Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F181 I0 R1
|
1262 |
323.1 |
10297870 |
97.5% |
10040423 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
134,652 |
G→T |
32.3% |
M361I (ATG→ATT) |
cueO → |
multicopper oxidase (laccase) |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 134,652 | 0 | G | T | 32.3%
| 481.2
/ 238.4
| 263 | M361I (ATG→ATT) | cueO | multicopper oxidase (laccase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (65/113); new base T (42/43); total (107/156) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.00e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
AGCCTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCA > CP009273/134504‑134800
|
aGCCTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATatga > 1:334891/1‑150 (MQ=255)
aGCCTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATatga < 1:2208255/150‑1 (MQ=255)
gCCTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATatgat < 1:5050465/150‑1 (MQ=255)
ccTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATatgatg > 1:3426812/1‑150 (MQ=255)
ccTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATatgatg < 1:1995437/150‑1 (MQ=255)
cATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATgggg < 1:4581569/150‑1 (MQ=255)
cATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATgggg < 2:3550215/150‑1 (MQ=255)
cATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATgggg < 2:4189571/150‑1 (MQ=255)
aTCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGa < 1:3613300/150‑1 (MQ=255)
ccGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATg < 2:2495944/150‑1 (MQ=255)
ccGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATg > 1:2612122/1‑150 (MQ=255)
gCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCt < 2:4180905/150‑1 (MQ=255)
cGGATTCAGCCGATTGCTATTTGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTa < 2:3341265/150‑1 (MQ=255)
gATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAAt < 1:3065091/150‑1 (MQ=255)
tCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGga < 1:2147349/150‑1 (MQ=255)
aGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGgaga > 2:187504/1‑150 (MQ=255)
gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata < 1:1386628/150‑1 (MQ=255)
gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata < 1:1386691/150‑1 (MQ=255)
gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata > 1:2811429/1‑150 (MQ=255)
gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata < 2:3107914/150‑1 (MQ=255)
tGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATgg < 1:2322246/150‑1 (MQ=255)
tGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATgg > 1:3825167/1‑150 (MQ=255)
gCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGc > 2:2822081/1‑150 (MQ=255)
tATGAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATGAAGTAGCCGGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGa < 2:2975612/150‑1 (MQ=255)
ttAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATc < 2:3436974/150‑1 (MQ=255)
ttAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATc < 1:3397304/150‑1 (MQ=255)
tAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCa > 1:3023378/1‑150 (MQ=255)
tAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCa < 2:1385881/150‑1 (MQ=255)
aGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTCATGGAGAAATATGGCGATCAg > 1:3244348/1‑150 (MQ=255)
gTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAgg > 2:427767/1‑150 (MQ=255)
gTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAgg > 2:3022661/1‑150 (MQ=255)
tGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGc > 1:1449543/1‑150 (MQ=255)
tGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGc < 2:57493/150‑1 (MQ=255)
cTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTTCCTGCGTTACCAACGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACACGATGCTCGATATGAAGGGGATGCAGCTGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGAt > 1:3114177/1‑150 (MQ=255)
cTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGAt > 1:2517730/1‑150 (MQ=255)
cTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGAt < 2:2295152/150‑1 (MQ=255)
cctgTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATgg > 2:2607376/4‑150 (MQ=255)
gTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCg < 2:199793/150‑1 (MQ=255)
gTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCg < 2:581351/150‑1 (MQ=255)
tttGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggat < 1:4821436/150‑1 (MQ=255)
ttGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggatg > 1:766397/1‑150 (MQ=255)
tGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggatgg < 2:4823648/150‑1 (MQ=255)
tGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggatgg < 1:4539426/150‑1 (MQ=255)
gCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggatgga < 1:141481/150‑1 (MQ=255)
ccAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggatggat < 1:3067195/150‑1 (MQ=255)
cAGACACATTAAGTAGCCTGCCCGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATc > 1:533407/1‑150 (MQ=255)
acacATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATcaca > 2:2390468/1‑150 (MQ=255)
acacATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATcaca > 1:706399/1‑150 (MQ=255)
acaTTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGc < 1:1296671/150‑1 (MQ=255)
caTTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGcc < 2:4882866/150‑1 (MQ=255)
aTTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCa < 2:1502394/150‑1 (MQ=255)
aTTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCa > 1:2298657/1‑150 (MQ=255)
tAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAga > 1:1158281/1‑150 (MQ=255)
aaGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGTTGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgat > 1:407282/1‑150 (MQ=255)
aaGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgat > 1:450853/1‑150 (MQ=255)
aaGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgat < 1:2404001/150‑1 (MQ=255)
gTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgatga > 1:1023381/1‑150 (MQ=255)
aGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGatgatg > 2:1619483/1‑150 (MQ=255)
cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat > 2:2651200/1‑150 (MQ=255)
cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat > 2:1893687/1‑150 (MQ=255)
cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat < 1:2865873/150‑1 (MQ=255)
tgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCatat > 2:2777451/1‑150 (MQ=255)
tgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCatat > 2:4204563/1‑150 (MQ=255)
ttACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATgggg < 2:3768083/150‑1 (MQ=255)
tACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGc > 1:613195/1‑150 (MQ=255)
aCCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCa > 2:3199708/1‑150 (MQ=255)
aCCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCa > 2:2679830/1‑150 (MQ=255)
ttCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACgg < 1:2902436/150‑1 (MQ=255)
tCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGc < 1:783320/150‑1 (MQ=255)
gCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCaa > 2:434986/1‑150 (MQ=255)
tGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAata < 1:2947780/150‑1 (MQ=255)
ggAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAatat < 2:2475378/150‑1 (MQ=255)
ggAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAatat < 2:631432/150‑1 (MQ=255)
gggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAAt > 1:4143707/1‑150 (MQ=255)
ggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATc > 1:1016331/1‑150 (MQ=255)
cTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCat < 1:1362979/150‑1 (MQ=255)
gACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCatat < 1:52494/150‑1 (MQ=255)
aCGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATg > 1:3994031/1‑150 (MQ=255)
aCGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGAGGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATg < 2:3884036/150‑1 (MQ=255)
aCGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCa < 2:503708/150‑1 (MQ=255)
gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg > 2:3691465/1‑150 (MQ=255)
gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg < 1:3018257/150‑1 (MQ=255)
gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg < 1:867980/150‑1 (MQ=255)
aaGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcggc < 1:1530463/150‑1 (MQ=255)
aaGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcggc < 2:4981796/150‑1 (MQ=255)
aGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcggcg < 1:2465625/150‑1 (MQ=255)
aGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcggcg < 2:334891/150‑1 (MQ=255)
tGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGa > 1:4862721/1‑150 (MQ=255)
tctctATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCg < 2:1031413/150‑1 (MQ=255)
ctATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGAtt > 2:43518/1‑150 (MQ=255)
tATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGAttt > 1:1458366/1‑150 (MQ=255)
aTGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTc < 2:2559157/150‑1 (MQ=255)
tGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTcc > 1:3747998/1‑150 (MQ=255)
tGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTcc < 1:4574737/150‑1 (MQ=255)
cccGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTccacca < 2:4428857/150‑1 (MQ=255)
gCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCcaa > 2:3289014/1‑150 (MQ=255)
cTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCcaac > 1:4244606/1‑150 (MQ=255)
atatTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACaaaa > 2:878777/1‑150 (MQ=255)
tattatGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTACCACCATGCCAACAAAAt > 1:4731017/1‑150 (MQ=255)
tgatgGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCa > 2:468218/1‑150 (MQ=255)
|
AGCCTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCA > CP009273/134504‑134800
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
