Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,575,339 |
G→T |
93.7% |
F481L (TTC→TTA) |
ydeN ← |
putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,575,339 | 0 | G | T | 93.7%
| 876.4
/ 46.0
| 286 | F481L (TTC→TTA) | ydeN | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/12); new base T (146/122); total (152/134) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.24e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
TTACCACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTATGTGG > CP009273/1575191‑1575485
|
ttACCACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAgaga > 1:2255330/1‑150 (MQ=255)
cccACGCCTTGCATCTCTTTACAGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAAt < 1:1946595/149‑1 (MQ=255)
gCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAAt < 2:2770276/145‑1 (MQ=255)
gCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAAt < 2:2350284/145‑1 (MQ=255)
gCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAAt > 1:2770276/1‑145 (MQ=255)
cTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTa < 1:1801584/150‑1 (MQ=255)
cTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTa < 2:2435877/150‑1 (MQ=255)
ttGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTaa > 1:1091236/1‑150 (MQ=255)
aTCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTcc < 1:4321215/150‑1 (MQ=255)
aTCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTcc > 2:651302/1‑150 (MQ=255)
aTCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTcc < 1:4010363/150‑1 (MQ=255)
tttAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAgt < 2:157433/150‑1 (MQ=255)
ttAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAgtg > 1:1762164/1‑150 (MQ=255)
aaCGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGtt < 2:1591925/150‑1 (MQ=255)
aaCGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGtt < 2:2626589/150‑1 (MQ=255)
aaCGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGtt > 2:1079782/1‑150 (MQ=255)
cGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTgg < 1:2954495/150‑1 (MQ=255)
ccTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGt < 2:2316406/150‑1 (MQ=255)
tGCGGATTGGCGGCGGCAATGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTa > 1:2882117/1‑150 (MQ=255)
ggATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGc > 1:4067996/1‑150 (MQ=255)
ggcggcggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTa < 2:162381/150‑1 (MQ=255)
ggcggcggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTa < 2:2388274/150‑1 (MQ=255)
ggcggcggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTa < 2:3600600/150‑1 (MQ=255)
ggcggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATc < 1:2749415/150‑1 (MQ=255)
gcggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCg < 1:517460/150‑1 (MQ=255)
ggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTc < 2:4449539/150‑1 (MQ=255)
ggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTc > 2:3084352/1‑150 (MQ=255)
ggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTc > 1:3942465/1‑150 (MQ=255)
ggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTc < 2:3842459/150‑1 (MQ=255)
ggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTc < 2:3923683/150‑1 (MQ=255)
cAAGGTTATCTTTTTGCTCTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctg > 1:4433359/1‑150 (MQ=255)
aGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctgac > 2:797887/1‑150 (MQ=255)
ggTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctgact < 1:3609835/150‑1 (MQ=255)
gTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGGATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGGTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctgactg > 2:1879091/1‑150 (MQ=255)
ttATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGAGGGTAATCGTctgactga > 2:3333823/1‑150 (MQ=255)
tATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGAt > 1:370715/1‑150 (MQ=255)
tATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGAt > 1:2724615/1‑150 (MQ=255)
tATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGAt < 1:1447155/150‑1 (MQ=255)
tATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGAt < 1:3019507/150‑1 (MQ=255)
tCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATgg > 1:2198029/1‑150 (MQ=255)
tCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATgg > 1:4197285/1‑150 (MQ=255)
tCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATgg > 1:3976227/1‑150 (MQ=255)
tCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATgg > 1:1022691/1‑150 (MQ=255)
tttGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGaa < 2:2519357/150‑1 (MQ=255)
gCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGACCaa > 1:645707/1‑150 (MQ=255)
aGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTa < 2:216936/150‑1 (MQ=255)
aGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTa > 2:1126371/1‑150 (MQ=255)
ttGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATcc > 2:2843911/1‑150 (MQ=255)
gagaCCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGaa < 2:403659/150‑1 (MQ=255)
gaCCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATg < 1:3219984/150‑1 (MQ=255)
gaCCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATg < 2:2255330/150‑1 (MQ=255)
aCCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATgg > 1:2298266/1‑150 (MQ=255)
aCCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATgg < 2:433795/150‑1 (MQ=255)
aaCTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAata < 2:4138233/150‑1 (MQ=255)
tGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATAttt > 1:2706269/1‑150 (MQ=255)
tGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATAttt > 1:2706284/1‑150 (MQ=255)
aTTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTc < 2:3291486/150‑1 (MQ=255)
aTTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTc < 2:2356478/150‑1 (MQ=255)
ttGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTcc > 1:335328/1‑150 (MQ=255)
gTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTc < 1:1241066/150‑1 (MQ=255)
gTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTc > 1:3933407/1‑150 (MQ=255)
ttttCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCg < 2:3045380/150‑1 (MQ=255)
tttCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGt < 2:2826133/150‑1 (MQ=255)
ttCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTTGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGAGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATACCAGAATGGAATATTTTCCTCGTc > 2:2674163/1‑150 (MQ=255)
tCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCa > 2:3742323/1‑150 (MQ=255)
cTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGACCAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCaa > 2:3158451/1‑150 (MQ=255)
aCTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAAc > 1:3277527/1‑150 (MQ=255)
tGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCa > 2:1550764/1‑150 (MQ=255)
gTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAg > 1:886641/1‑150 (MQ=255)
taGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTga < 2:4384436/150‑1 (MQ=255)
aGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTgag > 2:2265595/1‑150 (MQ=255)
gACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTgaga > 1:1562584/1‑150 (MQ=255)
aaGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATa < 2:4362159/150‑1 (MQ=255)
aGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATaa > 2:3453761/1‑150 (MQ=255)
gAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAagag < 2:9626/150‑1 (MQ=255)
gAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAagag > 2:1268428/1‑150 (MQ=255)
aataatCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAgg > 2:3776408/1‑150 (MQ=255)
aatCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTa < 2:1585331/150‑1 (MQ=255)
aatCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTa < 1:1771373/150‑1 (MQ=255)
atCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGACCAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGGGAGAATAAGAGGttct > 1:567785/1‑148 (MQ=255)
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gTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCa > 1:895556/1‑150 (MQ=255)
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TCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGG > SRR19973076.1024215/1‑150 (MQ=60)
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TATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTAT > SRR19973076.1744225/1‑150 (MQ=60)
TAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTATGT < SRR19973076.4085786/150‑1 (MQ=60)
TAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTATGT > SRR19973076.1371838/1‑150 (MQ=60)
AAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTATGTG < SRR19973076.1680487/150‑1 (MQ=60)
AGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTATGTGG > SRR19973076.1384093/1‑150 (MQ=60)
TAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTATGTGGCTC > SRR19973076.40445/1‑150 (MQ=60)
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TTACCACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTATGTGGCTC > CP009273/1575191‑1575488
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
