Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
658,096 |
C→A |
59.9% |
M1M (ATG→ATT) † |
ybeD ← |
UPF0250 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 658,096 | 0 | C | A | 59.9%
| 69.3
/ 315.6
| 234 | M1M (ATG→ATT) † | ybeD | UPF0250 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/54); new base A (64/76); total (104/130) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.88e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
CTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGT > CP009273/657950‑658242
|
tGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATg > 1:1170534/1‑148 (MQ=255)
tGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATg < 1:3004115/148‑1 (MQ=255)
ggTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGt < 2:939344/148‑1 (MQ=255)
ggTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGt < 2:3122218/148‑1 (MQ=255)
ttGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGc > 1:3549953/1‑148 (MQ=255)
gtAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcgtaacgt > 1:2162152/1‑148 (MQ=255)
gTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGACCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAAt > 1:133915/1‑148 (MQ=255)
aCCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTaa < 1:849172/148‑1 (MQ=255)
tcgcgcAGCGCGCTGGACCACGTCAACCACCAGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCCAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATa < 1:2132912/146‑1 (MQ=255)
gcgcATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGc > 2:1880871/1‑148 (MQ=255)
cgcATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCa < 1:1070218/148‑1 (MQ=255)
ggCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTcc < 1:2510436/148‑1 (MQ=255)
aCCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGaa < 2:3189516/148‑1 (MQ=255)
cACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAgg < 2:2455258/148‑1 (MQ=255)
cACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAgg < 1:1029253/148‑1 (MQ=255)
cACGTCAACCTCCTGATCAACCAGCTCATGTAACTCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGTTGTAGGGAATTCAAGCATTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCCGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCATCTCCCGCCATAAgg < 2:1132818/148‑1 (MQ=255)
aCTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGc > 2:1468436/1‑148 (MQ=255)
cTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCg > 1:2602953/1‑148 (MQ=255)
ttCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCgg < 2:2298698/148‑1 (MQ=255)
ttCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCgg < 2:806190/148‑1 (MQ=255)
accaccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGt > 2:1350689/1‑148 (MQ=255)
accaccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGt > 2:1350916/1‑148 (MQ=255)
accaccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGt < 1:2745035/148‑1 (MQ=255)
ccaccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAttt > 1:3006417/1‑148 (MQ=255)
ccaccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGtt > 1:612867/1‑148 (MQ=255)
ccaccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGtt > 2:2337007/1‑148 (MQ=255)
caccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGttt > 2:2866837/1‑148 (MQ=255)
caccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGttt < 2:3184288/148‑1 (MQ=255)
caccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGttt > 2:436892/1‑148 (MQ=255)
caccTGAACAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGttt < 1:341276/148‑1 (MQ=255)
accTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGtttt < 1:1839656/148‑1 (MQ=255)
accTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGtttt < 1:1718335/148‑1 (MQ=255)
accTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGtttt > 1:1659934/1‑148 (MQ=255)
gATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTAc > 2:2160447/1‑148 (MQ=255)
gATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTAc > 1:2491751/1‑148 (MQ=255)
tCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTg > 2:3024838/1‑148 (MQ=255)
cAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGa < 2:11576/148‑1 (MQ=255)
aCCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATg > 1:2811484/1‑148 (MQ=255)
cAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCt < 2:387967/148‑1 (MQ=255)
aGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCtt < 2:2912646/148‑1 (MQ=255)
aGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGtat < 2:2764765/148‑1 (MQ=255)
gTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTatat < 2:1843344/148‑1 (MQ=255)
gTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTatat > 2:1401964/1‑148 (MQ=255)
gCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGa > 1:1422859/1‑148 (MQ=255)
cccATAACTGTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGaaa < 2:3344524/148‑1 (MQ=255)
ccATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAt > 1:376191/1‑148 (MQ=255)
ccATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAt > 1:2052618/1‑148 (MQ=255)
ccATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAt < 2:2811484/148‑1 (MQ=255)
cATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAGTTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAAATCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAtt > 1:1913884/1‑148 (MQ=255)
cATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAtt < 2:2126016/148‑1 (MQ=255)
tAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTac > 1:1062213/1‑148 (MQ=255)
tAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTac < 1:1127179/148‑1 (MQ=255)
tAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTac < 2:1557287/148‑1 (MQ=255)
aCTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTacac < 1:1798374/148‑1 (MQ=255)
cTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACt > 2:623287/1‑148 (MQ=255)
tttGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGATTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACtt < 2:2230481/148‑1 (MQ=255)
ttGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACttt > 1:418522/1‑148 (MQ=255)
taagtaaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCaa > 2:1686490/1‑148 (MQ=255)
agtaaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAgt > 2:1214022/1‑148 (MQ=255)
taaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTGTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAgtgt < 2:3536685/148‑1 (MQ=255)
aaaGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGttt > 2:324021/1‑148 (MQ=255)
aGGTGTAGGGAATTCACGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCTGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTaa < 1:3493168/148‑1 (MQ=255)
aGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTaa < 1:892285/148‑1 (MQ=255)
ggAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAt > 1:3080098/1‑148 (MQ=255)
tAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAttttt > 2:3478493/1‑148 (MQ=255)
aGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTa < 1:1350943/148‑1 (MQ=255)
aGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTa < 1:1350699/148‑1 (MQ=255)
ggAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAAATCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTAAACTTTCAAGTGTTTAATTTTTaac > 2:3137330/1‑148 (MQ=255)
ttCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTaaccaaa > 1:286409/1‑148 (MQ=255)
ttCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTaaccaaa < 1:1468436/148‑1 (MQ=255)
tCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTaaccaaac > 1:1680605/1‑148 (MQ=255)
aaGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTaaccaaacca < 2:376191/148‑1 (MQ=255)
gCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGt > 1:2315825/1‑148 (MQ=255)
cAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTg > 2:2302540/1‑148 (MQ=255)
cAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGCCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTg < 1:3450484/148‑1 (MQ=255)
cAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTg < 1:2106698/148‑1 (MQ=255)
gTTCGTTAAGTTTGTTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGAt < 1:757257/148‑1 (MQ=255)
gTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGAt < 2:2966641/148‑1 (MQ=255)
ttCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGAGATg > 1:2386569/1‑148 (MQ=255)
ttCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATg < 2:1594057/148‑1 (MQ=255)
tCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATgg < 1:1483080/148‑1 (MQ=255)
gTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGaa < 1:1334939/148‑1 (MQ=255)
gTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGaa < 1:3108192/148‑1 (MQ=255)
gTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGaa < 1:3162443/148‑1 (MQ=255)
gTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGaa < 1:1387317/148‑1 (MQ=255)
tAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACa < 1:1085984/148‑1 (MQ=255)
tAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACa < 1:206509/148‑1 (MQ=255)
tAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAAATAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTATCCAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACa > 2:721582/1‑148 (MQ=255)
aaGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAt < 2:1328553/148‑1 (MQ=255)
tttGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaa < 1:2237083/148‑1 (MQ=255)
tttGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaa < 1:2565333/148‑1 (MQ=255)
ttGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAtta > 1:1309415/1‑146 (MQ=255)
ttGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaat > 1:337857/1‑148 (MQ=255)
tGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaatt > 2:3139840/1‑148 (MQ=255)
ttttAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGACCAttaatgtac > 2:1940346/1‑147 (MQ=255)
ttttAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaatttaa > 2:2502783/1‑148 (MQ=255)
ttttAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaatttaa > 2:713565/1‑148 (MQ=255)
tttAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaatttaat < 1:2191623/148‑1 (MQ=255)
tgtCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaatttaat < 2:1580306/146‑1 (MQ=255)
tCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGt < 2:2052618/148‑1 (MQ=255)
|
CTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGT > CP009273/657950‑658242
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGT > CP009273/657950‑658242
|
CTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATG > SRR19973066.1450087/1‑150 (MQ=60)
CTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATG > SRR19973066.1178802/1‑150 (MQ=60)
TGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTC < SRR19973066.3024092/150‑1 (MQ=60)
GGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCA > SRR19973066.1920396/1‑150 (MQ=60)
GGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCA < SRR19973066.1093789/150‑1 (MQ=60)
GGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCA < SRR19973066.1093790/150‑1 (MQ=60)
TTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCT < SRR19973066.712142/150‑1 (MQ=60)
TACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTGTAATGTCAGCTCC > SRR19973066.2217924/1‑150 (MQ=60)
CGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGACTTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTATTGTCAGCTCCGGC > SRR19973066.3573296/1‑150 (MQ=60)
CGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGC > SRR19973066.260744/1‑150 (MQ=60)
CGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGC > SRR19973066.2073530/1‑150 (MQ=60)
CGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGC > SRR19973066.3573515/1‑150 (MQ=60)
TTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGT < SRR19973066.1377147/150‑1 (MQ=60)
GTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGT > SRR19973066.2177176/1‑150 (MQ=60)
GTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGT > SRR19973066.11765/1‑150 (MQ=60)
GTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGGTCGTTCAGTGTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGG > SRR19973066.2176705/1‑150 (MQ=60)
TAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGACCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAAT > SRR19973066.135222/1‑150 (MQ=60)
ACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAAT < SRR19973066.327133/150‑1 (MQ=60)
ACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAAT < SRR19973066.855321/150‑1 (MQ=60)
tcgcgcagcGCGCTGGACCACGTCAACCACCAGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCCAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGC < SRR19973066.2147695/141‑1 (MQ=60)
TGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGC > SRR19973066.374474/1‑150 (MQ=60)
CGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAAC < SRR19973066.1078065/150‑1 (MQ=60)
GGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCG < SRR19973066.2527520/150‑1 (MQ=60)
GCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCA > SRR19973066.1789764/1‑150 (MQ=60)
TACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAG < SRR19973066.3025904/150‑1 (MQ=60)
CACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCG > SRR19973066.2620557/1‑150 (MQ=60)
CACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCG > SRR19973066.3491718/1‑150 (MQ=60)
CACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCG < SRR19973066.1036833/150‑1 (MQ=60)
CACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCG < SRR19973066.2043804/150‑1 (MQ=60)
ACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTATGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGG < SRR19973066.1253969/150‑1 (MQ=60)
CTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGG > SRR19973066.909381/1‑150 (MQ=60)
AACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGATTT > SRR19973066.3026412/1‑150 (MQ=60)
AACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTT > SRR19973066.617148/1‑150 (MQ=60)
AACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTT > SRR19973066.617149/1‑150 (MQ=60)
AACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTT > SRR19973066.1682500/1‑150 (MQ=60)
ACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTT < SRR19973066.2763502/150‑1 (MQ=60)
CCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTT > SRR19973066.1672031/1‑150 (MQ=60)
CCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTT > SRR19973066.2878021/1‑150 (MQ=60)
CACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTT > SRR19973066.1969916/1‑150 (MQ=60)
CACCTGAACAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTT < SRR19973066.343911/150‑1 (MQ=60)
ACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTT < SRR19973066.1730786/150‑1 (MQ=60)
ACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTT < SRR19973066.1852803/150‑1 (MQ=60)
CTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTAC > SRR19973066.2508745/1‑150 (MQ=60)
CTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTAC > SRR19973066.313059/1‑150 (MQ=60)
TGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACT > SRR19973066.2517530/1‑150 (MQ=60)
GATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTG < SRR19973066.2775183/150‑1 (MQ=60)
CAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATG > SRR19973066.2830394/1‑150 (MQ=60)
ACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCT < SRR19973066.2610440/150‑1 (MQ=60)
CCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTT < SRR19973066.1072633/150‑1 (MQ=60)
CCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTT > SRR19973066.877344/1‑150 (MQ=60)
CAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTA < SRR19973066.1710554/150‑1 (MQ=60)
CTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTA > SRR19973066.1579240/1‑150 (MQ=60)
CTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTA > SRR19973066.1578888/1‑150 (MQ=60)
CAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATA < SRR19973066.2495047/150‑1 (MQ=60)
CTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGA > SRR19973066.1433037/1‑150 (MQ=60)
CCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCTTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACAACCGCCAGAAGGCGCGAGTTTTTTACTGATTCTTAGAATATGGGGACGGAAAT > SRR19973066.1978530/1‑150 (MQ=60)
CCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGTGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAT > SRR19973066.379145/1‑150 (MQ=60)
CCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAT > SRR19973066.2066873/1‑150 (MQ=60)
CCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAGTTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAAATCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATT > SRR19973066.1927510/1‑150 (MQ=60)
CCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATT < SRR19973066.1310501/150‑1 (MQ=60)
CATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTAC > SRR19973066.1069468/1‑150 (MQ=60)
CATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTAC > SRR19973066.1070003/1‑150 (MQ=60)
ATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACA > SRR19973066.741948/1‑150 (MQ=60)
TAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACAC < SRR19973066.1135278/150‑1 (MQ=60)
ACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTT < SRR19973066.2327643/150‑1 (MQ=60)
ACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTT < SRR19973066.1811160/150‑1 (MQ=60)
CTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTT > SRR19973066.421784/1‑150 (MQ=60)
GTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAG > SRR19973066.2177622/1‑150 (MQ=60)
TAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGT < SRR19973066.2751760/150‑1 (MQ=60)
AAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTG > SRR19973066.387119/1‑150 (MQ=60)
AAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTG < SRR19973066.3423167/150‑1 (MQ=60)
AAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTG < SRR19973066.309253/150‑1 (MQ=60)
AAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTA < SRR19973066.815642/150‑1 (MQ=60)
AAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTA < SRR19973066.3437438/150‑1 (MQ=60)
AAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAT > SRR19973066.3100672/1‑150 (MQ=60)
AAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAT < SRR19973066.3002487/150‑1 (MQ=60)
AAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAT < SRR19973066.1740444/150‑1 (MQ=60)
AGGTGTAGGGAATTCACGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCTGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATT < SRR19973066.3516465/150‑1 (MQ=60)
AGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATT < SRR19973066.898602/150‑1 (MQ=60)
AGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTT > SRR19973066.2142949/1‑150 (MQ=60)
AGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAAC < SRR19973066.1360038/150‑1 (MQ=60)
AGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAAC < SRR19973066.1360477/150‑1 (MQ=60)
AGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAAC < SRR19973066.1360487/150‑1 (MQ=60)
AGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAAC < SRR19973066.2456924/150‑1 (MQ=60)
AGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAAC < SRR19973066.1360732/150‑1 (MQ=60)
AGGGAAGTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAAC < SRR19973066.1360705/150‑1 (MQ=60)
GGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAANC < SRR19973066.1814247/150‑1 (MQ=60)
AATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAA > SRR19973066.288469/1‑150 (MQ=60)
AATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAA > SRR19973066.288476/1‑150 (MQ=60)
ATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAAC > SRR19973066.1692836/1‑150 (MQ=60)
TTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACC < SRR19973066.1478794/150‑1 (MQ=60)
TCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCA < SRR19973066.2222420/150‑1 (MQ=60)
AAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGT > SRR19973066.2331668/1‑150 (MQ=60)
AAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGT > SRR19973066.3487298/1‑150 (MQ=60)
GCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGA < SRR19973066.2352932/150‑1 (MQ=60)
CAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGAT > SRR19973066.3059594/1‑150 (MQ=60)
CAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGAT < SRR19973066.2553262/150‑1 (MQ=60)
CAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGCCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGAT < SRR19973066.3473555/150‑1 (MQ=60)
CAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGAT < SRR19973066.2128823/150‑1 (MQ=60)
CAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGAT < SRR19973066.2121226/150‑1 (MQ=60)
CAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGAT < SRR19973066.2121230/150‑1 (MQ=60)
AGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGAGATG > SRR19973066.2402649/1‑150 (MQ=60)
GTTCGTTAAGTTTGTTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGG < SRR19973066.762867/150‑1 (MQ=60)
TCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAA < SRR19973066.1493493/150‑1 (MQ=60)
CGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTTATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGAGGGAGTTTTTTACTTATGCTTAGTATATGGGTACTGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAAC < SRR19973066.3169430/150‑1 (MQ=60)
GTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACA < SRR19973066.1344624/150‑1 (MQ=60)
GTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACA < SRR19973066.1344630/150‑1 (MQ=60)
GTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACA < SRR19973066.1344639/150‑1 (MQ=60)
GTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACA < SRR19973066.1397338/150‑1 (MQ=60)
GTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACA < SRR19973066.3128951/150‑1 (MQ=60)
GTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACA < SRR19973066.3183507/150‑1 (MQ=60)
TAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATT < SRR19973066.1097115/150‑1 (MQ=60)
TAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATT < SRR19973066.1093908/150‑1 (MQ=60)
TAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATT < SRR19973066.208243/150‑1 (MQ=60)
GTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAAT > SRR19973066.1318916/1‑150 (MQ=60)
GTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAAT > SRR19973066.340456/1‑150 (MQ=60)
TTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATT < SRR19973066.2582743/150‑1 (MQ=60)
TTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATT < SRR19973066.1399960/150‑1 (MQ=60)
TTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATT < SRR19973066.2252512/150‑1 (MQ=60)
TTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATT < SRR19973066.1399882/150‑1 (MQ=60)
TTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATT < SRR19973066.217459/150‑1 (MQ=60)
TGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTA > SRR19973066.384505/1‑150 (MQ=60)
TTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATG < SRR19973066.1491477/150‑1 (MQ=60)
TTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATG < SRR19973066.3273588/150‑1 (MQ=60)
TTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGT < SRR19973066.2206826/150‑1 (MQ=60)
|
CTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGT > CP009273/657950‑658242
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
