Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
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90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 559 total aligned reads displayed.
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|
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TTAGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTT < SRR13214403.459453/150‑1 (MQ=60)
TAGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTC > SRR13214403.3406431/1‑150 (MQ=60)
AGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCA > SRR13214403.575725/1‑150 (MQ=60)
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AAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCG < SRR13214403.2348326/150‑1 (MQ=60)
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AGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAAC > SRR13214403.2641185/1‑150 (MQ=60)
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AAATCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTT < SRR13214403.1482749/150‑1 (MQ=60)
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AATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAG > SRR13214403.2222869/1‑150 (MQ=60)
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TTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTT > SRR13214403.1807017/1‑150 (MQ=60)
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TGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTA < SRR13214403.2054373/150‑1 (MQ=60)
tagaAATCTTTTGTTTATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAG < SRR13214403.313063/146‑1 (MQ=60)
GAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAG < SRR13214403.4194582/150‑1 (MQ=60)
AGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGCTAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGC < SRR13214403.4002402/150‑1 (MQ=60)
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GAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCA < SRR13214403.1414480/150‑1 (MQ=60)
AAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAG < SRR13214403.1293233/150‑1 (MQ=60)
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AATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGC > SRR13214403.1670844/1‑150 (MQ=60)
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TCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTG < SRR13214403.4257835/150‑1 (MQ=60)
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CTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGC > SRR13214403.2874676/1‑150 (MQ=60)
CTTTTGTTCATCATAAGAAAGTCGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGC < SRR13214403.3441132/150‑1 (MQ=60)
TTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAA > SRR13214403.290447/1‑150 (MQ=60)
TTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGAGTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAA > SRR13214403.4008174/1‑150 (MQ=60)
TTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAAC > SRR13214403.4278206/1‑150 (MQ=60)
TTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAAC < SRR13214403.74536/150‑1 (MQ=60)
TTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAAC > SRR13214403.194374/1‑150 (MQ=60)
TGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACG > SRR13214403.1095078/1‑150 (MQ=60)
TGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTGCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACG > SRR13214403.4454667/1‑150 (MQ=60)
TGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACG > SRR13214403.4209908/1‑150 (MQ=60)
TGTTCATAATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACG < SRR13214403.962216/150‑1 (MQ=60)
GTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGA > SRR13214403.3269995/1‑150 (MQ=60)
GTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGA > SRR13214403.2370169/1‑150 (MQ=60)
TTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGAT > SRR13214403.1448698/1‑150 (MQ=60)
TTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGAT > SRR13214403.1678007/1‑150 (MQ=60)
TCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGACTATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATT > SRR13214403.2765762/1‑150 (MQ=60)
TCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATT > SRR13214403.44398/1‑150 (MQ=60)
ATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGA > SRR13214403.2287013/1‑150 (MQ=60)
ATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGA > SRR13214403.4241153/1‑150 (MQ=60)
CATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATT > SRR13214403.3162594/1‑150 (MQ=60)
AGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGC > SRR13214403.2014619/1‑150 (MQ=60)
AGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGC > SRR13214403.3286068/1‑150 (MQ=60)
AGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGC > SRR13214403.520264/1‑150 (MQ=60)
AAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAA > SRR13214403.3518893/1‑150 (MQ=60)
AAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAA > SRR13214403.3504288/1‑150 (MQ=60)
AGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATC < SRR13214403.2803544/150‑1 (MQ=60)
AGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATC < SRR13214403.2794672/150‑1 (MQ=60)
AGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATC > SRR13214403.79060/1‑150 (MQ=60)
GATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGT < SRR13214403.2471287/150‑1 (MQ=60)
GATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGT > SRR13214403.4398836/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTG > SRR13214403.1868888/1‑150 (MQ=60)
TTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAG > SRR13214403.2147113/1‑150 (MQ=60)
TTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGT > SRR13214403.3664852/1‑150 (MQ=60)
CACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGG > SRR13214403.592823/1‑150 (MQ=60)
CGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAA > SRR13214403.3787421/1‑150 (MQ=60)
CGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAA > SRR13214403.1149418/1‑150 (MQ=60)
GAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAAC > SRR13214403.4317991/1‑150 (MQ=60)
GAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAAC > SRR13214403.50307/1‑150 (MQ=60)
GAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAAC > SRR13214403.624117/1‑150 (MQ=60)
AAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACT > SRR13214403.897951/1‑150 (MQ=60)
AGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTT < SRR13214403.2669643/150‑1 (MQ=60)
AGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTT < SRR13214403.2846577/150‑1 (MQ=60)
GATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTC < SRR13214403.1398642/150‑1 (MQ=60)
ATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCC > SRR13214403.1538590/1‑150 (MQ=60)
ATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCC > SRR13214403.1511591/1‑150 (MQ=60)
ATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTT > SRR13214403.1410616/1‑150 (MQ=60)
ATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTT > SRR13214403.1550188/1‑150 (MQ=60)
TTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTC < SRR13214403.2841323/150‑1 (MQ=60)
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AGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTG < SRR13214403.3247915/150‑1 (MQ=60)
GTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGC > SRR13214403.1382748/1‑150 (MQ=60)
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TTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCT < SRR13214403.1100826/150‑1 (MQ=60)
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TAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTG < SRR13214403.3686175/150‑1 (MQ=60)
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ATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATG > SRR13214403.2491558/1‑150 (MQ=60)
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TTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGAT < SRR13214403.4053246/150‑1 (MQ=60)
TTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGAT > SRR13214403.3631065/1‑150 (MQ=60)
TGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATT > SRR13214403.1479009/1‑150 (MQ=60)
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GATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTT > SRR13214403.4218823/1‑150 (MQ=60)
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GATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTT < SRR13214403.4630390/150‑1 (MQ=60)
ATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTG > SRR13214403.2320319/1‑150 (MQ=60)
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TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTG < SRR13214403.1695180/150‑1 (MQ=60)
TTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTC < SRR13214403.3537990/150‑1 (MQ=60)
TGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCT < SRR13214403.763590/150‑1 (MQ=60)
TGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCT > SRR13214403.609607/1‑150 (MQ=60)
TGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCT < SRR13214403.3766356/150‑1 (MQ=60)
TGATTAACTTGCCCATTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCTCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCT < SRR13214403.3892950/150‑1 (MQ=60)
GATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTG < SRR13214403.1056405/150‑1 (MQ=60)
GATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTG > SRR13214403.38322/1‑150 (MQ=60)
GATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTG < SRR13214403.1883795/150‑1 (MQ=60)
GATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTG < SRR13214403.3920555/150‑1 (MQ=60)
GATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTG > SRR13214403.260540/1‑150 (MQ=60)
ATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGT > SRR13214403.3755254/1‑150 (MQ=60)
TTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTT > SRR13214403.3382073/1‑150 (MQ=60)
TAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTT < SRR13214403.1652695/150‑1 (MQ=60)
AACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTC < SRR13214403.1196616/150‑1 (MQ=60)
AACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTC < SRR13214403.3184233/150‑1 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCAT < SRR13214403.1073754/150‑1 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCAT > SRR13214403.1640848/1‑150 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCAT < SRR13214403.7096/150‑1 (MQ=60)
TTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATC > SRR13214403.1574036/1‑150 (MQ=60)
TTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCCACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCCACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATC > SRR13214403.1838667/1‑150 (MQ=60)
GCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAG > SRR13214403.2970897/1‑150 (MQ=60)
CCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGT < SRR13214403.4311254/150‑1 (MQ=60)
CCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGT < SRR13214403.2620932/150‑1 (MQ=60)
TTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAA > SRR13214403.4057342/1‑150 (MQ=60)
TTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAA > SRR13214403.1280641/1‑150 (MQ=60)
TTACTTCCAACTCCTGGAATATTTTCATCCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAA < SRR13214403.4101314/150‑1 (MQ=60)
TTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAA < SRR13214403.672216/150‑1 (MQ=60)
TTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTACCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAA < SRR13214403.3568916/150‑1 (MQ=60)
TTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAA > SRR13214403.2004550/1‑150 (MQ=60)
TAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAAT < SRR13214403.773540/150‑1 (MQ=60)
TAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAAT < SRR13214403.919698/150‑1 (MQ=60)
ATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCA > SRR13214403.3727760/1‑150 (MQ=60)
ATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCA > SRR13214403.2563912/1‑150 (MQ=60)
TCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAA > SRR13214403.414970/1‑150 (MQ=60)
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ACATCTTGTTGTTCATTGATTAGGAAAGATACAGTTAAACCTAAATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAAT > CP043523/479997‑480295
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |