Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
372,581 |
G→T |
100% |
A118A (GCG→GCT) |
yaiL → |
DUF2058 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 372,581 | 0 | G | T | 97.5%
| 1026.4
/ 11.4
| 322 | A118A (GCG→GCT) | yaiL | DUF2058 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/5); new base T (168/146); total (171/151) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
AAAGCTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCGATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCC > CP009273/372435‑372727
|
aaaGCTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTAtt > 2:487717/1‑150 (MQ=255)
aaaGCTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTAtt > 2:3568191/1‑150 (MQ=255)
aaGCTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTg > 2:5004801/1‑150 (MQ=255)
aGCTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGc > 2:3994473/1‑150 (MQ=255)
tCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCg < 2:886758/150‑1 (MQ=255)
tCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCg < 1:3587289/150‑1 (MQ=255)
tGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCGATTGCCCGCttgt < 1:1325405/150‑1 (MQ=255)
gAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTTCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCTCTGACGGCAATCTGATTAAGTAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCttgtt < 1:2540609/150‑1 (MQ=255)
gcagcTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGt > 2:112549/1‑150 (MQ=255)
gcagcTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCGATTGCCCGCTTGTTGGt < 1:4099997/150‑1 (MQ=255)
cagcTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTc < 2:5035953/150‑1 (MQ=255)
cagcTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTc < 1:2318302/150‑1 (MQ=255)
agcTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCg < 1:2258934/150‑1 (MQ=255)
gcTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGa > 2:1175464/1‑150 (MQ=255)
gcTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGa < 1:1438327/150‑1 (MQ=255)
cTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGAt > 1:3037811/1‑150 (MQ=255)
cTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGAt > 1:1361852/1‑150 (MQ=255)
tATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATaa < 1:2269632/150‑1 (MQ=255)
aTTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAAc > 2:1259072/1‑150 (MQ=255)
tGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACaa > 1:1573851/1‑150 (MQ=255)
aaaTGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATa < 2:476623/150‑1 (MQ=255)
aaaTGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATa > 2:1435444/1‑150 (MQ=255)
aaaTGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATa < 1:4667714/150‑1 (MQ=255)
aaTGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAg > 1:647882/1‑150 (MQ=255)
aaTGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAg < 2:3537142/150‑1 (MQ=255)
tGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCg > 2:4048957/1‑150 (MQ=255)
gAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGa > 2:1590963/1‑150 (MQ=255)
gAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGa > 2:670103/1‑150 (MQ=255)
aCCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAg < 2:3824834/150‑1 (MQ=255)
cGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGt > 1:2576737/1‑150 (MQ=255)
cGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGt < 2:2390235/150‑1 (MQ=255)
cGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGt > 1:96040/1‑150 (MQ=255)
gAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTg < 1:4665772/150‑1 (MQ=255)
aTCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGaa > 1:5097790/1‑150 (MQ=255)
cACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATa < 1:479664/150‑1 (MQ=255)
aCCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCGATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATAc > 2:208473/1‑150 (MQ=255)
ccATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACg < 1:1652702/150‑1 (MQ=255)
cATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGc > 2:4168116/1‑150 (MQ=255)
cATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGc > 1:5120154/1‑150 (MQ=255)
aTTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGcc < 2:1788342/150‑1 (MQ=255)
tGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCat > 1:4301655/1‑150 (MQ=255)
gCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCatt < 2:3039378/150‑1 (MQ=255)
gCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCatt < 2:4598465/150‑1 (MQ=255)
ccAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCatta > 2:594971/1‑150 (MQ=255)
ccAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCatta > 1:823759/1‑150 (MQ=255)
cAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCattat < 1:1069550/150‑1 (MQ=255)
aaTGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCattatt > 2:3108098/1‑150 (MQ=255)
aaTGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCattatt > 2:1920031/1‑150 (MQ=255)
aaTGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCattatt < 1:5042953/150‑1 (MQ=255)
aTGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTc > 2:3224363/1‑150 (MQ=255)
aTGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTc > 2:2982111/1‑150 (MQ=255)
ggCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTccc < 1:2814210/150‑1 (MQ=255)
ggCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTccc < 1:560478/150‑1 (MQ=255)
gATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGcc < 2:4351165/150‑1 (MQ=255)
atatTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCa < 2:1001097/150‑1 (MQ=255)
tatTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAg < 2:3234915/150‑1 (MQ=255)
atTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGc > 1:321994/1‑150 (MQ=255)
ttGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCg < 2:4946009/150‑1 (MQ=255)
tGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGt < 1:2919684/150‑1 (MQ=255)
tttAACTTCACTGACGGGAATCTGATTATGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGcc < 2:3910670/150‑1 (MQ=255)
tAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGa < 2:2897502/150‑1 (MQ=255)
tAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGa < 2:738790/150‑1 (MQ=255)
aaCTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGAt > 1:1120312/1‑150 (MQ=255)
cTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATaa > 2:1878089/1‑150 (MQ=255)
tCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATaaaa > 1:4889238/1‑150 (MQ=255)
tGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGc > 2:5082371/1‑150 (MQ=255)
gACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCt > 2:2372050/1‑150 (MQ=255)
aaTCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAgcgc > 1:204934/1‑150 (MQ=255)
aTCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGcgcg < 1:2454683/150‑1 (MQ=255)
tGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATg < 2:4101256/150‑1 (MQ=255)
gaagaTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCcagcag > 1:1001432/1‑150 (MQ=255)
aagaTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGt > 2:1053587/1‑150 (MQ=255)
gaTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGtat > 1:336730/1‑150 (MQ=255)
gaTTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGtat > 2:4285412/1‑150 (MQ=255)
ttttGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTACTGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAgt < 1:4409067/150‑1 (MQ=255)
ttttGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAgt < 1:4652376/150‑1 (MQ=255)
gTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTg < 1:3688420/150‑1 (MQ=255)
gTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTg > 1:1597995/1‑150 (MQ=255)
cGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGca < 2:2837742/150‑1 (MQ=255)
gATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGcac > 1:682968/1‑150 (MQ=255)
tAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAg < 2:1363432/150‑1 (MQ=255)
aaGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAgc < 2:449482/150‑1 (MQ=255)
cTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAgcgcg > 2:3479735/1‑150 (MQ=255)
tCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAgcgcgc > 2:4455515/1‑150 (MQ=255)
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GGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCC < SRR19973063.2823259/150‑1 (MQ=60)
GGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCC < SRR19973063.562133/150‑1 (MQ=60)
GCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCG > SRR19973063.4686863/1‑150 (MQ=60)
GCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCGATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCG > SRR19973063.3362424/1‑150 (MQ=60)
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AAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGC > SRR19973063.1653195/1‑150 (MQ=60)
TCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGC > SRR19973063.3382308/1‑150 (MQ=60)
CACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCT > SRR19973063.609285/1‑150 (MQ=60)
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TCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGA < SRR19973063.3118249/150‑1 (MQ=60)
TCTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGA < SRR19973063.3936352/150‑1 (MQ=60)
TCTGGCTAGTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGA < SRR19973063.3118099/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGAC > SRR19973063.3547294/1‑150 (MQ=60)
GGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTCTAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCC > SRR19973063.4670292/1‑150 (MQ=60)
GGCTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCC > SRR19973063.2477451/1‑150 (MQ=60)
CTATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGT > SRR19973063.2465585/1‑150 (MQ=60)
TATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTA > SRR19973063.4532535/1‑150 (MQ=60)
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TATAAAGCTCAGGTGAAGCAGCTTATTGAAATGAACCGAATCACCATTGCCAATGGCGATATTGGTTTTAACTTCACTGACGGCAATCTGATTAAGAAGATTTTTGTCGATAAGCTCACACAGGCGCAGTTGATTAATGGTCGTCTGGCGATTGCCCGCTTGTTGGTCGATAACAATAGCGAAGGTGAATACGCCATTATTCCCGCCAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTA > CP009273/372432‑372730
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
