Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
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95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
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description |
| RA |
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|
| |
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new |
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reads |
annotation |
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| * | CP009273 | 4,163,117 | 0 | T | A | 49.3%
| 8.4
/ inf
| 221 | I36I (ATT→ATA) | birA | bifunctional biotin‑[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase/ DNA‑binding transcriptional repressor, bio‑5'‑AMP‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/55); new base A (57/52); total (114/107) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.89e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GGTGCATCAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAGTGTAGCCGTGCTGC > CP009273/4162972‑4163262
|
gTGCATCAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATtaat > 2:2894906/1‑148 (MQ=255)
aTCAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAac < 1:1748472/148‑1 (MQ=255)
cAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAacac < 1:2577706/148‑1 (MQ=255)
cAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAacac > 1:61560/1‑148 (MQ=255)
aGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAAcaca < 1:2785959/148‑1 (MQ=255)
ggTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACAt < 2:3794966/148‑1 (MQ=255)
ggTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACAt < 1:1385428/148‑1 (MQ=255)
ggTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACAt < 2:3537314/148‑1 (MQ=255)
tGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTc > 2:325218/1‑148 (MQ=255)
tGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTc < 2:2075168/148‑1 (MQ=255)
aaGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAg < 2:2480/148‑1 (MQ=255)
aGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGa > 1:3244622/1‑148 (MQ=255)
gAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGacac < 1:1598243/148‑1 (MQ=255)
aGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACt > 2:3350332/1‑148 (MQ=255)
gcgcAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTg < 1:1116938/148‑1 (MQ=255)
gcAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCg < 2:3307254/148‑1 (MQ=255)
gTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGa < 2:1675397/148‑1 (MQ=255)
gTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGACACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGATCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGa < 2:3595484/148‑1 (MQ=255)
tGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGAc > 1:862880/1‑148 (MQ=255)
tGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGAc > 1:3667039/1‑148 (MQ=255)
gagaCAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTg < 1:1225349/148‑1 (MQ=255)
agaCAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTgg < 1:2825986/148‑1 (MQ=255)
cAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGc > 1:517124/1‑148 (MQ=255)
aaTTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCg > 2:2446407/1‑148 (MQ=255)
aTTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGt < 1:1344553/148‑1 (MQ=255)
tttCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGtt > 2:424997/1‑148 (MQ=255)
ttCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTg < 2:2404861/148‑1 (MQ=255)
ttCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTg > 1:2499441/1‑148 (MQ=255)
tCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGa < 2:709452/148‑1 (MQ=255)
tCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGa < 2:2043814/148‑1 (MQ=255)
cATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGAt > 1:3060335/1‑148 (MQ=255)
gAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTc > 2:1138075/1‑148 (MQ=255)
aGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCtt < 1:1923334/148‑1 (MQ=255)
ggATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCttt > 2:1554056/1‑148 (MQ=255)
gATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATGAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTa > 2:757485/1‑148 (MQ=255)
gATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTa > 1:3589045/1‑148 (MQ=255)
tAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTAcc > 1:2263899/1‑148 (MQ=255)
aaCACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGTCACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCGCTTAATTGACTCAGTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGGTGATGTCTTTAGCg > 1:3187298/1‑148 (MQ=255)
acacCGTTACACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTTGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAAAACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGt > 2:2349124/1‑148 (MQ=255)
cacCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGtt > 2:1267574/1‑148 (MQ=255)
acCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTc > 1:3406842/1‑148 (MQ=255)
ccGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTcc > 1:1455190/1‑148 (MQ=255)
cGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCg > 1:3705360/1‑148 (MQ=255)
tGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCggg > 1:3068960/1‑148 (MQ=255)
gCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGt > 1:997115/1‑148 (MQ=255)
gCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGt > 1:3032512/1‑148 (MQ=255)
aCTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTaaa > 1:683939/1‑148 (MQ=255)
cTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAg < 1:2894944/148‑1 (MQ=255)
gAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGa > 2:3634598/1‑148 (MQ=255)
attgattgCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTCTAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATAc > 1:3081047/1‑148 (MQ=255)
attgattgCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATAc > 2:1902604/1‑148 (MQ=255)
tgattgCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAg > 1:1999471/1‑148 (MQ=255)
gattgCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAgc < 1:1548999/148‑1 (MQ=255)
tgCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAgcctg > 2:54444/1‑148 (MQ=255)
tgCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAgcctg > 2:51519/1‑148 (MQ=255)
gCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAgcctgc < 2:3767015/148‑1 (MQ=255)
gCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAgcctgc < 2:1826165/148‑1 (MQ=255)
tGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGa > 1:1579152/1‑148 (MQ=255)
tAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGcc > 2:662043/1‑148 (MQ=255)
cGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTAt > 2:2222210/1‑148 (MQ=255)
gAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATc < 2:1272648/148‑1 (MQ=255)
cGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAg > 2:3171269/1‑148 (MQ=255)
ggTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGt < 2:1967584/148‑1 (MQ=255)
aaTTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACt < 1:1384079/148‑1 (MQ=255)
aTTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACtt > 1:3422278/1‑148 (MQ=255)
ttCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTaa > 1:2674319/1‑148 (MQ=255)
ttCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTaa > 1:2674501/1‑148 (MQ=255)
cACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATg < 2:323815/148‑1 (MQ=255)
aCTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGc > 1:808993/1‑148 (MQ=255)
tctGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCCGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTa > 2:2442836/1‑148 (MQ=255)
ggCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAAc > 2:2973998/1‑148 (MQ=255)
ggCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAAc < 2:3032512/148‑1 (MQ=255)
ggCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAAc > 1:2348183/1‑148 (MQ=255)
cAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGatat > 2:2186320/1‑148 (MQ=255)
cAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGatat > 2:1776704/1‑148 (MQ=255)
cAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGatat > 2:162272/1‑148 (MQ=255)
aGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATAtt < 1:3739828/148‑1 (MQ=255)
ttGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTgg > 1:2566742/1‑148 (MQ=255)
ttGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTgg > 1:2245584/1‑148 (MQ=255)
ttGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTgg > 2:2712798/1‑148 (MQ=255)
ggTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTc > 1:3651840/1‑148 (MQ=255)
tGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAg < 1:2105791/148‑1 (MQ=255)
gAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGc < 1:1447591/148‑1 (MQ=255)
aaCGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTg > 1:2867139/1‑148 (MQ=255)
aCGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTgg < 1:1902604/148‑1 (MQ=255)
cGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGa > 2:3097659/1‑148 (MQ=255)
cTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATg < 2:61560/148‑1 (MQ=255)
ggAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCg > 1:101385/1‑148 (MQ=255)
gAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCgg < 2:3499638/148‑1 (MQ=255)
aaTGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGt > 2:688598/1‑148 (MQ=255)
aaTGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGt > 1:35581/1‑148 (MQ=255)
aTGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTa < 2:1455190/148‑1 (MQ=255)
aGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAgtg > 1:2760844/1‑148 (MQ=255)
aGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAgtg < 2:3589045/148‑1 (MQ=255)
gCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAgtgt < 2:2499815/148‑1 (MQ=255)
ggcTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAGTGTAGCCGtg > 1:428472/1‑148 (MQ=255)
ggcTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAGTGTAGCCGtg < 2:125817/148‑1 (MQ=255)
ggcTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAGTGTAGCCGtg < 1:545782/148‑1 (MQ=255)
gcTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAGTGTAGCCGtgc < 1:232196/148‑1 (MQ=255)
aTTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAGTGTAGCCGtgctgc < 2:2043356/148‑1 (MQ=255)
|
GGTGCATCAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAGTGTAGCCGTGCTGC > CP009273/4162972‑4163262
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
