Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,604,988 |
G→A |
intergenic (‑51/+176) |
uxaB ← / ← yneF |
altronate oxidoreductase, NAD‑dependent/putative membrane‑bound diguanylate cyclase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,604,988 | 0 | G | A | 99.4%
| 563.0
/ NA
| 177 | intergenic (‑51/+176) | uxaB/yneF | altronate oxidoreductase, NAD‑dependent/putative membrane‑bound diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (78/98); minor base C (1/0); total (79/98) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.46e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
AGTCAACAAAGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAGGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGAACACATTGC > CP009273/1604841‑1605134
|
aGTCAACAAAGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGt > 1:656651/1‑150 (MQ=255)
caacaaAGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAg > 1:3649853/1‑150 (MQ=255)
acaaAGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATCCGTTCTGGATACTGTGCACCGGGACAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACACGTTAGCa > 2:1509112/1‑150 (MQ=255)
acaaAGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCa > 2:3407143/1‑150 (MQ=255)
aaaGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCaaa > 2:3006429/1‑150 (MQ=255)
aaGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAAc < 1:2424771/150‑1 (MQ=255)
aGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACt > 1:155121/1‑150 (MQ=255)
aGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACt < 1:2522775/150‑1 (MQ=255)
ggCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACtt < 2:656651/150‑1 (MQ=255)
ggCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACtt < 2:1408422/150‑1 (MQ=255)
gcgcgcAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACttt < 1:3043084/150‑1 (MQ=255)
cgcgcAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTa < 1:3086111/150‑1 (MQ=255)
gcAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATa < 1:3297432/150‑1 (MQ=255)
cAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGTATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATAc < 1:2366239/150‑1 (MQ=255)
cAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATAc < 1:3170865/150‑1 (MQ=255)
cAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATAc < 2:301483/150‑1 (MQ=255)
cAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATAc < 2:1931677/150‑1 (MQ=255)
gAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCGCAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGcc < 1:424177/150‑1 (MQ=255)
gAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTGTAATACGcc > 1:2284385/1‑150 (MQ=255)
aaGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCg < 1:2666777/150‑1 (MQ=255)
aGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGa > 2:170925/1‑150 (MQ=255)
aGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGa > 2:2321847/1‑150 (MQ=255)
aGTTACCTTCACCAAACTGAATGATAAGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGa > 2:721371/1‑150 (MQ=255)
aCCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAAccc > 1:3694947/1‑150 (MQ=255)
aCCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAAccc < 1:3362960/150‑1 (MQ=255)
cTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCt > 1:2635565/1‑150 (MQ=255)
aCCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGttt < 2:878071/150‑1 (MQ=255)
ccAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGA‑TAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTg < 1:3310110/150‑1 (MQ=255)
cAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTg < 2:381978/150‑1 (MQ=255)
cAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTg < 1:3310126/150‑1 (MQ=255)
aaaCTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGa < 1:1996510/150‑1 (MQ=255)
aaCTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGAt > 2:3502239/1‑150 (MQ=255)
aTGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTc < 2:214511/150‑1 (MQ=255)
tGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTcc > 2:112286/1‑150 (MQ=255)
gATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCt < 1:2600599/150‑1 (MQ=255)
aCGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCtgat < 1:2452426/150‑1 (MQ=255)
ttCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTgatgat < 2:2710148/150‑1 (MQ=255)
tCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGAtt < 1:1173544/150‑1 (MQ=255)
cTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTa < 1:1889101/150‑1 (MQ=255)
gATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATg < 1:592610/150‑1 (MQ=255)
gATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATg < 2:681458/150‑1 (MQ=255)
gATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATg > 2:976403/1‑150 (MQ=255)
gATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATg < 2:1482720/150‑1 (MQ=255)
tACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAg < 2:820527/150‑1 (MQ=255)
aCTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGc < 2:799664/150‑1 (MQ=255)
aCTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGc < 2:234149/150‑1 (MQ=255)
tgtgCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAg < 1:914220/150‑1 (MQ=255)
gtgCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGt < 2:1227655/150‑1 (MQ=255)
tgCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGtt < 2:3041250/150‑1 (MQ=255)
ccGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTAt < 2:2988535/150‑1 (MQ=255)
ccGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTAt < 2:1485655/150‑1 (MQ=255)
cGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATg < 2:2406574/150‑1 (MQ=255)
gAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATgaga > 1:2404692/1‑150 (MQ=255)
aaaaTCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGaa > 1:735150/1‑150 (MQ=255)
aaaTCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGaaa < 2:3241304/150‑1 (MQ=255)
cgcgACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAgtg < 1:124359/150‑1 (MQ=255)
cgacgaTTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGtgtg > 1:3340230/1‑150 (MQ=255)
cgacgaTTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGtgtg > 1:1441137/1‑150 (MQ=255)
gacgaTTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTgg > 1:1777263/1‑150 (MQ=255)
acgaTTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGgc < 1:1794639/150‑1 (MQ=255)
cgaTTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGgcg > 1:180350/1‑150 (MQ=255)
taTTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGgcgc > 1:2818945/2‑150 (MQ=255)
aTTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGcgcg > 2:2499161/1‑150 (MQ=255)
ttAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGa < 2:866915/150‑1 (MQ=255)
aGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATc > 1:2488984/1‑150 (MQ=255)
aGTGCTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATc > 1:122859/1‑150 (MQ=255)
gtgtTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCa < 2:2635565/150‑1 (MQ=255)
gtgtTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCa < 1:3005185/150‑1 (MQ=255)
gtgtTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCa < 1:3005186/150‑1 (MQ=255)
gtTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATg < 1:3365489/150‑1 (MQ=255)
tNACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGttt > 1:1049447/1‑150 (MQ=255)
tCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGttt < 1:2933300/150‑1 (MQ=255)
acaATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTaa > 1:1035978/1‑150 (MQ=255)
caATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAAt > 1:3586451/1‑150 (MQ=255)
aaTGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATc > 2:2239084/1‑150 (MQ=255)
aaTGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATc < 1:170925/150‑1 (MQ=255)
ggTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAgg > 2:807550/1‑150 (MQ=255)
ccTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGaaaaa > 2:3349993/1‑150 (MQ=255)
tGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCGAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCt > 1:3486750/1‑150 (MQ=255)
tGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCt < 1:1640203/150‑1 (MQ=255)
aTTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCttt < 2:2871009/150‑1 (MQ=255)
ttAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCtttt < 2:1303476/150‑1 (MQ=255)
tAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTc < 2:1549853/150‑1 (MQ=255)
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cATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTgg > 1:2261259/1‑150 (MQ=255)
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GTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCA < SRR19973061.3012944/150‑1 (MQ=60)
GTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCA > SRR19973061.1674715/1‑150 (MQ=60)
GTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCA < SRR19973061.3012943/150‑1 (MQ=60)
GTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATG < SRR19973061.3374142/150‑1 (MQ=60)
TNACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTT > SRR19973061.1052140/1‑150 (MQ=60)
TCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTT < SRR19973061.2940845/150‑1 (MQ=60)
ACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAA > SRR19973061.1038634/1‑150 (MQ=60)
CAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAAT > SRR19973061.3595644/1‑150 (MQ=60)
AATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATC < SRR19973061.171516/150‑1 (MQ=60)
AATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATC < SRR19973061.171451/150‑1 (MQ=60)
TGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGA < SRR19973061.3519192/150‑1 (MQ=60)
GGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAG < SRR19973061.1533894/150‑1 (MQ=60)
GGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTAAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGAATAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGG > SRR19973061.903634/1‑150 (MQ=60)
CCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAA > SRR19973061.1795493/1‑150 (MQ=60)
TGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCGAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCT > SRR19973061.3495664/1‑150 (MQ=60)
TGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCT < SRR19973061.1644312/150‑1 (MQ=60)
CATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGG > SRR19973061.2266955/1‑150 (MQ=60)
GTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGT > SRR19973061.1211209/1‑150 (MQ=60)
GTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGT > SRR19973061.1211286/1‑150 (MQ=60)
TTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGG > SRR19973061.959191/1‑150 (MQ=60)
ATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGA > SRR19973061.1675348/1‑150 (MQ=60)
GGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGAACA < SRR19973061.3014191/150‑1 (MQ=60)
GGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGAACA < SRR19973061.3015102/150‑1 (MQ=60)
GTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGAACAC > SRR19973061.1550769/1‑150 (MQ=60)
AGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGAACACATTGCATT > SRR19973061.53496/1‑150 (MQ=60)
AGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGAACACATTGCATT < SRR19973061.2034082/150‑1 (MQ=60)
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AGTCAACAAAGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAGGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGAACACATTGCATT > CP009273/1604841‑1605137
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |