCAAAGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCTT > CP009273/1355200‑1355498
|
cAAAGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATa < 1:3950001/150‑1 (MQ=255)
aaaGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATaa < 1:3747475/150‑1 (MQ=255)
aaGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGAAAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATAATGAACATAAATGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAAt > 1:2133442/1‑150 (MQ=255)
aGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAAtt < 2:1613621/150‑1 (MQ=255)
aGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAAtt > 1:1084750/1‑150 (MQ=255)
gCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAAttt < 1:831934/150‑1 (MQ=255)
gCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAAttt < 1:4424704/150‑1 (MQ=255)
cGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTa > 1:4712667/1‑150 (MQ=255)
cGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTa < 2:83731/150‑1 (MQ=255)
tAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGt < 1:4525366/150‑1 (MQ=255)
tAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGt < 1:4608798/150‑1 (MQ=255)
tAAAATATAAAGACCACCATTCTAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGATAAATTGAGTTTGAAAAAATGAAAACCAACTGCTAGATAGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAATCGCAGTAATGGCGATAATTTatt > 1:4612699/1‑148 (MQ=255)
aaaTATAATGACCACCATTCGAATCTGTCTGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTcc < 2:1855668/150‑1 (MQ=255)
tataATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACt > 2:2471748/1‑150 (MQ=255)
aaTGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTtg < 2:2896805/150‑1 (MQ=255)
accaccATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTgag > 1:2380807/1‑150 (MQ=255)
accaccATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTgag > 2:3945101/1‑150 (MQ=255)
ccaTTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTg < 2:3036770/150‑1 (MQ=255)
ccaTTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTg > 1:664957/1‑150 (MQ=255)
caTTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGa < 2:2597109/150‑1 (MQ=255)
cGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCAt > 2:1344491/1‑150 (MQ=255)
cGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCAt < 1:312652/150‑1 (MQ=255)
gAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATg > 1:2049004/1‑150 (MQ=255)
aaTCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATgg < 2:3442053/150‑1 (MQ=255)
aTCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGa < 2:3636479/150‑1 (MQ=255)
aTCTGTATGCAAACCAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGa < 1:2560848/150‑1 (MQ=255)
tATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAata < 1:3260412/150‑1 (MQ=255)
aTGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAatat > 2:4674974/1‑150 (MQ=255)
cAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAAt < 2:4306666/150‑1 (MQ=255)
cAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAAt < 2:1668078/150‑1 (MQ=255)
aCTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGaa < 2:1333240/150‑1 (MQ=255)
aaTGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAAt > 2:599834/1‑150 (MQ=255)
aTGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATc < 1:2625188/150‑1 (MQ=255)
tttGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCgg > 1:3371162/1‑150 (MQ=255)
tttGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGAAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCgg < 1:4616618/150‑1 (MQ=255)
gTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTa > 1:1493311/1‑150 (MQ=255)
aTGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGgt < 1:3456220/150‑1 (MQ=255)
gTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGgtgt > 1:2000565/1‑150 (MQ=255)
gTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGgtgt > 1:2000560/1‑150 (MQ=255)
tAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCg > 1:2043421/1‑150 (MQ=255)
tAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCg > 1:2043681/1‑150 (MQ=255)
aaTTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTa > 1:489894/1‑150 (MQ=255)
aTTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTaa < 1:1155217/150‑1 (MQ=255)
aTTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTaa > 2:4429108/1‑150 (MQ=255)
gAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAAtgt < 2:1263087/150‑1 (MQ=255)
tttGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCa < 2:1359564/150‑1 (MQ=255)
tttGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCa < 2:3821211/150‑1 (MQ=255)
ttGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAg > 2:2900344/1‑150 (MQ=255)
ttGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAg > 2:728402/1‑150 (MQ=255)
tGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAgg > 1:3898119/1‑150 (MQ=255)
cAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGaa < 1:144443/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAAc < 2:1673893/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGATGTCGTAATGTGCAGGAAc > 1:4250358/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACa > 2:2253096/1‑150 (MQ=255)
aaaTGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAg > 2:1107752/1‑150 (MQ=255)
tGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGACAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCt > 2:3814145/1‑150 (MQ=255)
tGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCt > 2:3418677/1‑150 (MQ=255)
gAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCtt < 2:1532541/150‑1 (MQ=255)
ccACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGt > 2:1168666/1‑150 (MQ=255)
cACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTc > 1:3639615/1‑150 (MQ=255)
cACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTc > 1:3640993/1‑150 (MQ=255)
cTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCAt > 1:1050693/1‑150 (MQ=255)
tAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGa > 2:3516966/1‑150 (MQ=255)
tAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGa > 1:723096/1‑150 (MQ=255)
aGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGAc > 2:2435610/1‑150 (MQ=255)
gATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATACGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGAcc > 2:1219206/1‑150 (MQ=255)
tGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAg > 1:1968642/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGAct < 2:1072071/150‑1 (MQ=255)
aaaTATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGActct < 1:2838864/150‑1 (MQ=255)
aaTATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTg > 1:2754196/1‑150 (MQ=255)
atTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCaa > 2:2390550/1‑150 (MQ=255)
cATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAg > 1:3811240/1‑150 (MQ=255)
aTAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGt > 1:516530/1‑150 (MQ=255)
tAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCACGAAAAGTa > 2:4582775/1‑150 (MQ=255)
aaaGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTAc < 2:605725/150‑1 (MQ=255)
aaGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGACAAGTAcc > 2:3020588/1‑150 (MQ=255)
aGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCt > 1:2403678/1‑150 (MQ=255)
gTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGa < 2:707603/150‑1 (MQ=255)
gTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGa < 2:3139062/150‑1 (MQ=255)
tCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGaa > 1:558377/1‑150 (MQ=255)
tCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGaa > 2:2468112/1‑150 (MQ=255)
cATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAAt > 1:2107667/1‑150 (MQ=255)
cATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAAt > 2:2269086/1‑150 (MQ=255)
aTTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTATTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATACGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATg > 1:520960/1‑150 (MQ=255)
aTTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATg > 1:872884/1‑150 (MQ=255)
aTTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATg > 1:4633371/1‑150 (MQ=255)
ttAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGcc > 1:3205791/1‑150 (MQ=255)
tAAAGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCca > 2:4057895/1‑150 (MQ=255)
aaaGCGCAGTAATGGCGAAAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCcat > 1:2575847/1‑150 (MQ=255)
aaGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCcatc > 1:3831034/1‑150 (MQ=255)
aaGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCcatc > 1:866461/1‑150 (MQ=255)
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aaTGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATAAAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGTAACAGGCTTAAGGGTCAAGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGAACCTGAATGCCAACAACCATGCa > 1:114038/1‑150 (MQ=255)
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tGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAgg > 2:2088539/1‑150 (MQ=255)
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cGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAggcgg < 2:4104967/150‑1 (MQ=255)
gATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAggcggc > 1:1601956/1‑150 (MQ=255)
tAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCtt > 1:4277131/1‑150 (MQ=255)
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TCAAAGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCTT > CP009273/1355200‑1355498
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
