Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,886,725 |
G→T |
100% |
I256I (ATC→ATA) |
yoaA ← |
putative ATP‑dependent helicase, DinG family |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,886,725 | 0 | G | T | 97.7%
| 699.0
/ 5.8
| 220 | I256I (ATC→ATA) | yoaA | putative ATP‑dependent helicase, DinG family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/2); new base T (111/104); total (114/106) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
TGAATTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCGATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAATCCACTCTCTT > CP009273/1886579‑1886870
|
tGAATTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCGAt > 1:3829582/1‑149 (MQ=255)
gAATTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATg < 1:2201676/149‑1 (MQ=255)
aTTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGt > 1:89891/1‑149 (MQ=255)
aTTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGt > 2:3526024/1‑149 (MQ=255)
aTTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGt < 1:2120292/149‑1 (MQ=255)
ggATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTc < 1:223561/149‑1 (MQ=255)
aTTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCtt < 2:3744165/149‑1 (MQ=255)
ttAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACTATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCttt < 1:2308805/149‑1 (MQ=255)
ttAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCttt < 1:232962/149‑1 (MQ=255)
ttAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCttt < 2:684734/149‑1 (MQ=255)
aGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTg > 1:4069341/1‑149 (MQ=255)
tAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCa < 2:4017218/149‑1 (MQ=255)
aCAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAgg < 2:85934/149‑1 (MQ=255)
cACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGc < 2:711869/149‑1 (MQ=255)
cGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAg > 1:581468/1‑149 (MQ=255)
gCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGt < 2:332088/149‑1 (MQ=255)
ggTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGt > 2:3622927/1‑149 (MQ=255)
ggTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGt > 2:3248980/1‑149 (MQ=255)
ttACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGTCAGGTCGAGCAGTTGTCg > 1:1567116/1‑149 (MQ=255)
ttACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCg > 2:83360/1‑149 (MQ=255)
tACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGa > 2:2415614/1‑149 (MQ=255)
aTAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGgaga > 1:2968425/1‑149 (MQ=255)
aTAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGgaga > 2:2040207/1‑149 (MQ=255)
aTAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGgaga > 1:1227848/1‑149 (MQ=255)
tAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGagag < 1:3196259/149‑1 (MQ=255)
aCCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTNGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtg < 1:2085621/149‑1 (MQ=255)
ccTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtga < 2:1958962/149‑1 (MQ=255)
tGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtgact > 1:1587764/1‑149 (MQ=255)
tGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtgact > 1:2126643/1‑149 (MQ=255)
ggCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCGATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtgactg > 1:4038158/1‑149 (MQ=255)
gCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtgactga < 2:932409/149‑1 (MQ=255)
gCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtgactga < 1:2724410/149‑1 (MQ=255)
cTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtgactgac > 1:2413227/1‑149 (MQ=255)
aCCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTGTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCaa > 1:3498026/1‑149 (MQ=255)
ccGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCaaa > 2:2801358/1‑149 (MQ=255)
cGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCaaaa < 2:1876398/149‑1 (MQ=255)
cGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGAAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGTGTGTCTTTTAATTCGGTGCGTTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGACAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCaaaa > 2:2919552/1‑149 (MQ=255)
ttGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATAct > 2:1123695/1‑149 (MQ=255)
tGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActg < 1:1939263/149‑1 (MQ=255)
gCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActgg < 1:443073/149‑1 (MQ=255)
cAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActggc < 1:782546/149‑1 (MQ=255)
cAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActggc < 1:755991/149‑1 (MQ=255)
aGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActggct > 1:2267373/1‑149 (MQ=255)
aCGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActggctgg < 1:2437426/149‑1 (MQ=255)
aCGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActggctgg > 1:3858298/1‑149 (MQ=255)
cGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACtggctggc > 1:532432/1‑149 (MQ=255)
aaaaTCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCaa > 1:3074108/1‑149 (MQ=255)
aTCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGt < 1:2744964/149‑1 (MQ=255)
tCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTc > 2:2169669/1‑149 (MQ=255)
tCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTc < 2:91366/149‑1 (MQ=255)
tGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCtggtg < 2:3594630/149‑1 (MQ=255)
gggCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCtggtgg > 1:4076139/1‑149 (MQ=255)
gggCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCtggtgg > 1:2487380/1‑149 (MQ=255)
gggCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCGATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCtggtgg < 1:2843785/149‑1 (MQ=255)
gCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGc < 1:1584556/149‑1 (MQ=255)
gCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGc < 2:311024/149‑1 (MQ=255)
aaGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCtt < 2:3007681/149‑1 (MQ=255)
aGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTtc < 2:2329071/149‑1 (MQ=255)
gACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTtcg < 1:3849321/149‑1 (MQ=255)
cGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTtcgtc < 2:66165/149‑1 (MQ=255)
aTCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGa > 2:714679/1‑149 (MQ=255)
aTCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGa > 2:2382767/1‑149 (MQ=255)
aGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGa < 1:3332329/149‑1 (MQ=255)
aGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGa < 2:2562056/149‑1 (MQ=255)
gcgcACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGAt > 1:808020/1‑149 (MQ=255)
gcgcACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGAt > 2:3916055/1‑149 (MQ=255)
gcACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCa < 1:3851518/149‑1 (MQ=255)
cTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGa < 1:1448575/149‑1 (MQ=255)
cTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGa < 1:1033469/149‑1 (MQ=255)
tgctgGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTc < 2:338178/149‑1 (MQ=255)
gctgGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTcc > 1:3799829/1‑149 (MQ=255)
ctgGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCg < 2:1902909/149‑1 (MQ=255)
tgGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAGGATCATGACGTCCGCTTCCgg > 1:1804615/1‑149 (MQ=255)
tgGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCgg > 1:2525070/1‑149 (MQ=255)
tgGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCgg > 1:2013101/1‑149 (MQ=255)
ggTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGa > 2:1165645/1‑149 (MQ=255)
gtgtCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGAt > 1:3659293/1‑149 (MQ=255)
gtgtCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGAt > 2:512550/1‑149 (MQ=255)
gtCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCa > 2:6759/1‑149 (MQ=255)
gtCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCa > 2:1729682/1‑149 (MQ=255)
tCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAg < 2:4062352/149‑1 (MQ=255)
cTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGt < 1:2585933/149‑1 (MQ=255)
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CTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGG < SRR19973068.3956080/150‑1 (MQ=60)
GCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTA < SRR19973068.4137679/150‑1 (MQ=60)
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GCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCT < SRR19973068.1594965/150‑1 (MQ=60)
CAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTT < SRR19973068.2160789/150‑1 (MQ=60)
CAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTT > SRR19973068.584646/1‑150 (MQ=60)
GACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGT < SRR19973068.3872556/150‑1 (MQ=60)
CGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCG > SRR19973068.1578172/1‑150 (MQ=60)
CAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGA > SRR19973068.1806858/1‑150 (MQ=60)
AGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGAT > SRR19973068.2883933/1‑150 (MQ=60)
AGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGAT > SRR19973068.813519/1‑150 (MQ=60)
AGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGAT < SRR19973068.3352664/150‑1 (MQ=60)
GCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCAT < SRR19973068.3874644/150‑1 (MQ=60)
GCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCAT < SRR19973068.3874774/150‑1 (MQ=60)
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CTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAATCCACTCTCTTTAA > SRR19973068.2072456/1‑150 (MQ=60)
CTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAATCCACTCTCTTTAA > SRR19973068.1723783/1‑150 (MQ=60)
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CGCTGAATTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCGATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAATCCACTCTCTTTAA > CP009273/1886576‑1886873
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
