Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,290,033 |
G→T |
86.2% |
pseudogene (416/567 nt) |
insZ ← |
pseudogene, transposase homolog |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,290,033 | 0 | G | T | 86.2%
| 684.2
/ 107.4
| 285 | pseudogene (416/567 nt) | insZ | pseudogene, transposase homolog |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (20/20); new base T (118/127); total (138/147) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.66e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
AGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGTTATCCG > CP009273/1289889‑1290180
|
agagGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGc < 2:4518279/149‑1 (MQ=255)
agCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCgtgt < 1:3541275/149‑1 (MQ=255)
gCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGtt > 2:4697405/1‑149 (MQ=255)
tATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGc < 2:4546468/149‑1 (MQ=255)
aTGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGct > 1:2529470/1‑149 (MQ=255)
tGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGctc > 2:3018218/1‑149 (MQ=255)
tCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATc < 2:1115810/149‑1 (MQ=255)
tCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATc > 2:291098/1‑149 (MQ=255)
acaGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCAt < 1:656851/149‑1 (MQ=255)
aGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCAttt > 2:2832470/1‑149 (MQ=255)
aGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTGTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCACCTCTATCAttt > 2:4138085/1‑149 (MQ=255)
ggATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTc < 1:4367251/149‑1 (MQ=255)
gATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTTTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTACCAGCTCTATAAtttat > 1:211070/1‑147 (MQ=255)
gATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACATCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCATTCGTGTCGGGATGGTACCAGGTGAACCCCTGTTTCCCACCACTAACAtttat > 1:1834222/1‑147 (MQ=255)
aTAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCAATTCTg > 2:3846047/1‑149 (MQ=255)
tAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCAATTCTGa > 2:648509/1‑149 (MQ=255)
ggTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGa < 2:4761088/149‑1 (MQ=255)
tttttGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGata < 1:3766095/149‑1 (MQ=255)
ttttGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGatat < 1:1737461/149‑1 (MQ=255)
ttGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATAttc < 2:2693289/149‑1 (MQ=255)
ttGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATAttc < 2:1972579/149‑1 (MQ=255)
tGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATAttct < 1:150940/149‑1 (MQ=255)
tatCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCAGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATTCGATATTATTcc > 1:2603168/1‑149 (MQ=255)
tCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCAc < 1:2160442/149‑1 (MQ=255)
aCCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCAGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTATGATGCGATATTATTCCACgcagg > 2:525089/1‑149 (MQ=255)
aCCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGTTTGTCCCAGGTTAACCCCTGTTTACCACCTCAATAAATTAAGATGCGCTATTCTTACACccacg > 1:4487441/1‑147 (MQ=255)
gACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGGGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTATTACACgcaggcag > 1:3048863/1‑149 (MQ=255)
aCCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTATGATGCGATATTCTTACACGCAGGCAGt > 2:1566847/1‑149 (MQ=255)
ccTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCAGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTATGATGCGATATTCTTACACGCAGGCAGTa > 2:3732263/1‑149 (MQ=255)
tCGGCCTTGATGGTCGGGTGCGTTTTGTTATGAACACCACATCCAGAGCACCCCCAAGATGCTCCAGTCGTTTCCGGATGGTCCCAGGGTAAGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCAATTCTGATGCGATAATCTTCCACGCAGGCAGTAGc > 2:4519393/1‑149 (MQ=255)
tCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGCAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGc < 2:4709089/149‑1 (MQ=255)
tCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTACCAGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCAGATGCGATAATCATCCACGCAGGCAGTAGc > 2:3122835/1‑149 (MQ=255)
cGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGcc < 1:2494687/149‑1 (MQ=255)
cTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTg > 2:1959866/1‑149 (MQ=255)
cTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTg < 2:2346589/149‑1 (MQ=255)
