Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,139,402 |
C→A |
100% |
R141L (CGC→CTC) |
rne ← |
fused ribonucleaseE: endoribonuclease/RNA‑binding protein/RNA degradosome binding protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,139,402 | 0 | C | A | 97.5%
| 944.1
/ 9.7
| 300 | R141L (CGC→CTC) | rne | fused ribonucleaseE: endoribonuclease/RNA‑binding protein/RNA degradosome binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/6); new base A (143/149); total (145/155) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.85e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
GTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAACACA > CP009273/1139256‑1139548
|
gtTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGagag < 2:4033713/150‑1 (MQ=255)
cAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAAt < 2:3945416/150‑1 (MQ=255)
cAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAAt < 1:5059444/150‑1 (MQ=255)
cAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAAt < 1:357069/150‑1 (MQ=255)
cGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCa > 1:4456394/1‑150 (MQ=255)
aaGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCAccc > 2:2130494/1‑150 (MQ=255)
ttAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCcgcgc > 2:3360415/1‑150 (MQ=255)
tAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCcgcgcg > 2:1540150/1‑150 (MQ=255)
tAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCcgcgcg > 2:3334338/1‑150 (MQ=255)
aaaTCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGGGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCcgcgcgc > 1:3881678/1‑150 (MQ=255)
aaTCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCcgcgcgcg > 1:3968805/1‑150 (MQ=255)
aaTCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCcgcgcgcg < 1:2588079/150‑1 (MQ=255)
aTCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCgg < 1:3051367/150‑1 (MQ=255)
tCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCCCCCGCGCGCggg > 2:3659373/1‑150 (MQ=255)
cccATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGgt < 2:1238970/150‑1 (MQ=255)
ccATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGgtt < 1:2198921/150‑1 (MQ=255)
ccATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGgtt < 1:599347/150‑1 (MQ=255)
cATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGgttg > 2:3838467/1‑150 (MQ=255)
cATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGgttg < 1:668354/150‑1 (MQ=255)
cATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGgttg > 2:2649883/1‑150 (MQ=255)
cAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCgg < 1:2311838/150‑1 (MQ=255)
tgcCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCAt > 2:1911367/2‑150 (MQ=255)
cgcCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCAt > 2:2010087/1‑150 (MQ=255)
cgcCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCAt > 2:2010074/1‑150 (MQ=255)
cTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGAATCAg > 2:3526797/1‑150 (MQ=255)
cagcagATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGaa > 1:2158128/1‑150 (MQ=255)
cagATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCa < 1:4288458/150‑1 (MQ=255)
agATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAg < 2:4580855/150‑1 (MQ=255)
aTTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGAt < 1:5102490/150‑1 (MQ=255)
ttGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAg > 2:3080668/1‑150 (MQ=255)
gACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTAcc < 1:2528829/150‑1 (MQ=255)
gACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTAcc > 2:2840371/1‑150 (MQ=255)
cGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCg > 1:1747666/1‑150 (MQ=255)
gCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGc > 2:2272710/1‑150 (MQ=255)
gCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGc < 2:3968115/150‑1 (MQ=255)
aGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAg > 1:831536/1‑150 (MQ=255)
cGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGAc < 1:1678334/150‑1 (MQ=255)
ggTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACt > 2:1067427/1‑150 (MQ=255)
tGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGa > 2:1632834/1‑150 (MQ=255)
aCGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAg > 1:2849211/1‑150 (MQ=255)
gATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAggt > 1:2539792/1‑150 (MQ=255)
tAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAggtgg > 2:4754177/1‑150 (MQ=255)
gCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTa < 1:4158334/150‑1 (MQ=255)
cATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGc > 2:2970856/1‑150 (MQ=255)
aTGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGcc > 1:1486498/1‑150 (MQ=255)
aTGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGcc < 1:502954/150‑1 (MQ=255)
aTGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGcc > 2:5150346/1‑150 (MQ=255)
tGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCcg < 1:4512413/150‑1 (MQ=255)
tGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCcg < 2:4973549/150‑1 (MQ=255)
gCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCcgc < 1:1336282/150‑1 (MQ=255)
ttCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGcc < 2:2785040/150‑1 (MQ=255)
tCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGACCCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCt < 2:2302366/150‑1 (MQ=255)
ccGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCtt < 1:709092/150‑1 (MQ=255)
ccGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCtt < 1:4054209/150‑1 (MQ=255)
cAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTttgtt > 1:1817071/1‑150 (MQ=255)
cAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTttgtt < 1:4790028/150‑1 (MQ=255)
aGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTttgttg < 2:3103879/150‑1 (MQ=255)
gTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGc > 2:659955/1‑150 (MQ=255)
ttCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGct < 2:4258437/150‑2 (MQ=255)
tCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGcca < 2:137788/150‑2 (MQ=255)
tCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCcg > 1:3494904/1‑150 (MQ=255)
aaGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCcgcg > 1:1926286/1‑150 (MQ=255)
gCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGctc < 1:2039631/150‑1 (MQ=255)
cTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGctct < 2:4895694/150‑1 (MQ=255)
cTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGctct > 1:1281142/1‑150 (MQ=255)
ccAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCtcttctg > 2:1193148/1‑149 (MQ=255)
ccAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTcttctt < 2:559164/150‑1 (MQ=255)
ccAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTcttctt > 1:1579973/1‑150 (MQ=255)
cAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCttt < 1:780333/150‑1 (MQ=255)
aGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTa < 1:4910797/150‑1 (MQ=255)
gTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTAt < 1:32916/150‑1 (MQ=255)
tGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATc < 2:4928843/150‑1 (MQ=255)
gCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCg < 2:764233/150‑1 (MQ=255)
gCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCg < 1:912048/150‑1 (MQ=255)
cttcttTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGa > 1:4856378/1‑150 (MQ=255)
ttcttTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGAt < 2:2569875/150‑1 (MQ=255)
ttcttTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGAt < 1:3334384/150‑1 (MQ=255)
tcttTTAAGTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATc < 2:1975966/150‑1 (MQ=255)
cttTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCt < 2:4803031/150‑1 (MQ=255)
ttttAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTg < 2:2176878/150‑1 (MQ=255)
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tttAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGa > 1:1012209/1‑150 (MQ=255)
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ACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAG > SRR19973063.2858351/1‑150 (MQ=60)
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GATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGT > SRR19973063.862988/1‑150 (MQ=60)
GATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGT > SRR19973063.2550391/1‑150 (MQ=60)
GATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGT > SRR19973063.2547891/1‑150 (MQ=60)
GATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGT < SRR19973063.1275629/150‑1 (MQ=60)
AGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTT < SRR19973063.1637820/150‑1 (MQ=60)
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TCGCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCT > SRR19973063.4066175/1‑150 (MQ=60)
GCCTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTC > SRR19973063.649774/1‑150 (MQ=60)
CTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCAC < SRR19973063.4430086/150‑1 (MQ=60)
CTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCAC < SRR19973063.820378/150‑1 (MQ=60)
CTTCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCAC < SRR19973063.820385/150‑1 (MQ=60)
TCGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGC > SRR19973063.3831604/1‑150 (MQ=60)
CGATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCA > SRR19973063.3741399/1‑150 (MQ=60)
ATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAAC > SRR19973063.1108923/1‑150 (MQ=60)
ATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAAC > SRR19973063.2723840/1‑150 (MQ=60)
ATACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAAC > SRR19973063.1109291/1‑150 (MQ=60)
TACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGNCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAACA > SRR19973063.2684273/1‑150 (MQ=60)
ACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAACAC < SRR19973063.2639478/150‑1 (MQ=60)
ACGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAACAC < SRR19973063.527995/150‑1 (MQ=60)
CGGAGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAACACA < SRR19973063.4621750/150‑1 (MQ=60)
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AGTGTTTCAGACGGAAGCTTAAATCCCATTGCAGCGCCTCAGCAGATTTGCCGACGCCAGCGGTGCGCACGATAAGCCCCATGCCTTCCGGCAGTTCAAGGCTTGCCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAACACA > CP009273/1139253‑1139548
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |