Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP043523 |
1,848,409 |
A→T |
T40S (ACA→TCA) |
FTN78_chr1898 → |
Cold shock protein of CSP family |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP043523 | 1,848,409 | 0 | A | T | 100.0%
| 797.0
/ NA
| 303 | T40S (ACA→TCA) | FTN78_chr1898 | Cold shock protein of CSP family |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (149/154); total (149/154) |
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
ACGCAGATAAAGGATTTGGCTTTATCACTTCAGAAGAAGGCAAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCAGCAATCCAATCTGATGGATTCAAAACACTTGATGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGC > CP043523/1848320‑1848553
|
acgctactAAAGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCa > 2:4148062/8‑148 (MQ=11)
cgctactAAAGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCaa > 2:3335242/7‑148 (MQ=11)
cgctactAAAGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCaa < 2:2535275/142‑1 (MQ=11)
ctactAAAGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGc < 1:2792447/144‑1 (MQ=11)
ctactAAAGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGc < 1:3388363/144‑1 (MQ=11)
tactAAAGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCa < 1:463505/145‑1 (MQ=11)
ctAAAGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGt > 2:3714311/2‑148 (MQ=11)
tAAAGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGtt > 1:2879696/1‑148 (MQ=11)
tAAAGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGtt > 1:471562/1‑148 (MQ=11)
aaaGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTa < 1:664035/148‑1 (MQ=11)
aaaGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTa > 2:3836472/1‑148 (MQ=11)
aaGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTaa > 1:4388048/1‑148 (MQ=11)
aGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAat > 2:2514677/1‑148 (MQ=11)
aGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAat < 2:3071380/148‑1 (MQ=11)
aGGATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAat < 1:4593783/148‑1 (MQ=11)
ggATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAata < 1:4190761/148‑1 (MQ=11)
gATTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAatat < 1:4502506/148‑1 (MQ=11)
aTTTGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATc < 2:2478151/148‑1 (MQ=11)
tttGGTTTTATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATca > 2:1499987/1‑148 (MQ=11)
gttttATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACaaa < 1:3790181/146‑1 (MQ=11)
gttttATTACCTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACaaa > 1:1520755/3‑148 (MQ=11)
cctctgaagatGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAAtt < 2:2210587/143‑1 (MQ=11)
gatggtcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGa > 2:901718/8‑148 (MQ=14)
atggtcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGaa < 1:3737240/142‑1 (MQ=14)
atggtcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGaa > 2:1030778/7‑148 (MQ=14)
atggtcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGaa > 2:4278196/7‑148 (MQ=14)
ggtcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGaaaa < 1:3992256/144‑1 (MQ=14)
ggtcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGaaaa > 1:428425/5‑148 (MQ=14)
tcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATc > 2:3235817/3‑148 (MQ=255)
tcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATc > 2:3480563/3‑148 (MQ=255)
tcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATc > 2:3547149/3‑148 (MQ=255)
tcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATc > 2:3554169/3‑148 (MQ=255)
tcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATc > 1:2157785/3‑148 (MQ=255)
tcaaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATc < 1:1702869/146‑1 (MQ=255)
caaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCg < 2:2795629/147‑1 (MQ=255)
caaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCg > 2:82244/2‑148 (MQ=255)
aaGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGt > 2:3108856/1‑148 (MQ=255)
aGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTg < 2:1963178/148‑1 (MQ=255)
gATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGc < 2:3769553/148‑1 (MQ=255)
gATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGc > 1:185462/1‑148 (MQ=255)
gATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGc > 2:2448596/1‑148 (MQ=255)
aTTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCa < 1:1641260/148‑1 (MQ=255)
tttGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCaa < 2:2292684/148‑1 (MQ=255)
tttGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCaa < 1:4330350/148‑1 (MQ=255)
ttGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCaaa > 2:2590230/1‑148 (MQ=255)
tGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCaaaa < 2:3169294/148‑1 (MQ=255)
tGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCaaaa > 2:4651015/1‑148 (MQ=255)
tGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCaaaa > 1:306716/1‑148 (MQ=255)
tGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCaaaa < 1:2076466/148‑1 (MQ=255)
tGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCaaaa > 2:1654363/1‑148 (MQ=255)
gTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCaaaaa < 1:181504/148‑2 (MQ=255)
gTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCaaaaa > 1:3280558/1‑147 (MQ=255)
ttCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCaaaaac > 2:1784858/1‑146 (MQ=255)
tCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACt < 1:2240163/148‑1 (MQ=255)
gCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCGACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTgg < 2:1324110/148‑1 (MQ=14)
gCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTgg > 1:928005/1‑148 (MQ=14)
cTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGa < 2:4332623/148‑1 (MQ=255)
cTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGa > 1:1016397/1‑148 (MQ=14)
cTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGa > 1:2346132/1‑148 (MQ=14)
cTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGa < 1:1711212/148‑1 (MQ=14)
aCTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTc < 1:3235817/148‑1 (MQ=255)
aCTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTc < 1:3430084/148‑1 (MQ=14)
aCTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTc < 2:50559/148‑1 (MQ=14)
aCTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTc > 1:1357898/1‑148 (MQ=14)
aCTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTc > 1:3915442/1‑148 (MQ=14)
ttCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCAt < 1:1939949/148‑1 (MQ=14)
ttCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCAt > 2:4007286/1‑148 (MQ=14)
tcatcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGAc > 1:2589572/5‑148 (MQ=14)
tcatcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGAc < 1:3531215/144‑1 (MQ=14)
catcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACt < 1:747105/145‑1 (MQ=255)
catcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACt > 1:3549852/4‑148 (MQ=17)
catcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACt < 1:251760/145‑1 (MQ=17)
atcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACtt > 2:2894574/3‑148 (MQ=255)
atcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACtt < 1:1156750/146‑1 (MQ=255)
atcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACtt < 2:2228342/146‑1 (MQ=255)
atcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACtt < 2:2096044/146‑1 (MQ=255)
atcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATAGTGCAAAAACTGGAGTCATGACtt < 2:748499/146‑1 (MQ=17)
caatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCa > 2:2429690/1‑148 (MQ=255)
caatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAAAAATGAAAAAACTGGAGTCATGACTTCa < 2:1767637/148‑1 (MQ=17)
aatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAg < 1:2432982/148‑1 (MQ=255)
atccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGt < 1:1294334/148‑1 (MQ=255)
tccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGtt > 2:28613/1‑148 (MQ=255)
ccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGttt > 1:4544966/1‑148 (MQ=255)
ccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGttt > 2:676837/1‑148 (MQ=255)
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tattacctctgaagatggtcAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATA < SRR13214404.361829/130‑1 (MQ=21)
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TTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGA < SRR13214404.1953159/150‑1 (MQ=50)
TCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGAC > SRR13214404.3813348/1‑150 (MQ=52)
TCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGAC > SRR13214404.2606395/1‑150 (MQ=52)
CTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACT < SRR13214404.2212598/150‑1 (MQ=54)
TCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTT > SRR13214404.520481/1‑150 (MQ=56)
TCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTT < SRR13214404.3556690/150‑1 (MQ=56)
TCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTT < SRR13214404.3553721/150‑1 (MQ=56)
CATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTC < SRR13214404.752392/150‑1 (MQ=59)
CATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTC < SRR13214404.253600/150‑1 (MQ=59)
ATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCA < SRR13214404.1164933/150‑1 (MQ=60)
TCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAG > SRR13214404.1859661/1‑150 (MQ=60)
CAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGT > SRR13214404.3383321/1‑150 (MQ=60)
CAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGT < SRR13214404.881132/150‑1 (MQ=60)
CAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGT < SRR13214404.4386020/150‑1 (MQ=60)
AATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTT < SRR13214404.2448931/150‑1 (MQ=60)
ATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTT < SRR13214404.1303614/150‑1 (MQ=60)
ATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTT < SRR13214404.1303469/150‑1 (MQ=60)
ATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTT > SRR13214404.4573353/1‑150 (MQ=60)
TCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTT > SRR13214404.3717879/1‑150 (MQ=60)
TCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTT < SRR13214404.2390847/150‑1 (MQ=60)
CCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTT < SRR13214404.420922/150‑1 (MQ=60)
CCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTT < SRR13214404.3757917/150‑1 (MQ=60)
AATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTT > SRR13214404.2217639/1‑150 (MQ=60)
ATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTA < SRR13214404.2851678/150‑1 (MQ=60)
ATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTA < SRR13214404.1650352/150‑1 (MQ=60)
ATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTA < SRR13214404.170672/150‑1 (MQ=60)
TCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTAT < SRR13214404.901589/150‑1 (MQ=60)
TGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATAT < SRR13214404.3957397/150‑1 (MQ=60)
TGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATAT < SRR13214404.3959246/150‑1 (MQ=60)
GATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATT > SRR13214404.3410417/1‑150 (MQ=60)
ATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTC < SRR13214404.2872787/150‑1 (MQ=60)
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TGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCA > SRR13214404.3634778/1‑150 (MQ=60)
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ATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTT > SRR13214404.1910824/1‑150 (MQ=60)
TTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTG > SRR13214404.2739748/1‑150 (MQ=60)
TTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTG < SRR13214404.4612557/150‑1 (MQ=60)
TCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGC < SRR13214404.3753035/150‑1 (MQ=60)
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CAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCA < SRR13214404.4541303/150‑1 (MQ=60)
AAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAA > SRR13214404.3458318/1‑150 (MQ=60)
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AATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAAT > SRR13214404.4680082/1‑150 (MQ=60)
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AATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAAT > SRR13214404.250868/1‑150 (MQ=60)
AATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAAT > SRR13214404.249931/1‑150 (MQ=60)
ATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATT < SRR13214404.823479/150‑1 (MQ=60)
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TTAACGCAGATAAAGGATTTGGCTTTATCACTTCAGAAGAAGGCAAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCAGCAATCCAATCTGATGGATTCAAAACACTTGATGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATG > CP043523/1848317‑1848557
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |