Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,482,005 |
G→T |
100% |
D172Y (GAT→TAT) |
ydcF → |
DUF218 superfamily protein, SAM‑binding |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,482,005 | 0 | G | T | 97.8%
| 868.6
/ 8.3
| 272 | D172Y (GAT→TAT) | ydcF | DUF218 superfamily protein, SAM‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/5); new base T (138/128); total (139/133) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.14e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
ACAAACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACG > CP009273/1481861‑1482150
|
acaaACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGc > 1:2814044/1‑149 (MQ=255)
aaCTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGcacc > 1:2585591/1‑149 (MQ=255)
aCTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGcacca < 2:378378/149‑1 (MQ=255)
aCTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGcacca > 2:3655918/1‑149 (MQ=255)
gTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTgg > 1:795455/1‑149 (MQ=255)
tGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGt > 2:3066450/1‑149 (MQ=255)
aaaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTa > 1:362684/1‑149 (MQ=255)
aaaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTa > 2:672365/1‑149 (MQ=255)
aaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTaa < 1:3766107/149‑1 (MQ=255)
aaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTaa > 1:1881435/1‑149 (MQ=255)
aaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAg > 1:339812/1‑149 (MQ=255)
acgcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATc > 2:2289940/1‑149 (MQ=255)
acgcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATc > 1:1266001/1‑149 (MQ=255)
gcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATccc > 2:1643216/1‑149 (MQ=255)
gcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATccc < 1:90496/149‑1 (MQ=255)
cTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCg > 1:590700/1‑149 (MQ=255)
cTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCg > 2:3921631/1‑149 (MQ=255)
ttAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGa < 2:817227/149‑1 (MQ=255)
tAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGAt < 2:2499382/149‑1 (MQ=255)
tAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGAt < 1:678896/149‑1 (MQ=255)
aGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGAtt < 2:600466/149‑1 (MQ=255)
gCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTc < 2:3394952/149‑1 (MQ=255)
gCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTc < 2:2401706/149‑1 (MQ=255)
cATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCg < 1:3122363/149‑1 (MQ=255)
tCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGtt > 1:1013443/1‑149 (MQ=255)
gcgcTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTcc > 1:3862146/1‑149 (MQ=255)
gcTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTc > 2:2871965/1‑149 (MQ=255)
cTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCa < 2:2640305/149‑1 (MQ=255)
tATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAg < 2:2214043/149‑1 (MQ=255)
ttGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGtt < 1:839213/149‑1 (MQ=255)
ttGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGtt > 2:3949385/1‑149 (MQ=255)
ttGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGtt < 1:1667401/149‑1 (MQ=255)
tCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGaa < 2:1976613/149‑1 (MQ=255)
cAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGaaa < 2:4093440/149‑1 (MQ=255)
aGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAAt < 1:1228806/149‑1 (MQ=255)
aGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAAt > 1:2823520/1‑149 (MQ=255)
gCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATaa < 1:3980996/149‑1 (MQ=255)
gCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATaa > 2:2786787/1‑149 (MQ=255)
gCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATaa < 1:3278907/149‑1 (MQ=255)
ccGGAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTGGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAAc < 1:2472733/149‑1 (MQ=255)
cGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACg > 2:1770757/1‑149 (MQ=255)
cGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACg > 1:2883772/1‑149 (MQ=255)
tAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACCATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCa < 1:3480854/149‑1 (MQ=255)
tAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCa > 1:2995992/1‑149 (MQ=255)
tAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCa < 1:377129/149‑1 (MQ=255)
aGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAg > 1:1794258/1‑149 (MQ=255)
aGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAg > 2:720201/1‑149 (MQ=255)
gAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAgt < 1:1478170/149‑1 (MQ=255)
gTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAgtgt < 1:500120/149‑1 (MQ=255)
ttCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTa < 2:3830295/149‑1 (MQ=255)
ttCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTa > 2:585426/1‑149 (MQ=255)
cATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCGTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAAt < 1:3921635/149‑1 (MQ=255)
aTACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATTCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATc < 1:2006972/149‑1 (MQ=255)
tACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTATGAAATAACGCAGACAGTGTAATCt < 1:1297267/149‑1 (MQ=255)
tACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCt > 2:1882088/1‑149 (MQ=255)
aCGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt < 2:3613537/149‑1 (MQ=255)
ggCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTtta < 2:3021481/149‑1 (MQ=255)
ggCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTtta < 2:964566/149‑1 (MQ=255)
cTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTttatt < 1:180105/149‑1 (MQ=255)
tATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTttatta > 2:2573186/1‑149 (MQ=255)
aTCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTaa > 2:3729299/1‑149 (MQ=255)
tCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAAt > 2:3121177/1‑149 (MQ=255)
gttgttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCa > 2:1212339/1‑149 (MQ=255)
ttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTa < 2:3851992/149‑1 (MQ=255)
cAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACa < 2:2847723/149‑1 (MQ=255)
ggACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTAATTAATCAGTTACAAg > 2:2973452/1‑149 (MQ=255)
ccaccaTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTa > 1:2380012/1‑149 (MQ=255)
accaTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATg < 2:84775/149‑1 (MQ=255)
caTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGc < 2:98615/149‑1 (MQ=255)
gCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAg > 1:1836181/1‑149 (MQ=255)
gCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAg < 2:1304752/149‑1 (MQ=255)
cAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGt < 1:4111342/149‑1 (MQ=255)
ggcgCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACATTCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGTAATAACGGAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTTCAAGGTTTATGGCCTGTTGAg < 2:1955433/149‑1 (MQ=255)
gcgcACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGc > 1:387626/1‑149 (MQ=255)
aCGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTa > 2:2677630/1‑149 (MQ=255)
aCGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTa > 1:2879504/1‑149 (MQ=255)
ggCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTAtctct > 2:144235/1‑149 (MQ=255)
gACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCac > 1:2500165/1‑149 (MQ=255)
aCGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCact > 2:2766411/1‑149 (MQ=255)
gTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCactac < 2:2814044/149‑1 (MQ=255)
ttCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCactact > 2:3634845/1‑149 (MQ=255)
tCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTc < 2:3318171/149‑1 (MQ=255)
cgccgTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCAc < 1:3789059/149‑1 (MQ=255)
cgccgTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCAc < 1:2714936/149‑1 (MQ=255)
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GGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAA > SRR19973068.1846749/1‑150 (MQ=60)
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TGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAG > SRR19973068.1848289/1‑150 (MQ=60)
CAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTT < SRR19973068.4135934/150‑1 (MQ=60)
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CGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGC < SRR19973068.2026286/150‑1 (MQ=60)
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TATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGA > SRR19973068.1254058/1‑150 (MQ=60)
TATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGA > SRR19973068.2199251/1‑150 (MQ=60)
TATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGA > SRR19973068.2076139/1‑150 (MQ=60)
TATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGA > SRR19973068.2076035/1‑150 (MQ=60)
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GACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCT < SRR19973068.1404782/150‑1 (MQ=60)
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CTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGCGA > SRR19973068.391482/1‑150 (MQ=60)
CTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGCGA > SRR19973068.3207119/1‑150 (MQ=60)
CTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGCGA > SRR19973068.391178/1‑150 (MQ=60)
CTATGCACCACGCTGGTTAAGTCATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGCGA > SRR19973068.1991109/1‑150 (MQ=60)
TATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGCGAT < SRR19973068.2841783/150‑1 (MQ=60)
TATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGCGAT < SRR19973068.2841589/150‑1 (MQ=60)
TATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGCGAT < SRR19973068.2841506/150‑1 (MQ=60)
TATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGCGAT < SRR19973068.3678045/150‑1 (MQ=60)
TATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGCGAT < SRR19973068.1620167/150‑1 (MQ=60)
TATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGCGAT < SRR19973068.1620072/150‑1 (MQ=60)
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AGTCAACAAACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGCGAT > CP009273/1481856‑1482154
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
