Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 630 total aligned reads displayed.
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|
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ATTGATTAGGAAAGATACAGTTACACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAAT < SRR13214404.2403688/150‑1 (MQ=60)
TTGATTAGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATA > SRR13214404.4654732/1‑150 (MQ=60)
TGATTAGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATAT > SRR13214404.1810699/1‑150 (MQ=60)
TGATTAGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATAT < SRR13214404.3029314/150‑1 (MQ=60)
GATTAGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATT < SRR13214404.1820228/150‑1 (MQ=60)
GATTAGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATT < SRR13214404.1064216/150‑1 (MQ=60)
ATTAGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTT < SRR13214404.2087926/150‑1 (MQ=60)
TAGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTC < SRR13214404.124938/150‑1 (MQ=60)
AGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCA > SRR13214404.2128583/1‑150 (MQ=60)
GGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAA < SRR13214404.3567291/150‑1 (MQ=60)
GGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAA > SRR13214404.2329032/1‑150 (MQ=60)
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GAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAAC < SRR13214404.2169622/150‑1 (MQ=60)
AAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACC < SRR13214404.4418032/150‑1 (MQ=60)
AAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACC < SRR13214404.2751855/150‑1 (MQ=60)
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AAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCG < SRR13214404.1601550/150‑1 (MQ=60)
AAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCG > SRR13214404.2586438/1‑150 (MQ=60)
AAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCG < SRR13214404.3045070/150‑1 (MQ=60)
GATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCT > SRR13214404.2835288/1‑150 (MQ=60)
ATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTT > SRR13214404.4543581/1‑150 (MQ=60)
TACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTC < SRR13214404.4442274/150‑1 (MQ=60)
ACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCA < SRR13214404.3148702/150‑1 (MQ=60)
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CAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAA > SRR13214404.4141122/1‑150 (MQ=60)
AGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAAC > SRR13214404.4472234/1‑150 (MQ=60)
AGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAAC < SRR13214404.381527/150‑1 (MQ=60)
GTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACT < SRR13214404.2219156/150‑1 (MQ=60)
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GTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACT < SRR13214404.4129476/150‑1 (MQ=60)
TTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTT > SRR13214404.1803538/1‑150 (MQ=60)
TTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTT > SRR13214404.4499908/1‑150 (MQ=60)
AAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTT > SRR13214404.3278535/1‑150 (MQ=60)
AAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTT > SRR13214404.2809365/1‑150 (MQ=60)
AACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTA < SRR13214404.656149/150‑1 (MQ=60)
ACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGCTATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTCGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCACCTTTTAG > SRR13214404.3979770/1‑150 (MQ=60)
ACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAG < SRR13214404.1539494/150‑1 (MQ=60)
CCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGA > SRR13214404.3316618/1‑150 (MQ=60)
CTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGAT > SRR13214404.1201349/1‑150 (MQ=60)
TAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATT < SRR13214404.2123834/150‑1 (MQ=60)
AATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTC < SRR13214404.572281/150‑1 (MQ=60)
AATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTT < SRR13214404.2311004/150‑1 (MQ=60)
ATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTC < SRR13214404.3473549/150‑1 (MQ=60)
TCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTtct > SRR13214404.1700579/1‑147 (MQ=60)
TCNAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCA > SRR13214404.3805199/1‑150 (MQ=60)
CTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAA > SRR13214404.1448643/1‑150 (MQ=60)
CTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAA > SRR13214404.3490209/1‑150 (MQ=60)
TAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAG > SRR13214404.4257299/1‑150 (MQ=60)
AAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGA > SRR13214404.1404713/1‑150 (MQ=60)
ATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGG < SRR13214404.843663/150‑1 (MQ=60)
ATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGG < SRR13214404.669449/150‑1 (MQ=60)
ATTGAGGAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTT < SRR13214404.1026650/150‑1 (MQ=60)
TTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTT < SRR13214404.3018368/150‑1 (MQ=60)
TGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTA > SRR13214404.2708525/1‑150 (MQ=60)
GAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAG > SRR13214404.522613/1‑150 (MQ=60)
AATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGC > SRR13214404.4211150/1‑150 (MQ=60)
AATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGC > SRR13214404.2554697/1‑150 (MQ=60)
AATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGC > SRR13214404.4446106/1‑150 (MQ=60)
ATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCT > SRR13214404.3630800/1‑150 (MQ=60)
ATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCT > SRR13214404.3354169/1‑150 (MQ=60)
CTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGC > SRR13214404.61930/1‑150 (MQ=60)
CTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGC > SRR13214404.3700290/1‑150 (MQ=60)
tattatacgtcataaaaaaggttgtattcagaaaaagatttaaatcaAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCA < SRR13214404.4672968/103‑1 (MQ=60)
TTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCA > SRR13214404.957922/1‑150 (MQ=60)
TTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCA > SRR13214404.1643354/1‑150 (MQ=60)
TTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAA > SRR13214404.547509/1‑150 (MQ=60)
TTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAAC < SRR13214404.2316533/150‑1 (MQ=60)
TCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATT < SRR13214404.3692881/150‑1 (MQ=60)
TCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATT > SRR13214404.3843678/1‑150 (MQ=60)
TCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATT > SRR13214404.3280576/1‑150 (MQ=60)
TCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATT < SRR13214404.544749/150‑1 (MQ=60)
CATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTG < SRR13214404.4608137/150‑1 (MQ=60)
ATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGA > SRR13214404.748984/1‑150 (MQ=60)
TCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGAT < SRR13214404.346403/150‑1 (MQ=60)
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ATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTG < SRR13214404.2364154/150‑1 (MQ=60)
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TAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGA < SRR13214404.324149/150‑1 (MQ=60)
TAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGA > SRR13214404.4289348/1‑150 (MQ=60)
AAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAG < SRR13214404.62568/150‑1 (MQ=60)
AGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGC < SRR13214404.3370548/150‑1 (MQ=60)
GAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCA > SRR13214404.4578424/1‑150 (MQ=60)
GAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCA > SRR13214404.3001268/1‑150 (MQ=60)
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AAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAA > SRR13214404.1685315/1‑150 (MQ=60)
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ACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGCGGA > SRR13214404.1733263/1‑150 (MQ=60)
AAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACT > SRR13214404.1583574/1‑150 (MQ=60)
GATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTC > SRR13214404.344543/1‑150 (MQ=60)
ATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCC > SRR13214404.1086086/1‑150 (MQ=60)
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ATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTT > SRR13214404.4168106/1‑150 (MQ=60)
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TTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCA > SRR13214404.3579257/1‑150 (MQ=60)
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TGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCT < SRR13214404.4054575/150‑1 (MQ=60)
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AACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTC < SRR13214404.1709945/150‑1 (MQ=60)
AACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATATTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCGAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGTTTGATTGCGCAATCGAGTGTGTGGAACGTCCTTCCAGTGCTGacatacattgcagagtgtctgtttc > SRR13214404.1424260/1‑125 (MQ=60)
AACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTC > SRR13214404.3215579/1‑150 (MQ=60)
AACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTC > SRR13214404.4687492/1‑150 (MQ=60)
atcTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCA < SRR13214404.1777771/147‑1 (MQ=60)
ACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCA > SRR13214404.4610562/1‑150 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCAT < SRR13214404.174201/150‑1 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCAT < SRR13214404.3927584/150‑1 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCAT > SRR13214404.4108020/1‑150 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCAT > SRR13214404.4106062/1‑150 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCAT > SRR13214404.1986805/1‑150 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCAT < SRR13214404.1245872/150‑1 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCAT > SRR13214404.1985202/1‑150 (MQ=60)
TTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATC > SRR13214404.1003281/1‑150 (MQ=60)
TTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATC < SRR13214404.4456318/150‑1 (MQ=60)
TGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCA < SRR13214404.1647510/150‑1 (MQ=60)
TGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCA > SRR13214404.3802904/1‑150 (MQ=60)
CCCTTTAATCCCACCTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGT < SRR13214404.2980026/150‑1 (MQ=60)
CCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTA < SRR13214404.399743/150‑1 (MQ=60)
CCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTA < SRR13214404.3872279/150‑1 (MQ=60)
CTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAA > SRR13214404.4431004/1‑150 (MQ=60)
CTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAA < SRR13214404.3413284/150‑1 (MQ=60)
TTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAA < SRR13214404.27984/150‑1 (MQ=60)
TTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAA < SRR13214404.2906732/150‑1 (MQ=60)
TTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAA < SRR13214404.1325063/150‑1 (MQ=60)
TTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAA < SRR13214404.3188506/150‑1 (MQ=60)
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TTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAA < SRR13214404.1905447/150‑1 (MQ=60)
TTAATCCCACCTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAA < SRR13214404.1306295/150‑1 (MQ=60)
TAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAAT < SRR13214404.3916729/150‑1 (MQ=60)
TAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAAT < SRR13214404.482969/150‑1 (MQ=60)
TAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAAT < SRR13214404.2673923/150‑1 (MQ=60)
TAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAAT > SRR13214404.1340448/1‑150 (MQ=60)
AATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATC < SRR13214404.3857042/150‑1 (MQ=60)
ATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCA < SRR13214404.26182/150‑1 (MQ=60)
TTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAA > SRR13214404.1524487/1‑150 (MQ=60)
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ACATCTTGTTGTTCATTGATTAGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAAT > CP043523/479997‑480295
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
