Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
134,297 |
C→A |
25.6% |
S243* (TCG→TAG) |
cueO → |
multicopper oxidase (laccase) |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 134,297 | 0 | C | A | 25.6%
| 751.8
/ 193.9
| 333 | S243* (TCG→TAG) | cueO | multicopper oxidase (laccase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (114/132); new base A (42/44); total (156/177) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.08e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 345 total aligned reads displayed.
CGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGATAACAAACCCT > CP009273/134148‑134446
|
cGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTc < 2:3068035/150‑1 (MQ=255)
gCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCt > 2:4060033/1‑150 (MQ=255)
cAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTc < 1:5111449/150‑1 (MQ=255)
cAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTc > 2:3417595/1‑150 (MQ=255)
attgattATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAAt > 1:919018/1‑150 (MQ=255)
attgattATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAAt > 2:4250186/1‑150 (MQ=255)
tgattATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAAttt > 1:980557/1‑150 (MQ=255)
tgattATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAAttt < 1:431419/150‑1 (MQ=255)
gattATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTc > 2:5014060/1‑150 (MQ=255)
gattATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTc < 1:1126467/150‑1 (MQ=255)
attATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCg > 1:1563621/1‑150 (MQ=255)
ttATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGc > 2:918498/1‑150 (MQ=255)
ttATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGc < 1:4592117/150‑1 (MQ=255)
cAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGccacc < 1:3463237/150‑1 (MQ=255)
aCTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAg > 1:57091/1‑150 (MQ=255)
aCTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAg > 2:1352946/1‑150 (MQ=255)
ggATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGa > 1:4581510/1‑150 (MQ=255)
gATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGAc < 1:2822198/150‑1 (MQ=255)
aTGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACa < 1:859495/150‑1 (MQ=255)
gtgATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAAt < 1:1354553/150‑1 (MQ=255)
gtgATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAAt > 1:317956/1‑150 (MQ=255)
tgaCCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGcc > 1:3282800/1‑150 (MQ=255)
gccgccgTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTg < 2:181659/150‑1 (MQ=255)
ccgTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTAtg > 2:5258565/1‑150 (MQ=255)
cgTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTAtgt < 1:1902469/150‑1 (MQ=255)
cgTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTAtgt > 1:4067858/1‑150 (MQ=255)
gggCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGAt > 2:3749613/1‑150 (MQ=255)
tGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGcc > 2:2805223/1‑150 (MQ=255)
ggTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCa < 2:793689/150‑1 (MQ=255)
gTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAg < 1:3015046/150‑1 (MQ=255)
gTTTGGCGATACGTGGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAg < 2:509611/150‑1 (MQ=255)
tGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGa > 1:1750053/1‑150 (MQ=255)
ggCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGAc < 1:4046607/150‑1 (MQ=255)
ggCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGAc < 1:1290385/150‑1 (MQ=255)
gCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACg < 2:2192161/150‑1 (MQ=255)
cGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACgg < 2:3557328/150‑1 (MQ=255)
aTACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACggtg < 2:3905152/150‑1 (MQ=255)
cGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTc > 1:3989285/1‑150 (MQ=255)
ttGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTg > 2:4947453/1‑150 (MQ=255)
tGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTAc > 2:2728050/1‑150 (MQ=255)
aCCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCt < 1:624125/150‑1 (MQ=255)
aaCGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGaa > 2:3582061/1‑150 (MQ=255)
aCGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCACTGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAAc < 2:1074796/150‑1 (MQ=255)
aCGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAAc < 1:5128283/150‑1 (MQ=255)
cgttGCTATCTACCCTCAACTCGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGAGTTTGCTCTATTGCTGTAAGGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTTTTTGTTATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAAcc < 1:4805067/147‑1 (MQ=255)
ggTGCAATCTACCCGCACCACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAAGGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCa < 2:5152759/150‑1 (MQ=255)
gTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATGTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCGGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAg > 2:2390704/1‑150 (MQ=255)
tGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGt < 2:3016320/150‑1 (MQ=255)
cAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGa < 1:4454497/150‑1 (MQ=255)
cAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCACAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGa < 1:490218/150‑1 (MQ=255)
aaTCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGaa > 1:3422913/1‑150 (MQ=255)
aaTCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGaa > 2:884317/1‑150 (MQ=255)
aaTCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGaa > 1:361689/1‑150 (MQ=255)
aaTCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATGTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGaa > 1:15876/1‑150 (MQ=255)
aTCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAg > 1:4827060/1‑150 (MQ=255)
tACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCATGGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTg < 1:2481308/150‑1 (MQ=255)
aCCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGa < 1:1065728/150‑1 (MQ=255)
cGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCg < 2:4291815/150‑1 (MQ=255)
cGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCg > 1:142536/1‑150 (MQ=255)
cGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCg > 1:2333955/1‑150 (MQ=255)
cAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGaa > 2:1458392/1‑150 (MQ=255)
acacGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACt < 2:1788393/150‑1 (MQ=255)
cGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGcc < 1:3786127/150‑1 (MQ=255)
tGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGt > 1:1980421/1‑150 (MQ=255)
tGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGt > 2:4409915/1‑150 (MQ=255)
ccGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTg > 1:3655863/1‑150 (MQ=255)
ggTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGc > 1:610757/1‑150 (MQ=255)
tGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAg > 1:147143/1‑150 (MQ=255)
tGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAg > 2:3207462/1‑150 (MQ=255)
ggCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGc > 1:1689931/1‑150 (MQ=255)
gCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCg > 2:2488154/1‑150 (MQ=255)
gcgcCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGttt < 1:5016776/150‑1 (MQ=255)
gcgcCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGAAAATCGCCCGCTGTTTGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGttt < 1:5146651/150‑1 (MQ=255)
gcCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATTAGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCAGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTg < 2:2012680/150‑1 (MQ=255)
ccTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGa < 1:336196/150‑1 (MQ=255)
tGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAg < 2:4581510/150‑1 (MQ=255)
gCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGt < 2:690486/150‑1 (MQ=255)
ttGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCtg < 2:3282800/150‑1 (MQ=255)
tGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCtgg > 1:5307106/1‑150 (MQ=255)
gCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCtggt < 1:2203720/150‑1 (MQ=255)
aaTGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGACGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAg > 2:1541213/1‑150 (MQ=255)
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cccGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACACTCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGATAACa < 2:770865/150‑1 (MQ=255)
tCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGTCGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGATAACAAAccc < 2:4553250/150‑1 (MQ=255)
cGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGATAACAAACCCt < 1:795264/150‑1 (MQ=255)
|
CGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGATAACAAACCCT > CP009273/134148‑134446
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
