Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
743,797 |
G→T |
R214R (CGC→CGA) |
ybgO ← |
putative fimbrial protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 743,797 | 0 | G | T | 100.0%
| 616.0
/ NA
| 183 | R214R (CGC→CGA) | ybgO | putative fimbrial protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (92/91); total (92/91) |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GGTGCATTGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACGCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTCTCGTATTTTGAC > CP009273/743650‑743943
|
gCATTGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAAt < 2:3081195/150‑1 (MQ=255)
cATTGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATg < 2:2268604/150‑1 (MQ=255)
aTTGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGt > 1:2574481/1‑150 (MQ=255)
aTTGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGt > 2:2304665/1‑150 (MQ=255)
tGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGttt < 2:3082941/150‑1 (MQ=255)
tGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGttt > 1:509011/1‑150 (MQ=255)
aTCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTc > 2:885101/1‑150 (MQ=255)
gTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAg > 2:3572613/1‑150 (MQ=255)
tctTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTaa < 1:1861153/150‑1 (MQ=255)
ctTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAat < 2:844426/150‑1 (MQ=255)
ttGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAata > 1:3709680/1‑150 (MQ=255)
ttGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAata < 1:2128080/150‑1 (MQ=255)
tGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAatat < 1:3282652/150‑1 (MQ=255)
cGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGata < 1:1057869/150‑1 (MQ=255)
cGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGata > 1:3479019/1‑150 (MQ=255)
atttttAATTCTTAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGTCGTATATCCTGCAAATTTATTTTACAAAAATCAATCAACTGTGTTTCCGGTGTTTTGGAATAATTGTCGCTGCAATCCAGCACTATAATGTTTTCCAGAACAGTATTATGata < 1:3532607/148‑1 (MQ=255)
gTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGatat < 2:2438831/150‑1 (MQ=255)
gTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGatat > 2:157781/1‑150 (MQ=255)
ttttAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATAtt < 2:2830853/150‑1 (MQ=255)
ttttAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATAtt > 1:3804939/1‑150 (MQ=255)
ttAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATCTTTc > 2:2997878/1‑150 (MQ=255)
aaTACTGAACGTTTTCGACAGTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAACTCAATCCCCTGTGTTTCCGGTGAACTGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAg < 2:1879950/150‑1 (MQ=255)
aTACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAgg > 1:908019/1‑150 (MQ=255)
aTACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAgg > 1:2494959/1‑150 (MQ=255)
aTACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAgg < 2:236819/150‑1 (MQ=255)
aCTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGtt > 1:2687328/1‑150 (MQ=255)
cGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGc < 2:819481/150‑1 (MQ=255)
cGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGc > 2:3559036/1‑150 (MQ=255)
cGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGc < 2:1369496/150‑1 (MQ=255)
gTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCa > 2:2457765/1‑150 (MQ=255)
gTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCa > 2:2944622/1‑150 (MQ=255)
gTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCa > 2:1311009/1‑150 (MQ=255)
ttttCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAg < 2:1146156/150‑1 (MQ=255)
gACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAggg < 2:1354189/150‑1 (MQ=255)
aCATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGt > 1:3001402/1‑150 (MQ=255)
aCATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGt < 2:317548/150‑1 (MQ=255)
cATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTc > 2:2750629/1‑150 (MQ=255)
cATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTc > 2:2750325/1‑150 (MQ=255)
cATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTc < 1:326474/150‑1 (MQ=255)
aTTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCt > 2:1947117/1‑150 (MQ=255)
ttGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCtt < 1:2487545/150‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCtt < 1:179273/150‑1 (MQ=255)
tgtgtgGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTc < 2:3402901/150‑1 (MQ=255)
gCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAAc < 2:1888788/150‑1 (MQ=255)
gACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGc > 1:715686/1‑150 (MQ=255)
gACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGc > 2:694356/1‑150 (MQ=255)
aCGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCt > 1:3297288/1‑150 (MQ=255)
atatCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCg < 1:2801844/150‑1 (MQ=255)
tatCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCgg > 2:701175/1‑150 (MQ=255)
atCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGc > 2:755162/1‑150 (MQ=255)
tCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCa > 1:1479078/1‑150 (MQ=255)
cAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCAcc > 2:413775/1‑150 (MQ=255)
cAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCAcc > 1:2827015/1‑150 (MQ=255)
gCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGt < 1:1663807/150‑1 (MQ=255)
ttaaattTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAAt > 1:1789453/1‑150 (MQ=255)
aaattTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTg > 1:1066566/1‑150 (MQ=255)
aattTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGc < 2:2749623/150‑1 (MQ=255)
tttACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCac < 2:2996228/150‑1 (MQ=255)
ttACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCacg > 1:2647235/1‑150 (MQ=255)
ttACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCaca < 2:2326801/150‑2 (MQ=255)
ccAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCacgacg < 1:1720728/150‑1 (MQ=255)
aaaaTCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGnt < 1:1172698/150‑1 (MQ=255)
aaaaTCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGat < 1:2304665/150‑1 (MQ=255)
aaaTCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGata > 1:1981511/1‑150 (MQ=255)
tcaatcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAg < 2:3646118/150‑1 (MQ=255)
caatcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGt < 2:2233452/150‑1 (MQ=255)
caatcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGt > 1:2954488/1‑150 (MQ=255)
atcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCg > 1:2753101/1‑150 (MQ=255)
atcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCg > 1:2753277/1‑150 (MQ=255)
aCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTa > 2:2117033/1‑150 (MQ=255)
aCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTa > 2:1774431/1‑150 (MQ=255)
ccTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTaa < 2:347502/150‑1 (MQ=255)
ccTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTaa > 2:3566093/1‑150 (MQ=255)
cTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAg > 2:2262740/1‑150 (MQ=255)
tgtgTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGc > 1:2508138/1‑150 (MQ=255)
tgtgTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGc < 1:1588462/150‑1 (MQ=255)
gtgtTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCg < 1:2932051/150‑1 (MQ=255)
tttCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTAc > 1:3073774/1‑150 (MQ=255)
ccGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACttt < 2:2574481/150‑1 (MQ=255)
ggTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGa < 1:2427956/150‑1 (MQ=255)
ggTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGa < 1:2428150/150‑1 (MQ=255)
tGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATa > 1:2090221/1‑150 (MQ=255)
tGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATa < 2:1506256/150‑1 (MQ=255)
aTGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCa < 2:1791530/150‑1 (MQ=255)
aTGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCa < 1:2944622/150‑1 (MQ=255)
gAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATgc < 2:2668240/150‑1 (MQ=255)
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CCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTT > SRR19973061.822755/1‑150 (MQ=60)
GGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGA < SRR19973061.2434327/150‑1 (MQ=60)
GGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGA < SRR19973061.2434152/150‑1 (MQ=60)
GGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGA < SRR19973061.2434346/150‑1 (MQ=60)
TGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATA > SRR19973061.2095472/1‑150 (MQ=60)
GAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAA > SRR19973061.2171186/1‑150 (MQ=60)
ATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCA < SRR19973061.2952202/150‑1 (MQ=60)
TTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGC > SRR19973061.665985/1‑150 (MQ=60)
TTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGC < SRR19973061.1148861/150‑1 (MQ=60)
TTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAAACATGCGGCGGC > SRR19973061.666023/1‑150 (MQ=60)
GACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTACGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCAT < SRR19973061.2751738/150‑1 (MQ=60)
GCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTC > SRR19973061.1865840/1‑150 (MQ=60)
GCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTC < SRR19973061.2941766/150‑1 (MQ=60)
GCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTC > SRR19973061.1358702/1‑150 (MQ=60)
GCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTC < SRR19973061.3220269/150‑1 (MQ=60)
GCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTC < SRR19973061.1314292/150‑1 (MQ=60)
TGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTCTC < SRR19973061.2579417/150‑1 (MQ=60)
TGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTCTC < SRR19973061.668833/150‑1 (MQ=60)
AATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTCTCGTA > SRR19973061.75915/1‑150 (MQ=60)
AATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTCTCGTA > SRR19973061.2865585/1‑150 (MQ=60)
AATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTCTCGTA > SRR19973061.1991099/1‑150 (MQ=60)
AATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTCTCGTA > SRR19973061.256593/1‑150 (MQ=60)
ACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTCTCGTATTTTGACG > SRR19973061.41815/1‑150 (MQ=60)
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GTGCATTGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACGCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTCTCGTATTTTGACG > CP009273/743651‑743944
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |