Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
658,096 |
C→A |
100% |
M1M (ATG→ATT) † |
ybeD ← |
UPF0250 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 658,096 | 0 | C | A | 96.3%
| 619.2
/ 12.2
| 204 | M1M (ATG→ATT) † | ybeD | UPF0250 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/4); new base A (81/115); total (85/119) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.21e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
TTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAAT > CP009273/657951‑658240
|
ttGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAAt < 2:791526/148‑1 (MQ=255)
ttGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAAt < 1:1237730/148‑1 (MQ=255)
ttGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAAt > 2:122042/1‑148 (MQ=255)
tGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGGTTGGTTTTAATg > 2:1642861/1‑148 (MQ=255)
gTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTc > 1:3444689/1‑148 (MQ=255)
ttttACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCa < 2:1645227/148‑1 (MQ=255)
ttttACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCa < 1:1382313/148‑1 (MQ=255)
tttACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAg < 1:218832/148‑1 (MQ=255)
aCCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTc > 1:2601788/1‑148 (MQ=255)
aCCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTc > 1:382894/1‑148 (MQ=255)
cGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCg < 1:220685/148‑1 (MQ=255)
gggTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCTCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcgta < 1:2467912/148‑1 (MQ=255)
gggTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcgta > 2:2514991/1‑148 (MQ=255)
gtAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcgtaacgt < 2:2869266/148‑1 (MQ=255)
aGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcgtaacgtaa < 1:404879/148‑1 (MQ=255)
tCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAAtt > 1:2902144/1‑148 (MQ=255)
ccTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGGAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTaaa > 2:3029299/1‑148 (MQ=255)
cTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAAt < 2:1530588/148‑1 (MQ=255)
ggCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAg > 2:2259196/1‑148 (MQ=255)
gcATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCaa < 1:32517/148‑1 (MQ=255)
cATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAAc > 2:2362646/1‑148 (MQ=255)
aTGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACt > 1:2665240/1‑148 (MQ=255)
tGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTc > 2:323493/1‑148 (MQ=255)
tGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTc < 2:25776/148‑1 (MQ=255)
tGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTc < 1:2022258/148‑1 (MQ=255)
ggCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTcc < 1:76993/148‑1 (MQ=255)
ggCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTcc < 2:761852/148‑1 (MQ=255)
gcTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTATGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGc < 2:3324456/148‑1 (MQ=255)
gcTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGc < 2:3185407/148‑1 (MQ=255)
tACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGa > 2:1182902/1‑148 (MQ=255)
tACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGa > 2:522990/1‑148 (MQ=255)
ccACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAg < 2:2833597/148‑1 (MQ=255)
ccACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAg < 2:3284390/148‑1 (MQ=255)
ttCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCgg > 1:1096837/1‑148 (MQ=255)
accaccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGt < 1:2060820/148‑1 (MQ=255)
accTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGtttt > 1:2262668/1‑148 (MQ=255)
accTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGtttt < 1:2818275/148‑1 (MQ=255)
tGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTa < 1:122042/148‑1 (MQ=255)
gATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTAc < 2:1518745/148‑1 (MQ=255)
aaCCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGAt < 1:1370342/148‑1 (MQ=255)
aCCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATg > 2:2258627/1‑148 (MQ=255)
aCCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATg > 1:272665/1‑148 (MQ=255)
ccAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGc > 1:75219/1‑148 (MQ=255)
cAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCt < 2:2139129/148‑1 (MQ=255)
aGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCtt > 2:3466894/1‑148 (MQ=255)
gCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTa < 2:1745021/148‑1 (MQ=255)
gCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTa < 1:3036281/148‑1 (MQ=255)
tCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGt < 1:211473/148‑1 (MQ=255)
cAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGta > 1:2391450/1‑148 (MQ=255)
aGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGtat < 2:589578/148‑1 (MQ=255)
aGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGtat < 1:1308940/148‑1 (MQ=255)
gTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTatat < 1:1013791/148‑1 (MQ=255)
gTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTatat > 2:340175/1‑148 (MQ=255)
cGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATgggg > 1:988141/1‑148 (MQ=255)
gCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGa < 1:1114270/148‑1 (MQ=255)
ccTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGAc > 2:2625852/1‑148 (MQ=255)
tGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACgg < 1:3314124/148‑1 (MQ=255)
cccATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGaaa < 2:2946751/148‑1 (MQ=255)
cccATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGaaa < 2:2244368/148‑1 (MQ=255)
cccATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTATGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGaaa < 2:2069727/148‑1 (MQ=255)
ccATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAt < 1:3123241/148‑1 (MQ=255)
cATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAtt > 2:2956970/1‑148 (MQ=255)
cATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAtt > 1:810608/1‑148 (MQ=255)
aTAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTa > 1:1610132/1‑148 (MQ=255)
aaCTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTaca < 1:2362646/148‑1 (MQ=255)
cTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACt > 1:2528924/1‑148 (MQ=255)
tGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTc < 1:1695270/148‑1 (MQ=255)
gtaagtaaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCa > 2:39583/1‑148 (MQ=255)
taagtaaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCaa < 2:2336502/148‑1 (MQ=255)
gtaaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAgtg > 2:2662042/1‑148 (MQ=255)
gtaaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAgtg > 1:1174852/1‑148 (MQ=255)
taaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAgtgt > 1:2501817/1‑148 (MQ=255)
taaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAAGGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAgtgt < 2:3109305/148‑1 (MQ=255)
aaaGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGttt < 2:527805/148‑1 (MQ=255)
aaaGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTAATGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGttt < 1:1485358/148‑1 (MQ=255)
ggAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAt > 1:181751/1‑148 (MQ=255)
gAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAtt > 1:234839/1‑148 (MQ=255)
tAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACttt > 1:2632288/1‑132 (MQ=255)
aGGGAATTCACGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCGCCGGCGTAACGTAATTAAAGAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTa < 2:2810314/148‑1 (MQ=255)
aGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTa < 1:2505023/148‑1 (MQ=255)
ggAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTaac < 2:1832487/148‑1 (MQ=255)
ggAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTaac > 1:618010/1‑148 (MQ=255)
ttCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTATTTTTTaaccaaa > 1:2138353/1‑148 (MQ=255)
ttCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTaaccaaa < 2:542074/148‑1 (MQ=255)
ttCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTaaccaaa < 2:1201058/148‑1 (MQ=255)
gCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGt > 2:3264776/1‑148 (MQ=255)
gCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGt > 1:492627/1‑148 (MQ=255)
cAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTg > 2:2087025/1‑148 (MQ=255)
ttCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATg > 2:244662/1‑148 (MQ=255)
ttCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATg > 2:1331135/1‑148 (MQ=255)
cGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGa < 2:2918604/148‑1 (MQ=255)
ttAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAAc < 1:953212/148‑1 (MQ=255)
tAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACa > 2:3089084/1‑148 (MQ=255)
tAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACa < 1:2258627/148‑1 (MQ=255)
aGTTTGGTTTTAATGTCATCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAtt < 2:3266256/148‑1 (MQ=255)
tttGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACTTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaa < 1:2956970/148‑1 (MQ=255)
ggTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaattt < 1:323493/148‑1 (MQ=255)
ggTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaattt > 2:2986881/1‑148 (MQ=255)
gTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaattta < 1:1653544/148‑1 (MQ=255)
gTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaattta < 1:3003781/148‑1 (MQ=255)
|
TTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAAT > CP009273/657951‑658240
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGCTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGTAAT > CP009273/657947‑658245
|
CTGCTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTA > SRR19973065.1132501/1‑150 (MQ=60)
CTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATG < SRR19973065.2046417/150‑1 (MQ=60)
CTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATG < SRR19973065.2047328/150‑1 (MQ=60)
TTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGT < SRR19973065.1245852/150‑1 (MQ=60)
TGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTC > SRR19973065.3465693/1‑150 (MQ=60)
GTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTCGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAG > SRR19973065.1232581/1‑150 (MQ=60)
TTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGC < SRR19973065.1391413/150‑1 (MQ=60)
TTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGC < SRR19973065.1391159/150‑1 (MQ=60)
TTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCT < SRR19973065.220464/150‑1 (MQ=60)
TTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCT < SRR19973065.220374/150‑1 (MQ=60)
TTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTC > SRR19973065.385571/1‑150 (MQ=60)
TTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTC > SRR19973065.2617947/1‑150 (MQ=60)
CGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGC < SRR19973065.222328/150‑1 (MQ=60)
GGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCTCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAAC < SRR19973065.2483461/150‑1 (MQ=60)
GGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAAC < SRR19973065.1694726/150‑1 (MQ=60)
GTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGT > SRR19973065.1222645/1‑150 (MQ=60)
AGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATT > SRR19973065.2047674/1‑150 (MQ=60)
AGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATT < SRR19973065.252155/150‑1 (MQ=60)
AGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATT > SRR19973065.2919845/1‑150 (MQ=60)
AGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATT < SRR19973065.407711/150‑1 (MQ=60)
AGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATT > SRR19973065.1544069/1‑150 (MQ=60)
ACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAAT < SRR19973065.1097309/150‑1 (MQ=60)
TGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGC > SRR19973065.3263347/1‑150 (MQ=60)
CGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAAC < SRR19973065.333056/150‑1 (MQ=60)
GCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACT > SRR19973065.2681734/1‑150 (MQ=60)
GCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACT < SRR19973065.32924/150‑1 (MQ=60)
GCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACT < SRR19973065.188012/150‑1 (MQ=60)
GCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACT < SRR19973065.2513475/150‑1 (MQ=60)
GCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACT > SRR19973065.2477125/1‑150 (MQ=60)
TGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCC < SRR19973065.286357/150‑1 (MQ=60)
TGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCC < SRR19973065.2035265/150‑1 (MQ=60)
GGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCG < SRR19973065.77775/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCC > SRR19973065.3462861/1‑150 (MQ=60)
CGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCC > SRR19973065.795440/1‑150 (MQ=60)
GCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCA < SRR19973065.3006369/150‑1 (MQ=60)
CTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAG > SRR19973065.209570/1‑150 (MQ=60)
ACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGG > SRR19973065.1104056/1‑150 (MQ=60)
ACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGG < SRR19973065.2222563/150‑1 (MQ=60)
ACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGG > SRR19973065.1104067/1‑150 (MQ=60)
CTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGG > SRR19973065.3076416/1‑150 (MQ=60)
AACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTT > SRR19973065.2387921/1‑150 (MQ=60)
ACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTT < SRR19973065.2073966/150‑1 (MQ=60)
CCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTT > SRR19973065.2276973/1‑150 (MQ=60)
ACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTT < SRR19973065.2835687/150‑1 (MQ=60)
ACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTT < SRR19973065.1128789/150‑1 (MQ=60)
CTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTAC > SRR19973065.3502761/1‑150 (MQ=60)
CTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTAC > SRR19973065.625067/1‑150 (MQ=60)
TGATCACCCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACT < SRR19973065.123107/150‑1 (MQ=60)
TCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGAT < SRR19973065.963632/150‑1 (MQ=60)
CAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATG > SRR19973065.274502/1‑150 (MQ=60)
AACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGC > SRR19973065.2679116/1‑150 (MQ=60)
AACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGC > SRR19973065.75986/1‑150 (MQ=60)
AACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGC < SRR19973065.1379393/150‑1 (MQ=60)
GCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGT < SRR19973065.3054877/150‑1 (MQ=60)
GCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGT < SRR19973065.911889/150‑1 (MQ=60)
CTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTA > SRR19973065.2406469/1‑150 (MQ=60)
TCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTAT < SRR19973065.213075/150‑1 (MQ=60)
TCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTAT < SRR19973065.213437/150‑1 (MQ=60)
CAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATA < SRR19973065.526430/150‑1 (MQ=60)
CAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATA < SRR19973065.2372491/150‑1 (MQ=60)
AGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATAT < SRR19973065.1317921/150‑1 (MQ=60)
AGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATAT < SRR19973065.1317578/150‑1 (MQ=60)
GTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGG < SRR19973065.1020507/150‑1 (MQ=60)
AACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGG > SRR19973065.994703/1‑150 (MQ=60)
CGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGAC < SRR19973065.1489328/150‑1 (MQ=60)
CGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGAC < SRR19973065.304861/150‑1 (MQ=60)
GCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACG < SRR19973065.1121550/150‑1 (MQ=60)
CCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGG > SRR19973065.768822/1‑150 (MQ=60)
TGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAA < SRR19973065.3334331/150‑1 (MQ=60)
CCCCATAACTTTGTAATTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAT < SRR19973065.2730094/150‑1 (MQ=60)
CCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATT > SRR19973065.2584970/1‑150 (MQ=60)
CCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATT > SRR19973065.815955/1‑150 (MQ=60)
CCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATT > SRR19973065.397076/1‑150 (MQ=60)
CCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTA < SRR19973065.293608/150‑1 (MQ=60)
CCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTA < SRR19973065.3142635/150‑1 (MQ=60)
CCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTA < SRR19973065.3142261/150‑1 (MQ=60)
CCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTA > SRR19973065.1620932/1‑150 (MQ=60)
AACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACT < SRR19973065.2377349/150‑1 (MQ=60)
AACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACT > SRR19973065.2544798/1‑150 (MQ=60)
CTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTT > SRR19973065.477931/1‑150 (MQ=60)
TGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAA < SRR19973065.1706585/150‑1 (MQ=60)
AAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTG < SRR19973065.1269378/150‑1 (MQ=60)
AAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTG > SRR19973065.1182327/1‑150 (MQ=60)
AAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTG < SRR19973065.262922/150‑1 (MQ=60)
AGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGT > SRR19973065.2517542/1‑150 (MQ=60)
AAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTAATGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAA < SRR19973065.1494832/150‑1 (MQ=60)
AAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAT < SRR19973065.2205904/150‑1 (MQ=60)
AAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAT > SRR19973065.183189/1‑150 (MQ=60)
AAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAT < SRR19973065.1712471/150‑1 (MQ=60)
AGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATT > SRR19973065.236524/1‑150 (MQ=60)
AGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATT > SRR19973065.236538/1‑150 (MQ=60)
AGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAACTTACACTTTCAAGatcggaagagca > SRR19973065.2648556/1‑138 (MQ=60)
AGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAAC > SRR19973065.621981/1‑150 (MQ=60)
AGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAAC < SRR19973065.2520767/150‑1 (MQ=60)
AATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTATTTTTTAACCAAA > SRR19973065.2152110/1‑150 (MQ=60)
AAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGT > SRR19973065.495946/1‑150 (MQ=60)
CAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGAT < SRR19973065.1623794/150‑1 (MQ=60)
CGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAAC > SRR19973065.835369/1‑150 (MQ=60)
TTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAT < SRR19973065.959512/150‑1 (MQ=60)
TTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAT > SRR19973065.2749449/1‑150 (MQ=60)
TAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACTTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATT < SRR19973065.2272915/150‑1 (MQ=60)
TAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATT < SRR19973065.2272920/150‑1 (MQ=60)
AAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTA < SRR19973065.2530793/150‑1 (MQ=60)
TTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACTTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGTAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATT < SRR19973065.2975016/150‑1 (MQ=60)
TTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTT < SRR19973065.2451370/150‑1 (MQ=60)
GGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAA < SRR19973065.325740/150‑1 (MQ=60)
GTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAAT < SRR19973065.3022183/150‑1 (MQ=60)
GTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAAT < SRR19973065.1664632/150‑1 (MQ=60)
TTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGT > SRR19973065.1565414/1‑150 (MQ=60)
AATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGTAAT > SRR19973065.861385/1‑150 (MQ=60)
AATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGTAAT < SRR19973065.2704735/150‑1 (MQ=60)
|
CTGCTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGTAAT > CP009273/657947‑658245
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