cTTGAAGGTCGGGGGCGTTTTGTTATTAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCACCAGTCGTTTCCGGATGGTCCCAGGGTAAGCCCTGTTTCCCAGCACAAACAATTCAGAAGCGATAATCTTCCACCCACGCACAACCCAGTg > 2:2073771/1‑149 (MQ=255)
ggCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAAccc < 2:1847411/149‑1 (MQ=255)
ggCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAAccc < 1:3633817/149‑1 (MQ=255)
gTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTc > 2:3093732/1‑149 (MQ=255)
ttttGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTACACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCt > 2:2159347/1‑149 (MQ=255)
tttGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTg < 2:4037908/149‑1 (MQ=255)
tGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGt < 1:4591115/149‑1 (MQ=255)
gTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGtt > 2:467182/1‑149 (MQ=255)
gTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCGTCTGGtt > 2:2246801/1‑149 (MQ=255)
ttATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGGTGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTATTCCACGCAGGCCGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTc > 1:4213370/1‑149 (MQ=255)
aTGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAg < 1:4173600/149‑1 (MQ=255)
tGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGc < 2:1644836/149‑1 (MQ=255)
tGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGc > 2:4615504/1‑149 (MQ=255)
tGAACACCACTCCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGc < 1:4262155/149‑1 (MQ=255)
gAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCCTTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCGTCTGGTTCAGCg > 1:4357314/1‑149 (MQ=255)
aaCACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGt < 1:2813055/149‑1 (MQ=255)
aaCACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCAGTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGt > 1:1574410/1‑149 (MQ=255)
caccacTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTAACATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCCGTGGCGGTTAAAACCCGTCTGGTTCATCGTca > 2:3595222/1‑149 (MQ=255)
accacGTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTcag < 2:4464200/149‑1 (MQ=255)
ccacTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTGTCGGGCTGGTCCCAGGTTAAGCCGTGTTTACCAGCTATATCATTTGTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTATCCAGTGGCGGTTACAAACCATCTGGTTCAGCGTcagc > 1:808428/1‑149 (MQ=255)
cTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCGTCTGGTTCAGCGTcagcagc > 2:1425681/1‑149 (MQ=255)
tCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTcagcagcag < 2:2529470/149‑1 (MQ=255)
agagCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTc < 1:3795041/149‑1 (MQ=255)
agCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCtt < 2:1705957/149‑1 (MQ=255)
agCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCtt < 1:2833867/149‑1 (MQ=255)
agCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCtt < 2:2489810/149‑1 (MQ=255)
gCACCCAGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTc < 1:3341743/149‑1 (MQ=255)
aCCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGTTGGTACCTGGTGACGCCGTGTTTACCAGCACTAAAATTTATGATGGGAGATTATTACAAGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTAAAACCCTTCTGGTTAAGCGTCAGCAGCAGGTCttatc > 1:3033524/1‑146 (MQ=255)
aCCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGc < 1:3246804/149‑1 (MQ=255)
ccccGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCCGGGGCGGTTACAACCCATCTGGTTCAGCGTCAGCCGCAGGTCTTCGCt > 1:3074323/1‑149 (MQ=255)
ccccGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCATCTGGTTCAGCGGCAGCAGCCGGTCTTCGcg > 1:237958/1‑148 (MQ=255)
cccGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTg < 2:4315639/149‑1 (MQ=255)
cccGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATAATTTCTGATTCGATATTATTCCACGCAGGCAGTAGCCACTGGCGGTTACAAACCTTCTGGTTAATCGGCAGCAGCAGGTCTTCGcgg > 1:1280817/1‑147 (MQ=255)
ccGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCAATTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCCGTGGCGGTTACAACCCATCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGt > 1:3328697/1‑149 (MQ=255)
gAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTaa > 2:3467108/1‑149 (MQ=255)
gAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTAGCTGTaa > 2:4025893/1‑149 (MQ=255)
gAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCAATTATGATGCGATAATATTCCACGCAGGCAGTATCCAGTGGCGGTTAAAAACCTTCTGGTTCAGCGTCAGCCGCAGGTCTTAGCTGTaa > 1:93807/1‑149 (MQ=255)
gAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCAGGTTACGCCGTGTTTCCCCGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCCCTGGCGGTTACAACCCGTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGGaa > 1:2340726/1‑149 (MQ=255)
aaGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTaaa > 2:4244457/1‑149 (MQ=255)
aaGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTaaa > 1:4699672/1‑149 (MQ=255)
tGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCATCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAg > 1:3982879/1‑149 (MQ=255)
tCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGttt < 2:264945/149‑1 (MQ=255)
ccAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTa < 2:84592/149‑1 (MQ=255)
ccAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTa > 2:2586558/1‑149 (MQ=255)
cGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCaaa < 2:406192/149‑1 (MQ=255)
gTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAaac < 1:824354/149‑1 (MQ=255)
ttCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAaacaa < 2:118972/149‑1 (MQ=255)
ggATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTa < 1:2413655/149‑1 (MQ=255)
gATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTaa < 1:2941105/149‑1 (MQ=255)
gATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTaa > 2:1815664/1‑149 (MQ=255)
aTGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAAt < 2:4604273/149‑1 (MQ=255)
tGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATa < 1:3209436/149‑1 (MQ=255)
tGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATa > 1:2760030/1‑149 (MQ=255)
ggTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCGTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATag < 2:1278841/149‑1 (MQ=255)
gTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATaga > 1:4152379/1‑149 (MQ=255)
gTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATaga < 1:612534/149‑1 (MQ=255)
gTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATaga < 1:1961207/149‑1 (MQ=255)
gTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATaga < 2:809974/149‑1 (MQ=255)
gTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATaga < 2:3199296/149‑1 (MQ=255)
tCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATagag < 1:2716761/149‑1 (MQ=255)
tCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGGAATagag > 2:2977110/1‑149 (MQ=255)
cccTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGt > 1:144055/1‑149 (MQ=255)
cTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGCTGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTACGCTGTAAAAAAGTTTATCAAAAAACGTAATAGAGttc > 2:2500374/1‑148 (MQ=255)
tGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGTTAt < 2:1557271/149‑1 (MQ=255)
tGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGACATAGAGATATCCg > 1:111554/1‑149 (MQ=255)
|
AGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGTTATCCG > CP009273/1289889‑1290180
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGTTATCCGG > CP009273/1289885‑1290181
|
CTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTA < SRR19973071.3062187/150‑1 (MQ=60)
AGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGT > SRR19973071.2995350/1‑150 (MQ=60)
GGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTG < SRR19973071.145092/150‑1 (MQ=60)
GGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGGG > SRR19973071.207989/1‑150 (MQ=60)
AGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTT < SRR19973071.3553651/150‑1 (MQ=60)
GGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCC < SRR19973071.927745/150‑1 (MQ=60)
ACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAG < SRR19973071.617762/150‑1 (MQ=60)
ACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAG < SRR19973071.466830/150‑1 (MQ=60)
TATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACCCCGTGTTTACCAGCT > SRR19973071.2538671/1‑150 (MQ=60)
TGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCT < SRR19973071.1777918/150‑1 (MQ=60)
TTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGGGTTTCCCAGCACTATC > SRR19973071.4201961/1‑150 (MQ=60)
TTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGATGGTACCAGGTTACGCCGTGTTTACCAGCACAATC > SRR19973071.2410546/1‑150 (MQ=60)
ACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATT < SRR19973071.659239/150‑1 (MQ=60)
CAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTT < SRR19973071.3084606/150‑1 (MQ=60)
CAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTT < SRR19973071.3084586/150‑1 (MQ=60)
GGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTTTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTACCAGCTCTATAATTTAT > SRR19973071.211919/1‑150 (MQ=60)
GGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCT < SRR19973071.4382612/150‑1 (MQ=60)
GGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCT < SRR19973071.3788381/150‑1 (MQ=60)
GATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTG < SRR19973071.274430/150‑1 (MQ=60)
TAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGAT < SRR19973071.2828406/150‑1 (MQ=60)
TAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCAGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGAT > SRR19973071.1506991/1‑150 (MQ=60)
TAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTACCTGGGTAAGCCGTGTTTGCCAGCTCTATAATTTGTGAT > SRR19973071.3312470/1‑150 (MQ=60)
GTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATA < SRR19973071.2876265/150‑1 (MQ=60)
TTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATAT < SRR19973071.3779483/150‑1 (MQ=60)
TTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATT < SRR19973071.1743937/150‑1 (MQ=60)
TTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATT < SRR19973071.930942/150‑1 (MQ=60)
TTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCAGGTTACGCCGTGTTTACCAGCACTATCATTTATGATTCGATATTA > SRR19973071.3915398/1‑150 (MQ=60)
TGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTT < SRR19973071.151625/150‑1 (MQ=60)
ATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCAGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATTCGATATTATTCC > SRR19973071.2612582/1‑150 (MQ=60)
ATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCAC < SRR19973071.2457234/150‑1 (MQ=60)
ATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGGGTTTACCAGCTCaataaattatgtttcgatattattaaac > SRR19973071.2112725/1‑122 (MQ=60)
TCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACG < SRR19973071.2168429/150‑1 (MQ=60)
TCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACG < SRR19973071.2168269/150‑1 (MQ=60)
TCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACG < SRR19973071.2168194/150‑1 (MQ=60)
AACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACATCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGATGGTCCCAGGTTACGCCGggtttaccaacgcaatcaattattattcgctattaatacacccagg > SRR19973071.4503345/1‑104 (MQ=60)
CGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAG < SRR19973071.1641087/150‑1 (MQ=60)
CGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAG < SRR19973071.490136/150‑1 (MQ=60)
CGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCAGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATAAATTATGATGCGATATTCTTacaccccggcac > SRR19973071.3059102/1‑138 (MQ=60)
CGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGGGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTATTACACGCAGGCAG > SRR19973071.3059695/1‑150 (MQ=60)
GACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGT < SRR19973071.1545915/150‑1 (MQ=60)
CCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAG < SRR19973071.812932/150‑1 (MQ=60)
CCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGATGGTCCCAGGTTACGCCGTGTTTACCAGCTCTATCATTTATGATTCGATATTATTACACGCCGGCAGTAG > SRR19973071.2290999/1‑150 (MQ=60)
CGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCA < SRR19973071.2626568/150‑1 (MQ=60)
CGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCA < SRR19973071.113316/150‑1 (MQ=60)
CGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCA < SRR19973071.2503766/150‑1 (MQ=60)
TGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCG < SRR19973071.1903727/150‑1 (MQ=60)
GGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGCTGGTCCCAGGTGACGCCGTGTTTCCCACCTCTATAATTTATGATTCGATATTCTTACACCCAGGCAGTAGCCACTGGCGGTTACAACCCA > SRR19973071.4081439/1‑150 (MQ=60)
GGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCT < SRR19973071.3646586/150‑1 (MQ=60)
GTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCT > SRR19973071.2750316/1‑150 (MQ=60)
GTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTATTCCACGCAGGCAGTAGCCCGTGGCGGTTACAACCCTTCT > SRR19973071.2458417/1‑150 (MQ=60)
GTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTGTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCGTCT > SRR19973071.4280647/1‑150 (MQ=60)
TGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTT < SRR19973071.4607480/150‑1 (MQ=60)
GTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGGTGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTATTCCACGCAGGCCGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTC > SRR19973071.4228354/1‑150 (MQ=60)
TTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATAATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCA > SRR19973071.3051900/1‑150 (MQ=60)
ATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGC < SRR19973071.4188458/150‑1 (MQ=60)
TGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCCTTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCGTCTGGTTCAGCG > SRR19973071.4372655/1‑150 (MQ=60)
TGAACACCACTCCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCG < SRR19973071.4277304/150‑1 (MQ=60)
TGAACACCACTCCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCG < SRR19973071.4277271/150‑1 (MQ=60)
TGAACACCACTCCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCG < SRR19973071.4277270/150‑1 (MQ=60)
GAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTATCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGT > SRR19973071.3978040/1‑150 (MQ=60)
GAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCAGTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGT > SRR19973071.1579991/1‑150 (MQ=60)
GAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGGGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGT > SRR19973071.1580018/1‑150 (MQ=60)
AACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTC < SRR19973071.2823278/150‑1 (MQ=60)
AACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTC < SRR19973071.2822991/150‑1 (MQ=60)
AACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTC < SRR19973071.2822987/150‑1 (MQ=60)
ACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCA < SRR19973071.4196251/150‑1 (MQ=60)
ACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGC > SRR19973071.351374/1‑150 (MQ=60)
ACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTGTCGGGCTGGTCCCAGGTTAAGCCGTGTTTACCAGCTATATCATTTGTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTATCCAGTGGCGGTTACAAACCATCTGGTTCAGCGTCAGC > SRR19973071.811140/1‑150 (MQ=60)
CCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCGTCTGGTTCAGCGTCAGCA > SRR19973071.323037/1‑150 (MQ=60)
CACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAG < SRR19973071.3223455/150‑1 (MQ=60)
CACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAG < SRR19973071.2881995/150‑1 (MQ=60)
AGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCT < SRR19973071.3808529/150‑1 (MQ=60)
AGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCT < SRR19973071.3808525/150‑1 (MQ=60)
AGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCT < SRR19973071.426218/150‑1 (MQ=60)
AGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCT < SRR19973071.2261456/150‑1 (MQ=60)
GGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCGGGTGCCGCCGGGTTTACCAGCTCTATCATTTCTGATGCGCTATTATTCCACCCCGGCCGTAGCCACGGGCGGGTACAACCCCTCCGGTTCAGCGTCAGCAGCcgggcgtc > SRR19973071.3740607/1‑142 (MQ=60)
AGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTC < SRR19973071.1789256/150‑1 (MQ=60)
AGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTC > SRR19973071.2695679/1‑150 (MQ=60)
AGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTC < SRR19973071.2843925/150‑1 (MQ=60)
GCACCCAGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCG < SRR19973071.3353588/150‑1 (MQ=60)
CACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGTTGGTACCTGGTGACGCCGTGTTTACCAGCACTAAAATTTATGATGGGAGATTATTACAAGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTAAAACCCTTCTGGTTAAGCGTCAGCAGCAGGTCTTatc > SRR19973071.3044317/1‑147 (MQ=60)
ACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCCGGGGCGGTTACAACCCATCTGGTTCAGCGTCAGCCGCAGGTCTTCGCT > SRR19973071.3085207/1‑150 (MQ=60)
ACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCT < SRR19973071.2551132/150‑1 (MQ=60)
ACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCT < SRR19973071.4525794/150‑1 (MQ=60)
ACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCT < SRR19973071.3258256/150‑1 (MQ=60)
ACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCG > SRR19973071.3198862/1‑150 (MQ=60)
ACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCATCTGGTTCAGCGGCAGCAGCCGGTCTTCGCG > SRR19973071.238875/1‑150 (MQ=60)
ACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATGTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGTAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCT < SRR19973071.2551164/150‑1 (MQ=60)
CCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTG < SRR19973071.707902/150‑1 (MQ=60)
CCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTG < SRR19973071.3107285/150‑1 (MQ=60)
CCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTAGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATAATTTCTGATTCGATATTATTCCACGCAGGCAGTAGCCACTGGCGGTTACAAACCTTCTGGTTAATCGGCAGCAGCAGGTCTTCGCGG > SRR19973071.1285467/1‑150 (MQ=60)
CCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCAATTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCCGTGGCGGTTACAACCCATCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGT > SRR19973071.3340494/1‑150 (MQ=60)
CCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATAATTTATGATGCGATATTCTTACACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTAAAACCCATCTGGTTAAGCGTCAGCAGCAGGTCTTAGCTGT > SRR19973071.3340448/1‑150 (MQ=60)
CCCGAAGATGCTCCAGTCGTGTCGGGATGGTCCCATGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTATGATTCGATATTCTTACACCCAGGCAGTATCCAGTGGCGGTTAAAAACCATCTGGTTCAGCGTCAGCACCAGGTCTTCGCTGT > SRR19973071.3340498/1‑150 (MQ=60)
CCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTA < SRR19973071.2375672/150‑1 (MQ=60)
CCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTA < SRR19973071.2375703/150‑1 (MQ=60)
CCGAAGATGCTCCAGTCGTGTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTATGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAAACCGTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCggga > SRR19973071.4377815/1‑146 (MQ=60)
CGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCAATTATGATGCGATAATATTCCACGCAGGCAGTATCCAGTGGCGGTTAAAAACCTTCTGGTTCAGCGTCAGCCGCAGGTCTTAGCTGTAA > SRR19973071.94295/1‑150 (MQ=60)
CGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCAGGTTACGCCGTGTTTCCCCGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCCCTGGCGGTTACAACCCGTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGGAA > SRR19973071.2349226/1‑150 (MQ=60)
GAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAA > SRR19973071.4716355/1‑150 (MQ=60)
GATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCGTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAA < SRR19973071.4376247/150‑1 (MQ=60)
ATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCATCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAG > SRR19973071.3996818/1‑150 (MQ=60)
CTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTT < SRR19973071.2504931/150‑1 (MQ=60)
CTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTT < SRR19973071.3713405/150‑1 (MQ=60)
TCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCGTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTA < SRR19973071.142896/150‑1 (MQ=60)
AGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATAATTTCTGATGCGATATTATTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATAA > SRR19973071.985167/1‑150 (MQ=60)
CGTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAAC < SRR19973071.3608706/150‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACA < SRR19973071.827200/150‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACA < SRR19973071.827189/150‑1 (MQ=60)
TTTCGGGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAA < SRR19973071.3524916/150‑1 (MQ=60)
GGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAA < SRR19973071.2422367/150‑1 (MQ=60)
GGATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAA < SRR19973071.2422330/150‑1 (MQ=60)
GATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAAT < SRR19973071.2951641/150‑1 (MQ=60)
GATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAAT < SRR19973071.746735/150‑1 (MQ=60)
ATGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATA > SRR19973071.2769776/1‑150 (MQ=60)
TGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAG < SRR19973071.3220672/150‑1 (MQ=60)
TGGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAG < SRR19973071.4514240/150‑1 (MQ=60)
GGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGA > SRR19973071.4167166/1‑150 (MQ=60)
GGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGA > SRR19973071.4167154/1‑150 (MQ=60)
GGTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGA > SRR19973071.4167172/1‑150 (MQ=60)
GTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAG < SRR19973071.614800/150‑1 (MQ=60)
GTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAG < SRR19973071.615182/150‑1 (MQ=60)
GTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAG < SRR19973071.1519386/150‑1 (MQ=60)
GTCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAG < SRR19973071.1968325/150‑1 (MQ=60)
TCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGT > SRR19973071.144723/1‑150 (MQ=60)
TCCCTGGTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGT < SRR19973071.2726433/150‑1 (MQ=60)
TGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGTTATC > SRR19973071.1402096/1‑150 (MQ=60)
GTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGTTATCCG < SRR19973071.124605/150‑1 (MQ=60)
GTTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGTTATCCG < SRR19973071.124490/150‑1 (MQ=60)
GTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGACATAGAGATATCCG > SRR19973071.112107/1‑150 (MQ=60)
TTACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGTTATCCGG > SRR19973071.4777152/1‑150 (MQ=60)
|
CTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATGAACACCACTTCCAGAGCACCCCGAAGATGCTCCAGTCGTTTCGGGATGGTCCCTGGTGACGCCGTGTTTCCCAGCTCTATCATTTCTGATGCGATATTCTTCCACGCAGGCAGTAGCCAGTGGCGGTTACAACCCTTCTGGTTCAGCGTCAGCAGCAGGTCTTCGCTGTAAAAAAGTTTATCAAACAACGTAATAGAGTTATCCGG > CP009273/1289885‑1290181
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |