Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
837,716 |
G→T |
100% |
intergenic (‑204/‑72) |
mcbA ← / → rlmF |
colanic acid mucoidy stimulation protein/23S rRNA m(6)A1618 methyltransferase, SAM‑dependent |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 837,716 | 0 | G | T | 96.7%
| 757.1
/ 14.0
| 244 | intergenic (‑204/‑72) | mcbA/rlmF | colanic acid mucoidy stimulation protein/23S rRNA m(6)A1618 methyltransferase, SAM‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/4); new base T (144/92); total (148/96) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.15e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
AAATGACGCAAAAAATTGACAGAGATGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATGATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGTCATCACAGCCGCTACGATCTCGCCACGCTTTGT > CP009273/837574‑837859
|
aaTGACGCAAAAAATTGACAGAGATGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAAc > 1:1191678/1‑148 (MQ=255)
tGACGCAAAAAATTGACAGAGATTTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGc < 2:2603047/148‑1 (MQ=255)
tGACGCAAAAAATTGACAGAGATGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGc > 2:1437941/1‑148 (MQ=255)
tGACGCAAAAAATTGACAGAGATGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGc < 2:2359545/148‑1 (MQ=255)
gACGCAAAAAATTGACAGAGATGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCa < 2:1794867/148‑1 (MQ=255)
aaaaaTTGACAGAGATGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGa < 2:741766/148‑1 (MQ=255)
aaaTTGACAGAGATGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGata < 1:1046299/148‑1 (MQ=255)
aaaTTGACAGAGATGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGata > 2:42757/1‑148 (MQ=255)
aCAGAGATGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTAcc < 1:1718795/148‑1 (MQ=255)
aCAGAGATGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTAcc < 2:3273105/148‑1 (MQ=255)
agaTGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGt > 2:45815/1‑148 (MQ=255)
agaTGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGt > 2:2208240/1‑148 (MQ=255)
gtgCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTcgcg > 2:377369/1‑148 (MQ=255)
gtgCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTcgcg > 2:3440959/1‑148 (MQ=255)
tgCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGt < 1:2708088/148‑1 (MQ=255)
tATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATg < 1:200458/148‑1 (MQ=255)
ttttttGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATgtg > 1:597184/1‑146 (MQ=255)
ttttttGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATGATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCg > 2:836045/1‑148 (MQ=255)
tttGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGt < 2:2913129/148‑1 (MQ=255)
ttGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTa > 2:3346335/1‑148 (MQ=255)
aCGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCtt < 1:364463/148‑1 (MQ=255)
aCGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCtt > 2:977034/1‑148 (MQ=255)
aCGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCtt > 2:306205/1‑148 (MQ=255)
atatatTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTAcg > 2:1110118/1‑148 (MQ=255)
atatatTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTAcg > 1:2883296/1‑148 (MQ=255)
atTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATCGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTAcgccgc < 1:1484045/148‑1 (MQ=255)
atTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTAcgccgc > 2:624479/1‑148 (MQ=255)
tttttACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCgct > 1:319962/1‑148 (MQ=255)
tttAAAATATAATACAAATGAATGAAATTCATAATGCTGATTTTTATGTTGTATTGCCATAAACCATAGACATTTTTAGTTTTTTTGGAATTATAAACGCAGCCATTTATTTACGCTGTCGCGTTATGCTGGTATATTACGCCgcttc < 2:1520112/148‑3 (MQ=255)
tACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGACTTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCtt > 2:2034875/1‑148 (MQ=255)
tACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGGTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCtt > 2:2929145/1‑148 (MQ=255)
aCAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTa > 2:173186/1‑148 (MQ=255)
aaaTAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGACATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTAGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCTCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAg > 2:1718855/1‑148 (MQ=255)
aaTAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAgg > 1:744384/1‑148 (MQ=255)
aTAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGga > 2:337962/1‑148 (MQ=255)
tAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGgag < 1:107660/148‑1 (MQ=255)
tAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGgag < 1:2506496/148‑1 (MQ=255)
aaGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGgaga > 1:1130707/1‑148 (MQ=255)
aaGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGgaga < 1:306205/148‑1 (MQ=255)
aaGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGgaga > 1:3114471/1‑148 (MQ=255)
aaGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGgaga < 2:1994305/148‑1 (MQ=255)
aGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGaa > 1:3448475/1‑148 (MQ=255)
gACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAAt > 2:2651327/1‑148 (MQ=255)
gACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAAt > 1:224237/1‑148 (MQ=255)
aCAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATg < 2:1482801/148‑1 (MQ=255)
aCAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATg > 1:961725/1‑148 (MQ=255)
aCAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATg > 1:960717/1‑148 (MQ=255)
cAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGc > 1:2766688/1‑148 (MQ=255)
aaTCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTa < 2:1410413/148‑1 (MQ=255)
aaTCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTa < 1:2208240/148‑1 (MQ=255)
aTCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTAt > 1:51727/1‑148 (MQ=255)
aTGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTcc > 1:2757357/1‑148 (MQ=255)
gACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGc < 2:1195882/148‑1 (MQ=255)
gACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGc > 1:620522/1‑148 (MQ=255)
gACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGc < 2:674992/148‑1 (MQ=255)
gACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGc > 1:1633072/1‑148 (MQ=255)
aCATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGcc > 2:1852969/1‑148 (MQ=255)
gCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGa > 1:652606/1‑148 (MQ=255)
cATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGaa < 1:2899961/148‑1 (MQ=255)
aTAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGaaa > 2:765200/1‑148 (MQ=255)
tAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAAc > 2:3034404/1‑148 (MQ=255)
aTGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATGATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCg < 2:1177588/148‑1 (MQ=255)
tGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCgg < 2:2294051/148‑1 (MQ=255)
gCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCggg > 2:2168464/1‑148 (MQ=255)
cTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCgggg < 1:1214059/148‑1 (MQ=255)
tttttATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGc < 2:1275509/148‑1 (MQ=255)
ttttATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCa < 2:1452405/148‑1 (MQ=255)
ttttATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCa > 2:1301331/1‑148 (MQ=255)
gatgaATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCcgcg < 1:207470/148‑1 (MQ=255)
atgaATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCgcgc > 2:3530153/1‑148 (MQ=255)
aaTTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGACTTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAAc > 2:2613117/1‑148 (MQ=255)
aTTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAAcc > 2:96293/1‑148 (MQ=255)
aTTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAAcc > 1:43390/1‑148 (MQ=255)
ttGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCg > 2:1617669/1‑148 (MQ=255)
tGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATNCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGt > 1:1808285/1‑148 (MQ=255)
tGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGt > 1:746476/1‑148 (MQ=255)
tGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGt > 2:1753548/1‑148 (MQ=255)
gCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGtc < 1:829318/148‑1 (MQ=255)
gCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGtc < 1:2616671/148‑1 (MQ=255)
ccATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGtca > 1:2577506/1‑148 (MQ=255)
cATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGtcat > 1:633574/1‑148 (MQ=255)
aTAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGtcatc > 1:1295858/1‑148 (MQ=255)
aaaCCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGTCATcac < 1:322843/148‑1 (MQ=255)
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aCCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGTCATCACAg > 1:3160915/1‑148 (MQ=255)
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ATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGA > SRR19973066.657363/1‑150 (MQ=60)
ATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGA > SRR19973066.658030/1‑150 (MQ=60)
ATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGA > SRR19973066.657486/1‑150 (MQ=60)
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ATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGATATGTACGCGCAGAAACC > SRR19973066.1061439/1‑150 (MQ=60)
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TTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATC < SRR19973066.307004/150‑1 (MQ=60)
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ATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATTATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCG < SRR19973066.1215163/150‑1 (MQ=60)
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GATGCAAATGACGCAAAAAATTGACAGAGATGTGCTTATTTTTTGAACGATATATTTTTACAAAATAAGACAAATCAATGACATGCATAATGCTGATTTTTATGATGAATTGCCATAAACCATAGCCATGTTAAGGTTTTGGGGAATGATAAACGCAGCCAGATATTTACCCTGTCGCGTTATGCGGGTATCTTACGCCGCTGCTTAAAGGAGAATGCTATGTCCGCCCAGAAACCGGGGTTGCATCCGCGCAACCGTCATCACAGCCGCTACGATCTCGCCACGCTTTGTCAGGTC > CP009273/837569‑837865
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |