Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F55 I0 R1
|
519 |
344.2 |
11360120 |
95.0% |
10792114 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
828,374 |
G→T |
81.4% |
V11V (GTC→GTA) |
ybiA ← |
DUF1768 family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 828,374 | 0 | G | T | 81.4%
| 678.3
/ 173.8
| 300 | V11V (GTC→GTA) | ybiA | DUF1768 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/32); new base T (121/122); total (146/154) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.76e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
TATTTTTCATCAAGGAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATTTCAGGTT > CP009273/828225‑828520
|
tATTTTTCATCAAGGAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATg > 2:3359394/1‑150 (MQ=255)
tttttCATCAAGGAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTAc > 2:4260167/1‑150 (MQ=255)
atcaAGGAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTg < 2:4724012/150‑1 (MQ=255)
atcaAGGAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTg > 2:2624118/1‑150 (MQ=255)
aaGGAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGAt > 1:3177366/1‑150 (MQ=255)
aaGGAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGAt < 2:1551323/150‑1 (MQ=255)
aaGGAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGAt > 1:3318046/1‑150 (MQ=255)
aaGGAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGAt > 1:4110327/1‑150 (MQ=255)
ggACTTTTTGTGCCTGAACATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATcc > 2:2688643/1‑150 (MQ=255)
ggAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATcc < 1:1664160/150‑1 (MQ=255)
ggAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATcc > 2:1787552/1‑150 (MQ=255)
ggAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATcc > 2:4772249/1‑150 (MQ=255)
gAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCt < 2:43707/150‑1 (MQ=255)
gAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCt < 2:43566/150‑1 (MQ=255)
gAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCt > 1:2970416/1‑150 (MQ=255)
aTTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCttt < 1:2192710/150‑1 (MQ=255)
aTTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCttt < 2:3099817/150‑1 (MQ=255)
tgCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCg < 2:3846465/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCTACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGaa > 2:3536581/1‑150 (MQ=255)
ccTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGaa > 2:5037519/1‑150 (MQ=255)
cTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGTTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAAc < 2:1024606/150‑1 (MQ=255)
aaaaTAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACggg > 2:5110324/1‑150 (MQ=255)
aaaaTAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACggg > 1:3757339/1‑150 (MQ=255)
aaaaTAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACggg > 1:1632687/1‑150 (MQ=255)
aaaTAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGc > 1:918647/1‑150 (MQ=255)
tAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCAtt > 1:2750466/1‑150 (MQ=255)
aGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTa > 1:753144/1‑150 (MQ=255)
aGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTa < 2:3630652/150‑1 (MQ=255)
tCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCg > 2:2009767/1‑150 (MQ=255)
cTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGc > 1:3875264/1‑150 (MQ=255)
cTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGc > 1:1031476/1‑150 (MQ=255)
ggTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTa < 1:1195442/150‑1 (MQ=255)
gTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTAt < 1:1979231/150‑1 (MQ=255)
ggCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGtt > 1:432432/1‑150 (MQ=255)
aGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTtggtg > 1:264884/1‑150 (MQ=255)
ggTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTtggtgg < 2:4619915/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTtggtgg < 1:887377/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTaggtgg > 2:5084970/1‑150 (MQ=255)
gTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTggtggt < 1:3607776/150‑1 (MQ=255)
ttttCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTCGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGtt > 2:5505406/1‑150 (MQ=255)
ttttCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGtt > 2:1141004/1‑150 (MQ=255)
ttttCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGGGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGtt < 2:1322779/150‑1 (MQ=255)
tttCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTa < 1:4240253/150‑1 (MQ=255)
tttCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTa < 2:2142490/150‑1 (MQ=255)
tCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTAtt > 1:3542312/1‑150 (MQ=255)
tCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTAtt < 1:2920665/150‑1 (MQ=255)
cccGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTg > 2:4279025/1‑150 (MQ=255)
ccGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGc < 2:491976/150‑1 (MQ=255)
ccGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGc < 1:65019/150‑1 (MQ=255)
gTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGa > 2:2931075/1‑150 (MQ=255)
aCCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCg < 1:1905440/150‑1 (MQ=255)
tGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCca < 2:4189377/150‑1 (MQ=255)
ggCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcaga < 1:2927781/150‑1 (MQ=255)
gcggcAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcagaaacaga > 2:515964/1‑150 (MQ=255)
cggcAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGGGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcagaaacagaa > 2:5312370/1‑150 (MQ=255)
ggcAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcagaaacagaaa > 1:4170392/1‑150 (MQ=255)
cAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGaaaaa < 1:3299631/150‑1 (MQ=255)
aGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCa > 2:4825839/1‑150 (MQ=255)
ttAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCAtt < 1:5069587/150‑1 (MQ=255)
gAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTAcc < 1:3072347/150‑1 (MQ=255)
gAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTAcc < 1:209946/150‑1 (MQ=255)
gAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTAcc > 1:1368026/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTAccc > 1:2910357/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTAccc > 1:1763482/1‑150 (MQ=255)
aaTCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTg > 1:3635716/1‑150 (MQ=255)
aTCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGa > 1:4688158/1‑150 (MQ=255)
cACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGaaa < 1:2606951/150‑1 (MQ=255)
ccGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAAc < 1:1215182/150‑1 (MQ=255)
cGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAAcc < 1:5612422/150‑1 (MQ=255)
cGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAAcc < 1:486384/150‑1 (MQ=255)
cGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAAcc > 1:5244607/1‑150 (MQ=255)
cGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAAcc < 1:2246701/150‑1 (MQ=255)
tAGTCATCGCTGTTGCTCTAGAAATTTATTATGGTGTCATGCATAACGTGTTGGATCCTTTGTGCTAGAACGGGCATTAAACCGCAGTATGTTGTTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGa > 2:526380/1‑150 (MQ=255)
tAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCGTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGa < 1:4295720/150‑1 (MQ=255)
gTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGaaa < 1:5030074/150‑1 (MQ=255)
gTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGaaa < 1:2558693/150‑1 (MQ=255)
tCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGaaaa < 1:2445270/150‑1 (MQ=255)
cATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGaaaaa > 1:1416913/1‑150 (MQ=255)
tCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATg > 2:1838060/1‑150 (MQ=255)
gCTTGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGcc < 2:3318046/150‑1 (MQ=255)
cTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCca > 2:1565580/1‑150 (MQ=255)
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tGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGTTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAAAAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGacac > 1:4517707/1‑150 (MQ=255)
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TGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCA < SRR19973055.4868138/150‑1 (MQ=60)
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TTTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTT < SRR19973055.298236/150‑1 (MQ=60)
TTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTA < SRR19973055.3045734/150‑1 (MQ=60)
TTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTA > SRR19973055.895649/1‑150 (MQ=60)
TTATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTA < SRR19973055.173206/150‑1 (MQ=60)
TATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTAT < SRR19973055.2147300/150‑1 (MQ=60)
TATGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTAT < SRR19973055.4982585/150‑1 (MQ=60)
TGATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATAC > SRR19973055.2533753/1‑150 (MQ=60)
GATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACA < SRR19973055.4713230/150‑1 (MQ=60)
GATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACA < SRR19973055.2614120/150‑1 (MQ=60)
GATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACA < SRR19973055.2613954/150‑1 (MQ=60)
ATGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAG > SRR19973055.1635729/1‑150 (MQ=60)
TGGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGT > SRR19973055.516975/1‑150 (MQ=60)
GGTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTA > SRR19973055.856406/1‑150 (MQ=60)
GTGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTAT < SRR19973055.1684604/150‑1 (MQ=60)
TGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATT < SRR19973055.1837578/150‑1 (MQ=60)
TGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATT > SRR19973055.3713505/1‑150 (MQ=60)
TGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATT < SRR19973055.1830274/150‑1 (MQ=60)
TGTCTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATT < SRR19973055.1708407/150‑1 (MQ=60)
TGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATT > SRR19973055.1167477/1‑150 (MQ=60)
CTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATTTCA < SRR19973055.4933688/150‑1 (MQ=60)
CTTGCATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATTTCA < SRR19973055.3684076/150‑1 (MQ=60)
CATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTCTTTCAGGTT > SRR19973055.5149894/1‑150 (MQ=60)
CATTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATTTCAGGTT > SRR19973055.5235383/1‑150 (MQ=60)
TTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATTTCAGGTTTT > SRR19973055.1696416/1‑150 (MQ=60)
TTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATTTCAGGTTTT < SRR19973055.3673890/150‑1 (MQ=60)
TTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATTTCAGGTTTT < SRR19973055.3673909/150‑1 (MQ=60)
TTACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATTTCAGGTTTT < SRR19973055.1197269/150‑1 (MQ=60)
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TTTTCATCAAGGAATTTTTGTGCCTGAAAATAGTGTTCTGAGGTAGGCCAGGTTTTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCCCTGAAAACCGAAAAATGCCACAATATTGGCTGTTTATACAGTATTTCAGGTTTT > CP009273/828228‑828522
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |