Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,575,339 |
G→T |
100% |
F481L (TTC→TTA) |
ydeN ← |
putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,575,339 | 0 | G | T | 100.0%
| 746.1
/ NA
| 225 | F481L (TTC→TTA) | ydeN | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (105/120); total (105/120) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
CACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTATG > CP009273/1575195‑1575482
|
cACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAAt < 2:2232000/148‑1 (MQ=255)
cGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTg < 1:707263/148‑1 (MQ=255)
gCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTgg < 2:2564162/148‑1 (MQ=255)
ccTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGc > 1:3016937/1‑148 (MQ=255)
cTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCt > 2:2734559/1‑148 (MQ=255)
cTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCt < 2:1396994/148‑1 (MQ=255)
gCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTaa < 1:606916/148‑1 (MQ=255)
cATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAg < 2:141932/148‑1 (MQ=255)
cATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGGAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAg < 2:695366/148‑1 (MQ=255)
aTCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGt < 2:1030794/148‑1 (MQ=255)
tctcTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTc < 1:1374288/148‑1 (MQ=255)
tctcTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTc > 2:2851924/1‑148 (MQ=255)
tctcTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTc < 1:272207/148‑1 (MQ=255)
ctctTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTcc > 1:1231085/1‑148 (MQ=255)
tttAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGCTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCa > 1:1790356/1‑148 (MQ=255)
ccTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGATACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACACGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTggg > 1:1703141/1‑148 (MQ=255)
ccTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTggg < 2:2043938/148‑1 (MQ=255)
ccTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTggg < 1:1610449/148‑1 (MQ=255)
cTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTgggg < 1:991989/148‑1 (MQ=255)
cTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTgggg > 1:1140972/1‑148 (MQ=255)
cGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTa < 1:275400/148‑1 (MQ=255)
tGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCgg < 1:2398904/148‑1 (MQ=255)
tGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCgg < 2:707598/148‑1 (MQ=255)
cggcggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTa < 1:2274163/148‑1 (MQ=255)
gcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGt < 1:843804/148‑1 (MQ=255)
ggTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctga < 1:3458136/148‑1 (MQ=255)
ggTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctga < 2:1626760/148‑1 (MQ=255)
ttATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctgact > 1:1309029/1‑148 (MQ=255)
tATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctgactg < 1:2085543/148‑1 (MQ=255)
tATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctgactg > 1:791834/1‑148 (MQ=255)
tATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctgactg < 1:867694/148‑1 (MQ=255)
aTCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctgactga < 2:3500757/148‑1 (MQ=255)
aTCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctgactga > 1:1253537/1‑148 (MQ=255)
tCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGAt > 2:1738599/1‑148 (MQ=255)
ttttGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGc < 1:1131354/148‑1 (MQ=255)
ttttGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGc > 2:348960/1‑148 (MQ=255)
tGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGaa < 2:1682403/148‑1 (MQ=255)
tGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGaa < 1:1329960/148‑1 (MQ=255)
gTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACaaa < 1:1463738/148‑1 (MQ=255)
gTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACaaa > 1:2452832/1‑148 (MQ=255)
tAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGGGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAAt > 2:1348340/1‑148 (MQ=255)
aTCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGACGAACAAATTtg > 2:940348/1‑148 (MQ=255)
cGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTgg < 1:3271657/148‑1 (MQ=255)
gTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGt > 2:1794631/1‑148 (MQ=255)
gTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGt > 2:14907/1‑148 (MQ=255)
tCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTa < 1:3257342/148‑1 (MQ=255)
tCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTa > 2:1200992/1‑148 (MQ=255)
cAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTaa > 1:3041849/1‑148 (MQ=255)
cAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTaa > 2:2196657/1‑148 (MQ=255)
cAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTaa > 1:2638556/1‑148 (MQ=255)
gTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAAtt > 2:875573/1‑148 (MQ=255)
tttGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTa < 2:3351155/148‑1 (MQ=255)
ttGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTAt > 1:2834333/1‑148 (MQ=255)
ttGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTAt < 1:1898000/148‑1 (MQ=255)
gTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATcc > 1:1950068/1‑148 (MQ=255)
tAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATccc < 1:1446270/148‑1 (MQ=255)
tAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTAATGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCTTATAATATAATTGGCTTATGTCCTCAGTTTTTGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATccc < 2:2224570/148‑1 (MQ=255)
agagACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTGGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCa > 2:2128890/1‑148 (MQ=255)
aCCTAACTGATTATATACTACTGAATACACAAGCGAATAAACCATATTTCTCACCTTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGAGGGTAATACTCTGACTGATGGCGAACAAAATTGTGGTAATTATCCCAGAAt > 2:897104/1‑148 (MQ=255)
ccTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATg < 2:1674204/148‑1 (MQ=255)
aCTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAat < 2:434661/148‑1 (MQ=255)
aCTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAat > 1:3150556/1‑148 (MQ=255)
aCTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAat < 2:1881032/148‑1 (MQ=255)
tGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAatat < 1:2118890/148‑1 (MQ=255)
tttCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTc > 2:2503184/1‑148 (MQ=255)
tttCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTc > 1:1181557/1‑148 (MQ=255)
tCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGt < 1:542263/148‑1 (MQ=255)
tCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGt < 1:2243433/148‑1 (MQ=255)
cTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCaaa > 2:2589393/1‑148 (MQ=255)
tGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAAc < 1:1929989/148‑1 (MQ=255)
gTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAAcc > 2:1662063/1‑148 (MQ=255)
ataGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAg < 1:1756702/148‑1 (MQ=255)
ataGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAg < 1:2320342/148‑1 (MQ=255)
aGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTg < 1:342334/148‑1 (MQ=255)
aGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTg < 1:29440/148‑1 (MQ=255)
aGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTg > 2:864136/1‑148 (MQ=255)
aGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTg < 2:1282030/148‑1 (MQ=255)
aCAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTgag < 2:642397/148‑1 (MQ=255)
aaGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGaa > 1:1742891/1‑148 (MQ=255)
aGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAAt < 1:2164201/148‑1 (MQ=255)
aataatCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAaga < 2:2406529/148‑1 (MQ=255)
aataatCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAaga < 1:963650/148‑1 (MQ=255)
ataatCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAagag > 1:1365707/1‑148 (MQ=255)
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CTTACCACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTATGT > CP009273/1575190‑1575483
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |