Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP009273 |
2,359,673 |
G→T |
100% |
M89I (ATG→ATT) |
arnB → |
uridine 5'‑(beta‑1‑threo‑pentapyranosyl‑4‑ulose diphosphate) aminotransferase, PLP‑dependent |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP009273 | 2,359,673 | 0 | G | T | 100.0%
| 646.7
/ ‑6.7
| 196 | M89I (ATG→ATT) | arnB | uridine 5'‑(beta‑1‑threo‑pentapyranosyl‑4‑ulose diphosphate) aminotransferase, PLP‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (108/87); minor base A (1/0); total (109/87) |
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
CTTTTTGCCAGTTGACGGGAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATT > CP009273/2359528‑2359817
|
cTTTTTGCCAGTTGACGGGAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAAtattat < 1:3143460/148‑1 (MQ=255)
tttttGCCAGTTGACGGGACATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATattatt < 2:2496309/148‑1 (MQ=255)
ttttGCCAGTTGACGGGAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTAttt < 1:1355514/148‑1 (MQ=255)
ttttGCCAGTTGACGGGAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTAttt < 2:823694/148‑1 (MQ=255)
tttGCCAGTTGACGGGAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTc < 1:3245542/148‑1 (MQ=255)
ttGCCAGTTGACGGGAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTcc < 2:488292/148‑1 (MQ=255)
tGCCAGTTGACGGGAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCt > 1:233360/1‑148 (MQ=255)
ccAGTTGACGGGAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCttg < 2:3678014/148‑1 (MQ=255)
ccAGTTGACGGGAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCttg < 2:3120594/148‑1 (MQ=255)
gACGGGAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGt > 1:1275492/1‑148 (MQ=255)
ggAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCaa < 2:1654585/148‑1 (MQ=255)
gAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAAc > 2:625513/1‑148 (MQ=255)
aaaTCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACg < 1:57264/148‑1 (MQ=255)
gCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTa > 2:3067806/1‑148 (MQ=255)
gCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATAGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCACTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCAATTTTGGGTGCAACGCCGGTa > 1:3171409/1‑148 (MQ=255)
cATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTaa < 2:2864694/148‑1 (MQ=255)
cATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTaa < 2:805725/148‑1 (MQ=255)
cATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTaa > 1:886519/1‑148 (MQ=255)
tGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAAtg < 2:384751/148‑1 (MQ=255)
gCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAAtgg < 2:3293930/148‑1 (MQ=255)
gCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAAtgg < 2:1821674/148‑1 (MQ=255)
gCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAAtgg > 1:1568063/1‑148 (MQ=255)
cgGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGt < 2:264439/148‑1 (MQ=255)
ggTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTc > 2:630890/1‑148 (MQ=255)
cAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGAc > 1:1395260/1‑148 (MQ=255)
gTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCACCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACcg > 1:2880198/1‑148 (MQ=255)
ttCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACcgc > 1:2441823/1‑148 (MQ=255)
aGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGAt < 1:2708099/148‑1 (MQ=255)
aGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGAt < 1:2163781/148‑1 (MQ=255)
aGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGAt < 1:3609540/148‑1 (MQ=255)
gCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATa < 2:1845916/148‑1 (MQ=255)
ccACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATAc > 2:1769749/1‑148 (MQ=255)
ccACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATAc > 2:1454862/1‑148 (MQ=255)
ccACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATAc > 2:1769698/1‑148 (MQ=255)
ccACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATAc > 2:806887/1‑148 (MQ=255)
gAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGt > 1:401693/1‑148 (MQ=255)
gAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGt > 1:3364518/1‑148 (MQ=255)
tGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTGGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCAc > 1:294237/1‑148 (MQ=255)
cATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGc > 1:923996/1‑148 (MQ=255)
atatCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGcc < 1:2080171/148‑1 (MQ=255)
atCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTg > 2:1695016/1‑148 (MQ=255)
cACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTCATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGaa > 1:3010441/1‑148 (MQ=255)
cGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGc < 2:1784606/148‑1 (MQ=255)
gCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCt > 2:211789/1‑148 (MQ=255)
aaTGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATc > 2:96557/1‑148 (MQ=255)
aTGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGAGATGAAGTGAGTAAGCCTTGCCTGACCTGTGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCg < 2:1164313/148‑1 (MQ=255)
ggCTTTGTAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGAGCTTGGTTTCAACACTAATTAGTATTTCCTTGTTTGGTGCATCGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCTCGCCTGAAGCTATCGAg < 2:2648166/148‑1 (MQ=255)
ggCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAg < 2:731255/148‑1 (MQ=255)
gCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGt < 1:3071581/148‑1 (MQ=255)
tGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGc > 1:870080/1‑148 (MQ=255)
tGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACg > 2:257610/1‑148 (MQ=255)
aGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACg > 2:3800112/1‑148 (MQ=255)
aGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACg < 1:804745/148‑1 (MQ=255)
gggCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGc > 1:1012422/1‑148 (MQ=255)
gggCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGc > 2:215310/1‑148 (MQ=255)
ggCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCa < 2:870080/148‑1 (MQ=255)
ggCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCa < 2:3364518/148‑1 (MQ=255)
aTGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTaa < 2:233360/148‑1 (MQ=255)
aTGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTaa < 2:235136/148‑1 (MQ=255)
aaGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGc < 2:840612/148‑1 (MQ=255)
aaGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGc > 2:774920/1‑148 (MQ=255)
aaGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGc > 2:1387348/1‑148 (MQ=255)
aaGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGc > 2:1388330/1‑148 (MQ=255)
gTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCca > 2:1963322/1‑148 (MQ=255)
gTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCca < 2:3661627/148‑1 (MQ=255)
tGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCcat > 1:1681185/1‑148 (MQ=255)
tGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGACGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCcat > 1:2655208/1‑148 (MQ=255)
aTTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCcatca > 1:3473758/1‑148 (MQ=255)
tACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCAtt > 2:2212806/1‑148 (MQ=255)
aCGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTAGTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTc < 2:172592/148‑1 (MQ=255)
gCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCg > 2:3584009/1‑148 (MQ=255)
ccTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCgg < 1:3728592/148‑1 (MQ=255)
ttCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTg > 1:3671553/1‑148 (MQ=255)
tCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGc > 1:471485/1‑148 (MQ=255)
cccTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCa < 2:211159/148‑1 (MQ=255)
ccTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCAt < 1:1222960/148‑1 (MQ=255)
cTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCAtt < 2:3515815/148‑1 (MQ=255)
cTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCAtt < 2:1285895/148‑1 (MQ=255)
tGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTa > 1:428667/1‑148 (MQ=255)
tGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTa > 1:689851/1‑148 (MQ=255)
tGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTa > 1:2607474/1‑148 (MQ=255)
gACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTAt > 2:846195/1‑148 (MQ=255)
ccTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGc > 2:2751082/1‑148 (MQ=255)
tGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCg > 1:1837154/1‑148 (MQ=255)
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CTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGC > SRR19973069.474919/1‑150 (MQ=60)
CTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGC > SRR19973069.474770/1‑150 (MQ=60)
CCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATT > SRR19973069.495372/1‑150 (MQ=60)
CCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTA > SRR19973069.694676/1‑150 (MQ=60)
CCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTA > SRR19973069.2624895/1‑150 (MQ=60)
CCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTA > SRR19973069.431817/1‑150 (MQ=60)
CCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTA < SRR19973069.1231317/150‑1 (MQ=60)
TGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATG < SRR19973069.2690113/150‑1 (MQ=60)
CCTGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCG > SRR19973069.1850008/1‑150 (MQ=60)
TGGGTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGT > SRR19973069.2235819/1‑150 (MQ=60)
GTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTTAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCG > SRR19973069.3164716/1‑150 (MQ=60)
GTTTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCG > SRR19973069.3164753/1‑150 (MQ=60)
TTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCC < SRR19973069.812603/150‑1 (MQ=60)
TTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCC < SRR19973069.1782168/150‑1 (MQ=60)
TTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCC < SRR19973069.1782203/150‑1 (MQ=60)
TTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCC < SRR19973069.1782219/150‑1 (MQ=60)
TTCAACCCTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCC < SRR19973069.812181/150‑1 (MQ=60)
CTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGAT > SRR19973069.1171752/1‑150 (MQ=60)
CTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGAT > SRR19973069.2645667/1‑150 (MQ=60)
CTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGAT > SRR19973069.471783/1‑150 (MQ=60)
CTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGAT < SRR19973069.359078/150‑1 (MQ=60)
CTCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGAT > SRR19973069.219016/1‑150 (MQ=60)
TCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATA < SRR19973069.1845494/150‑1 (MQ=60)
TCAATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATA < SRR19973069.1112029/150‑1 (MQ=60)
AATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATT > SRR19973069.3622907/1‑150 (MQ=60)
AATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATT < SRR19973069.2715502/150‑1 (MQ=60)
AATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATT > SRR19973069.2537003/1‑150 (MQ=60)
AATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATT > SRR19973069.2536978/1‑150 (MQ=60)
ATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTG > SRR19973069.1777207/1‑150 (MQ=60)
ATATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTG > SRR19973069.3436968/1‑150 (MQ=60)
TATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGA > SRR19973069.313545/1‑150 (MQ=60)
ATTATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGAC < SRR19973069.3056689/150‑1 (MQ=60)
TATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGC > SRR19973069.1444012/1‑150 (MQ=60)
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CAAGCTTTTTGCCAGTTGACGGGAAATCAGCATGCCATCGCGGTCAGTTCAGCCACCGCCGGAATGCATATCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGC > CP009273/2359524‑2359822
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |