Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,131,601 |
C→A |
T194T (ACC→ACA) |
flgH → |
flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,131,601 | 0 | C | A | 100.0%
| 707.0
/ NA
| 216 | T194T (ACC→ACA) | flgH | flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (129/87); total (129/87) |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
GCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGTGGTGATTAAATTTCTCTCT > CP009273/1131456‑1131747
|
gCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAAtacagtac < 1:3065042/150‑1 (MQ=255)
tgacggtgacggTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTa > 1:3749722/1‑150 (MQ=255)
gacggtgacggtTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTAc > 2:1025029/1‑150 (MQ=255)
gacggtgacggtTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTAc > 2:1025212/1‑150 (MQ=255)
acggtgacggtTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACt < 2:1258502/150‑1 (MQ=255)
acggtgacggtTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACt < 1:2536733/150‑1 (MQ=255)
ggtgacggtTGACCAGGTACTGGTCAACGGCATCCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAATATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGATTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCa < 1:2129742/150‑1 (MQ=255)
ggtgacggtTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCa > 2:1181131/1‑150 (MQ=255)
ggtgacggtTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCa > 1:1157103/1‑150 (MQ=255)
ggtgacggtTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCa < 1:1776535/150‑1 (MQ=255)
gacggtTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGt < 1:1900348/150‑1 (MQ=255)
ttGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCgg > 1:1323621/1‑150 (MQ=255)
gACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGAt < 2:2098994/150‑1 (MQ=255)
gACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGAt < 1:3691953/150‑1 (MQ=255)
aCCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATg < 2:3419032/150‑1 (MQ=255)
ccAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgc < 2:2742804/150‑1 (MQ=255)
aGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgcgc > 2:895385/1‑150 (MQ=255)
ggTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgcgcg < 2:1630465/150‑1 (MQ=255)
cTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCAtt > 2:3798447/1‑150 (MQ=255)
ggTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGa > 1:2422595/1‑150 (MQ=255)
tCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAAt < 2:1586139/150‑1 (MQ=255)
catcGGCAACCTGCTTGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATa < 2:3513101/147‑1 (MQ=255)
aCGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACg < 1:3790356/150‑1 (MQ=255)
aCGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACg > 2:1295520/1‑150 (MQ=255)
ggCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTa > 2:3408175/1‑150 (MQ=255)
aCCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCa > 1:1920433/1‑150 (MQ=255)
aCCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCa < 1:612158/150‑1 (MQ=255)
tGCTTGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATg < 2:3589509/150‑1 (MQ=255)
tgtgGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTa < 2:2178048/150‑1 (MQ=255)
tggtggGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACa < 1:3624357/150‑1 (MQ=255)
ggtgAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAAc < 2:2698534/150‑1 (MQ=255)
gtgAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACg < 2:2539175/150‑1 (MQ=255)
tgAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAActa > 1:1451504/1‑148 (MQ=255)
aaaaGATTGCCATTAATCATGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTTTATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGTAgagc < 2:939482/147‑1 (MQ=255)
aaaaGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAgcgc > 1:2385570/4‑150 (MQ=255)
aaaaGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAgcgc > 1:3251093/4‑150 (MQ=255)
aaaGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCa > 2:3459721/3‑150 (MQ=255)
aaGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCaa > 2:2609428/2‑150 (MQ=255)
aaGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCGTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCaa < 2:3146905/149‑1 (MQ=255)
gATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCaaaa < 1:3154249/150‑1 (MQ=255)
aTTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAat > 1:66352/1‑150 (MQ=255)
aTTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAat < 2:2092623/150‑1 (MQ=255)
gCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATg < 2:814287/150‑1 (MQ=255)
ccATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGACGCGCAAAATATgg > 1:2960247/1‑150 (MQ=255)
ccATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATgg > 1:503469/1‑150 (MQ=255)
aTTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGc > 2:3073668/1‑150 (MQ=255)
aTTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGc > 1:2215526/1‑150 (MQ=255)
aTTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGc > 2:2052758/1‑150 (MQ=255)
ttAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCt < 2:140563/150‑1 (MQ=255)
tAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTg > 1:708110/1‑150 (MQ=255)
tAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTg > 2:1852512/1‑150 (MQ=255)
aaTCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTgg < 2:34525/150‑1 (MQ=255)
aTCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGt > 2:1972262/1‑150 (MQ=255)
tCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGtt > 2:3031468/1‑150 (MQ=255)
tCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGtt > 1:1626293/1‑150 (MQ=255)
ggTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAg > 1:1871297/1‑150 (MQ=255)
gTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGc > 2:2769679/1‑150 (MQ=255)
gTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGc > 2:2571667/1‑150 (MQ=255)
aaTTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTttct < 1:1025029/150‑1 (MQ=255)
aaTTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTttct < 1:1025212/150‑1 (MQ=255)
tttATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTttcttc < 1:871756/150‑1 (MQ=255)
cGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAAc < 2:3251093/150‑1 (MQ=255)
cGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAAc > 1:462734/1‑150 (MQ=255)
cTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCt > 2:621243/1‑150 (MQ=255)
ttCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTg > 2:1183254/1‑150 (MQ=255)
tctcTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGt > 1:732165/1‑150 (MQ=255)
tctGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCg > 2:581667/1‑150 (MQ=255)
ctGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGc > 1:2584633/1‑150 (MQ=255)
cGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAAt < 1:3798447/150‑1 (MQ=255)
gTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATg > 1:1308873/1‑150 (MQ=255)
gTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATg > 1:3377864/1‑150 (MQ=255)
tGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGt < 2:3296515/150‑1 (MQ=255)
gTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTaa > 1:2173175/1‑150 (MQ=255)
gTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTaa > 2:2948899/1‑150 (MQ=255)
aaTCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTg > 1:1560554/1‑150 (MQ=255)
aTCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGa > 1:3632396/1‑150 (MQ=255)
cACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGc > 1:3204645/1‑150 (MQ=255)
aCGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCAGGTTTCAGCGTTTATTACTTAACCTGTCGCCAAAGTAATTGAGGCt > 1:915811/1‑150 (MQ=255)
cGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCtg < 1:3781316/150‑1 (MQ=255)
gCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCtgt > 2:180924/1‑150 (MQ=255)
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cACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCtgtg > 2:2535292/1‑150 (MQ=255)
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AATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCT < SRR19973061.1027700/150‑1 (MQ=60)
AATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCT < SRR19973061.1027649/150‑1 (MQ=60)
AATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCT < SRR19973061.1027833/150‑1 (MQ=60)
TTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTC < SRR19973061.874021/150‑1 (MQ=60)
ATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTT > SRR19973061.2819168/1‑150 (MQ=60)
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CGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAAC > SRR19973061.463993/1‑150 (MQ=60)
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GCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACC > SRR19973061.1187345/1‑150 (MQ=60)
TCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGT > SRR19973061.734083/1‑150 (MQ=60)
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CTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGC > SRR19973061.2591373/1‑150 (MQ=60)
CGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAAT < SRR19973061.3808130/150‑1 (MQ=60)
GTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATG > SRR19973061.1312146/1‑150 (MQ=60)
GTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATG > SRR19973061.3386546/1‑150 (MQ=60)
GTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAA > SRR19973061.2178637/1‑150 (MQ=60)
TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAG > SRR19973061.3451587/1‑150 (MQ=60)
AATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTG > SRR19973061.1564433/1‑150 (MQ=60)
ATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGA > SRR19973061.3641685/1‑150 (MQ=60)
ATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGA < SRR19973061.193469/150‑1 (MQ=60)
ATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGA > SRR19973061.1030685/1‑150 (MQ=60)
ATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGA < SRR19973061.2108442/150‑1 (MQ=60)
CCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGG > SRR19973061.2119947/1‑150 (MQ=60)
CACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGC > SRR19973061.3212878/1‑150 (MQ=60)
CACGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGC > SRR19973061.3211838/1‑150 (MQ=60)
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CGCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTG < SRR19973061.3790960/150‑1 (MQ=60)
GCACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGT > SRR19973061.3672613/1‑150 (MQ=60)
CACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGTG > SRR19973061.1542521/1‑150 (MQ=60)
ACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGTGG > SRR19973061.359774/1‑150 (MQ=60)
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ACTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGTGG > SRR19973061.391607/1‑150 (MQ=60)
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CTATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGTGGT > SRR19973061.848591/1‑150 (MQ=60)
TATCAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGTGGTG < SRR19973061.645125/150‑1 (MQ=60)
CAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGTGGTGATT < SRR19973061.3794110/150‑1 (MQ=60)
CAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGTGGTGATT > SRR19973061.204217/1‑150 (MQ=60)
CAGCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGTGGTGATT > SRR19973061.2621381/1‑150 (MQ=60)
GCGGCAGCAATACAGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGTGGTGATTAA < SRR19973061.2822118/150‑1 (MQ=60)
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GCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAAAATATGGGCTGGTTGCAGCGTTTCTTCCTTAACCTGTCGCCAATGTAAGTGAGGCTGTGGTGATTAAATTTCTCTCTG > CP009273/1131456‑1131748
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |