Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
362,629 |
A→T |
100% |
Y9N (TAC→AAC) |
mhpR ← |
mhp operon transcriptional activator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 362,629 | 0 | A | T | 97.2%
| 809.6
/ 9.0
| 249 | Y9N (TAC→AAC) | mhpR | mhp operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/3); new base T (98/143); total (102/147) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.50e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
TTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGT > CP009273/362483‑362775
|
ttCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGgttttgtttt < 1:1671279/149‑1 (MQ=255)
ttCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGgttttgtttt > 2:1606523/1‑149 (MQ=255)
ttCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGgttttgtttt < 1:1250925/149‑1 (MQ=255)
gCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTc < 1:3996667/149‑1 (MQ=255)
gCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTc < 2:2161119/149‑1 (MQ=255)
gCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTc < 1:1960489/149‑1 (MQ=255)
gCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTc < 1:313816/149‑1 (MQ=255)
cAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCt > 1:1269231/1‑149 (MQ=255)
tctcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCa > 2:1243935/1‑149 (MQ=255)
ctcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCAt < 1:3756911/149‑1 (MQ=255)
ctcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCAt < 1:282289/149‑1 (MQ=255)
tcCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCAtt < 2:351627/149‑1 (MQ=255)
cagcagTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGt < 2:2894605/149‑1 (MQ=255)
cagcagTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGt < 1:2074416/149‑1 (MQ=255)
cagcagTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGt < 1:589345/149‑1 (MQ=255)
agcagTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGtt < 2:3365655/149‑1 (MQ=255)
gcagTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTc < 2:741323/149‑1 (MQ=255)
cgccgcACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCat < 2:3422928/149‑1 (MQ=255)
cgccgcACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCat < 1:752187/149‑1 (MQ=255)
gccgcACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCata < 2:1379642/149‑1 (MQ=255)
cacaGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTaa < 2:2301084/149‑1 (MQ=255)
acaGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAAt < 1:1109580/149‑1 (MQ=255)
gtggtgCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGa > 2:1577435/1‑149 (MQ=255)
gtggtgCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGa > 2:2801662/1‑149 (MQ=255)
gtggtgCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGa < 1:3692098/149‑1 (MQ=255)
ggtgCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACa < 2:1311725/149‑1 (MQ=255)
gtgCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCAGATTAATTGACAt > 2:601170/1‑149 (MQ=255)
tgCGATGCAGGCCCCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACAtt < 2:1983037/149‑1 (MQ=255)
cGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTc < 2:2071985/149‑1 (MQ=255)
cGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTc < 2:1699684/149‑1 (MQ=255)
gCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCtata > 2:2419440/1‑149 (MQ=255)
ggCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGtt < 1:3323642/149‑1 (MQ=255)
ggCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGtt > 1:3462988/1‑149 (MQ=255)
ggCCGCTGAGTTCCACCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGtt > 1:990885/1‑149 (MQ=255)
gCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTa > 1:129676/1‑149 (MQ=255)
ccGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTaa < 2:46664/149‑1 (MQ=255)
ccGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTaa < 1:742287/149‑1 (MQ=255)
ccGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTaa < 1:2802534/149‑1 (MQ=255)
cTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAaac < 1:81864/149‑1 (MQ=255)
cTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGGCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAaac > 2:360153/1‑149 (MQ=255)
gAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAaacaa < 1:4021864/149‑1 (MQ=255)
gAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAaacaa < 1:1607187/149‑1 (MQ=255)
gAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAaacaa < 1:1437593/149‑1 (MQ=255)
aGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAaacaac < 1:298525/149‑1 (MQ=255)
ttCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACgt > 2:411184/1‑149 (MQ=255)
cGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACgtggt > 2:1191283/1‑149 (MQ=255)
cGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACgtggt < 1:2564882/149‑1 (MQ=255)
ccAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGc < 1:3242967/149‑1 (MQ=255)
cagcagCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCa < 1:348511/149‑1 (MQ=255)
gcagcCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAAAATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCAcc < 1:39207/149‑1 (MQ=255)
agcCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTg > 2:228355/1‑149 (MQ=255)
gcCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTgg < 1:3620589/149‑1 (MQ=255)
gACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGca > 2:2564414/1‑149 (MQ=255)
gCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACAt < 1:643615/149‑1 (MQ=255)
gCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACAt > 2:803368/1‑149 (MQ=255)
cTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACAtt < 2:1061484/149‑1 (MQ=255)
cTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACAtt < 2:1439399/149‑1 (MQ=255)
gCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCgg > 2:238055/1‑149 (MQ=255)
cGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCAt < 2:2952104/149‑1 (MQ=255)
gCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATg < 1:1744537/149‑1 (MQ=255)
aTCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGttt > 1:3196431/1‑149 (MQ=255)
aTCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGttt < 1:1050318/149‑1 (MQ=255)
aaGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATGTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGa > 2:1575602/1‑149 (MQ=255)
aGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGAt > 1:2617243/1‑149 (MQ=255)
aGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGAt < 2:3212398/149‑1 (MQ=255)
tttaACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGc > 1:3815387/1‑149 (MQ=255)
tttaACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGc > 1:677222/1‑149 (MQ=255)
aCATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGaa < 2:187137/149‑1 (MQ=255)
aCATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGaa > 1:1152722/1‑149 (MQ=255)
aCATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGaa < 2:2129870/149‑1 (MQ=255)
atTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAaca < 1:2659287/149‑1 (MQ=255)
ttAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACAcc > 1:1446432/1‑149 (MQ=255)
taataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACAccc > 2:3809714/1‑149 (MQ=255)
aataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCCCGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCt < 2:3926993/149‑1 (MQ=255)
aataaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCt < 2:3221505/149‑1 (MQ=255)
taaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTc > 1:2356090/1‑149 (MQ=255)
aaCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTcc > 2:884565/1‑149 (MQ=255)
aCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCt < 1:3903023/149‑1 (MQ=255)
aCATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCt < 2:1796525/149‑1 (MQ=255)
cATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCta < 1:1804148/149‑1 (MQ=255)
aTTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtat > 2:3046144/1‑149 (MQ=255)
aTTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCGTCCtat > 1:733383/1‑149 (MQ=255)
aTTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTGTTCCGTCTGCTGATTGTTCTGCATATTATTTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCAACTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtat < 2:662247/149‑1 (MQ=255)
ttAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCtata < 1:238109/149‑1 (MQ=255)
aGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACt < 1:150557/149‑1 (MQ=255)
ccGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAg > 1:3864648/1‑149 (MQ=255)
gcgGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTGTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAgcg > 2:402598/1‑149 (MQ=255)
cgGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAgcgc < 2:3666459/149‑1 (MQ=255)
gggTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGca > 1:1620270/1‑149 (MQ=255)
ggTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGcac < 1:182085/149‑1 (MQ=255)
tAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAAt < 2:2496515/149‑1 (MQ=255)
aaGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATa > 1:53617/1‑149 (MQ=255)
aGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATaa > 2:799390/1‑149 (MQ=255)
gcgcACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATaaaaaa < 2:3279115/149‑1 (MQ=255)
gcACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGAATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCAAATTCGGGCATGTTTTTATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATc < 2:3118986/149‑1 (MQ=255)
aCGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATATTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAAAACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCAt < 1:2419440/149‑1 (MQ=255)
gttttgttttCCGTCTGCTCATTGTTCTGAATATTAATTTACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTa < 1:2187617/149‑1 (MQ=255)
ttGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACAt < 1:3429353/149‑1 (MQ=255)
ttGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACAt < 2:3636842/149‑1 (MQ=255)
tGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATg < 2:2678149/149‑1 (MQ=255)
|
TTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGT > CP009273/362483‑362775
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGT > CP009273/362481‑362775
|
TCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTT < SRR19973068.3267747/150‑1 (MQ=60)
CTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTT > SRR19973068.2081167/1‑150 (MQ=60)
CTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTT < SRR19973068.2171733/150‑1 (MQ=60)
TTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTC < SRR19973068.1682061/150‑1 (MQ=60)
TTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTC < SRR19973068.1680728/150‑1 (MQ=60)
TTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTC < SRR19973068.1259196/150‑1 (MQ=60)
TTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTC < SRR19973068.1259485/150‑1 (MQ=60)
CTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGT < SRR19973068.1787316/150‑1 (MQ=60)
GCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCT < SRR19973068.315869/150‑1 (MQ=60)
GCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCT < SRR19973068.315893/150‑1 (MQ=60)
GCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCT > SRR19973068.1277265/1‑150 (MQ=60)
GCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCT > SRR19973068.1277600/1‑150 (MQ=60)
GCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCT < SRR19973068.4020825/150‑1 (MQ=60)
GCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCT < SRR19973068.1973495/150‑1 (MQ=60)
CAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTG < SRR19973068.1505495/150‑1 (MQ=60)
AGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGC > SRR19973068.3627466/1‑150 (MQ=60)
GTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCA > SRR19973068.3032917/1‑150 (MQ=60)
CTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATT > SRR19973068.749176/1‑150 (MQ=60)
CTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATT < SRR19973068.3779374/150‑1 (MQ=60)
CTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATT < SRR19973068.284231/150‑1 (MQ=60)
CAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTT < SRR19973068.2087852/150‑1 (MQ=60)
CAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTT < SRR19973068.593344/150‑1 (MQ=60)
CAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTT > SRR19973068.3985810/1‑150 (MQ=60)
AGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTC < SRR19973068.1753863/150‑1 (MQ=60)
CAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTG < SRR19973068.1442529/150‑1 (MQ=60)
CAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTG < SRR19973068.608699/150‑1 (MQ=60)
CAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTG < SRR19973068.1279638/150‑1 (MQ=60)
CAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTG < SRR19973068.3740312/150‑1 (MQ=60)
AGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGC > SRR19973068.1448821/1‑150 (MQ=60)
AGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGC > SRR19973068.1068420/1‑150 (MQ=60)
CGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATA > SRR19973068.1355200/1‑150 (MQ=60)
CGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATA < SRR19973068.757237/150‑1 (MQ=60)
CGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTA > SRR19973068.1129091/1‑150 (MQ=60)
GCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAA < SRR19973068.2413428/150‑1 (MQ=60)
CACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAAT < SRR19973068.782559/150‑1 (MQ=60)
ACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATT < SRR19973068.1116982/150‑1 (MQ=60)
AGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGA < SRR19973068.3734766/150‑1 (MQ=60)
GTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGAC < SRR19973068.3714351/150‑1 (MQ=60)
GCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAG < SRR19973068.743110/150‑1 (MQ=60)
GCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAG < SRR19973068.743214/150‑1 (MQ=60)
AGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTT > SRR19973068.3483960/1‑150 (MQ=60)
AGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTT > SRR19973068.3483944/1‑150 (MQ=60)
AGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTT > SRR19973068.3483930/1‑150 (MQ=60)
AGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTT < SRR19973068.3314713/150‑1 (MQ=60)
AGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTT < SRR19973068.1252179/150‑1 (MQ=60)
AGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTT > SRR19973068.798016/1‑150 (MQ=60)
AGGCCGCTGAGTTCCACCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTT > SRR19973068.3967193/1‑150 (MQ=60)
AGGCCGCTGAGTTCCACCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTT > SRR19973068.997397/1‑150 (MQ=60)
GGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTA < SRR19973068.3343936/150‑1 (MQ=60)
GGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTA > SRR19973068.130861/1‑150 (MQ=60)
GCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAA < SRR19973068.3639193/150‑1 (MQ=60)
CCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAA < SRR19973068.747232/150‑1 (MQ=60)
CCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAA < SRR19973068.2819948/150‑1 (MQ=60)
CTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACA < SRR19973068.82734/150‑1 (MQ=60)
GAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAAC < SRR19973068.1447002/150‑1 (MQ=60)
GAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAAC < SRR19973068.1447338/150‑1 (MQ=60)
GAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAAC < SRR19973068.4046134/150‑1 (MQ=60)
GAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAAC < SRR19973068.4045500/150‑1 (MQ=60)
GAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAAC < SRR19973068.1617684/150‑1 (MQ=60)
GAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAAC < SRR19973068.1617722/150‑1 (MQ=60)
AGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACG < SRR19973068.2388873/150‑1 (MQ=60)
AGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACG < SRR19973068.300524/150‑1 (MQ=60)
TTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTG < SRR19973068.1682615/150‑1 (MQ=60)
TTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTG > SRR19973068.2920683/1‑150 (MQ=60)
CGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTG < SRR19973068.2581131/150‑1 (MQ=60)
CCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCA < SRR19973068.3262897/150‑1 (MQ=60)
CCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCA < SRR19973068.3262840/150‑1 (MQ=60)
CAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCAC < SRR19973068.350721/150‑1 (MQ=60)
CAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCAC < SRR19973068.350719/150‑1 (MQ=60)
GCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAAAATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCT < SRR19973068.39699/150‑1 (MQ=60)
CAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTG < SRR19973068.480466/150‑1 (MQ=60)
AGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGG < SRR19973068.3381998/150‑1 (MQ=60)
GCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGT < SRR19973068.3642561/150‑1 (MQ=60)
GCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATT < SRR19973068.647828/150‑1 (MQ=60)
GGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGG < SRR19973068.3690990/150‑1 (MQ=60)
CCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCAT < SRR19973068.3857250/150‑1 (MQ=60)
CCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCAT < SRR19973068.3857241/150‑1 (MQ=60)
GCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGT < SRR19973068.1755653/150‑1 (MQ=60)
CATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTT > SRR19973068.3216097/1‑150 (MQ=60)
CATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTT > SRR19973068.647155/1‑150 (MQ=60)
ATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTT < SRR19973068.1057125/150‑1 (MQ=60)
TCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTG > SRR19973068.947445/1‑150 (MQ=60)
CAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGA > SRR19973068.893220/1‑150 (MQ=60)
AAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGAT > SRR19973068.3440630/1‑150 (MQ=60)
AAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGAT > SRR19973068.2633725/1‑150 (MQ=60)
AAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGAT > SRR19973068.2633695/1‑150 (MQ=60)
GTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTG > SRR19973068.577649/1‑150 (MQ=60)
TTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCGGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGT < SRR19973068.496568/150‑1 (MQ=60)
ATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGC > SRR19973068.681431/1‑150 (MQ=60)
ATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGC > SRR19973068.681529/1‑150 (MQ=60)
ATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGC < SRR19973068.2837431/150‑1 (MQ=60)
ATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGC > SRR19973068.166096/1‑150 (MQ=60)
ATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGC > SRR19973068.1965073/1‑150 (MQ=60)
ATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGC > SRR19973068.3838331/1‑150 (MQ=60)
AACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAA > SRR19973068.1160438/1‑150 (MQ=60)
ACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAA > SRR19973068.1986107/1‑150 (MQ=60)
ATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATagatcggaagagc > SRR19973068.3919913/1‑137 (MQ=60)
ATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACAC < SRR19973068.2675920/150‑1 (MQ=60)
TTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACC > SRR19973068.1455920/1‑150 (MQ=60)
AATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTT < SRR19973068.383305/150‑1 (MQ=60)
AATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCGGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTT < SRR19973068.294119/150‑1 (MQ=60)
ATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTC > SRR19973068.2371183/1‑150 (MQ=60)
TAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCC < SRR19973068.3889891/150‑1 (MQ=60)
ACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTA < SRR19973068.3926634/150‑1 (MQ=60)
ACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTA < SRR19973068.3926646/150‑1 (MQ=60)
CATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTAT < SRR19973068.1815972/150‑1 (MQ=60)
CATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTAT > SRR19973068.2694845/1‑150 (MQ=60)
CATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCGTCCTAT > SRR19973068.738232/1‑150 (MQ=60)
ATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATA > SRR19973068.1832006/1‑150 (MQ=60)
ATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATA > SRR19973068.1832097/1‑150 (MQ=60)
TTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATAC < SRR19973068.239863/150‑1 (MQ=60)
TTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATAC < SRR19973068.239809/150‑1 (MQ=60)
TAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACT < SRR19973068.2174245/150‑1 (MQ=60)
AGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTG < SRR19973068.151842/150‑1 (MQ=60)
AGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTG > SRR19973068.705588/1‑150 (MQ=60)
GACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGA > SRR19973068.651041/1‑150 (MQ=60)
ACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAG < SRR19973068.2174701/150‑1 (MQ=60)
ACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAG > SRR19973068.3887980/1‑150 (MQ=60)
CCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGC < SRR19973068.2521306/150‑1 (MQ=60)
CGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCG > SRR19973068.3260635/1‑150 (MQ=60)
CGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCA < SRR19973068.1617055/150‑1 (MQ=60)
CGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCA > SRR19973068.1630846/1‑150 (MQ=60)
CGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCA > SRR19973068.1630853/1‑150 (MQ=60)
GGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACA < SRR19973068.183537/150‑1 (MQ=60)
TAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGGGCGCACAATA < SRR19973068.3184815/150‑1 (MQ=60)
TAAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATA > SRR19973068.54261/1‑150 (MQ=60)
AAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAA < SRR19973068.2669703/150‑1 (MQ=60)
AAGCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAA < SRR19973068.2669727/150‑1 (MQ=60)
GCCGCGCACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAA > SRR19973068.2481133/1‑150 (MQ=60)
ACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTTTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATATTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAAAACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATT < SRR19973068.2434770/150‑1 (MQ=60)
ACGGTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATT > SRR19973068.1153568/1‑150 (MQ=60)
GTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTAC < SRR19973068.2202452/150‑1 (MQ=60)
GTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTAC < SRR19973068.2819069/150‑1 (MQ=60)
GTTTTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGAATATTAATTTACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTAC < SRR19973068.2201929/150‑1 (MQ=60)
TTGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATG < SRR19973068.3450013/150‑1 (MQ=60)
TGTTTTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGT > SRR19973068.2313377/1‑150 (MQ=60)
|
TCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGT > CP009273/362481‑362775
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
