Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 614 total aligned reads displayed.
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|
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TCTAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCA > SRR13214404.4448929/1‑150 (MQ=60)
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TAAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAG < SRR13214404.2147452/150‑1 (MQ=60)
AAATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGA < SRR13214404.4120716/150‑1 (MQ=60)
ATATTGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGG < SRR13214404.669449/150‑1 (MQ=60)
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TGAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTA > SRR13214404.4479816/1‑150 (MQ=60)
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GAGAAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAG < SRR13214404.1320622/150‑1 (MQ=60)
AGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGC > SRR13214404.970775/1‑150 (MQ=60)
AATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGC > SRR13214404.4211150/1‑150 (MQ=60)
ATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCT > SRR13214404.2408108/1‑150 (MQ=60)
ATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCT > SRR13214404.3630800/1‑150 (MQ=60)
TCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTG > SRR13214404.2514720/1‑150 (MQ=60)
tattatacgtcataaaaaaggttgtattcagaaaaagatttaaatcaAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCA < SRR13214404.4672968/103‑1 (MQ=60)
TTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAA > SRR13214404.547509/1‑150 (MQ=60)
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TTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAAC > SRR13214404.2542222/1‑150 (MQ=60)
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TCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATT < SRR13214404.544749/150‑1 (MQ=60)
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AGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATC > SRR13214404.3965163/1‑150 (MQ=60)
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AAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACT > SRR13214404.1583574/1‑150 (MQ=60)
AGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTT < SRR13214404.4565885/150‑1 (MQ=60)
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AGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTG < SRR13214404.3215284/150‑1 (MQ=60)
TTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCT < SRR13214404.935576/150‑1 (MQ=60)
AACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGC > SRR13214404.765521/1‑150 (MQ=60)
ACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCC < SRR13214404.300080/150‑1 (MQ=60)
CAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCA > SRR13214404.879398/1‑150 (MQ=60)
CAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCA < SRR13214404.3776142/150‑1 (MQ=60)
AATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCTTTTTAATTCCAACTCCTGGAATTTTTTCTACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGTGTTTTAGCAGCTGCAACGTTTGTTTGAGCAATTGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCCT > SRR13214404.4740081/1‑150 (MQ=60)
AATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCAT < SRR13214404.2655641/150‑1 (MQ=60)
AATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCAT < SRR13214404.192835/150‑1 (MQ=60)
TTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGA > SRR13214404.2050753/1‑150 (MQ=60)
TTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTCATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGA > SRR13214404.4263094/1‑150 (MQ=60)
TTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGA < SRR13214404.2488020/150‑1 (MQ=60)
TTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGAT > SRR13214404.4581303/1‑150 (MQ=60)
TGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATT > SRR13214404.2839750/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAGTTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTT > SRR13214404.2202330/1‑150 (MQ=60)
TAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGG < SRR13214404.2063173/150‑1 (MQ=60)
TAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGG < SRR13214404.1532910/150‑1 (MQ=60)
TAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGG < SRR13214404.2574905/150‑1 (MQ=60)
TAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGG > SRR13214404.2879517/1‑150 (MQ=60)
AAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAG < SRR13214404.2322844/150‑1 (MQ=60)
AAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAG > SRR13214404.1607956/1‑150 (MQ=60)
AAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAGCTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGA < SRR13214404.1527820/150‑1 (MQ=60)
AAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGA < SRR13214404.3170671/150‑1 (MQ=60)
AAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGA > SRR13214404.1273898/1‑150 (MQ=60)
G‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAAT < SRR13214404.1350904/150‑1 (MQ=60)
TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATG > SRR13214404.1097267/1‑150 (MQ=60)
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TTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTC > SRR13214404.3804745/1‑150 (MQ=60)
TGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCT < SRR13214404.4051989/150‑1 (MQ=60)
GATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTG > SRR13214404.3567334/1‑150 (MQ=60)
ATTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGT > SRR13214404.4718544/1‑150 (MQ=60)
TTAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTT > SRR13214404.4193425/1‑150 (MQ=60)
TTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTT < SRR13214404.536761/150‑1 (MQ=60)
TAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTT > SRR13214404.1397459/1‑150 (MQ=60)
AACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATATTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCGAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGTTTGATTGCGCAATCGAGTGTGTGGAACGTCCTTCCAGTGCTGacatacattgcagagtgtctgtttc > SRR13214404.1424260/1‑125 (MQ=60)
AACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTC < SRR13214404.83609/150‑1 (MQ=60)
AACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTC > SRR13214404.4687492/1‑150 (MQ=60)
AACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTACAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGACATGATTTGGAGAATGTCTGTTTC > SRR13214404.3509051/1‑150 (MQ=60)
AACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCCGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTC > SRR13214404.753813/1‑150 (MQ=60)
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CTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCAT < SRR13214404.174201/150‑1 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCAT > SRR13214404.1986805/1‑150 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCAT < SRR13214404.1246041/150‑1 (MQ=60)
TTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATC > SRR13214404.1003281/1‑150 (MQ=60)
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TGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCA > SRR13214404.4462751/1‑150 (MQ=60)
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AATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATC < SRR13214404.16628/150‑1 (MQ=60)
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ATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCA < SRR13214404.26182/150‑1 (MQ=60)
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CTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTAC < SRR13214404.1895702/150‑1 (MQ=60)
TGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACG > SRR13214404.1687293/1‑150 (MQ=60)
TGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACG < SRR13214404.303628/150‑1 (MQ=60)
GGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCATTAAAATCAATAACATTACGA > SRR13214404.1677218/1‑150 (MQ=60)
TTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATA < SRR13214404.2092382/150‑1 (MQ=60)
TTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATA < SRR13214404.3758927/150‑1 (MQ=60)
TTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAA < SRR13214404.2264948/150‑1 (MQ=60)
TTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAA > SRR13214404.1834770/1‑150 (MQ=60)
TTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAA < SRR13214404.3231057/150‑1 (MQ=60)
TTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATGACATTACGAACAATAAA > SRR13214404.4543908/1‑150 (MQ=60)
TTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAA < SRR13214404.856138/150‑1 (MQ=60)
TCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAAC > SRR13214404.1620845/1‑150 (MQ=60)
CAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACT > SRR13214404.3396373/1‑150 (MQ=60)
AACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTT < SRR13214404.1138300/150‑1 (MQ=60)
AGCGCTTCGACTGTTAGAGTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTA < SRR13214404.3519465/150‑1 (MQ=60)
CGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACC > SRR13214404.3146020/1‑150 (MQ=60)
CGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACC < SRR13214404.195137/150‑1 (MQ=60)
GCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCG > SRR13214404.4437953/1‑150 (MQ=60)
GCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCG > SRR13214404.4436281/1‑150 (MQ=60)
CTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGT > SRR13214404.2607544/1‑150 (MQ=60)
CTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGT > SRR13214404.3725108/1‑150 (MQ=60)
CTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGT < SRR13214404.4518690/150‑1 (MQ=60)
CTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGT < SRR13214404.2417736/150‑1 (MQ=60)
TCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCA < SRR13214404.2632599/150‑1 (MQ=60)
CAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAG > SRR13214404.2798410/1‑150 (MQ=60)
CAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAG > SRR13214404.321185/1‑150 (MQ=60)
CAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAG > SRR13214404.2811784/1‑150 (MQ=60)
CTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTA > SRR13214404.1126188/1‑150 (MQ=60)
TTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAAT < SRR13214404.1102434/150‑1 (MQ=60)
TTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAAT < SRR13214404.3014458/150‑1 (MQ=60)
TTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAAT < SRR13214404.2355844/150‑1 (MQ=60)
TTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATG > SRR13214404.503021/1‑150 (MQ=60)
TTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATG < SRR13214404.4598782/150‑1 (MQ=60)
GATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTC < SRR13214404.2036045/150‑1 (MQ=60)
ATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGAATTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCC > SRR13214404.3921112/1‑150 (MQ=60)
TTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCC < SRR13214404.4330314/150‑1 (MQ=60)
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AATCTAAATATTGAGCAATCTTTTGTTCATCATAAGAAAGTTGATTTTCACGAAGATATTTATAGTTAACAATTTGATAAAAG‑TTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTT > CP043523/480040‑480338
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
