Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
134,652 |
G→T |
13.1% |
M361I (ATG→ATT) |
cueO → |
multicopper oxidase (laccase) |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 134,652 | 0 | G | T | 13.1%
| 777.7
/ 62.7
| 234 | M361I (ATG→ATT) | cueO | multicopper oxidase (laccase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (86/117); new base T (15/16); total (101/133) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.63e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCA > CP009273/134508‑134800
|
tCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATCTGATggg > 2:2141591/1‑150 (MQ=255)
tCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATggg > 2:2141620/1‑150 (MQ=255)
tCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATggg < 2:4394136/150‑1 (MQ=255)
cGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGc < 1:2007573/150‑1 (MQ=255)
aTGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACTCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATg > 2:2556856/1‑150 (MQ=255)
aTGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATg > 1:4365827/1‑150 (MQ=255)
aTGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATg > 2:276597/1‑150 (MQ=255)
aTGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATg > 1:1811946/1‑150 (MQ=255)
tGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGc < 1:3310177/150‑1 (MQ=255)
tGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGc < 1:3310023/150‑1 (MQ=255)
cGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCTTTGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTa < 1:1242665/150‑1 (MQ=255)
cGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTa < 1:926998/150‑1 (MQ=255)
gATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAAt < 2:1539934/150‑1 (MQ=255)
gATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAAt < 2:558534/150‑1 (MQ=255)
ttCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATgg < 1:187976/150‑1 (MQ=255)
aGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCATGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGgaga < 1:2590296/150‑1 (MQ=255)
ccGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGaaa > 2:1750150/1‑150 (MQ=255)
ccGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGaaa < 2:3782554/150‑1 (MQ=255)
cGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAat < 2:692361/150‑1 (MQ=255)
cGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAat > 2:3822467/1‑150 (MQ=255)
cGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAat < 2:2971356/150‑1 (MQ=255)
gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata > 1:44424/1‑150 (MQ=255)
gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata > 1:3725725/1‑150 (MQ=255)
gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata > 2:2336510/1‑150 (MQ=255)
gATAGCTATTAGTGACACCGGTGCTTTGCCATACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTACGCTGGAAGGGCTGACGGTACGAAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTAGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata > 2:2587491/1‑150 (MQ=255)
aTTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAatat < 1:2463430/150‑1 (MQ=255)
ttGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATg < 2:2766846/150‑1 (MQ=255)
tGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATgg < 1:4226605/150‑1 (MQ=255)
ttAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATc > 1:1536797/1‑150 (MQ=255)
aGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAg > 1:704515/1‑150 (MQ=255)
gTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAgg < 1:875288/150‑1 (MQ=255)
ccTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGa > 2:573053/1‑150 (MQ=255)
ggTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGcc < 1:3907727/150‑1 (MQ=255)
tGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTAAGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCgg > 1:1796998/1‑150 (MQ=255)
tttGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggat < 1:2888804/150‑1 (MQ=255)
aGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTAGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATca > 1:3690599/1‑150 (MQ=255)
gACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATcac < 1:4020724/150‑1 (MQ=255)
aTTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCa < 1:1829038/150‑1 (MQ=255)
tAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAga > 2:1159645/1‑150 (MQ=255)
tAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAga > 2:1159715/1‑150 (MQ=255)
aaGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgat < 2:615538/150‑1 (MQ=255)
gTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgatga > 1:21512/1‑150 (MQ=255)
gTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgatga > 1:2280024/1‑150 (MQ=255)
tAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTCATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgatgat > 2:1078593/1‑150 (MQ=255)
tAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgatgat > 2:243944/1‑150 (MQ=255)
aGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGatgatg > 2:1909359/1‑150 (MQ=255)
aGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGatgatg > 1:1954770/1‑150 (MQ=255)
gcctgcctGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATgg < 2:4133144/150‑1 (MQ=255)
ccttcGTTACATTCGCTTGAAGGGCTGTCGGTACGAAAGCTGCAACTCTCTCTGGACCCTATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTACTGGAGAAAGATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGTTCACAGCCAGATGATTGGCCat < 2:1856879/150‑1 (MQ=255)
cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat > 1:2664034/1‑150 (MQ=255)
cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat > 1:2663791/1‑150 (MQ=255)
cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat < 1:1929592/150‑1 (MQ=255)
cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat < 2:4225621/150‑1 (MQ=255)
ctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCata < 2:3819532/150‑1 (MQ=255)
ctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCata > 1:2758695/1‑150 (MQ=255)
gcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATg < 2:708771/150‑1 (MQ=255)
gTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATggg < 2:365851/150‑1 (MQ=255)
ttACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGTGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATgggg < 2:223472/150‑1 (MQ=255)
aCCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCa > 1:3653873/1‑150 (MQ=255)
aCCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCa < 1:691735/150‑1 (MQ=255)
ccTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCAc > 2:330821/1‑150 (MQ=255)
cGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCa < 2:2405180/150‑1 (MQ=255)
gCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCaa > 2:4174718/1‑150 (MQ=255)
gAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATg < 2:2065899/150‑1 (MQ=255)
gggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAAt < 2:21512/150‑1 (MQ=255)
gggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAAt < 2:2280024/150‑1 (MQ=255)
ggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATc < 2:1359190/150‑1 (MQ=255)
ggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATc < 2:48329/150‑1 (MQ=255)
cTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCat < 2:2368048/150‑1 (MQ=255)
cTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCat < 1:167892/150‑1 (MQ=255)
cTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCat < 1:167581/150‑1 (MQ=255)
tGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGGTCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCata > 1:2403995/1‑150 (MQ=255)
aCGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATg < 1:2168354/150‑1 (MQ=255)
aCGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATg < 2:4210722/150‑1 (MQ=255)
ggTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGaa < 1:2763899/150‑1 (MQ=255)
cGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAc < 2:2283033/150‑1 (MQ=255)
gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg < 1:2972285/150‑1 (MQ=255)
gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg > 1:2204661/1‑150 (MQ=255)
gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg < 1:1780022/150‑1 (MQ=255)
cAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcgg > 2:2583509/1‑150 (MQ=255)
cAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcgg > 2:1098578/1‑150 (MQ=255)
aaGCTGCACCTCTCGATGGACCCTATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATTGCGATCAGGCGATGGCCGTGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcggc < 2:4281701/150‑1 (MQ=255)
tGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGa < 2:278437/150‑1 (MQ=255)
tGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGa < 2:2576067/150‑1 (MQ=255)
gCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGaa < 1:1000678/150‑1 (MQ=255)
cAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAg < 2:4365827/150‑1 (MQ=255)
ctctctATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTc < 1:967745/150‑1 (MQ=255)
ctctATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGa > 2:3528266/1‑150 (MQ=255)
tATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGAttt < 2:3388894/150‑1 (MQ=255)
cccGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTccacca < 1:87497/150‑1 (MQ=255)
ccGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCAt < 1:3034169/150‑1 (MQ=255)
cGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATg < 1:3439616/150‑1 (MQ=255)
aTGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGcc > 2:2308170/1‑150 (MQ=255)
aTGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGcc > 2:1446274/1‑150 (MQ=255)
tGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCca < 1:2960934/150‑1 (MQ=255)
tGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCca > 1:3101239/1‑150 (MQ=255)
gCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCcaa > 1:747801/1‑150 (MQ=255)
gATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACaaa > 1:1487920/1‑150 (MQ=255)
atatGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACaaaa < 1:3391236/150‑1 (MQ=255)
tgatgGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCa > 2:2927028/1‑150 (MQ=255)
|
TCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCA > CP009273/134508‑134800
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
