Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,277,743 |
A→T |
38.9% |
N46Y (AAC→TAC) |
yejL → |
UPF0352 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,277,743 | 0 | A | T | 38.9%
| 259.4
/ inf
| 293 | N46Y (AAC→TAC) | yejL | UPF0352 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (79/100); new base T (61/53); total (140/153) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
GATTTCGATTTATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCT > CP009273/2277597‑2277891
|
gATTTCGATTTATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAac < 1:2650136/149‑1 (MQ=255)
aTTTCGATTTATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAaca > 2:973089/1‑149 (MQ=255)
aTTTCGATTTATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAaca > 1:2046253/1‑149 (MQ=255)
ttCGATTTATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACAcc > 2:1044773/1‑149 (MQ=255)
aTTTATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCa > 2:1106852/1‑149 (MQ=255)
tttATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCAt > 1:1465724/1‑149 (MQ=255)
tttATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCAt > 1:2878137/1‑149 (MQ=255)
tttATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCAt < 1:2371039/149‑1 (MQ=255)
ttATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCAtt < 1:650307/149‑1 (MQ=255)
ttATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCAtt < 2:1262139/149‑1 (MQ=255)
tATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTg > 2:2769564/1‑149 (MQ=255)
gCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGccc > 2:798000/1‑149 (MQ=255)
cacaAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCg > 2:2549298/1‑149 (MQ=255)
cacaAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCg > 2:954022/1‑149 (MQ=255)
tttCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCaa > 1:55813/1‑149 (MQ=255)
ccGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGcc > 1:3667781/1‑149 (MQ=255)
ccGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGcc < 1:2447216/149‑1 (MQ=255)
cAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCaa < 1:1173593/149‑1 (MQ=255)
gatgaACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGc > 2:3051655/1‑149 (MQ=255)
aaCAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAAc < 1:126435/149‑1 (MQ=255)
aCAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCACTTGCCAAct > 2:2601762/1‑149 (MQ=255)
cAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAActc < 1:189309/149‑1 (MQ=255)
aGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAActct < 1:2212805/149‑1 (MQ=255)
aGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAActct > 2:3610557/1‑149 (MQ=255)
gTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCttt < 1:840736/149‑1 (MQ=255)
gAACAATTGCTCGCCGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGc > 1:3589610/1‑149 (MQ=255)
aCAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCACCGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGccc > 1:74253/1‑149 (MQ=255)
aaTTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCcgc > 1:755637/1‑149 (MQ=255)
aaTTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCcgc < 1:1312858/149‑1 (MQ=255)
aTTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCCGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCcgcg > 1:2390771/1‑149 (MQ=255)
aTTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCcgcg > 1:610962/1‑149 (MQ=255)
tCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTa < 2:498990/149‑1 (MQ=255)
agagCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGt > 2:1814356/1‑149 (MQ=255)
agagCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGt > 2:598665/1‑149 (MQ=255)
agCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTcc < 1:3847868/149‑1 (MQ=255)
ctgctCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCctc < 2:1446896/149‑1 (MQ=255)
gctCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTa < 2:379334/149‑1 (MQ=255)
ctCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTAt < 1:93833/149‑1 (MQ=255)
tCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATc < 2:1941095/149‑1 (MQ=255)
tCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATc > 1:304771/1‑149 (MQ=255)
aaCGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCaa < 2:3268319/149‑1 (MQ=255)
aaCGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCaa > 2:1664955/1‑149 (MQ=255)
aaCGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCaa > 2:2371989/1‑149 (MQ=255)
aCGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAAc > 1:281530/1‑149 (MQ=255)
tACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGaa > 1:3972995/1‑149 (MQ=255)
aCTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAg > 1:3288870/1‑149 (MQ=255)
cTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGa < 2:545503/149‑1 (MQ=255)
ggAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACa > 1:3144731/1‑149 (MQ=255)
ggAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACa > 1:3105481/1‑149 (MQ=255)
ggAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACa > 1:1847569/1‑149 (MQ=255)
ggAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACa < 2:3833007/149‑1 (MQ=255)
gAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACaa > 1:2849797/1‑149 (MQ=255)
aaaaaCATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACaaa < 2:2046253/149‑1 (MQ=255)
aaaaCATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAg > 2:3962912/1‑149 (MQ=255)
cATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCa < 1:1005071/149‑1 (MQ=255)
cATAAGGCTCCGACCGACCTGTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCa < 2:2481135/149‑1 (MQ=255)
aTAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAACGCGCAc > 2:2830999/1‑149 (MQ=255)
aTAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCAc < 2:4068696/149‑1 (MQ=255)
cTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAggg < 2:369153/149‑1 (MQ=255)
tCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGa < 2:3633246/149‑1 (MQ=255)
accgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACa < 1:195413/149‑1 (MQ=255)
accgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACa < 1:996516/149‑1 (MQ=255)
accgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACa > 1:1026560/1‑149 (MQ=255)
accgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACa < 1:997224/149‑1 (MQ=255)
ccgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAg > 2:331699/1‑149 (MQ=255)
ccgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAg > 2:35783/1‑149 (MQ=255)
cgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGa < 2:1837901/149‑1 (MQ=255)
cgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGa < 1:3216165/149‑1 (MQ=255)
cgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGa > 1:1108442/1‑149 (MQ=255)
accTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATa > 1:3038075/1‑149 (MQ=255)
ccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATaa < 1:1545959/149‑1 (MQ=255)
ccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATaa > 1:2524963/1‑149 (MQ=255)
ttCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAg < 2:2401831/149‑1 (MQ=255)
ttCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAg < 2:3359136/149‑1 (MQ=255)
gtCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAg < 2:1797038/148‑1 (MQ=255)
cccTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCATATCTACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGt < 1:2458478/149‑1 (MQ=255)
ccTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGtt > 2:451391/1‑149 (MQ=255)
tGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCACTTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTAt > 2:4021831/1‑149 (MQ=255)
tGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTAt < 1:3360637/149‑1 (MQ=255)
ggTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTa < 1:1395576/149‑1 (MQ=255)
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gtgtTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTaa < 1:3282388/149‑1 (MQ=255)
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GATTTCGATTTATGCCACAAATTTCCCGCTACAGTGATGAACAGGTTGAACAATTGCTCGCAGAGCTGCTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCT > CP009273/2277597‑2277891
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
