Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
362,629 |
A→T |
91.9% |
Y9N (TAC→AAC) |
mhpR ← |
mhp operon transcriptional activator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 362,629 | 0 | A | T | 91.9%
| 566.7
/ 33.1
| 186 | Y9N (TAC→AAC) | mhpR | mhp operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (9/6); new base T (66/105); total (75/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.68e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.26e-01 |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
TCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGTT > CP009273/362484‑362776
|
tCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGgttttgtttt < 1:1946225/148‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGgttttgtttt < 1:1129055/148‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGgttttgtttt > 1:1603943/1‑148 (MQ=255)
gCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGt < 2:2150025/148‑1 (MQ=255)
cAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTc < 2:284427/148‑1 (MQ=255)
gCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTg < 1:789752/148‑1 (MQ=255)
gCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTg < 1:2307023/148‑1 (MQ=255)
gTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCt < 2:2217566/148‑1 (MQ=255)
tctcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTc > 1:3103614/1‑148 (MQ=255)
tctcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTc > 1:1674317/1‑148 (MQ=255)
ctcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCa > 2:482519/1‑148 (MQ=255)
ctcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCa > 2:1221457/1‑148 (MQ=255)
caccAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCa < 2:3092766/146‑1 (MQ=255)
cagTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTc > 2:2343957/1‑148 (MQ=255)
cagTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTc < 1:1471607/148‑1 (MQ=255)
gccgcACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCat < 1:324914/148‑1 (MQ=255)
ccgcACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCata < 2:2812766/148‑1 (MQ=255)
acaGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTaa < 2:78565/148‑1 (MQ=255)
aGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAAtt > 2:2728270/1‑148 (MQ=255)
gtggtgCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTg > 1:2397830/1‑148 (MQ=255)
gtgCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACa < 2:1622559/148‑1 (MQ=255)
cGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACAttt < 1:1046856/148‑1 (MQ=255)
cGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACAttt < 1:1046813/148‑1 (MQ=255)
aTGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCt < 1:692517/148‑1 (MQ=255)
gCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCtat < 2:2292695/148‑1 (MQ=255)
cGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTaa < 1:458773/148‑1 (MQ=255)
cTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTaaaa < 2:746224/148‑1 (MQ=255)
cTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCAGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTaaaa < 2:738379/148‑1 (MQ=255)
tGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAaac < 2:1936673/148‑1 (MQ=255)
gAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAaaca < 1:2871990/148‑1 (MQ=255)
tCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACgt < 2:1674317/148‑1 (MQ=255)
cGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACgtgg < 1:1467632/148‑1 (MQ=255)
agcagcCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCa > 1:94144/1‑148 (MQ=255)
gcagcCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCAc < 1:1547938/148‑1 (MQ=255)
gcagcCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATCGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCAc > 2:2776434/1‑148 (MQ=255)
cagcCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCAcc < 1:1851054/148‑1 (MQ=255)
gcCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTg > 1:2565967/1‑148 (MQ=255)
cGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTg < 2:1032164/148‑1 (MQ=255)
gCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGcaca < 2:1153190/148‑1 (MQ=255)
gCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGcaca < 1:381632/148‑1 (MQ=255)
cATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGt < 2:1360374/148‑1 (MQ=255)
cAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGtttt < 1:2652000/148‑1 (MQ=255)
aaGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTtgtg > 2:2212406/1‑148 (MQ=255)
aGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGa < 2:676366/148‑1 (MQ=255)
ttatttaACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTg > 1:444024/1‑148 (MQ=255)
tttaACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAg > 2:2642356/1‑148 (MQ=255)
ttaACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGc > 1:2330146/1‑148 (MQ=255)
ttaACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGc > 2:370050/1‑148 (MQ=255)
ttaACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGc > 2:2279885/1‑148 (MQ=255)
ttaACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGc > 2:3029091/1‑148 (MQ=255)
cATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGaa > 1:2929777/1‑148 (MQ=255)
atatTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGaaa < 2:1407965/148‑1 (MQ=255)
atatTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGaaa > 2:111194/1‑148 (MQ=255)
atTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAac > 2:1068121/1‑148 (MQ=255)
atTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAac > 2:455037/1‑148 (MQ=255)
tttAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAaca > 2:921692/1‑148 (MQ=255)
tttAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAaca < 1:1503105/148‑1 (MQ=255)
taataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACAcc < 1:205888/148‑1 (MQ=255)
aataaCATTAGACCGCGGTTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACAccc < 1:3204193/148‑1 (MQ=255)
aataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACAccc < 1:1234930/148‑1 (MQ=255)
aataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACAccc > 1:1382292/1‑148 (MQ=255)
aataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACAccc > 1:1382404/1‑148 (MQ=255)
taaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCtt > 1:1167153/1‑148 (MQ=255)
taaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCtt > 1:1807300/1‑148 (MQ=255)
aCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTcc > 2:1451374/1‑148 (MQ=255)
cATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCt > 1:2958372/1‑148 (MQ=255)
cATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCt < 2:1085770/148‑1 (MQ=255)
cATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCt > 1:529800/1‑148 (MQ=255)
cATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCt < 2:2569980/148‑1 (MQ=255)
aTTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCta < 2:1488879/148‑1 (MQ=255)
aTTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCta < 1:2552046/148‑1 (MQ=255)
aTTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCta < 2:1488618/148‑1 (MQ=255)
ttAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGTTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtat < 1:2251948/148‑1 (MQ=255)
ttAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtat < 2:3023691/148‑1 (MQ=255)
ttAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtat > 1:3144422/1‑148 (MQ=255)
ttAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtat > 1:1911582/1‑148 (MQ=255)
ttAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtat < 1:2455553/148‑1 (MQ=255)
ttAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtat < 1:2258248/148‑1 (MQ=255)
tAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtata < 1:495615/148‑1 (MQ=255)
tAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTGCCtata > 1:1996340/1‑148 (MQ=255)
tAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTAATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtata < 1:1100824/148‑1 (MQ=255)
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TTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGTTT < SRR19973070.2168210/150‑1 (MQ=60)
TTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGTTTT < SRR19973070.821052/150‑1 (MQ=60)
TTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGTTTT < SRR19973070.821095/150‑1 (MQ=60)
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CTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGTTTT > CP009273/362482‑362778
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
