Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,574,523 |
T→A |
100% |
L175F (TTA→TTT) |
ydeM ← |
putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,574,523 | 0 | T | A | 99.5%
| 633.6
/ ‑4.5
| 187 | L175F (TTA→TTT) | ydeM | putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base A (92/94); total (93/94) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
GGTTGACATAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTTAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTGTA > CP009273/1574376‑1574669
|
ggTTGACATAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTaaa < 1:4485747/150‑1 (MQ=255)
cATAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATg > 1:955700/1‑150 (MQ=255)
aTAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGa > 2:227382/1‑150 (MQ=255)
aTAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGa > 2:1259910/1‑150 (MQ=255)
tAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGAt > 1:2776110/1‑150 (MQ=255)
aaCTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATaa > 2:4885479/1‑150 (MQ=255)
ttGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATCAAcc > 2:1378635/1‑150 (MQ=255)
ccATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCa < 1:4635134/150‑1 (MQ=255)
aTAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAag > 1:2134720/1‑150 (MQ=255)
aTAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTAAag > 2:4397007/1‑150 (MQ=255)
aaGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAagag < 2:4770811/150‑1 (MQ=255)
aGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAgg < 1:4206840/150‑1 (MQ=255)
cGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTa < 2:2307303/150‑1 (MQ=255)
gTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTaa < 1:5028427/150‑1 (MQ=255)
gTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTaa < 2:3386023/150‑1 (MQ=255)
gTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATAAGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTaa > 1:2478567/1‑150 (MQ=255)
gtgAGGCACAGATAAATCAATGATACTGAATGTTTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGTCTTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAATAGGGTAATg < 2:3402549/148‑1 (MQ=255)
gggAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATg > 1:3480593/1‑150 (MQ=255)
gggAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATg < 2:2456960/150‑1 (MQ=255)
gggAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATg > 1:3780095/1‑150 (MQ=255)
ggAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATgg > 1:4694017/1‑150 (MQ=255)
ggCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACa < 2:597390/150‑1 (MQ=255)
ggCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACa > 1:4933045/1‑150 (MQ=255)
gCACAGAAAAATCAATGATCCGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACAt < 1:3344178/150‑1 (MQ=255)
cacaGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACAtt > 1:3278335/1‑150 (MQ=255)
aGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAAc > 1:1602330/1‑150 (MQ=255)
aGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAAc < 2:4730966/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGt > 1:3291034/1‑150 (MQ=255)
aTCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGttatt < 2:4724717/150‑1 (MQ=255)
tCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAAGTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGttatta < 2:4557487/150‑1 (MQ=255)
aaTGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAAt > 1:4741526/1‑150 (MQ=255)
tGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGa < 2:2824826/150‑1 (MQ=255)
aTACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACg > 1:263951/1‑150 (MQ=255)
cGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGtt < 2:827981/150‑1 (MQ=255)
ggAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTa < 2:1638845/150‑1 (MQ=255)
tgtTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTAt < 1:1991382/150‑1 (MQ=255)
ctcACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTaaa < 2:2927138/150‑1 (MQ=255)
tcACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAAc < 1:2083406/150‑1 (MQ=255)
aCTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAActc > 1:3870622/1‑150 (MQ=255)
tATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTa < 1:1161822/150‑1 (MQ=255)
tATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTa < 1:2364167/150‑1 (MQ=255)
aTGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTAc > 2:888410/1‑150 (MQ=255)
aTGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTAc > 2:5034030/1‑150 (MQ=255)
aTGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTAc > 2:2161059/1‑150 (MQ=255)
aTGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAAAGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACTTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTAc > 1:1760655/1‑150 (MQ=255)
gACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTANCGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACtt < 1:2678310/150‑1 (MQ=255)
ccACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGa > 1:3954983/1‑150 (MQ=255)
cACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTTAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGat > 1:4569652/1‑150 (MQ=255)
aCTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATTTTTAATGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGata < 2:900598/150‑1 (MQ=255)
aaaTCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATAAGAt > 1:442123/1‑150 (MQ=255)
tCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAGCGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTc < 2:4892450/150‑1 (MQ=255)
tCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTc < 2:3056044/150‑1 (MQ=255)
atatTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGa > 1:707700/1‑150 (MQ=255)
atatTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGa > 2:2953907/1‑150 (MQ=255)
atTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACg > 2:4275415/1‑150 (MQ=255)
ggCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCg > 1:4885954/1‑150 (MQ=255)
ggCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATAAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCg < 2:4599050/150‑1 (MQ=255)
cGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGAt < 2:3291034/150‑1 (MQ=255)
gTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATg < 2:1336720/150‑1 (MQ=255)
gTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATg > 1:2771157/1‑150 (MQ=255)
tCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATgg > 2:1765051/1‑150 (MQ=255)
tCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATgg < 1:1798401/150‑1 (MQ=255)
cccGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGgc > 2:2087206/1‑150 (MQ=255)
gTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGgctgct < 1:2602126/150‑1 (MQ=255)
cTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATACACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCa < 2:930059/150‑1 (MQ=255)
cTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCa > 2:2437616/1‑150 (MQ=255)
cTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCa > 2:1895778/1‑150 (MQ=255)
gCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACtt < 1:4490022/150‑1 (MQ=255)
aaTTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACtttt > 1:4042874/1‑150 (MQ=255)
aaTTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACtttt < 2:1119336/150‑1 (MQ=255)
aTTCGATTAATTGCATATGTTTTCTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTg < 1:1094829/150‑1 (MQ=255)
aTTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTg < 1:1662779/150‑1 (MQ=255)
aTTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTg < 1:3679508/150‑1 (MQ=255)
aTAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCaaaa < 1:3218510/150‑1 (MQ=255)
aTTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTAc < 1:3127360/150‑1 (MQ=255)
tGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCg < 1:1391534/150‑1 (MQ=255)
gCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGt < 2:4131044/150‑1 (MQ=255)
cATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCCAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGtt < 2:1529631/150‑1 (MQ=255)
cATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGtt > 1:1365798/1‑150 (MQ=255)
cATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGtt > 2:4790651/1‑150 (MQ=255)
cATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGtt > 2:3437074/1‑150 (MQ=255)
atatGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTa < 2:2583859/150‑1 (MQ=255)
atatGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTa < 2:3776883/150‑1 (MQ=255)
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GTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCT < SRR19973063.2610396/150‑1 (MQ=60)
AGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCACGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACC < SRR19973063.2502305/150‑1 (MQ=60)
GCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTT < SRR19973063.4504425/150‑1 (MQ=60)
CAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTT < SRR19973063.3458008/150‑1 (MQ=60)
AATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTT > SRR19973063.4055828/1‑150 (MQ=60)
ATTCGATTAATTGCATATGTTTTCTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTG < SRR19973063.1098162/150‑1 (MQ=60)
ATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTG < SRR19973063.1667851/150‑1 (MQ=60)
ATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTG < SRR19973063.3691286/150‑1 (MQ=60)
TTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGC < SRR19973063.4910129/150‑1 (MQ=60)
TTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGC < SRR19973063.1550191/150‑1 (MQ=60)
ATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAA < SRR19973063.3228855/150‑1 (MQ=60)
AAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGT > SRR19973063.2227651/1‑150 (MQ=60)
ATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTAC < SRR19973063.3137428/150‑1 (MQ=60)
TTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACC < SRR19973063.1745716/150‑1 (MQ=60)
TGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCG < SRR19973063.1395744/150‑1 (MQ=60)
CATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTT < SRR19973063.4534926/150‑1 (MQ=60)
CATATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTT > SRR19973063.1369912/1‑150 (MQ=60)
ATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACC < SRR19973063.4323967/150‑1 (MQ=60)
ATGTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACC < SRR19973063.2938106/150‑1 (MQ=60)
GTTTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTG > SRR19973063.820967/1‑150 (MQ=60)
TTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAA > SRR19973063.2073341/1‑150 (MQ=60)
TTACTGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAA > SRR19973063.4973641/1‑150 (MQ=60)
TGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTAC < SRR19973063.4351090/150‑1 (MQ=60)
TGCCGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTAC < SRR19973063.1172153/150‑1 (MQ=60)
CGATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGC > SRR19973063.5170849/1‑150 (MQ=60)
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ATAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGT > SRR19973063.777284/1‑150 (MQ=60)
TAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTC > SRR19973063.5158378/1‑150 (MQ=60)
TAGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTC > SRR19973063.2180981/1‑150 (MQ=60)
AGATTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCT > SRR19973063.543246/1‑150 (MQ=60)
TTTAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTGTA > SRR19973063.375029/1‑150 (MQ=60)
TAAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTGTAAC < SRR19973063.1759613/150‑1 (MQ=60)
AAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTGTAACG > SRR19973063.665054/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTGTAACG < SRR19973063.4901233/150‑1 (MQ=60)
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GGTTGACATAAACTTGCCATAAGCCGTGGGAGGCACAGAAAAATCAATGATACGGAATGTGTTCTCACTATGACCACTGAAATCAATATTCGGCGTCCCGGTTTCTAGCAATTCGATAAATTGCATATGTTTACTGCCGATAGATTTTAAAAAATGATAAACCTCAAGAGGGTAATGGACATTAACGTTATTAATGACGGTTAACGTATTAAACTCTACTTGATATGATTTCAGACGCTCGATGGCTGCTATCACTTTTGCAAAAGTACCGTTACCTGAATTACTGCGTCTGTAACG > CP009273/1574376‑1574672
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
