Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,358,641 |
G→T |
100% |
I153I (ATC→ATA) |
ais ← |
putative LPS core heptose(II)‑phosphate phosphatase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,358,641 | 0 | G | T | 97.7%
| 667.2
/ 4.7
| 212 | I153I (ATC→ATA) | ais | putative LPS core heptose(II)‑phosphate phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/3); new base T (101/106); total (103/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
TTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACGATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCGACTGAATGGTCCGGACGGTATTACT > CP009273/2358496‑2358784
|
ttAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACtata < 1:1947882/148‑1 (MQ=255)
tAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTatat < 2:2683027/148‑1 (MQ=255)
aGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATAtt > 2:1606814/1‑148 (MQ=255)
gTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATAttt > 2:2344523/1‑148 (MQ=255)
gTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATAttt < 1:1747384/148‑1 (MQ=255)
gTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTGTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATAttt < 2:3477773/148‑1 (MQ=255)
tGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAATTGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATAtttt > 2:1850935/1‑148 (MQ=255)
tGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCTCGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATAtttt > 1:3301176/1‑148 (MQ=255)
tGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATAtttt > 2:1957866/1‑148 (MQ=255)
tGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATAtttt > 2:419444/1‑148 (MQ=255)
ggTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATAttttt < 2:1537234/148‑1 (MQ=255)
tAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATc > 1:9957/1‑148 (MQ=255)
tAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATc > 2:3534139/1‑148 (MQ=255)
aaCGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCa < 2:2406328/148‑1 (MQ=255)
aaCGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCa < 1:1422972/148‑1 (MQ=255)
cGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAgg > 1:581136/1‑148 (MQ=255)
aaTTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGgcg > 2:1278177/1‑148 (MQ=255)
cccATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCgctttg > 2:1433928/1‑148 (MQ=255)
ccATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCgctttgc < 1:2494350/148‑1 (MQ=255)
ccATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACGATATTTTTATCAGGCgctttgc < 2:3282790/148‑1 (MQ=255)
aTCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCgctttgctt < 2:750109/148‑1 (MQ=255)
aTCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCgctttgctt < 2:697031/148‑1 (MQ=255)
cAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGt < 2:3428340/148‑1 (MQ=255)
cAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGt < 1:3467520/148‑1 (MQ=255)
aGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTa < 1:2842938/148‑1 (MQ=255)
aGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTa > 2:141230/1‑148 (MQ=255)
gATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTaa > 1:2133777/1‑148 (MQ=255)
gATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTaa < 2:1400838/148‑1 (MQ=255)
aaCTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTcc < 2:2601637/148‑1 (MQ=255)
aCTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCt < 1:1463452/148‑1 (MQ=255)
tttGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTa < 2:254322/148‑1 (MQ=255)
ttGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTaa > 1:1576734/1‑148 (MQ=255)
gCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAAtt > 2:3449877/1‑148 (MQ=255)
ccTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGATTTGTAAGTCCTTAATTg > 1:613037/1‑148 (MQ=255)
ttttCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACTCTTATATTTATCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGATTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCAc < 1:2554644/148‑1 (MQ=255)
ttttCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGACAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCAc > 2:922016/1‑148 (MQ=255)
ttttCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCAc > 1:2363309/1‑148 (MQ=255)
ttttCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCAc > 1:850926/1‑148 (MQ=255)
ttCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACta < 1:2747622/148‑1 (MQ=255)
catgcatgACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAAt < 2:2481498/148‑1 (MQ=255)
atgcatgACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAAtc > 2:1946730/1‑148 (MQ=255)
atgcatgACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAAtc > 1:2633610/1‑148 (MQ=255)
atgcatgACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAAtc > 1:854648/1‑148 (MQ=255)
tgACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCAtt < 2:520969/148‑1 (MQ=255)
gACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTa > 2:564075/1‑148 (MQ=255)
tAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCg < 1:3234701/148‑1 (MQ=255)
tAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCg < 1:3235949/148‑1 (MQ=255)
aaaCCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGc < 1:180965/148‑1 (MQ=255)
aaaCCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGc < 1:167604/148‑1 (MQ=255)
aaCCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCa < 2:796601/148‑1 (MQ=255)
cATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTg < 1:969715/148‑1 (MQ=255)
tCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTgaa > 1:1362840/1‑148 (MQ=255)
ccAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTgaag > 1:3383783/1‑148 (MQ=255)
aTCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGt < 2:1071310/148‑1 (MQ=255)
tCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGTGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGtt > 1:3445728/1‑148 (MQ=255)
tCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGtt > 2:411688/1‑148 (MQ=255)
aGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTa < 2:1184398/148‑1 (MQ=255)
ggTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTAt < 1:836550/148‑1 (MQ=255)
ggTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTAt < 2:45143/148‑1 (MQ=255)
gTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATc > 1:3091852/1‑148 (MQ=255)
ttAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTa < 1:2819084/148‑1 (MQ=255)
aTGTCGCGTTACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGt > 1:663134/1‑148 (MQ=255)
aTGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGt > 1:1882786/1‑148 (MQ=255)
tGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTc > 2:3213027/1‑148 (MQ=255)
cgcgTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAAt > 2:259060/1‑148 (MQ=255)
cgTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAAttt < 2:2196313/148‑1 (MQ=255)
cgTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAAttt < 2:2196788/148‑1 (MQ=255)
cgTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAAttt < 1:1451492/148‑1 (MQ=255)
gTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAAtttt < 1:2767983/148‑1 (MQ=255)
gTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAAtttt < 1:2630448/148‑1 (MQ=255)
gCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTAcc > 2:2660413/1‑148 (MQ=255)
gCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTAcc > 1:184130/1‑148 (MQ=255)
cTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTAccc > 1:1051737/1‑148 (MQ=255)
tATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGc > 2:2323482/1‑148 (MQ=255)
tttAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGaa < 1:2260455/148‑1 (MQ=255)
gCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAAcc > 1:2189283/1‑148 (MQ=255)
cAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCa < 1:2452228/148‑1 (MQ=255)
atatatGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAgg < 2:2229279/148‑1 (MQ=255)
tatatGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGt < 2:1482485/148‑1 (MQ=255)
atGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGc < 2:691048/148‑1 (MQ=255)
tGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGcc > 2:2808008/1‑148 (MQ=255)
gTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCg > 2:1471351/1‑148 (MQ=255)
gTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCAGAAAACCAGGTAGCCg > 1:111089/1‑148 (MQ=255)
tCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCGa < 1:3482919/148‑1 (MQ=255)
tCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCGa < 1:1723398/148‑1 (MQ=255)
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gCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCGACTGa < 2:2133646/148‑1 (MQ=255)
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AAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGT > SRR19973067.1895638/1‑150 (MQ=60)
AATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTC > SRR19973067.2838900/1‑150 (MQ=60)
AATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCGTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTTAAGAAGTCGTTTATATAACGTC > SRR19973067.1542399/1‑150 (MQ=60)
ATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCA > SRR19973067.2875206/1‑150 (MQ=60)
TCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATT > SRR19973067.3212637/1‑150 (MQ=60)
CGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTT < SRR19973067.1461216/150‑1 (MQ=60)
GTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTT < SRR19973067.2785869/150‑1 (MQ=60)
GTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTT < SRR19973067.2647484/150‑1 (MQ=60)
ACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACC > SRR19973067.185584/1‑150 (MQ=60)
CNCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCC > SRR19973067.1058951/1‑150 (MQ=60)
TTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAA < SRR19973067.856847/150‑1 (MQ=60)
TTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAA < SRR19973067.2275450/150‑1 (MQ=60)
TTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAA < SRR19973067.2648212/150‑1 (MQ=60)
TTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAATAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTTCCCGCTGAAAAC > SRR19973067.575256/1‑150 (MQ=60)
TAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACC > SRR19973067.2203897/1‑150 (MQ=60)
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CAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGG < SRR19973067.2468348/150‑1 (MQ=60)
CAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGG < SRR19973067.1896679/150‑1 (MQ=60)
TATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTAACGTCAATTTTTTACACGCTGAAAACCAGGTAGCC > SRR19973067.845581/1‑150 (MQ=60)
ATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCG > SRR19973067.1903515/1‑150 (MQ=60)
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TCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCGACT < SRR19973067.1735208/150‑1 (MQ=60)
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CAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCGACTG > SRR19973067.2904868/1‑150 (MQ=60)
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ATGATTATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAAACAGGTAGCCGACTGAATGGT > SRR19973067.2045315/1‑150 (MQ=60)
TATGGGTGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAAACAGGTAGCCGACTGAATGGTCCGGA > SRR19973067.3161474/1‑150 (MQ=60)
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TGAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTAACCGCTGAAAAACAGGTAGCCGACTGAAGGGTCCGGACGGTAT > SRR19973067.3469333/1‑150 (MQ=60)
GAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCGACTGAATGGTCCGGACGGTATT < SRR19973067.1374247/150‑1 (MQ=60)
GAAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCGACTGAATGGTCCGGACGGTATT < SRR19973067.3154353/150‑1 (MQ=60)
AAAATAACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCGACTGAATGGTCCGGACGGTATTA > SRR19973067.1711748/1‑150 (MQ=60)
AACTATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCGACTTAATGGTCCGGACGGTATTACTGGA > SRR19973067.1762662/1‑150 (MQ=60)
|
AAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCACATGCATGACTAAACCATCCAGATAATCAGGTTTAAATGTCGCGTCACGCTTATCTTTAGCAATATATGTCAGGCAATGATTATGGGTGAAAATAACGATATTTTTATCAGGCGCTTTGCTTTGTAAGTCCTTAATTGCACTATAAATCTCATTACCGCACTGAAGAAGTCGTTTATCTACCGTCAATTTTTTACCCGCTGAAAACCAGGTAGCCGACTGAATGGTCCGGACGGTATTACTGGA > CP009273/2358492‑2358787
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
