Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,574,523 |
T→A |
100% |
L175F (TTA→TTT) |
ydeM ← |
putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,574,523 | 0 | T | A | 99.1%
| 709.2
/ ‑2.5
| 213 | L175F (TTA→TTT) | ydeM | putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (116/95); total (117/96) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
GTTGACATAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTTAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTG > CP009273/1574377‑1574667
|
gTTGACATAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTaaa > 1:2199587/1‑149 (MQ=255)
gTTGACATAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTaaa < 1:947/149‑1 (MQ=255)
aCATAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAaaaaaa > 1:159783/1‑149 (MQ=255)
cATAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAAt < 1:705069/149‑1 (MQ=255)
aTAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATg > 1:2130952/1‑149 (MQ=255)
tAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGa > 2:3320434/1‑149 (MQ=255)
tAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGa > 2:3904776/1‑149 (MQ=255)
aaaCTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGAt > 1:1961165/1‑149 (MQ=255)
cTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATaaa < 2:3649063/149‑1 (MQ=255)
ttGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAAc > 1:3927322/1‑149 (MQ=255)
ttGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAAc > 1:1889455/1‑149 (MQ=255)
gCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCt > 1:3652298/1‑149 (MQ=255)
ccATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTc > 1:3860954/1‑149 (MQ=255)
cATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCa > 2:1434001/1‑149 (MQ=255)
aTAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTTAAAAAATGATAAACCTCaa > 2:3616048/1‑149 (MQ=255)
ccGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAggg < 2:1095654/149‑1 (MQ=255)
tGGGAGGCACAGAAAAATCACTGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCTATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTaa < 2:2283140/149‑1 (MQ=255)
gggAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAAt > 1:1630212/1‑149 (MQ=255)
gggAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAAt > 1:1168526/1‑149 (MQ=255)
ggAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATg < 2:4005337/149‑1 (MQ=255)
aGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGa < 2:3527622/149‑1 (MQ=255)
ggCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGAc > 1:476871/1‑149 (MQ=255)
gCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACa < 1:4077239/149‑1 (MQ=255)
gCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACa < 2:1323599/149‑1 (MQ=255)
cacaGAACAATCAATGATCCGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACAt < 2:2130258/149‑1 (MQ=255)
cacaGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACAt > 1:673243/1‑149 (MQ=255)
acaGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACAtt < 1:2253018/149‑1 (MQ=255)
aGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTaa < 2:3496117/149‑1 (MQ=255)
aGAAAAAACAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTaa < 2:3179276/149‑1 (MQ=255)
aaaaTCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGt < 1:3086184/149‑1 (MQ=255)
aaTCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGtta < 1:3755893/149‑1 (MQ=255)
aaTCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGtta < 2:374670/149‑1 (MQ=255)
tCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGttatt > 2:2213738/1‑149 (MQ=255)
aaTGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTaa < 1:3422411/149‑1 (MQ=255)
tGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATg < 1:2898112/149‑1 (MQ=255)
gATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGa < 2:1498365/149‑1 (MQ=255)
tACTGAATGTTGTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACg < 2:2817449/149‑1 (MQ=255)
tACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACg < 2:773815/149‑1 (MQ=255)
aCGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACgg < 2:1029740/149‑1 (MQ=255)
ggAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGtt < 2:283846/149‑1 (MQ=255)
aTGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAAc < 1:701111/149‑1 (MQ=255)
gtgtTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGt < 2:2516194/149‑1 (MQ=255)
tgtTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTa > 1:304058/1‑149 (MQ=255)
ttCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTAtt > 2:4113354/1‑149 (MQ=255)
ctcACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTaa > 2:187397/1‑149 (MQ=255)
tcACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTaaa < 1:1858927/149‑1 (MQ=255)
tcACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTaaa > 2:3700882/1‑149 (MQ=255)
tcACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTaaa < 1:1410480/149‑1 (MQ=255)
cACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAAc < 2:1847836/149‑1 (MQ=255)
aCTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTCATGGACATTAACGTTATTATTGACGGTTAACGTATTAAAct > 1:3166521/1‑149 (MQ=255)
tATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAActct < 2:464235/149‑1 (MQ=255)
aTGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTa > 2:3256185/1‑149 (MQ=255)
gACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACt < 1:3082188/149‑1 (MQ=255)
cACTGAAATCAAGATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGa < 2:1602072/149‑1 (MQ=255)
aCTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGat < 1:4094638/149‑1 (MQ=255)
aaaTCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGa > 1:54486/1‑149 (MQ=255)
aTCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGAtt < 2:681824/149‑1 (MQ=255)
tCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGAttt < 1:274819/149‑1 (MQ=255)
tCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGAttt < 1:2349857/149‑1 (MQ=255)
aaTATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCa > 2:593946/1‑149 (MQ=255)
atatTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAg > 1:1804111/1‑149 (MQ=255)
ggCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTCCTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAACCCTCAAGAGCGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTc < 2:1931428/149‑1 (MQ=255)
ggCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTc > 2:1658558/1‑149 (MQ=255)
gTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGAt > 1:489440/1‑149 (MQ=255)
gTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGAt < 2:2004851/149‑1 (MQ=255)
tCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATg > 1:1616260/1‑149 (MQ=255)
tCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATg > 2:886413/1‑149 (MQ=255)
tCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATg > 1:1223042/1‑149 (MQ=255)
ccGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGgc < 2:1195089/149‑1 (MQ=255)
ccGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGgc < 2:2047472/149‑1 (MQ=255)
tttCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGgctgct < 1:1144419/149‑1 (MQ=255)
ttCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTa < 2:1045192/149‑1 (MQ=255)
cTAGCAATTCGATACATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATc < 2:2189048/149‑1 (MQ=255)
cTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATc < 2:3085311/149‑1 (MQ=255)
tAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCa > 2:291487/1‑149 (MQ=255)
gCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACt > 1:1006770/1‑149 (MQ=255)
aaTTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACttt > 2:1245818/1‑149 (MQ=255)
gATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCaa > 1:145902/1‑149 (MQ=255)
aTAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCaaa > 1:2612489/1‑149 (MQ=255)
aTAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCaaa > 2:3958190/1‑149 (MQ=255)
tAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAATAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAAATATACTTGATATGATTTCAGACGATCGATGGCTGCTATCACTTTTGCaaaa > 1:2533048/1‑149 (MQ=255)
tAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCaaaa > 1:2861486/1‑149 (MQ=255)
tAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCaaaa > 1:802470/1‑149 (MQ=255)
tAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCaaaa > 2:1058523/1‑149 (MQ=255)
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GTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATG > SRR19973068.1626831/1‑150 (MQ=60)
GTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATG > SRR19973068.1627836/1‑150 (MQ=60)
GTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATG > SRR19973068.1231174/1‑150 (MQ=60)
GGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGC > SRR19973068.963801/1‑150 (MQ=60)
TTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTA < SRR19973068.1152077/150‑1 (MQ=60)
AGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACT > SRR19973068.1013336/1‑150 (MQ=60)
AGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACT > SRR19973068.3083212/1‑150 (MQ=60)
AATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTT > SRR19973068.1916706/1‑150 (MQ=60)
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ATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAATAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAAATATACTTGATATGATTTCAGACGATCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAA > SRR19973068.2549144/1‑150 (MQ=60)
ATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTCTCACTTTTGCAAAA > SRR19973068.520944/1‑150 (MQ=60)
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ATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTA > SRR19973068.3627501/1‑150 (MQ=60)
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TACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAAT < SRR19973068.4115073/150‑1 (MQ=60)
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TGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTAC > SRR19973068.121293/1‑150 (MQ=60)
CCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTG < SRR19973068.2450562/150‑1 (MQ=60)
GATTAAAAAAAATGATAAACCTCAATAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTATATATGATTTCAGAAGATCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACAGTTACCTGAATAAATGCGTCTG > SRR19973068.3274489/1‑150 (MQ=60)
TTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTGTA > SRR19973068.1862424/1‑150 (MQ=60)
TTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGTGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATGTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCAATTTTGCAATAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTGTTA < SRR19973068.1637507/150‑1 (MQ=60)
TTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTGTAA > SRR19973068.3347054/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTGTAACG > SRR19973068.1969534/1‑150 (MQ=60)
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ATGGTTGACATAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTTAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTGTAACG > CP009273/1574374‑1574672
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
