Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
362,629 |
A→T |
100% |
Y9N (TAC→AAC) |
mhpR ← |
mhp operon transcriptional activator |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 362,629 | 0 | A | T | 98.4%
| 978.5
/ 2.9
| 302 | Y9N (TAC→AAC) | mhpR | mhp operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/1); new base T (135/162); total (139/163) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.84e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
CTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGTTTT > CP009273/362482‑362778
|
ctTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGgttttgtttt < 1:1463163/150‑1 (MQ=255)
ctTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGgttttgtttt < 2:2977170/150‑1 (MQ=255)
ctTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGgttttgtttt < 1:2423331/150‑1 (MQ=255)
ctTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGgttttgtttt > 2:4177842/1‑150 (MQ=255)
ttCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTc > 2:927877/1‑150 (MQ=255)
tCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTcc < 1:1046054/150‑1 (MQ=255)
tcAGCTTCTCCATCAGTCGCCGAACAGTGGTGCGATTCAGGCCGCTGAGTTACGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCTGGTTAAGCCGCTCACGGTTTTGTTTTCCGTCt < 2:362410/149‑1 (MQ=255)
gctgCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGAACCGCAATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCt < 1:4271745/147‑1 (MQ=255)
gCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCt < 2:1250844/150‑1 (MQ=255)
cAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTg < 2:3756651/150‑1 (MQ=255)
cGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTc > 2:2032414/1‑150 (MQ=255)
gTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCa > 1:2920629/1‑150 (MQ=255)
gTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTGTGTTTTCCGTCTGCTCa > 2:4107233/1‑150 (MQ=255)
tctcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCAt < 2:2119279/150‑1 (MQ=255)
tctcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCAt > 1:1575020/1‑150 (MQ=255)
tctcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCAt < 2:5064259/150‑1 (MQ=255)
ctcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCAtt < 1:4139774/150‑1 (MQ=255)
gcagTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCt < 1:5166796/150‑1 (MQ=255)
cagTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTg < 2:4613900/150‑1 (MQ=255)
cagTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTg < 1:3734138/150‑1 (MQ=255)
gTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCa < 2:3276409/150‑1 (MQ=255)
gTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCa > 1:4904793/1‑150 (MQ=255)
cgcACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTa > 1:5219537/1‑150 (MQ=255)
cacaGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAAt > 2:2508159/1‑150 (MQ=255)
acaGTGGTGCGGTGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAAtt > 1:2767838/1‑150 (MQ=255)
acaGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCAtatttatt < 1:3920045/150‑1 (MQ=255)
caGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTg < 1:4685615/150‑1 (MQ=255)
caGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTg < 1:4180640/150‑1 (MQ=255)
aGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGa < 1:994578/150‑1 (MQ=255)
aGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGa > 2:3527218/1‑150 (MQ=255)
tggtgCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACa < 2:1196419/150‑1 (MQ=255)
tgCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACAttt < 1:3278449/150‑1 (MQ=255)
tgCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACAttt > 1:4977096/1‑150 (MQ=255)
gCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTc < 1:454936/150‑1 (MQ=255)
aTGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCtat < 2:4032426/150‑1 (MQ=255)
tGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCtata < 1:1483972/150‑1 (MQ=255)
aGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGtt > 1:1320386/1‑150 (MQ=255)
ggCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTa < 1:3590497/150‑1 (MQ=255)
gAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAaacaac > 1:2539581/1‑150 (MQ=255)
gAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAaacaac < 2:810198/150‑1 (MQ=255)
tCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACgtgg < 2:4442069/150‑1 (MQ=255)
ccGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACgtggt < 1:4391831/150‑1 (MQ=255)
ccAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCa < 2:4319017/150‑1 (MQ=255)
ccGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGc > 1:5054056/1‑150 (MQ=255)
cGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGca > 2:4826769/1‑150 (MQ=255)
cGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACAt < 1:2753094/150‑1 (MQ=255)
gCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACAtt < 2:3945142/150‑1 (MQ=255)
cTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTc < 2:5018729/150‑1 (MQ=255)
cGCCATCAATTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATg < 1:4589712/150‑1 (MQ=255)
cGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATg < 2:475874/150‑1 (MQ=255)
gCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGt > 1:5197094/1‑150 (MQ=255)
ccATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGtt < 1:313052/150‑1 (MQ=255)
aTCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGtttt < 2:896655/150‑1 (MQ=255)
tCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTg > 1:4113620/1‑150 (MQ=255)
aaGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGAt < 2:4861743/150‑1 (MQ=255)
aaGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGAt < 2:1340409/150‑1 (MQ=255)
aaGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGAt > 2:169952/1‑150 (MQ=255)
aGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGAtt < 2:2009486/150‑1 (MQ=255)
aGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGAtt < 1:805455/150‑1 (MQ=255)
tatttaACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAg > 1:2602841/1‑150 (MQ=255)
ttaACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCg > 2:5216038/1‑150 (MQ=255)
taACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGa > 2:1418099/1‑150 (MQ=255)
aaCATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGaa > 2:4539308/1‑150 (MQ=255)
aaCATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGaa > 1:685382/1‑150 (MQ=255)
cATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGaaaa < 2:4649134/150‑1 (MQ=255)
atatTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAac < 1:3376266/150‑1 (MQ=255)
atatTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAac < 2:1060936/150‑1 (MQ=255)
atatTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAac < 2:3075279/150‑1 (MQ=255)
tatTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAaca > 1:2468889/1‑150 (MQ=255)
ttAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACAccc < 2:24358/150‑1 (MQ=255)
ttAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACAccc > 2:4554693/1‑150 (MQ=255)
ttAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACAccc > 2:4835916/1‑150 (MQ=255)
taataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCt < 1:2841726/150‑1 (MQ=255)
taataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTATGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCt < 2:4079744/150‑1 (MQ=255)
aataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCtt > 1:624852/1‑150 (MQ=255)
aataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCtt < 2:4904797/150‑1 (MQ=255)
aataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCtt < 2:736799/150‑1 (MQ=255)
aataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCtt > 1:670999/1‑150 (MQ=255)
ataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACCTTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTc > 2:580057/1‑150 (MQ=255)
taaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTcc > 2:3388747/1‑150 (MQ=255)
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aTTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtata > 2:677847/1‑150 (MQ=255)
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ACGGTTTTGTTTTCAGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAATACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATT < SRR19973062.5239570/150‑1 (MQ=60)
GGTTTTGTTTTGCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTA > SRR19973062.2783684/1‑150 (MQ=60)
GGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTA > SRR19973062.5227142/1‑150 (MQ=60)
GGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTA < SRR19973062.938212/150‑1 (MQ=60)
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TTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGTTT < SRR19973062.1240674/150‑1 (MQ=60)
TTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGTTTT < SRR19973062.4562963/150‑1 (MQ=60)
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TCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGTTTT > CP009273/362481‑362778
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |